Name: Un flusso di lavoro computazionale bilingue per identificare potenziali inibitori PLK1 nella lingua dei segni americana e in inglese (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-04-03T15:00:00.000+00:00
Duration: 14 min 34 s
Description: Scopri un flusso di lavoro computazionale bilingue per identificare inibitori PLK1 utilizzando screening di database, docking proteina-legante e valutazione ADMET-S. Questo metodo supporta la scoperta di farmaci antitumorali selettivi.

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<table><tbody><tr><td>ADMETLab3</td><td>Simulations Plus. Inc</td><td>V3.0</td><td>Proprietà ADMET</td></tr><tr><td>Alphafold</td><td>Cerca DeepMind & Ricerca su Google Isomorphic Labs (filiali di Alphabet)</td><td>V3.0.1</td><td>Modellazione 3D delle proteine</td></tr><tr><td>Anaconda/Conda</td><td>Anaconda, Inc.</td><td>V24.9.2</td><td>Sistema di gestione pacchetti open source&nbsp;</td></tr><tr><td>CB-Dock2</td><td>Laboratorio Yang Cao</td><td>V2.0</td><td>Aggancio cieco proteina-ligando</td></tr><tr><td>CHARMM-GUI</td><td>Università di Lehigh</td><td>V3.8</td><td>Manipolazione e simulazione biomolecolare</td></tr><tr><td>DARWIN su ACCESS</td><td>Università del Delaware</td><td>N/A</td><td>Calcolo ad alte prestazioni</td></tr><tr><td>ORCA</td><td>FAccTs GmbH</td><td>V6.1.0</td><td>Pacchetto di chimica quantistica</td></tr><tr><td>Banca Dati Proteica</td><td>Banca Mondiale di Dati sulle Proteine</td><td>RRID:SCR_006555</td><td>Database proteico</td></tr><tr><td>RDKit</td><td>Open source</td><td>RRID:SCR_014274</td><td>Programmazione chemioinformatica</td></tr><tr><td>SuperNatural 3.0</td><td>Istituto di Fisiologia e Scienza-IT (Berlino)</td><td>V3.0</td><td>Libreria di molecole naturali</td></tr><tr><td>SwissADME</td><td>Istituto Svizzero di Bioinformatica</td><td>RRID:SCR_017865</td><td>Proprietà ADME</td></tr><tr><td>Toxtree</td><td>Ideaconsult Ltd</td><td>V3.1.0</td><td>Classificazione della tossicità</td></tr></tbody></table>

un flusso di lavoro computazionale bilingue per identificare potenziali inibitori plk1 nella lingua dei segni americana e in inglese

A Bilingual Computational Workflow for Identifying Potential PLK1 Inhibitors in American Sign Language and English

Un flusso di lavoro computazionale bilingue per identificare potenziali inibitori PLK1 nella lingua dei segni americana e in inglese

Polo-like Kinase 1 (PLK1) plays essential roles in the S, G2, and M phases of the cell cycle, and its overexpression is frequently observed in multiple ...

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Qui si mostrano come utilizzare Ligation analisi di prossimità (PLA), con una combinazione di anticorpi per visualizzare proteina morfogenetica dell'osso (BMP) di segnalazione nelle cellule fisso. Questa tecnica ci ha permesso di seguire l'accumulo nucleare di BMP endogene attivate effettore complessi e quantificare i loro livelli nel corso del tempo sotto BMP4 stimolazione.

Rilevazione di segnalazione Effettistica-Complessi valle di BMP4 utilizzo In situ PLA, una legatura di prossimità Assay

Qui usiamo una libreria umano LentiPlex raggruppati e tradizionali metodi di sequenziamento per identificare gli obiettivi gene promuovere la sopravvivenza delle cellule. Dimostriamo come impostare e deconvolute uno schermo LentiPlex e convalidare i risultati.

LentiPlex MISSIONE pool di screening Biblioteca shRNA in cellule di mammifero

Il controllo della sintesi proteica avviene principalmente nella fase di inizio della traduzione, le cui carenze sono legate a diversi disturbi. Per comprendere meglio la loro eziologia, abbiamo descritto qui un protocollo che utilizza ovociti di Xenopus laevis per valutare la traduzione del trascritto di mos in presenza di un mutante del fattore di inizio della traduzione eIF4G1.

Xenopus laevis come un modello per individuare Traduzione Impairment

La resistenza ai farmaci per terapie mirate è molto diffusa e la necessità di individuare meccanismi di resistenza - prima o dopo l'insorgenza clinica - è fondamentale per guidare le strategie alternative di gestione clinica. Qui, presentiamo un protocollo per accoppiare derivazione di linee farmaco-resistenti in vitro con sequenziamento per accelerare scoperta di questi meccanismi.

Implementazione di<em&gt; In Vitro</em&gt; Drug Resistance saggi: massimizzare il potenziale per scoprire clinicamente rilevanti Resistenza Meccanismi

Qui, un protocollo per analisi di medio-alto rendimento degli eventi di fosforilazione della proteina a livello cellulare è presentato. Phospho flusso cytometry è un approccio potente per caratterizzare la segnalazione aberrazioni, identificare e validare biomarcatori e valutare farmacodinamica.

Citometria a flusso di phospho con codici a barre fluorescenti cella per cella singola segnalazione analisi e scoperta del biomarcatore

Qui, presentiamo un protocollo eCLIP per determinare i principali obiettivi di RNA dei candidati RBP in testis.

Metodo di immunoprecipitazione crosslinking migliorato (eCLIP) per un'identificazione efficiente dell'RNA legato alle proteine nei testis del topo

Viene presentato un protocollo dettagliato per la generazione di microarray proteici umani auto-assemblati per lo screening degli inibitori della chinasi.

Screening dell'inibitore della kinasi in microarray proteici umane auto-assemblati

Questo studio mirava a presentare una strategia per identificare le interazioni farmaco-peptidico. La strategia prevede la biopanning di peptidi corti che riconoscono farmaci basati su un biosensore QCM (Quartz-Crystal Microbalance), seguito da un'analisi bioinformatica per valutare quantitativamente le informazioni ottenute per il riconoscimento del farmaco e l'annotazione dei siti di legame farmacologico sulle proteine.

Strategia di biopanning e analisi bioinformatica ad alta produttività basata su biosensore per la convalida globale delle interazioni farmaco-proteina

Abbiamo sviluppato un approccio oncogenomico comparativo cross-species utilizzando analisi genomiche e screening genomici funzionali per identificare e confrontare bersagli terapeutici nei tumori che insorgono in modelli murini geneticamente modificati e il corrispondente tipo di tumore umano.

Profilazione genetica e screening dell'abbandono su scala genomica per identificare bersagli terapeutici in modelli murini di tumore maligno della guaina nervosa periferica

Non mirati metabolomica fornisce una ipotesi la generazione di un'istantanea di un profilo di metabolico. Questo protocollo dimostrerà la estrazione e l'analisi delle metaboliti provenienti da cellule, siero, o tessuto. Una gamma di metaboliti vengono intervistati usando l'estrazione in fase liquido-liquido, microflusso UltraPerformance liquida cromatografia in fase / ad alta-risoluzione di massa spettrometria di (UPLC-HRMS) accoppiato ad software di analisi differenziale di.

Metabolomica non mirati da fonti biologiche Uso UltraPerformance cromatografia liquida-spettrometria di massa ad alta risoluzione (UPLC-HRMS)

Scopri un flusso di lavoro computazionale bilingue per identificare inibitori PLK1 utilizzando screening di database, docking proteina-legante e valutazione ADMET-S. Questo metodo supporta la scoperta di farmaci antitumorali selettivi.

Un flusso di lavoro computazionale bilingue per identificare potenziali inibitori PLK1 nella lingua dei segni americana e in inglese (Video) | JoVE Journal

Un flusso di lavoro computazionale bilingue per identificare potenziali inibitori PLK1 nella lingua dei segni americana e in inglese

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