Name: Valutazione delle risposte delle foglie ai metaboliti secondari microbici utilizzando un formato ad alto rendimento (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-12-05T13:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 51 s
Description: Scopri un metodo ad alto rendimento per valutare le risposte delle foglie ai metaboliti secondari microbici. Questo protocollo misura contemporaneamente perdita di ioni, attività perossidasica e produzione di callosio, ottimizzando l'uso di campioni limitati.

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<ol><li>Yu, X., Feng, B., He, P., Shan, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((From+chaos+to+harmony%3A+responses+and+signaling+upon+microbial+pattern+recognition%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Phytopathol%22%5BJournal%5D)">From chaos to harmony: responses and signaling upon microbial pattern recognition.</a> Annu Rev Phytopathol. 55 (1), 109-137 (2017).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+cyclic+lipopeptide+from+Fusarium+graminearum+targets+plant+membranes+to+promote+virulence%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Rep%22%5BJournal%5D)">A cyclic lipopeptide from Fusarium graminearum targets plant membranes to promote virulence.</a> Cell Rep. 43 (7), 114384(2024).</li>
<li>Thoms, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Innate+immunity+can+distinguish+beneficial+from+pathogenic+rhizosphere+microbiota%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Innate immunity can distinguish beneficial from pathogenic rhizosphere microbiota.</a> bioRxiv. , (2023).</li>
<li>Nishiuchi, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fusarium+phytotoxin+trichothecenes+have+an+elicitor-like+activity+in+Arabidopsis+thaliana%2C+but+the+activity+differed+significantly+among+their+molecular+species%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Fusarium phytotoxin trichothecenes have an elicitor-like activity in Arabidopsis thaliana, but the activity differed significantly among their molecular species.</a> Mol Plant Microbe Interact. 19 (5), 512-520 (2006).</li>
<li>Schellenberger, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Apoplastic+invasion+patterns+triggering+plant+immunity%3A+plasma+membrane+sensing+at+the+frontline%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">Apoplastic invasion patterns triggering plant immunity: plasma membrane sensing at the frontline.</a> Mol Plant Pathol. 20 (11), 1602-1616 (2019).</li>
<li>Henry, G., Deleu, M., Jourdan, E., Thonart, P., Ongena, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+bacterial+lipopeptide+surfactin+targets+the+lipid+fraction+of+the+plant+plasma+membrane+to+trigger+immune-related+defence+responses%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The bacterial lipopeptide surfactin targets the lipid fraction of the plant plasma membrane to trigger immune-related defence responses.</a> Cell Microbiol. 13 (11), 1824-1837 (2011).</li>
<li>Pršić, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanosensing+and+sphingolipid-docking+mediate+lipopeptide-induced+immunity+in+Arabidopsis%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Mechanosensing and sphingolipid-docking mediate lipopeptide-induced immunity in Arabidopsis.</a> bioRxiv. , (2023).</li>
<li>Crouzet, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biosurfactants+in+plant+protection+against+diseases%3A+rhamnolipids+and+lipopeptides+case+study%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Bioeng+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Biosurfactants in plant protection against diseases: rhamnolipids and lipopeptides case study.</a> Front Bioeng Biotechnol. 8, 1014(2020).</li>
<li>Khan, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Luminol-based+chemiluminescent+signals%3A+clinical+and+non-clinical+application+and+future+uses%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Biochem+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Luminol-based chemiluminescent signals: clinical and non-clinical application and future uses.</a> Appl Biochem Biotechnol. 173, 333-355 (2014).</li>
<li>Schenk, S. T., Schikora, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Staining+of+callose+depositions+in+root+and+leaf+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Bio-protoc%22%5BJournal%5D)">Staining of callose depositions in root and leaf tissues.</a> Bio-protoc. 5 (6), e1429(2015).</li>
<li>Mott, G. A., Desveaux, D., Guttman, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+high-sensitivity%2C+microtiter-based+plate+assay+for+plant+pattern-triggered+immunity%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">A high-sensitivity, microtiter-based plate assay for plant pattern-triggered immunity.</a> Mol Plant Microbe Interact. 31 (5), 499-504 (2018).</li>
<li>Hatsugai, N., Katagiri, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+plant+cell+death+by+electrolyte+leakage+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Bio-protoc%22%5BJournal%5D)">Quantification of plant cell death by electrolyte leakage assay.</a> Bio-protoc. 8 (5), e2758(2018).</li>
<li>Zhang, X. H., Yu, X. Z., Yue, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phytotoxicity+of+dimethyl+sulfoxide+%28DMSO%29+to+rice+seedlings%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Environ+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Phytotoxicity of dimethyl sulfoxide (DMSO) to rice seedlings.</a> Int J Environ Sci Technol. 13, 607-614 (2016).</li>
<li>Mannan, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DMSO+triggers+the+generation+of+ROS+leading+to+an+increase+in+artemisinin+and+dihydroartemisinic+acid+in+Artemisia+annua+shoot+cultures%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Rep%22%5BJournal%5D)">DMSO triggers the generation of ROS leading to an increase in artemisinin and dihydroartemisinic acid in Artemisia annua shoot cultures.</a> Plant Cell Rep. 29, 143-152 (2010).</li>
<li>Felix, G., Duran, J. D., Volko, S., Boller, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plants+have+a+sensitive+perception+system+for+the+most+conserved+domain+of+bacterial+flagellin%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+J%22%5BJournal%5D)">Plants have a sensitive perception system for the most conserved domain of bacterial flagellin.</a> Plant J. 18 (3), 265-276 (1999).</li>
<li>Jourdan, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Insights+into+the+defense-related+events+occurring+in+plant+cells+following+perception+of+surfactin-type+lipopeptide+from+Bacillus+subtilis%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Insights into the defense-related events occurring in plant cells following perception of surfactin-type lipopeptide from Bacillus subtilis.</a> Mol Plant Microbe Interact. 22 (4), 456-468 (2009).</li>
<li>Raaijmakers, J. M., De Bruijn, I., Nybroe, O., Ongena, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Natural+functions+of+lipopeptides+from+Bacillus+and+Pseudomonas%3A+more+than+surfactants+and+antibiotics%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Microbiol+Rev%22%5BJournal%5D)">Natural functions of lipopeptides from Bacillus and Pseudomonas: more than surfactants and antibiotics.</a> FEMS Microbiol Rev. 34 (6), 1037-1062 (2010).</li>
<li>vábová, L., Lebeda, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+selection+for+improved+plant+resistance+to+toxin-producing+pathogens%5BTitle%5D)+AND+%22J+Phytopathol%22%5BJournal%5D)">In vitro selection for improved plant resistance to toxin-producing pathogens.</a> J Phytopathol. 153 (1), 52-64 (2005).</li>
<li>Mousa, W. K., Raizada, M. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+diversity+of+antimicrobial+secondary+metabolites+produced+by+fungal+endophytes%3A+an+interdisciplinary+perspective%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The diversity of antimicrobial secondary metabolites produced by fungal endophytes: an interdisciplinary perspective.</a> Front Microbiol. 4, 65(2013).</li>
<li>Bektas, Y., Eulgem, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthetic+plant+defense+elicitors%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">Synthetic plant defense elicitors.</a> Front Plant Sci. 5, 804(2015).</li>
<li>Saeed, B., Trujillo, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+immunity-related+oxidative+bursts+by+a+luminol-based+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Responses+Plants%3A+Methods+Protoc%22%5BJournal%5D)">Analysis of immunity-related oxidative bursts by a luminol-based assay.</a> Environ Responses Plants: Methods Protoc. , 339-346 (2022).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+and+hormonal+profiling+of+Fusarium+graminearum-infected+wheat+reveals+an+association+between+auxin+and+susceptibility%5BTitle%5D)+AND+%22Physiol+Mol+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">Transcriptional and hormonal profiling of Fusarium graminearum-infected wheat reveals an association between auxin and susceptibility.</a> Physiol Mol Plant Pathol. 107, 33-39 (2019).</li>
<li>Taylor, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+wetting+of+leaf+surfaces%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Colloid+Interface+Sci%22%5BJournal%5D)">The wetting of leaf surfaces.</a> Curr Opin Colloid Interface Sci. 16 (4), 326-334 (2011).</li>
<li>Mika, A., Boenisch, M. J., Hopff, D., Lüthje, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Membrane-bound+guaiacol+peroxidases+from+maize+%28Zea+mays+L.%29+roots+are+regulated+by+methyl+jasmonate%2C+salicylic+acid%2C+and+pathogen+elicitors%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Bot%22%5BJournal%5D)">Membrane-bound guaiacol peroxidases from maize (Zea mays L.) roots are regulated by methyl jasmonate, salicylic acid, and pathogen elicitors.</a> J Exp Bot. 61 (3), 831-841 (2010).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+profiling+and+genetic+mapping+of+barley+responses+to+bacterial+flagellin%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Transcriptional profiling and genetic mapping of barley responses to bacterial flagellin.</a> Mol Plant Microbe Interact. 38 (2), 344-352 (2025).</li>
<li>Takáč, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((TALEN-based+HvMPK3+knock-out+attenuates+proteome+and+root+hair+phenotypic+responses+to+flg22+in+barley%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">TALEN-based HvMPK3 knock-out attenuates proteome and root hair phenotypic responses to flg22 in barley.</a> Front Plant Sci. 12, 666229(2021).</li>
<li>Kim, M. G., Macoy, D. M., Lee, J. Y., Cha, J. Y., Kim, W. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interactions+between+plant+immunity%2C+temperature%2C+light%2C+and+circadian+rhythm%5BTitle%5D)+AND+%22J+Plant+Biochem+Physiol%22%5BJournal%5D)">Interactions between plant immunity, temperature, light, and circadian rhythm.</a> J Plant Biochem Physiol. 9, 260(2021).</li>
<li>Bahadoor, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gramillin+A+and+B%3A+cyclic+lipopeptides+identified+as+the+nonribosomal+biosynthetic+products+of+Fusarium+graminearum%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Chem+Soc%22%5BJournal%5D)">Gramillin A and B: cyclic lipopeptides identified as the nonribosomal biosynthetic products of Fusarium graminearum.</a> J Am Chem Soc. 140 (48), 16783-16791 (2018).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Acido 5-aminosalicilico</td><td>Millipore Sigma&nbsp;</td><td>A79809</td><td></td></tr><tr><td>Pompa a vuoto Barnart</td><td>Gruppo Artigiano Tecnologico</td><td>400-3910</td><td></td></tr><tr><td>Sonda di microconduttività COND-905</td><td>Lazar Research Laboratories Inc.</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Peptide FLG22</td><td>AnaSpec</td><td>AS-62633</td><td></td></tr><tr><td>Infinite 200PRO F</td><td>TeCan Group Ltd.</td><td>30190086</td><td></td></tr><tr><td>Tensiotina</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S3523</td><td></td></tr><tr><td>Tossina T-2</td><td>Cayman Chemical Company Inc</td><td>20433</td><td></td></tr></tbody></table>

valutazione delle risposte delle foglie ai metaboliti secondari microbici utilizzando un formato ad alto rendimento

Evaluating Leaf Responses to Microbial Secondary Metabolites Using A High-Throughput Format

Valutazione delle risposte delle foglie ai metaboliti secondari microbici utilizzando un formato ad alto rendimento

Microbes secrete structurally diverse secondary metabolites during plant infection, some of which are detected by plant cells, which trigger stress ...

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Abbiamo sviluppato un protocollo semplice e riproducibile per l'accesso risposta stomatica di batteri vivi. Questo metodo riduce ferimento e la manipolazione della foglia rispetto all'utilizzo di bucce epidermica riferito in precedenza.

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Fonte: Ali, I., et al. Screening ad alto rendimento di isolati microbici con impatto sulla salute di Caenorhabditis elegans . J. Vis. Esp. (2022)Questo video mostra un saggio fluorescente ad alta produttività per valutare come i batteri intestinali influenzino la resilienza allo stress in Caenorhabditis elegans. Tracciando la fluorescenza blu dei granuli intestinali rotti, il test rivela segnali di morte precedenti nei vermi esposti ai batteri testati.

Test fluorescente ad alta produttività per studiare le interazioni microbio-vermi

La struttura della parete cellulare vegetale e i tratti chimici vengono valutati per identificare le materie prime ideali per i biocarburanti e i biomateriali. I metodi standard presentano limitazioni quando vengono applicati a set di dati di grandi dimensioni. Questi metodi di pretrattamento ad alto rendimento, saccarificazione enzimatica e spettrometria di massa a fascio molecolare di pirolisi confrontano un gran numero di campioni di biomassa con tempi e costi sperimentali ridotti.

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Questo manoscritto descrive come i tassi di metabolismo degli erbicidi possano essere efficacemente quantificati con foglie asportate da un'erbaccia dicotiledone, riducendo così la variabilità e rimuovendo qualsiasi possibile effetto confondente dell'assorbimento o della traslocazione dell'erbicida tipicamente osservato nei saggi su piante intere.

Misurare Tassi di erbicida Metabolismo in Dicot Erbacce con un saggio asportati Foglia

Qui si descrive un protocollo per l'estrazione di metaboliti da Staphylococcus aureus e la loro successiva analisi mediante cromatografia liquida e spettrometria di massa.

Un approccio Tandem HPLC-MS-based per analisi dei metaboliti di<em&gt; Staphylococcus aureus</em

Un sistema idroponico semplice, versatile e a basso costo in vitro è stato ottimizzato con successo, consentendo esperimenti su vasta scala in condizioni sterili. Questo sistema facilita l'applicazione di prodotti chimici in una soluzione e loro efficiente assorbimento dalle radici per studi molecolari, biochimiche e fisiologiche.

Un flessibile a basso costo sistema idroponico per valutare le risposte della pianta a piccole molecole in condizioni sterili

Spettrometria di massa di foglia spray è una tecnica di analisi chimica diretta che riduce al minimo la preparazione del campione ed Elimina cromatografia, consentendo per la rilevazione rapida di piccole molecole da tessuti vegetali.

Spettrometria di massa di foglia Spray: Una tecnica di ionizzazione ambiente rapido per valutare direttamente metaboliti dai tessuti vegetali

Questo protocollo descrive un singolo throughput per complementari tecniche analitiche e omiche che culmina in una caratterizzazione completamente accoppiato di sostanza organica naturale e proteomica microbica in ecosistemi differenti. Questo approccio permette confronti robusti per identificare vie metaboliche e trasformazioni importanti per descrivere la produzione di gas serra e predire le risposte al cambiamento ambientale.

Singolo-velocità effettiva complementari ad alta risoluzione tecniche analitiche per la caratterizzazione di miscele complesse di sostanza organica naturale

I saggi di interazione co-cultura presentati in questo protocollo sono economici, ad alta produttività e semplici. Questi saggi possono essere utilizzati per osservare le interazioni microbiche in co-cultura, identificare i modelli di interazione e caratterizzare il potenziale inibitorio di un ceppo microbico di interesse contro i patogeni umani e ambientali.

Analisi di cocultura ad alta produttività per l'analisi delle interazioni microbiche

Un protocollo di estrazione del genoma guidato dalla spettrometria di massa è stabilito e descritto qui. Si basa sulle informazioni sulla sequenza genomica e sull'analisi LC-MS/MS e mira a facilitare l'identificazione di molecole da complessi estratti microbici e vegetali.

Mass Spectrometry-Guided Genome Mining come strumento per scoprire nuovi prodotti naturali

Il metodo sviluppato della marcatura del 13C6-glucosio combinato con la cromatografia liquida e la spettrometria di massa ad alta risoluzione è versatile e pone le basi per studi futuri sugli organi primari e sui percorsi coinvolti nella sintesi di metaboliti secondari nelle piante medicinali, nonché sull'utilizzo completo di questi metaboliti secondari.

13Marcatura del C6-glucosio associata a LC-MS: identificazione degli organi primari delle piante nella sintesi di metaboliti secondari

Scopri un metodo ad alto rendimento per valutare le risposte delle foglie ai metaboliti secondari microbici. Questo protocollo misura contemporaneamente perdita di ioni, attività perossidasica e produzione di callosio, ottimizzando l'uso di campioni limitati.

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