Name: Traduzione di mRNA in vitro senza cellule nei lisati di Drosophila (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-06-12T15:30:00.000+00:00
Duration: 8 min 33 s
Description: Scopri la traduzione di mRNA in vitro senza cellule nei lisati di Drosophila per studiare la sintesi proteica e il controllo traduzionale. Questo metodo supporta la ricerca in biologia molecolare e biotecnologia.

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	<li>Marygold SJ, Attrill H, Lasko P. The translation factors of Drosophila melanogaster. Fly (Austin). 2017;11(1):65-74.</li>
	<li>Hern&#225;ndez G, Vazquez-Pianzola P. eIF4E as a molecular wildcard in metazoans RNA metabolism. Biol Rev Camb Philos Soc. 2023;98(6):2284-306.</li>
	<li>Kong J, Lasko P. Translational control in cellular and developmental processes. Nat Rev Genet. 2012;13(6):383-94.</li>
	<li>Bayer LV, Milano SN, Bratu DP. The mRNA dynamics underpinning translational control mechanisms of Drosophila melanogaster oogenesis. Biochem Soc Trans. 2024;52(5):2087-99.</li>
	<li>Filipowicz W, et al. A protein binding the methylated 5&#8242;-terminal sequence, m7GpppN, of eukaryotic messenger RNA. Proc Natl Acad Sci U S A. 1976;73(5):1559-63.</li>
	<li>Sondermeijer PJA, Lubsen NH. Heat-shock peptides in Drosophila hydei and their synthesis in vitro. Eur J Biochem. 1978;88(2):331-9.</li>
	<li>Hern&#225;ndez G, Vazquez-Pianzola P, Sierra JM, Rivera-Pomar R. Internal ribosome entry site drives cap-independent translation of reaper and heat shock protein 70 mRNAs in Drosophila embryos. RNA. 2004;10(11):1783-97.</li>
	<li>Zapata JM, Mart&#237;nez MA, Sierra JM. Purification and characterization of eukaryotic polypeptide chain initiation factor 4F from Drosophila melanogaster embryos. J Biol Chem. 1994;269(27):18047-52.</li>
	<li>Maroto FG, Sierra JM. Purification and characterization of mRNA cap-binding protein from Drosophila melanogaster embryos. Mol Cell Biol. 1989;9(5):2181-90.</li>
	<li>Andrews S, Snowflack DR, Clark IE, Gavis ER. Multiple mechanisms collaborate to repress nanos translation in the Drosophila ovary and embryo. RNA. 2011;17(5):967-77.</li>
	<li>Smibert CA, et al. Smaug, a novel and conserved protein, contributes to repression of nanos mRNA translation in vitro. RNA. 1999;5(12):1535-47.</li>
	<li>Gebauer F, et al. Translational control of dosage compensation in Drosophila by Sex-lethal: cooperative silencing via the 5&#8242; and 3&#8242; UTRs of msl-2 mRNA is independent of the poly(A) tail. EMBO J. 1999;18(21):6146-54.</li>
	<li>Pamudurti NR, et al. Translation of circRNAs. Mol Cell. 2017;66(1):9-21.e7.</li>
	<li>V&#225;zquez-Pianzola P, Hern&#225;ndez G, Suter B, Rivera-Pomar R. Different modes of translation for hid, grim and sickle mRNAs in Drosophila. Cell Death Differ. 2007;14(2):286-95.</li>
	<li>Hern&#225;ndez G, et al. Two functionally redundant isoforms of Drosophila eIF4B are involved in cap-dependent translation, cell survival and proliferation. Eur J Biochem. 2004;271(14):2923-36.</li>
	<li>Hern&#225;ndez G, et al. Functional analysis of the AUG initiator codon context reveals novel conserved sequences that disfavor mRNA translation in eukaryotes. Nucleic Acids Res. 2024;52(3):1064-79.</li>
	<li>Tuschl T, et al. Targeted mRNA degradation by double-stranded RNA in vitro. Genes Dev. 1999;13(24):3191-7.</li>
	<li>Scott MP, Storti RV, Pardue ML, Rich A. Cell-free protein synthesis in lysates of Drosophila melanogaster cells. Biochemistry. 1979;18(8):1588-94.</li>
	<li>Clark IE, Wyckoff D, Gavis ER. Synthesis of the posterior determinant Nanos is spatially restricted by a novel cotranslational regulatory mechanism. Curr Biol. 2000;10(20):1311-4.</li>
	<li>Jeske M, et al. Rapid ATP-dependent deadenylation of nanos mRNA in a cell-free system from Drosophila embryos. J Biol Chem. 2006;281(35):25124-33.</li>
	<li>Jeske M, Moritz B, Anders A, Wahle E. Smaug assembles an ATP-dependent stable complex repressing nanos mRNA translation at multiple levels. EMBO J. 2011;30(1):90-103.</li>
	<li>Castagnetti S, Hentze MW, Ephrussi A, Gebauer F. Control of oskar mRNA translation by Bruno in a novel cell-free system from Drosophila ovaries. Development. 2000;127(5):1063-8.</li>
	<li>Gebauer F, Hentze MW. Studying translational control in Drosophila cell-free systems. Methods Enzymol. 2007;429:23-33.</li>
	<li>Hern&#225;ndez G, et al. Mextli is a novel eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein that promotes translation in Drosophila melanogaster. Mol Cell Biol. 2013;33(15):2854-64.</li>
	<li>Lie YS, Macdonald PM. In vitro translation extracts prepared from Drosophila ovaries and embryos. Biochem Biophys Res Commun. 2000;270(2):473-81.</li>
	<li>Peng Y, Gavis ER. The Drosophila hnRNP F/H homolog Glorund recruits dFMRP to inhibit nanos translation elongation. Nucleic Acids Res. 2022;50(12):7067-83.</li>
	<li>Sanders MM, Triemer DF, Olsen AS. Regulation of protein synthesis in heat-shocked Drosophila cells: soluble factors control translation in vitro. J Biol Chem. 1986;261(5):2189-96.</li>
	<li>Storti RV, Scott MP, Rich A, Pardue ML. Translational control of protein synthesis in response to heat shock in Drosophila melanogaster cells. Cell. 1980;22(3):825-34.</li>
	<li>Kr&#252;ger C, Benecke BJ. In vitro translation of Drosophila heat-shock and non-heat-shock mRNAs in heterologous and homologous cell-free systems. Cell. 1981;23(2):595-603.</li>
	<li>Zhao F, Yu CH, Liu Y. Codon usage regulates protein structure and function by affecting translation elongation speed in Drosophila cells. Nucleic Acids Res. 2017;45(14):8484-92.</li>
	<li>Roy G, et al. The Drosophila poly(A) binding protein-interacting protein, dPaip2, is a novel effector of cell growth. Mol Cell Biol. 2004;24(3):1143-54.</li>
	<li>Wakiyama M, Yokoyama S. Posttranscriptional control of protein synthesis in Drosophila S2 cell-free system. Methods Mol Biol. 2014;1118:257-66.</li>
	<li>Spirin AS, Swartz JR. Cell-free protein synthesis systems: historical landmarks, classification, and general methods. In: Spirin AS, Swartz JR, editors. Cell-free protein synthesis. Weinheim: Wiley-VCH; 2008. p. 1-34.</li>
	<li>Gregorio NE, Levine MZ, Oza JP. A user&#8217;s guide to cell-free protein synthesis. Methods Protoc. 2019;2(1):24.</li>
	<li>Hern&#225;ndez G, Altmann M, Lasko P. Origins and evolution of the mechanisms regulating translation initiation in eukaryotes. Trends Biochem Sci. 2010;35(2):63-73.</li>
	<li>Hern&#225;ndez G, Proud C, Preiss T, Parsyan A. On the diversification of the translational apparatus across eukaryotes. Comp Funct Genomics. 2012;2012:256848.</li>
	<li>Lakovaara S. Malt as a culture medium for Drosophila species. Drosoph Inf Serv. 1969;44:128.</li>
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<table><tbody><tr><td>Aluminum foil sheet</td><td>Reynolds</td><td>N/A</td><td>Foglio di alluminio standard per uso domestico; qualsiasi marca commerciale equivalente è accettabile.</td></tr><tr><td>Amino acids mixture</td><td>Promega</td><td>L4461</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Apple cider vinegar</td><td>Heinz</td><td>N/A</td><td>Aceto di mele commerciale (acidità 5%); qualsiasi marca commerciale equivalente è accettabile.</td></tr><tr><td>Apple or grape fruit juice</td><td>Jumex</td><td>N/A</td><td>Succo d'uva commerciale; o qualsiasi marca commerciale equivalente.</td></tr><tr><td>Bacteriological agar</td><td>Merck/Sigma-Aldrich</td><td>9002-18-0</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Boric acid (H3BO3)</td><td>Merck/Sigma-Aldrich</td><td>B6768</td><td>BioReagent, grado Molecular Biology, &ge;99.5%, polvere; utilizzato per la preparazione del tampone TBE.</td></tr><tr><td>Cap: Anti reverse cap (ARCA): 3&acute;-O-Me-m7G(5&acute;)ppp(5&acute;)G RNA cap structure</td><td>BioLabs</td><td>S1411S</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Cap: m7G(5')ppp(5')G RNA cap structure analog</td><td>New England Biolabs</td><td>S1404S</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Cap: Non-functional cap analogue G(5&acute;)ppp(5&acute;)A</td><td>New England Biolabs</td><td>S1406</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Centrifuge Tube (15 mL)</td><td>Corning</td><td>430053</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Complete, EDTA-free protease inhibitor cocktail</td><td>Roche</td><td>11836170001</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Creatine phosphokinase from rabbit muscle</td><td>Merck/Sigma-Aldrich</td><td>C-3755</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Creatine phosphoric acid, disodium salt</td><td>Merck</td><td>1120A47950</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Dehydrated baker&acute;s yeast</td><td>Fleischmann's</td><td>N/A</td><td>Lievito secco attivo commerciale; qualsiasi marca commerciale equivalente è accettabile.</td></tr><tr><td>Diethyl pyrocarbonate</td><td>Merck/Sigma-Aldrich</td><td>D5758</td><td>97%(NNR)</td></tr><tr><td>DNA Clean &amp; Concentrator-5</td><td>Zymo Research</td><td>D4004</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Drosophila melanogaster wild-type strain Oregon-R</td><td>Bloomington Drosophila Stock Center, Indiana, USA</td><td></td><td>https://bdsc.indiana.edu/index.html ; mutant strains of Drosophila melanogaster, as well as wild-type reference strains of other Drosophila species, such as virilis, pseudoscura, grinshawi, hydei, etc. are also provided by this Stock Center.</td></tr><tr><td>Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA)</td><td>Merck/Sigma-Aldrich</td><td>E9884</td><td>ACS reagent, 99.4-100.6%, polvere; utilizzato per la preparazione del tampone TBE.</td></tr><tr><td>HEPES</td><td>Sigma</td><td>SLBH4583V</td><td>99.5%(titration)</td></tr><tr><td>Hydrogen peroxide (H2O2)</td><td>Equate</td><td>N/A</td><td>Perossido di idrogeno commerciale (~2,5-3,5% soluzione di perossido di idrogeno; qualsiasi marca commerciale equivalente è accettabile.</td></tr><tr><td>In vitro transcription mMessage mMachine T7, T3, or SP6 Kit</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>AM1344 and AM1348</td><td>N/A</td></tr><tr><td>KOAc, also termed KCH3COO</td><td>Merck/Sigma-Aldrich</td><td>Several</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Lb broth (lennox)</td><td>Merck/Sigma-Aldrich</td><td>L3022</td><td>1kg</td></tr><tr><td>Luciferase assay system</td><td>Promega</td><td>E1501</td><td>N/A</td></tr><tr><td>MAXIscript T7, T3, or SP6 in vitro transcription Kit</td><td>Invitrogen</td><td>AM1316 and AM1312</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Mg(OAc)2, also termed Mg(CH3COO)2</td><td>Merck/Sigma-Aldrich</td><td>Several</td><td>N/A</td></tr><tr><td>NaCl (sodium chloride)</td><td>J.T Baker</td><td>B17W53</td><td>ACS Reagent</td></tr><tr><td>Oligonucleotides</td><td>Any company</td><td>N/A</td><td>Specifico per sequenza.</td></tr><tr><td>Pasive lysis 5X buffer</td><td>Promega</td><td>E1941</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Pipet Tips</td><td>Axygen</td><td>T-200-Y</td><td>Suggerimenti in giallo da 200 microlitri.</td></tr><tr><td>Pipet Tips</td><td>Axygen</td><td>T-1000-B</td><td>Suggerimenti blu da 1 ml.</td></tr><tr><td>Pipet Tips</td><td>Axygen</td><td>T-300</td><td>Suggerimenti trasparenti da 0,5-10 microlitri.</td></tr><tr><td>Propionic Acid</td><td>Merck/Sigma-Aldrich</td><td>79-09-04</td><td>ACS reagent grade, &ge;99.5%, liquid.</td></tr><tr><td>PYREX&reg; 5 mL Glass Pestle Tissue Grinder</td><td>PYREX&reg;</td><td>7724-5</td><td>N/A</td></tr><tr><td>QIAprep spin plasmid miniprep kit</td><td>Qiagen</td><td>27106</td><td>N/A</td></tr><tr><td>QIAquick gel extraction kit</td><td>Qiagen</td><td>28704</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Rabbit reticulocyte lysate (RRL)</td><td>Promega</td><td>L4960</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Renilla luciferase (RLuc) assay system</td><td>Promega</td><td>E2820</td><td>N/A</td></tr><tr><td>RNasin ribonuclease inhibitor</td><td>Promega</td><td>N2111A</td><td>N/A</td></tr><tr><td>RNeasy minielute RNA clean up kit</td><td>Qiagen</td><td>74204</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Slide-A-Lyzer Dialysis Cassettes</td><td>Thermo Scientific</td><td>87735 (Tuttavia, dipende dal taglio molecolare).</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Sodium hypochlorite (bleach)</td><td>Clorox</td><td>N/A</td><td>Candeggina commerciale (~5-6% NaOCl); qualsiasi marca commerciale equivalente con concentrazione simile è accettabile.</td></tr><tr><td>Spermidine</td><td>Merck</td><td>85558</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Stainless steel sieve</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>Qualsiasi fornitore commerciale.</td></tr><tr><td>Taq plus precision DNA polymerase</td><td>Stratagene</td><td>600211-51</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Transfer ribonucleic acid (tRNA) from bovine liver type XI</td><td>Merck/Sigma-Aldrich</td><td>9014-25-9 or R4752</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Tris (Tris base)</td><td>IBI Scientific</td><td>IB70145</td><td>Molecular biology grade powder; utilizzato per la preparazione del tampone TBE.</td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>Sigma</td><td>SLBX9437</td><td>Laboratory Grade</td></tr><tr><td>UltraPure Agarose</td><td>Invitrogen</td><td>16500500</td><td>N/A</td></tr><tr><td>Unflavored gelatin powder</td><td>Knox</td><td>N/A</td><td>Polvere di gelatina non aromatizzata commerciale; qualsiasi marca commerciale equivalente è accettabile.</td></tr><tr><td>Unrefined cane sugar (piloncillo)</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>Zucchero di can

traduzione di mrna in vitro senza cellule nei lisati di drosophila

Cell-Free In Vitro mRNA Translation In Drosophila Lysates

Traduzione di mRNA in vitro senza cellule nei lisati di Drosophila

Cell-free mRNA in vitro translation has played a crucial role in the understanding of the protein synthesis process during gene expression across ...

La nostra ricerca utilizza un sistema di traduzione acellulare di drosophila per studiare la sintesi proteica e la rivelazione traduzionale in varie fasi dello sviluppo degli insetti. Questo protocollo riproduce con precisione gli eventi di traduzione in vivo specifici dello sviluppo degli insetti, a differenza dei lisati provenienti da metazoani filogeneticamente distanti. Per iniziare, aprire il software di clonazione Benchling.Selezionare un plasmide adatto per inserire il costrutto contenente una regione non tradotta a valle del cinque prime, un cistrone reporter di luciferasi di lucciola o Fluc, una regione non tradotta a valle del tre prime e una coda poliadenilata o coda poli(A) a valle di un promotore T7. Utilizzare il sito di restrizione unico di KPN1 immediatamente a valle della coda poli(A) per linearizzare ciascun costrutto plasmidico prima della trascrizione. Verificare la presenza di picchi netti e ben risolti dei costrutti ottenuti mediante sequenziamento prima di utilizzarli come stampi per la trascrizione in vitro.Separare il DNA linearizzato mediante elettroforesi su gel di agarosio all'1% a 100 volt per un'ora. Estrarre il DNA linearizzato dal gel. Collocarlo in

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Qui si descrive un insieme di montaggio...

Tutta la Monte RNA fluorescente<em&gt; In situ</em&gt; L&#39;ibridazione di<em&gt; Drosophila</em&gt; Embrioni

Descriviamo qui le procedure di estrazione e purificazione di mRNA e metaboliti...

Purificazione di Trascrizioni e metaboliti<em&gt; Drosophila</em&gt; Teste

Lo scopo di questa pubblicazione è quello di visualizzare e discutere le fasi operative di un protocollo Northern Blot avanzata su RNA estratto da Drosophila melanogaster embrioni, cellule e tessuti. Questo protocollo è particolarmente utile per il rilevamento efficiente delle piccole specie di RNA.

Maggiore Northern Blot rilevazione di piccoli RNA specie in Drosophila melanogaster

Il controllo della sintesi proteica avviene principalmente nella fase di inizio della traduzione, le cui carenze sono legate a diversi disturbi. Per comprendere meglio la loro eziologia, abbiamo descritto qui un protocollo che utilizza ovociti di Xenopus laevis per valutare la traduzione del trascritto di mos in presenza di un mutante del fattore di inizio della traduzione eIF4G1.

Xenopus laevis come un modello per individuare Traduzione Impairment

La purificazione dell'affinità ribosomiale traducente (TRAP) è in grado di catturare la traduzione specifica del tipo di cellula dell'mRNA. Qui riportiamo il primo protocollo TRAP dedicato all'isolamento dell'mRNA in rare popolazioni cellulari di embrioni di Drosophila.

TRAP-rc, Translating Ribosome Affinity Purification da popolazioni di cellule rare<em&gt; Drosophila</em&gt; Embrioni

L'obiettivo di questo protocollo è quello di fornire un approccio semplice e poco costoso per la raccolta di embrioni di Drosophila a media scala (0,5-1 g) e la preparazione di estratti proteici che possono essere utilizzati nelle applicazioni proteomiche a valle, come la spettrometria di massa di purificazione-affinità (AP-MS ).

Preparazione su media scala di<em&gt; Drosophila</em&gt; Estratti di embrioni per esperimenti proteomici

È descritta una procedura di isolamento di RNA (viaggio) tandem per il recupero dei complessi in modo endogeno formato mRNA-proteina. In particolare, complessi RNA-proteina sono reticolate in vivo, poliadenilazione RNAs sono isolati dagli estratti con i branelli di oligo e particolare mRNA vengono catturati con oligonucleotidi antisenso RNA modificati. Proteine legate a mRNA vengono rilevati dall'analisi del immunoblot.

Una procedura di isolamento del RNA basati su Oligonucleotide Tandem recuperare mRNA-proteina eucariotica complessi

Qui, presentiamo un protocollo per la visualizzazione, il rilevamento, l'analisi e il monitoraggio del traffico di mRNA endogeno nel vivo Drosophila melanogaster camera d'uovo utilizzando fari molecolari, microscopia confocale del disco rotante, e analisi open-source software.

Visualizzazione e monitoraggio di mRNA endogeni nelle camere uovo di Drosophila melanogaster dal vivo

Questo articolo delinea un protocollo dettagliato per l'utilizzo dell'enzima Cas13D mirato all'RNA (RfxCas13D) nelle mosche.

Targeting dell'RNA ubiquo e tessuto-specifico in Drosophila Melanogaster con CRISPR/CasRx

Questo articolo prende come esempio la transgenesi mediata dall'integrasi phiC31 in Drosophila e presenta un protocollo ottimizzato per la microiniezione di embrioni, un passaggio cruciale per la creazione di mosche transgeniche.

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