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<table><tbody><tr><td>&minus;80 &deg;C freezer</td><td>Eppendorf New Brunswick</td><td>U700</td><td>Conservazione dei campioni biologici prima della preparazione.</td></tr><tr><td>6" vertical bracket for breadboards, 1/4"-20 holes (2 pieces)</td><td>Millipore Sigma</td><td>VB01A</td><td>Supporto meccanico e stabilizzazione dell'assieme personalizzato per il supporto dello spruzzatore</td></tr><tr><td>Acetonitrile</td><td>Fisher Chemical</td><td>240744</td><td>Solvente organico per la preparazione e l'ottimizzazione del solvente compatibile con DESI</td></tr><tr><td>Formato di ammonio</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>401152500</td><td>Preparazione del buffer di lavaggio di formato di ammonio isotonico per il lavaggio delle cellule prima di DESI&ndash;MSI</td></tr><tr><td>Microscopio a campo luminoso</td><td>Fisher Scientific</td><td>12575252</td><td>Imaging ottico e visualizzazione delle cellule aderenti prima dell'acquisizione DESI&ndash;MSI</td></tr><tr><td>Colonna C18</td><td>Waters</td><td>186009259</td><td>Generazione della pressione di ritorno in linea per la formazione stabile dello spruzzo DESI a nano-flusso</td></tr><tr><td>Filo di rame</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>Connessione elettrica e messa a terra durante la fabbricazione del supporto dello spruzzatore</td></tr><tr><td>Spruzzatore DESI XS</td><td>Waters</td><td>700014033</td><td>Fonte di ionizzazione DESI ambiente per esperimenti DESI&ndash;MSI su singola cellula</td></tr><tr><td>Resina epossidica</td><td>Devcon</td><td>20945</td><td>Stabilizzazione meccanica e fissazione dei componenti personalizzati del supporto dello spruzzatore</td></tr><tr><td>Adattatore per alloggiamento sorgente ioni FAIMS Pro</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>98100-20046</td><td>Modifica e fabbricazione dell'interfaccia DESI compatibile con Orbitrap personalizzata</td></tr><tr><td>Acido formico</td><td>Ward&rsquo;s Science</td><td>470301-120</td><td>Modificatore acido per la preparazione del solvente per spruzzo DESI</td></tr><tr><td>Metanolo</td><td>Fisher Chemical</td><td>A456-4 Optima</td><td>Solvente organico per la preparazione del solvente per spruzzo DESI</td></tr><tr><td>Regolatore di gas</td><td>Millipore Sigma</td><td>23831-U</td><td>Regolazione della pressione del gas di rivestimento dell'azoto durante il funzionamento DESI</td></tr><tr><td>Coverslip di vetro grigliato</td><td>Ibidi</td><td>10817</td><td>Substrato per colture cellulari e riferimento di posizione per la registrazione delle immagini da ottica a MS</td></tr><tr><td>Filo di messa a terra</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>Connessione di messa a terra elettrica per lo spruzzatore DESI e l'assieme dell'interfaccia</td></tr><tr><td>Incubatore</td><td>HeraCell</td><td>51026282</td><td>Mantenimento delle colture cellulari di mammiferi in condizioni di temperatura e CO2 controllate</td></tr><tr><td>Acqua di grado LC/MS</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>W6500</td><td>Preparazione del buffer di lavaggio di formato di ammonio e del solvente per spruzzo DESI</td></tr><tr><td>Piattaforma METASPACE</td><td>METASPACE</td><td>https://metaspace2020.eu</td><td>Visualizzazione di immagini MS basata su cloud e analisi dei dati di metabolomica spaziale</td></tr><tr><td>Interfaccia FAIMS modificata</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>98100-20046</td><td>Interfaccia personalizzata per l'accoppiamento dello spruzzatore DESI con gli spettrometri di massa Orbitrap</td></tr><tr><td>Piano XYZ motorizzato</td><td>Newport Corporation</td><td>CONEX-MFACC</td><td>Movimento del piano raster controllato durante l'acquisizione DESI&ndash;MSI</td></tr><tr><td>Kit di rilevamento del micoplasma MycoAlert PLUS</td><td>Lonza</td><td>LT07-703</td><td>Monitoraggio di routine dell'infezione da micoplasma nelle cellule in coltura</td></tr><tr><td>Sistema di cromatografia nano-liquida</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>5200.0355</td><td>Sistema di erogazione del solvente a nano-flusso per la generazione dello spruzzo DESI</td></tr><tr><td>Breadboard ottica</td><td>Thorlabs</td><td>MB1012</td><td>Piattaforma di supporto meccanico per lo spruzzatore DESI e l'assieme dell'interfaccia modificato</td></tr><tr><td>Spettrometro di massa Orbitrap Fusion Lumos</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>UVPD</td><td>Spettrometro di massa Orbitrap ad alta risoluzione per l'acquisizione dei dati DESI&ndash;MSI</td></tr><tr><td>Tubi in PEEK</td><td>IDEX</td><td>1535</td><td>Connessione della linea del solvente tra il sistema nano-LC e lo spruzzatore DESI</td></tr><tr><td>Penicillina&ndash;streptomicina</td><td>Gibco</td><td>15140-122</td><td>Supplemento antibiotico per il terreno di coltura cellulare dei mammiferi</td></tr><tr><td>Soluzione salina tamponata a fosfati (PBS)</td><td>VWR</td><td>0780-50L</td><td>Soluzione di lavaggio per le cellule in coltura durante il passaggio</td></tr><tr><td>Terreno RPMI-1640</td><td>Gibco</td><td>11875093</td><td>Terreno di coltura cellulare dei mammiferi per il mantenimento delle cellule OVCAR-8</td></tr><tr><td>Software di controllo del piano</td><td>Lasken Group</td><td>Versione 6</td><td>Controllo software del raster scan, del movimento del piano e dei parametri di acquisizione delle immagini</td></tr><tr><td>Tubi in acciaio inossidabile</td><td>MicroGroup</td><td>316H16H</td><td>Tubi di trasferimento di ioni personalizzati (1/16" OD, 0,033" ID) per l'integrazione dell'interfaccia Orbitrap</td></tr><tr><td>Siringa, 250 &micro;L</td><td>Hamilton</td><td>1725LTN250UL</td><td>Caricamento del solvente e consegna del solvente a nano-flusso</td></tr><tr><td>Siero fetale bovino sintetico (FBS)</td><td>HyClone</td><td>SH3006603</td><td>Supplemento di siero per la preparazione del terreno di coltura cellulare completo dei mammiferi</td></tr><tr><td>Contatore cellulare automatizzato TC20</td><td>Bio-Rad Laboratories</td><td>1450102EDU</td><td>Conteggio automatizzato delle cellule in coltura prima della semina sui coverslip</td></tr><tr><td>Piatto per coltura tissutale, 100 mm</td><td>Fisher Scientific</td><td>FB012924</td><td>Espansione e mantenimento delle colture cellulari OVCAR-8 aderenti</td></tr><tr><td>Tripsina-EDTA</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>25200-072</td><td>Distacco enzimatico delle cellule aderenti durante il passaggio</td></tr><tr><td>Resina UV-curante</td><td>Prime Dental</td><td>6.03</td><td>Fabbricazione e stabilizzazione dei componenti personalizzati del supporto dello spruzzatore DESI</td></tr><tr><td>Software Xcalibur</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>4.7</td><td>Controllo dell'strumentazione, configurazione del metodo Orbitrap e acquisizione dei dati spettrometrici di massa</td></tr></tbody></table>

imaging con spettrometria di massa a singola cella utilizzando ionizzazione elettrospray da desorbiamento accortata agli spettrometri di massa orbitrap

Single-Cell Mass Spectrometry Imaging Using Desorption Electrospray Ionization Coupled To Orbitrap Mass Spectrometers

Imaging con spettrometria di massa a singola cella utilizzando ionizzazione elettrospray da desorbiamento accortata agli spettrometri di massa Orbitrap

Desorption electrospray ionization&#8211;mass spectrometry imaging (DESI&#8211;MSI) enables ambient, matrix-free molecular imaging with minimal sample ...

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Chimica

Desorbimento elettrospray ionizzazione spettrometria di massa (DESI-MS) è un metodo di ambiente da cui i campioni, tra cui i tessuti biologici, possono essere esposte con preparazione del campione minima. Con rastering il campione al di sotto della sonda di ionizzazione, questa tecnica a spruzzo a base fornisce sufficiente risoluzione spaziale di discernere le caratteristiche molecolari di interesse all'interno di sezioni di tessuto.

Imaging dei tessuti biologici per desorbimento Electrospray ionizzazione Spettrometria di Massa

Linee cellulari di cancro immortalato può essere coltivata come colture cellulari in 3D, un modello importante per la ricerca biologica. Questo protocollo descrive massa spettrometria di imaging di colture cellulari 3D, tra cui il miglioramento della piattaforma di preparazione del campione. L'obiettivo di questo protocollo è quello di istruire gli utenti a preparare colture cellulari in 3D per l'analisi di imaging spettrometria di massa.

Campione strategie di preparazione per la Spettrometria di Massa Imaging di 3D Models Cultura cellulare

Qui, presentiamo i protocolli per eseguire sia l'imaging con spettrometria di massa ambientale (MSI) dei tessuti che l'analisi in situ di MS a singola cellula viva (SCMS) utilizzando la sonda singola, che è un dispositivo multifunzionale miniaturizzato per l'analisi MS.

Applicazioni del singolo-probe: Mass Spectrometry Imaging e analisi singola cella in condizioni ambientali

Una sorgente di imaging per spettrometria di massa (MSI) operata a pressione atmosferica è stata sviluppata accoppiando il desorbimento laser nel medio infrarosso e la post-ionizzazione elettrospray. La matrice di ghiaccio esogena è stata utilizzata come matrice di assorbimento dell'energia per facilitare il desorbimento risonante del materiale correlato ai tessuti. Questo manoscritto fornisce un protocollo passo-passo per l'esecuzione dell'IR-MALDESI MSI di topo neonatale di tutto il corpo.

Tutto il corpo Imaging Mass Spectrometry da Infrared Matrix-Assisted Laser desorbimento per ionizzazione elettrospray (IR-Maldesi)

Proteoma caratterizzazione dei letti microvascolari oculari è fondamentale per la comprensione approfondita di molte patologie oculari in esseri umani. Questo studio dimostra un metodo efficace, rapido e affidabile per estrazione di proteine e preparazione del campione da piccoli vasi sanguigni che impiegano porcine brevi arterie ciliary posteriori come vasi di modello per le analisi di base di spettrometria di massa proteomica.

Preparazione del campione per l'analisi di proteomica massa-spettrometria-basato di microvasi oculari

Una piattaforma di manipolazione cellulare integrata è sviluppata per l'uso in combinazione con una configurazione di spettrometria di massa a singola sonda per l'analisi on-line delle singole cellule delle sospensioni in condizioni ambientali.

Piattaforma di manipolazione cellulare integrata accoppiata con la sonda singola per l'analisi della spettrometria di massa di farmaci e metaboliti in singole cellule di sospensione

Questo articolo introduce metodi di preparazione di esempio per un metodo analitico unico in tempo reale basato sulla spettrometria di massa ambientale. Questo metodo ci permette di eseguire analisi in tempo reale delle molecole biologiche in vivo senza particolari pretrattamenti.

Preparazione del campione per la spettrometria di massa di ionizzazione elettrospray sonda

La spettrometria di mobilità ionica (IMS) è un interessante complemento alla spettrometria di massa per la caratterizzazione delle biomolecole, in particolare perché è sensibile all'isomeria. Questo protocollo descrive un esperimento IMS (IMS/IMS) in tandem, che permette l'isolamento di una molecola e la generazione dei profili di mobilità dei suoi frammenti.

Utilizzo di uno spettrometro ciclico per la mobilità ionica per esperimenti di mobilità ionica tandem

Qui descriviamo una caratterizzazione proteomica basata sulla spettrometria di massa di linee cellulari con destini tissutali noti nell'embrione vertebrato di Xenopus laevis .

Proteomica della spettrometria di massa guidata da livrea cellulare nell'embrione in via di sviluppo (rana)

Questo protocollo delinea l'uso della microMS per la spettrometria di massa MALDI-2 a cellula singola guidata dalla fluorescenza, consentendo una migliore profilazione molecolare delle cellule neuronali primarie di ratto.

Desorbimento/ionizzazione laser assistita da matrice guidata da fluorescenza con spettrometria di massa di postionizzazione indotta da laser di singole cellule neurali di ratto

Questo protocollo mira a preservare i metaboliti cellulari per la spettrometria di massa a singola cellula (SCMS) combinando il lavaggio con soluzione salina volatile, l'estinzione rapida dell'azoto liquido, la liofilizzazione e lo stoccaggio a -8 °C. Dimostra che l'estinzione dell'azoto liquido è essenziale per mantenere i profili dei metaboliti, mentre la conservazione prolungata del freddo dovrebbe essere ridotta al minimo per prevenire alterazioni metaboliche.

Preparazione del campione per la spettrometria di massa a singola cellula Studi di metabolomica: lavaggio, tempra, essiccazione e conservazione combinati delle cellule

University of Oklahoma.  Questo protocollo descrive l'imaging di spettrometria di massa a singola cella delle celle OVCAR-8 utilizzando ionizzazione elettrospray a desorbo accoppiata a spettrometri di massa Orbitrap per analisi metabolomiche ad alta risoluzione spaziale.

Imaging con spettrometria di massa a singola cella utilizzando ionizzazione elettrospray da desorbiamento accortata agli spettrometri di massa Orbitrap

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