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</ol>

<table><tbody><tr><td>Agar</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>01916-500G</td><td>Componente del terreno LB agar; 15 g/L.</td></tr><tr><td>Autoclave</td><td>Lab1st&nbsp;</td><td>SV120H</td><td>Utilizzato per sterilizzare strumenti/materiali o validare il trattamento asettico.</td></tr><tr><td>Kit di estrazione del DNA batterico</td><td>Promocell</td><td>PK-MB708-206-100</td><td>Estrazione del DNA&nbsp;</td></tr><tr><td>Setup per conteggio/registrazione delle colonie</td><td>OCS</td><td>B079Y5W57N</td><td>Necessario per registrare CFU, morfotipi e differenze di piastra; il manoscritto non specifica contatore/modello.</td></tr><tr><td>Flaconi di crioserbatoio</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Z359033</td><td>Implicato per la conservazione di stock in glicerolo a -80 &deg;C; non nominato esplicitamente ma necessario per la fase di conservazione.</td></tr><tr><td>Sistema di registrazione digitale degli isolati</td><td>Non specificato nel manoscritto</td><td>Non applicabile</td><td>Utilizzato per registrare i metadati degli isolati: origine, replica, condizione, trattamento di sterilizzazione, data di isolamento, terreno di piastra, morfologia, stato di identificazione.</td></tr><tr><td>Etanolo</td><td>VWR</td><td>83813440</td><td>Usato per preparare una soluzione di etanolo 70% v/v per la sterilizzazione della superficie dei semi.</td></tr><tr><td>Carta da filtro</td><td>Fisher Scientific</td><td>11718772</td><td>Alternativa opzionale di supporto per la germinazione.</td></tr><tr><td>Forcipi/Pinzette</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>930229</td><td>Usate per trasferire i semi e raccogliere le piantine germinanti.</td></tr><tr><td>Kit di estrazione del DNA genomico</td><td>PromoCell</td><td>PK-MB708-206-100</td><td>Usato per estrarre il DNA genomico da colture batteriche purificate; kit/metodo esatto non specificato.</td></tr><tr><td>Glicerina, sterile 80%</td><td>VWR</td><td>24388364</td><td>Mischiato 1:1 v/v con cultura liquida per la preparazione di stock criogenici.</td></tr><tr><td>Cappuccio di flusso laminare Bio48</td><td>Faster</td><td>LAB-CAP-22</td><td>Necessario per la manipolazione asettica dei semi, trasferimenti di sterilizzazione e preparazione di materiali sterili.</td></tr><tr><td>Terreno LB agar</td><td>VWR</td><td>846495000</td><td>Terreno standard utilizzato per la coltura comparativa; per litro: 10 g di triptone, 5 g di estratto di lievito, 10 g di NaCl, 15 g di agar.</td></tr><tr><td>Tubetti per microcentrifuga</td><td>Ratiolab</td><td>RATI5615000</td><td>Usati per la sterilizzazione dei semi e il trattamento dei campioni.</td></tr><tr><td>Terreno MS</td><td>Sigma</td><td>M0404-10L</td><td>Menzionato come supporto di germinazione sterile per germinazione assenica.</td></tr><tr><td>NZYTaq II 2&times; Master mix</td><td>Nzytech</td><td>MB35803</td><td>Miscela PCR per l'amplificazione</td></tr><tr><td>Parafilm</td><td>Parafilm/Merck</td><td>HS234526A</td><td>Usato per sigillare le piastre di germinazione riducendo la contaminazione.</td></tr><tr><td>Piatti Petri</td><td>Labbox</td><td>PDIP-E9N-500</td><td>Usati per l'allestimento della germinazione, la messa in piastra e la manipolazione dei semi sterilizzati.</td></tr><tr><td>Fitoagar</td><td>Duchefa Biochemie</td><td>9002-18-0</td><td>Menzionato come supporto di germinazione sterile alternativo opzionale.</td></tr><tr><td>Set di pipette e punta</td><td>Merck</td><td>EP3123000918-1EA</td><td>Usate per rimuovere soluzioni di sterilizzazione, lavaggio, diluizione e messa in piastra.</td></tr><tr><td>Terreno R2A agar</td><td>HI-MEDIA</td><td>M1743-500G</td><td>Terreno aggiuntivo opzionale per flussi di lavoro culturomici estesi.</td></tr><tr><td>Cloruro di sodio, NaCl</td><td>Fisher Chemical</td><td>10040460</td><td>Usato per preparare NaCl sterile 0,45% per l'omogeneizzazione e le diluizioni seriali; anche parte del terreno LB.</td></tr><tr><td>Ipoclorito di sodio</td><td>Carlo Erba</td><td>370323</td><td>Usato per preparare una soluzione di ipoclorito di sodio 20% v/v per la sterilizzazione della superficie dei semi. Corrosivo; richiede DPI.</td></tr><tr><td>Pistilli sterili monouso</td><td>Eppendorf</td><td>EP0030120973</td><td>Usati per l'omogeneizzazione di semi secchi e piantine germinanti.</td></tr><tr><td>Miscelatore Vortex</td><td>Fisher Scientific</td><td>15901137</td><td>Usato per risospensione di cellule microbiche dagli omogeneizzati.</td></tr></tbody></table>

isolamento del microbiota associato ai semi di pomodoro tramite germinazione controllata e coltura comparativa

Isolation of Tomato Seed-Associated Microbiota Through Controlled Germination and Comparative Culturing

Isolamento del microbiota associato ai semi di pomodoro tramite germinazione controllata e coltura comparativa

Surface sterilization is a critical yet frequently under-optimized step in studies aiming to isolate seed-associated microorganisms, as excessively harsh ...

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Biologia

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Seedling Flood Assay per lo screening della resistenza batterica nei pomodori

Fonte: Nathoo, N., et al. Un sistema di co-coltivazione idroponica per l'analisi simultanea e sistematica delle interazioni molecolari pianta/microbo e della segnalazione. J. Vis. Exp. (2017).Questo video mostra un sistema di co-coltivazione idroponica per lo studio delle interazioni pianta-batteri in condizioni sterili. Le piantine delle piante vengono trasferite in un terreno di coltura sterile e acido, incubate e ispezionate per verificare la presenza di contaminazioni prima...

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I batteri endofiti colonizzano i tessuti vegetali e ne favoriscono la crescita.Per studiare il loro impatto sulla crescita delle piante di pomodoro sotto stress salino, inizia con piantine sterili che mostrano foglie e radici in via di sviluppo.Immergere le radici della piantina sperimentale in una sospensione di batteri endofitici; Lasciare il controllo non inoculato.Trasferire entrambi i gruppi in terreno sterilizzato per evitare interferenze microbiche esterne e incubare in una camera di...

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Valutazione della colonizzazione radicale delle piantine di pomodoro da parte di un batterio patogeno utilizzando conteggi cellulari vitali

Un metodo semplice per la misurazione e la caratterizzazione di adesione batterica alle piante, in particolare radici e germogli, è descritto in questo articolo.

Aderenza dei batteri per piantare superfici misurate in laboratorio

Qui, presentiamo un metodo versatile per la trasformazione della radice di pomodoro seguito da inoculazione con Ralstonia solanacearum per eseguire un'analisi genetica semplice per lo studio della malattia dell'avvizzimento batterico.

Trasformazione della radice di pomodoro seguita da inoculazione con Ralstonia Solanacearum per un'analisi genetica diretta della malattia batterica di Wilt

Il saggio sull'alluvione delle piantine facilita lo screening rapido delle adesioni di pomodoro selvatico per la resistenza al batterio delle siringhe Pseudomonas. Questo test, utilizzato in combinazione con il test della crescita batterica delle piantine, può aiutare a caratterizzare ulteriormente la resistenza sottostante al batterio e può essere utilizzato per lo screening delle popolazioni di mappatura per determinare la base genetica della resistenza.

Identificazione ad alto contenuto di velocità effettiva della resistenza a Pseudomonas syringae pv. Pomodoro nel pomodoro utilizzando Seedling Flood Assay

Per ottenere un insetto ascianico, la sua superficie dell'uovo viene sterilizzata e la larva tratteggiata viene successivamente allevata usando foglie astronche. Questo metodo fornisce un modo efficiente per la preparazione degli insetti axenici senza somministrare antibiotici o sviluppare una dieta artificiale, che può essere applicata anche ad altri insetti mangiatori di foglie.

Preparazione e allevamento di insetti axenici con piantine coltivate su tessuto per studi di interazione microbiota ospite-intestino dello scarabeo fogliare

Questo protocollo presenta un riepilogo dettagliato delle strategie per inoculare le radici delle piante con microbi trasmessi dal suolo. Esemplificato per i funghi Verticillium longisporum e Verticillium dahliae, vengono descritti tre diversi sistemi di infezione delle radici. Vengono evidenziate le potenziali applicazioni e le possibili analisi a valle e vengono discussi vantaggi o svantaggi per ciascun sistema.

Strategie di inoculazione per infettare le radici delle piante con microrganismi trasmessi dal suolo

Questo protocollo mira a fornire procedure dettagliate per la raccolta, la fissazione e il mantenimento di campioni di piante micoeterotrofiche, applicando diverse tecniche di microscopia come la microscopia elettronica a scansione e trasmissione, la microscopia ottica, confocale e a fluorescenza per studiare la colonizzazione fungina nei tessuti delle piante e nei semi germinati con funghi micorrizici.

Tecniche di microscopia per l'interpretazione della colonizzazione fungina nei tessuti delle piante micoeterotrofiche e della germinazione simbiotica dei semi

Il seme di pomodoro è un modello importante per lo studio della genetica e della biologia dello sviluppo durante la riproduzione delle piante. Questo protocollo è utile per eliminare i semi di pomodoro nelle diverse fasi di sviluppo per osservare la struttura embrionale più fine.

Un protocollo di compensazione efficace per lo studio dello sviluppo delle sementi nel pomodoro (Solanum lycopersicum L.)

iPlantMicro Lab..  Questo protocollo combina la sterilizzazione standardizzata della superficie dei semi con la germinazione controllata per consentire l'isolamento riproducibile del microbiota associato ai semi di pomodoro durante la transizione dal seme alla piantinella. L'approccio favorisce il recupero dei microrganismi coltivabili sottorappresentati nei semi secchi e supporta studi culturali comparativi durante lo sviluppo precoce delle piantine.

Isolamento del microbiota associato ai semi di pomodoro tramite germinazione controllata e coltura comparativa

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