JoVE Core
Molecular Biology
Chapter 1: DNA, Cells, and Evolution
1.5:
生命の樹 - バクテリア、古細菌、真核生物
「生命の樹」は、生命の進化と生物間の進化的関係を表しています。木の根は、地球上のすべての生命の共通の祖先です。他のすべての種は、木の枝のように、この点から放射状に広がっています。生命の樹にあるこれらの枝の多数の先端は、すべての生きている、または現存する種を表しています。絶滅した種は、もはや存在しない種であり、木の中心に向かって見つけることができます。現在、これらの生物は、現存するものも絶滅したものも含めて、細菌、古細菌、真核生物の3つのドメインに整理されています。しかし、これらのドメインと生物の分類との区別は絶えず議論されており、その結果、より多くの情報が明らかになるにつれて変化する「生きた」生命の系統樹が生まれています。
生命の樹の歴史
生命の樹自体は、それに含まれる生物と同じように進化してきました。チャールズ・ダーウィンが1859年に『種の起源について』を出版した直後、エルンスト・ヘッケルは、植物、動物、原生生物という生命の3つの「王国」を提案しました。これらの王国の違いは、完全に容易に観察可能な表現型に基づいていました。
1937年、エドゥアール・チャットンは生命の樹を真核生物と原核生物という2つの巨大な「帝国」に分割しました。簡単に言えば、真核生物は膜結合した核を持っていましたが、原核生物は持っていませんでした。1970年代、Woeseは、古細菌と呼ばれる細菌分類のグループが、細胞壁にペプチドグリカンが存在しない、補酵素の違い、16S rRNA遺伝子配列の違いなど、いくつかの点で細菌と異なることを発見しました。これらの違いはすべて、古細菌が細菌とは別の系統に由来することを示唆しています。
生命の3つの領域
現代の生命の系統樹は、バクテリア、古細菌、真核生物の3つの「枝」で構成されています。ドメイン細菌は、膜結合核を欠く単細胞の原核生物で構成されています。細菌は、球状の球菌から棒状の桿菌まで、さまざまな形をとることができます。このドメインのメンバーは、人体上や人体など、地球上のほぼすべての場所に見られます。
細菌と同様に、古細菌も単細胞の原核生物です。表現型的には、古細菌は細菌と区別するのが非常に困難です。分子レベルでは、古細菌は複製、転写、翻訳の機構の点で真核生物に似ています。しかし、古細菌は代謝とエネルギー変換の点でバクテリアに似ています。古細菌は、沼地、廃水処理施設、海の最深部、熱酸泉など、最も住みにくい生息地でよく見られます。
チャールズ・ダーウィンは、異なる種間の進化的関係を木の枝に例えたことで有名ですが、それらはすべて共通の祖先に由来します。
歴史的に、樹木上の生物の位置は、葉、背骨、目の存在など、観察可能な特性や表現型に基づいて単純に決定されていました。
絶滅した種は、化石記録に保存されている表現型の特徴を使用して、同様の方法で樹木に配置することができます。
ダーウィンが『種の起源について』を出版した直後の1866年、ヘッケルは、植物、動物、原生生物(植物でも動物でもない)の3つの生命の「王国」を、容易に観察できる表現型に基づいて提案した。
最終的に、植物と動物の区別は、以前に提案されていたほど重要ではないことがわかりました。
したがって、1937年に、生命の系統樹は、膜結合した核を持つ真核生物と膜結合していない原核生物という2つの大きな「帝国」を含むように進化しました。
しかし、このパラダイムは、原核生物を木の上に置くことに関しては、いくつかの困難をもたらしました:1つの棒状の微生物は、表現型的に他の微生物と区別するのが困難です。
遺伝子解析、特に16S rRNAシーケンシングの進歩により、伝統的に原核生物として分類されていた生物が遺伝的に異なる進化的起源を持つことが判明したとき、この系統はすぐに崩壊しました。
それで、生命の樹は1990年に再び進化し、原核生物は2つの領域に分けられました-現代の生命の系統樹の3つのドメイン、バクテリア、古細菌、真核生物をもたらしました。
これらのドメインの最初のドメインであるバクテリアは、膜結合核を欠く単細胞の原核生物で構成されています。
次のドメインである古細菌も、そのユニークな進化の歴史によって細菌と区別される単細胞の原核生物で構成されています。
最後に、真核生物は、膜結合した核によって区別される単細胞生物と多細胞生物で構成されています。このドメインには、菌類、植物、動物が含まれます。
生命の進化の系統樹は、実際の樹と同様に「生きた」比喩であり、多くの生物の分類、さらには古細菌と細菌の区別さえも、しばしば論争され、時には変更される。
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