5.12: ヒストン修飾

Histone Modification
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Molecular Biology
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Histone Modification
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02:32 min
November 23, 2020

ヒストンタンパク質は、ヌクレオソームから伸びる柔軟なN末端テールを有する。これらのヒストンテールは、アセチル化、メチル化、リン酸化、ユビキチン化などの翻訳後修飾を受けることがよくあります。これらの修飾の特定の組み合わせは、クロマチンフォールディングと組織特異的な遺伝子発現に影響を与える「ヒストンコード」を形成します。

アセチル化

酵素ヒストンアセチルトランスフェラーゼは、ヒストンにアセチル基を追加します。別の酵素であるヒストン脱アセチル化酵素は、アセチル化ヒストンからアセチル基を除去します。N末端ヒストンテールの4位と9位のリジンアミノ酸は、多くの場合、アセチル化および脱アセチル化されています。アセチル化はヒストンの負電荷を増加させます。これにより、DNAとヒストンの相互作用が弱まり、クロマチンが緩み、DNAへのアクセスが増加します。例えば、赤血球細胞では、β-グロビン遺伝子はアセチル化ヒストンと関連しており、その発現を増加させます。遺伝子が不活性な非赤血球細胞では、非アセチル化ヒストンと関連していることがわかっています。

メチル 化

ヒストンH3のリジン9位にあるヒストンテールは、ヒストンメチルトランスフェラーゼという酵素によってジメチル化またはトリメチル化されます。このメチル化は、非ヒストンタンパク質の結合を開始し、クロマチンの圧縮を増加させる可能性があります。メチル化によりヒストンの正電荷が増加し、負に帯電したDNAとヒストンとの間の親和性が高まり、クロマチンの圧縮が高くなります。抑制されたクロマチンは、ヘテロクロマチンとも呼ばれ、高度にメチル化されています。

ヒストン修飾とその遺伝子発現への影響の要約表

ヒストン修飾 遺伝子発現への影響
アセチル化リジン アクティベーション
低アセチル化リジン 弾圧
リン酸化セリン/スレオニン アクティベーション
メチル化アルギニン アクティベーション
メチル化リジン 弾圧
ユビキチン化リジン 活性化/抑制

ヒストンのコードまたは修飾はエピジェネティックに遺伝するため、これらの修飾は遺伝的にコードされていません。したがって、これらの修飾は、各細胞分裂中にエピジェネティックな記憶として次の細胞に忠実に受け継がれます。

Transcript

ヌクレオソームには、H2A、H2B、H3、H4の4つのヒストンコアタンパク質で構成されるタンパク質コアが含まれています。

これら4つの標準的なコアヒストンに加えて、真核生物はH4を除いて、各ヒストンのいくつかの変種も持っています。

コアスタンダードヒストンとバリアントコアヒストンのアミノ末端テールはヌクレオソームから突出しており、高度に非構造化で可動性があります。

これらの尾部は、約30種類のアミノ酸からなり、リジンのアセチル化、セリンのリン酸化、リジンのモノメチル化、ジメチル化、トリメチル化など、いくつかの形態の共有結合修飾を受けます。

これらの修飾につながる反応は、メチルトランスフェラーゼ、アセチル化酵素、キナーゼなどのさまざまな酵素によって触媒されます。これらの酵素群は、総称して「ライター」と呼ばれます。

これらの化学基の除去を触媒する反応は、脱メチル化酵素、脱アセチル化酵素、ホスファターゼなどの酵素によって触媒されます。これらの酵素は、総称して「消しゴム」と呼ばれます。

さまざまなヒストン変異体とアミノ末端修飾の多数の可能な組み合わせの中で、特定の配位セットのみが発生することが知られています。これらの修飾の組み合わせセットの一部は、細胞の特定のシグナルをコードします。

例えば、1セットの修飾は、DNAの損傷と修復の必要性を示しています。別のものは遺伝子発現をシグナルし、他のものはヘテロクロマチンの確立と拡散のような遺伝子サイレンシングまたはクロマチン修飾をシグナルします。

この符号化方式は「ヒストンコード」と呼ばれます。

これらのタンパク質とマルチタンパク質複合体には、さまざまな小さなドメインが含まれており、それぞれが特定のヒストンマークを認識しています。

それらは、いくつかの異なるヒストンマークを含むクロマチンの領域にしっかりと結合し、触媒活性を持つ追加のタンパク質複合体を引き付けます。これは、クロマチン修飾、遺伝子発現、遺伝子サイレンシングなどの特定の生物学的機能につながります。