JoVE Core
Molecular Biology
Chapter 7: DNA Repair and Recombination
7.2:
ベースエクスキシジョンリペア
一般的なDNA損傷の1つは、アルキル化、酸化、または脱アミノ化による単一塩基の化学的変化です。変更された塩基は、複製中にミスペアやストランドの破損を引き起こします。このタイプの損傷は、DNA二重らせん構造に最小限の変化を引き起こし、塩基切除修復(BER)経路によって修復できます。BERは、損傷した塩基を除去し、相補鎖をテンプレートとして元の塩基配列を復元することにより、損傷したDNA配列を修正します。
BERの最初のステップは、DNAグリコシラーゼによって行われるDNA損傷の認識です。塩基の種類にもよりますが、特定のグリコシラーゼはヌクレオチド塩基とリボースとの間のN-グリコシド結合を切断し、DNAのリン酸骨格はそのまま残りますが、アプリンまたはアピリミジン(AP)部位を作成します。二官能性グリコシラーゼはホスホジエステル鎖を切開し、5’または3’リン酸を形成します。単官能性グリコシラーゼはこの特性を示さず、APエンドヌクレアーゼに依存して糖-リン酸結合を切断し、非塩基性部位に5’を切断し、3’OHおよび5’デオキシリボリン酸を生成します。対応するW-Cペアに基づいて、DNAポリメラーゼは正しい塩基を挿入し、関連するAPリアーゼ活性を使用してデオキシリボースリン酸を除去します。バックボーンのニックはDNAリガーゼによって密封されています。DNAリガーゼIIIとDNAポリメラーゼはどちらも、XRCC1というタンパク質を骨格として利用し、修復部位に結合します。
BER経路のタンパク質の変異は、さまざまな種類のがんを引き起こす可能性があります。例えば、ヒトグリコシラーゼOGG1の変異は、肺がんや膵臓がんのリスク増加と関連しています。
損傷したDNAを修復する最も一般的な方法は、損傷した部分を切り取り、損傷していない相補鎖とライゲートを再コピーするか、ニックを「再シール」することです。この一般的な切り取り、コピー、貼り付けのスキームは、すべてのタイプの切除メカニズムに従います。
塩基切除修復(BER)は、自然発生的に発生する、または環境毒素によって引き起こされる脱アミノ化、酸化、またはアルキル化によって引き起こされる小さな塩基損傷を修復します。
BERでは、DNAグリコシラーゼと呼ばれる約11の異なる酵素のグループが、さまざまな変化した塩基を認識し、それらの除去を触媒します。修飾塩基は、グリカラーゼによって検出される弱い塩基対を作ります。
このような弱い塩基対に遭遇すると、DNAグリコシラーゼは隣接する塩基対をくさびで引き離し、修飾塩基を反転させます。この反転により、酵素は塩基のすべての側面と相互作用して、塩基を正確に識別できます。
DNAグリコシラーゼは、修飾されたDNA塩基とデオキシリボースとの間の結合を切断し、遊離塩基を放出してDNAヘリックスに隙間を残します。このギャップは、APエンドヌクレアーゼ(APE)と呼ばれる酵素によって認識され、ホスホジエステラーゼと呼ばれる別の酵素とともに、ポリヌクレオチド鎖内のホスホジエステル骨格を切断します。
DNAヘリックスの欠落塩基はDNAポリメラーゼβによって充填され、その位置の相補鎖から正しい塩基がコピーされます。次に、DNAリガーゼと呼ばれる酵素が残りのニックをシールして、無傷の修復されたDNA分子を与えます。
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