10.11: コンビナトリアル遺伝子制御

Combinatorial Gene Control
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Molecular Biology
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Combinatorial Gene Control
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02:33 min
November 23, 2020

Overview

コンビナトリアル遺伝子制御とは、複数の転写因子が1つの遺伝子の発現を調節する相乗作用のことです。これらの因子の1つ以上が欠如すると、遺伝子発現または抑制のレベルに大きな違いが生じる可能性があります。

30,000以上の遺伝子の発現は、約2000-3000の転写因子によって制御されています。これが可能なのは、1つの転写因子が複数の調節配列を認識できるからです。遺伝子発現の特異性は、これらのタンパク質がさまざまな組み合わせで互いに働き、さまざまな遺伝子の発現を調節することで発生します。

コンビナトリアル遺伝子制御は、いくつかの異なるメカニズムを通じて行われます。酵母では、3つの異なるメカニズムが説明されています。待機活性化システムでは、遺伝子の発現を調節するために必要なすべての転写因子がDNAに結合し、シグナルを受け取ったときにのみ転写を活性化します。例えば、細胞周期の後期G1期に必要な遺伝子を調節する転写因子は、G1初期に標的遺伝子の制御部位に結合します。しかし、それらはサイクリン-プロテインキナーゼがG1後期に活性化された場合にのみ転写を誘導します。

関節相コンビナトリアルコントロールでは、主に細胞周期の特定の段階に必要な転写因子が細胞周期全体を通じて調節配列に付着したままで、他の段階では遺伝子の調節に協力的に関与します。例えば、SBFとFkh2は、それぞれG1期とG2期で発現する必要がある遺伝子の調節に主に関与する2つの転写因子です。しかし、S期に発現させる必要のある特定の必須遺伝子は、SBFとFkh2の複合作用によっても調節されています。

共同プロセスの組み合わせには、異なる細胞プロセスの調節のために、他の転写因子のさまざまな組み合わせによって支援される単一の転写因子の使用が含まれます。例えば、細胞周期のG1期に必要な遺伝子の発現を調節する転写因子は、異なる調節因子のセットと関連して、交配プロセスに必要な遺伝子の調節にも関与しています。

Transcript

ほとんどの遺伝子の発現は、複数の転写因子によって制御されており、多くの遺伝子はタンパク質の異なる組み合わせを使用してオンまたはオフにされます。この組み合わせ遺伝子制御により、真核生物は転写を正確に制御することができます。

遺伝子コンビナトリアル制御は、遺伝子が転写されるかどうか、およびその転写効率を制御できる。遺伝子Xの転写に影響を与える3つの転写因子A、B、Cについて考えてみます。

Aが存在しない場合、遺伝子Xは転写されません。Cが存在しない場合、遺伝子Xは転写されません。また、Bがないと転写効率が低下します。したがって、遺伝子Xの高レベルの転写には、3つの調節因子すべての組み合わせが必要です。

転写調節因子は、複数の遺伝子の調節に関与することができます。AはBおよびCとともに遺伝子Xの転写を引き起こしますが、Aと別の転写因子Dは、別の遺伝子Yの転写を刺激することができます。これにより、いくつかの転写因子が多数の遺伝子を調節することができます。

転写因子は異なるファミリーに分類され、同じファミリーの他のタンパク質または異なるファミリーのタンパク質と相乗的に機能することができます。

POUファミリーに属する転写因子は、ハウスキーピングから細胞分化に至るまで、さまざまな機能を持つ遺伝子を調節しますが、このファミリーにはタンパク質が非常に少なく、ヒトにはわずか15

個あります。

その多様な機能を果たす能力は、異なるファミリーの他の転写因子との調整にかかっています。

コンビナトリアル遺伝子制御は、分化した細胞のin vitroリプログラミングに必要です。転写因子Oct-4、Sox-2、Klf-4、およびc-Mycの体細胞での発現は、幹細胞への変換を引き起こす可能性があります。

リプログラミングは、最初の3つのタンパク質のいずれにも存在しない場合は起こらず、c-Mycが存在しないと、リプログラミングの効率が低下します。4つの因子すべての組み合わせ制御は、人工多能性幹細胞の形成に必要です。

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