JoVE Core
Molecular Biology
Chapter 13: Genomes and Evolution
13.7:
エクソン組換え
新しい遺伝子の進化は、種分化にとって重要です。エクソン組換えは、エクソンシャッフルまたはドメインシャッフルとも呼ばれ、新しい遺伝子形成の重要な手段です。脊椎動物、無脊椎動物、およびジャガイモやヒマワリなどの一部の植物で観察されます。エクソン組換えでは、同じ遺伝子または異なる遺伝子のエクソンが再結合して新しいエクソン-イントロンの組み合わせを生成し、それが新しい遺伝子に進化する可能性があります。
エクソンシャッフルは「スプライスフレームルール」に従います。各エクソンには3つの読み取りフレームがあります。入ってくるエクソンは、3つの読み取りフレームのいずれかで再結合して結合し、フレームシフト変異を引き起こす可能性があります。したがって、すべての組換えイベントが役立つわけではありません。中には、早期の終止コドンや未熟なタンパク質をもたらすことさえあります。
遺伝子の重複と分岐に加えて、エクソンシャッフルはいくつかのヒト特異的遺伝子の進化に起因しています。例えば、約2500万年前、初期の霊長類では、MCH(メラニン濃縮ホルモン)という遺伝子が後転置換によってエクソン組換えを受けました。それはde novoイントロン-エクソン境界を作成し、それが後にヒト科特異的保存遺伝子PMCHL1に進化しました-これは偽遺伝子ですが、アンチセンスRNAはヒトの脳で発現しています。元のMCH遺伝子は、げっ歯類のエネルギー必要量と体重のバランスに関与する神経ペプチドをコードしているため、PMCHL-1も同様の機能を持つと期待されています。
イグレタリー組換え(IR)は、エクソン組換えまたはエクソンシャッフルの最も一般的に観察されるメカニズムの1つです。IRはエクソンの重複につながります。これは、デュシェンヌ型筋ジストロフィーやベッカー型筋ジストロフィー、家族性高コレステロール血症、レッシュ・ナイハン症候群、血友病、リポタンパク質リパーゼ欠損症など、いくつかのヒト疾患で観察されています。
真核生物の遺伝子は、エクソンと呼ばれるタンパク質コード配列とイントロンと呼ばれる非コード配列の交互のブロックで構成されています。
エクソン組換えとは、同じ遺伝子または異なる遺伝子のエクソンが組み換えて、新しいエクソン-イントロン配列の組み合わせを生み出し、それが新しい遺伝子に進化するプロセスです。
エクソン組換えは、非相同組換えまたはレトロ転位によって媒介され得る。
非相同または非違法な組換えの際には、配列の類似性がないDNA鎖が組み換えられ、新しい遺伝子構造が生成されることがあります。
慢性肉芽腫性疾患 – 免疫系の遺伝性疾患が良い例です。この疾患の多くの患者は、酵素NADPHオキシダーゼをコードするphox遺伝子にまれな変異を持っています。
野生型NADPHオキシダーゼは、感染時にスーパーオキシドなどの活性酸素種を産生し、感染性病原体の食細胞を介した殺傷を助けます。
まれに、phox遺伝子のエクソン8とエクソン11の間の非相同配列が組み換えられ、エクソン9とエクソン10の重複を引き起こす。これにより、酵素NADPHオキシダーゼの活性が低下します。障害のある酵素は、細菌感染を取り除くのに十分な活性酸素種を生成できず、肉芽腫またはマクロファージと関連する免疫細胞の凝集を引き起こします。
レトロトランスポジションによるエクソン組換えは、アフリカのショウジョウバエにおけるJingwei遺伝子の進化を最もよく説明できます。
約250万年前、Adh mRNAの一部がDNAに逆転写され、Ynd遺伝子のエクソンと再結合して、Jingweiと呼ばれる新しい遺伝子が生まれました。
Ynd遺伝子はショウジョウバエの精巣の発達に関与しており、Adh遺伝子はアルコールデヒドロゲナーゼをコードしています。新しい遺伝子Jingweiは、Yndに由来するドメインとAdhに由来するドメインの2つのドメインを持つタンパク質をコードしています。
したがって、タンパク質Jingweiはショウジョウバエの精巣で発現し、ホルモンとフェロモンの生合成に関与しています。
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