3.16
酵素は、さまざまな物理的および化学的メカニズムを使用して反応を触媒し、活性化エネルギーを低下させます。
これらのメカニズムは、酵素と基質を適切に配置し、遷移状態を安定化し、結合の形成または切断を助けることにより、反応速度を増加させる可能性があります。
ほとんどの酵素は、基質に結合するときに誘導フィットを採用します。このコンフォメーションの変化により、アミノ酸の相対的な位置が変化し、基質との相互作用が増加します。
複数の基質との反応では、酵素はしばしば分子を遷移状態に似せて配置し、その形質転換を助けます。
多くの酵素は、触媒作用のために金属イオンを必要とします。金属イオンは、基板上に反対に帯電した基を引き付け、反応のためにそれらを配向させます。イオンは、反応中間体の電荷を安定させるために、酸化状態を変化させることもできます。
一部の酵素では、アミノ酸がプロトンを受け入れたり、プロトンを提供したりして、pHを局所的に変化させたり、基質と直接反応させたりします。これにより、結合を強化または弱め、反応速度を高めることができます。
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