JoVE Core
Cell Biology
Chapter 3: Energy and Catalysis
3.14:
ターンオーバー数と触媒効率
酵素のターンオーバー数は、単位時間あたりに変換できる基質分子の最大数です。ほとんどの酵素の代謝回転数は、1秒あたり1〜1000分子の範囲です。カタラーゼは、毎秒最大2.8×106分子の過酸化水素を水と酸素に変換することができる、既知の最高の回転数を持っています。リゾチームは、知られているターンオーバー数が最も低く、1秒あたり半分子です。
キモトリプシンは、消化中にタンパク質を分解する膵臓酵素です。キモトリプシンの回転数は毎秒100分子です。この反応が触媒なしで起こると、ペプチド結合が中性pHの水中で切断されるまでに数百年かかります。したがって、キモトリプシンの高いターンオーバー数は、腸内のタンパク質の迅速な消化に役立ちます。
酵素リブロース1,5-ビスリン酸カルボキシラーゼオキシゲナーゼまたはRuBisCOは、毎秒3分子のCO2を固定する回転数が非常に低く、最も遅い酵素の1つです。しかし、自然界にRuBisCOが豊富にあるため、離職率の低さが補われています。RuBisCOは、葉に含まれる全タンパク質の約50%を占めています。
ターンオーバー数が多い酵素は、必ずしも高効率であるとは限りません。酵素の触媒効率は、ターンオーバー数kcatと親和性K Mの比によって与えられます。言い換えれば、酵素は効率的であるために、基質に対しても低いKMを持つ必要があります。ほとんどの酵素の平均触媒効率は約105 M-1 s-1であり、これは中程度の効率であることを意味します。触媒効率が10、8-10、9、M-1、s-1の間の酵素で、超効率的または触媒的に完璧な酵素はほとんどありません。
ターンオーバー数またはkcatは、酵素が基質分子を製品に変換できる速度を示します。
KCatは、酵素活性部位ごとに所定の時間内に形質転換できる基質分子の最大数に等しくなります。
さまざまな酵素の代謝回転数は、1 つの基質分子未満から 1 秒あたり数百万分子までさまざまです。
kcatを計算するには、酵素触媒反応の最大速度またはVmaxを総酵素濃度で割る。
触媒速度であるkcatと基質に対する親和性であるKMは、酵素の触媒効率、つまり酵素が特定の生化学反応をどれだけ効果的に加速するかに影響を与えます。
特定の基質の触媒効率を測定する方法の1つは、kcatとKMの比率です。
kキャットが高い酵素は基質の形質転換を迅速に触媒し、KMが低い酵素は基質に強く結合します。したがって、比率が大きい酵素はより効率的です。
複数の基質に結合する酵素は、kcat と KM の比率が最も高い基質に対して最も触媒的に効率的です。
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