現代の分子系統分類学

現代の分子分類学は、多相アプローチに従っています。このレッスンでは、細菌を同定および分類するために組み合わせて使用されるいくつかの方法に焦点を当てます。

保存された遺伝子配列解析では、recA やgyrBなどの高度に保存された遺伝子の配列を使用して、密接に関連する細菌種を区別します。

マルチローカスシークエンスタイピング(MLST)では、多くの関連種または系統のいくつかのハウスキーピング遺伝子の約450の塩基対フラグメントがシーケンシングされ、解析されます。

MLSTは、 E. coli K-12やO157:H7などの密接に関連する株間の鑑別を可能にします。1塩基の違いでも効率的に検出できます。

ゲノムフィンガープリント法は、遺伝子または全ゲノムのDNA断片を使用して、種の系統間の多型を評価します。

リボタイピング法は、リボソームRNA遺伝子パターンの解析に使用されるゲノムフィンガープリント法であり、種や菌株の迅速な同定を可能にし、食品、水、飲料の微生物解析に役立ちます。

近年のDNAシーケンシングの進歩により、複数の遺伝子や全ゲノムを用いて、正確な細菌の同定と分類学が可能になりました。