微生物ゲノムの進化

微生物ゲノムは遺伝子の増減を通じて時間とともに変化します。

種内では、複数の系統がコアゲノムと呼ばれる共通の遺伝子セットを一貫して受け継ぎます。

例えば、細菌種Xは解析株全体で共有する約5つのコア遺伝子ファミリーを持つと推定されています。

また、一部の株は水平遺伝子移動を通じて追加の遺伝子を得ることもあります。

種Xのパンゲノムは、研究された株全体に存在するコア遺伝子ファミリーの全セットと、多くの株にまたがる追加の遺伝子によって形成されます。

一部の種では、新しい遺伝子セットが得られるにつれてパンゲノムが継続的に拡大します。

これらの獲得遺伝子は中性的または有害であり、微生物ゲノムでよく見られる遺伝子欠失を引き起こす一方で、自然選択は有益な遺伝子を保持します。

つまり、基本的な生存のためのすべての遺伝子は、種のコアゲノムの一部です。