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微生物生態学は、微生物の多様性と、さまざまな生態系内で微生物がどのように相互作用するかを研究する学問です。
生態系とは、微生物が生物的要因と非生物的要因の両方と相互作用する機能的単位です。
これらの生態系では、葉や根、土壌などの生息地に多くの微生物が宿っています。同じ種の微生物が集団を形成します。
異なる個体群が共存し、生息地で相互作用すると、微生物群集が形成されます。
生態系内のすべての微生物がマイクロバイオータを構成し、その遺伝物質の総集合体はマイクロバイオームと呼ばれます。
群集内の微生物多様性は種の豊富さや相対的な個体数によって測定され、これらは栄養素の利用可能性や温度、pH、酸素レベルなどの環境条件に影響されます。
例えば、栄養豊富な土壌は種の多様性が高く、多くの微生物が適度な個体数で共存しています。
一方、酸性で鉄分を多く含む極端な生態系は、種の豊富さは低いものの、 Acidithiobacillus ferrooxidansのような特殊な微生物の豊富度を支持します。
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