Methods to Assess Microbial Populations

微生物集団とは、同じ種が同じ環境に存在する集団のことです。さまざまな方法で評価されます。

培養ベースの方法であるバイアブルプレートカウントは、希釈されたサンプルを一層の可視的な植株にプレートすることで生細胞を推定します。

最も確率の高い数法では、段階的に希釈されたサンプルを複製体として接種します。次に、成長を示すチューブの数を用いてサンプル中の微生物密度を推定します。

生化学的検査は酵素産生などの形質を追跡することで微生物活動を評価し、個体群と生態学的役割を結びつけます。

例えば、セルラーゼ産生微生物は森林の主要な分解者として機能している可能性が高いです。

フルオレッセンス ・イン・シチュ ・ハイブリダイゼーションは、特定の微生物に特有のrRNA配列に結合する蛍光プローブを使用します。

これにより、微生物分類群の顕微鏡的同定と定量が可能になります。

フローサイトメトリーは、微生物をレーザービームに一つずつ通して分析します。

細胞サイズ、複雑性、生存可能性などの形質を評価し、複雑な群集内での高スループット定量化やサブポップ評価を可能にします。