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方法論記事

自由に歩くハエの追跡:ショウジョウバエの移動を評価する方法

2.4K 閲覧数

2023年4月30日

この記事について

要約

出典:Sun, M. and Chen, L. L. ショウジョウバエの慢性外傷性脳症をモデル化する新しい方法J. Vis. Exp.(2017年)。

このビデオでは、自由に歩くハエを追跡して一般的な移動能力を評価する方法を説明しています。注目のプロトコルは、ビデオ追跡ソフトウェアを使用したアッセイのセットアップとデータ解析を示しています。

プロトコル

このプロトコルは、Sun and Chen, A Novel Method to Model Chronic Traumatic Encephalopathy in Drosophila, J. Vis. Exp. (2017)からの抜粋です。

1. ビデオアシストによる動きの追跡

  1. 直径6cmのシャーレに透明なシリコンエラストマーを充填して、トラッキングアリーナを作ります。シリコンと皿の蓋の間に3mmのスペースを空けて、ハエが自由に歩くことができますが、飛ばないようにします。
  2. 毎回、偽のグループまたは治療されたグループのいずれかから4匹のハエを麻酔し、アリーナに配置します。フライを22°Cで1時間放置します。
  3. 電荷結合素子(CCD)カメラをアリーナの上に設置し、5分間録画します。
  4. 記録された動きの軌跡をCtraxソフトウェア(カリフォルニア工科大学から無料入手可能)を使用して分析します。追跡データをプログラミング言語(Matlabなど)互換の形式でエクスポートし、フレームあたりの移動距離に基づいてデータを分析します。各ハエの平均歩行距離を計算し、それを他のすべての記録されたハエ/グループと組み合わせて、同じグループ内のファイルの母集団が移動した平均累積距離を取得します。

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材料

この記事で使用された材料の一覧
名前会社カタログ番号コメント
60mmシャーレフィッシャーサイエンティフィックFB0875713Aトラッキングアリーナとして使用
フローレギュレータージェネシー・サイエンティフィック59-122WC
ファインブラシジェネシー・サイエンティフィック59〜204
フライパッドジェネシー・サイエンティフィック59〜114
Sylgardシリコーンエラストマーダウコーニング4019862
CCDカメラマイクロソフトHD-5000
Ctraxウォーキングフライトラッカーカリフォルニア工科大学Ctrax 0.2.11
MATLAB 画像処理ツールボックスMATLABR2015bの

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