1. 細菌および宿主細胞の調製
- 12mmまたは14mmのガラスカバースリップを、それぞれ24ウェルまたは12ウェルプレートに無菌ピンセットで転送し、実験条件ごとに1つのウェル数をカウントします。これらは組織培養フードで紫外線(UV)処理で15分間滅菌します。
注: 細菌チャレンジおよび外因性ストレスによる応力顆粒(SG)誘導のための対照井戸を含める。 - 24ウェルプレートに12 mmのカバースリップがある場合は、カバースリップに1×105 個の哺乳類細胞(例: HeLa細胞)をシードします。カバースリップを滅菌ピペットの先端で押し下げます。細胞は37°Cで、各細胞タイプに適した培地で5%CO2 組織培養インキュベーターで一晩接着します。
注: 翌日に細胞の合流率が40〜60%になるようにプレートを塗ります。- HeLa細胞の場合は、非必須アミノ酸(NEAA)および10%脱補質胎児乳牛血清(FCS)を含んだDulbeccoの修飾Eagle培地(DMEM)でインキュベートします。FCSを脱補相化するために、56°Cの水浴で30分間加熱し、15分後に1回巻きます。
- 細菌をストライク状に取り除きたい場合は、滅菌ピペットの先端を使って、-80°Cの冷凍庫に保存された細菌グリセロールストック(20%グリセロール)から少量を除去し、ラベル付きのプレートに置きます。滅菌ループを使って、細菌をプレートの約10%に広げます。新しい滅菌ループを使い、塗布に通して3本の平行線(半皿分)を作ります。これらの線を通って、プレートの残りを覆うように。37°CでO/Nプレートを培養します。
- 新たにストリークしたプレートから単一の細菌コロニー(例:シゲラ・フレクスネリ)を選びます。1週間以上の細菌群落は避けてください。
- S. flexneri株M90Tでは、新たにストリークしたトリプティック大豆寒天-0.1%コンゴ赤寒天プレートから赤いコロニーを15mLチューブ内の8mLのトリプティック大豆ブロスに接種します。蓋をしっかり閉め、222rpmのO/N、30°Cで振動させて培養します。注意:大きな白色コロニーは病原性プラスミドを失い、感染性がないため使用しないでください。
2. 宿主細胞の細菌的挑戦
- 感染の可能性を最大化するために細菌を準備しましょう。
- S. flexneriの場合、8mLのトリプティック大豆寒天に150μLのO/N培養を加え、222rpm、37°Cで振動させて後期指数関数的段階(~2時間)まで培養し、病原性遺伝子発現を誘導し感染を促進します。
- 培養液の光学密度が0.6から0.9(600 nmで測定)になった場合、1 mLの培養液を1.5 mLのチューブに移します。ペレット菌を8,000 x gで2分間、感染培地(DMEMとNEAAでFCSなし)に再懸浮させ、OD600 = 1で投与します。したがって、OD600 が0.85であれば、850μLで再懸濁します。
注: S. flexneriの場合、OD600 = 1の場合、8 mL培地で培養すると1 mLあたり8 x 108菌が存在します。感染の多重率(MOI)は20が適切です。他の病原体については、OD600における1mLあたりの細菌数と適切なMOIを経験的に決定する必要があります。
- 細菌と宿主の相互作用を促進するために、ポリL-リジン(PLL)で細菌をコーティングします。
注: S. flexneriのPLL治療はSG動態に影響を与えませんでした。他の病原体については、PLL治療への適応度を評価する必要があります。- PLLで細菌をコーティングするには、1 mLの細菌培養液を8,000 x gで2分間遠心分離し、その後、ペレットをリン酸塩緩衝生食塩水(PBS)で10 μg/mL PLLで外径600 =1で再懸濁します。
- 細菌溶液を12ウェルプレート内のウェルなどの小さな皿に加え、RT(~20°C)で10分間、皿シェーカーで優しく攪拌しながら培養します。
- 8,000 x gで2分間ペレット菌を投与し、余分なPLLを取り除きます。ペレットを1 mL PBSに再懸浮させ、この洗浄工程を2回繰り返します。最終洗浄後、OD600 = 1で感染培地に再懸濁します。
注: ここで、 S. flexneri の感染培地は、FCSなしの20 mM N-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-N'-(2-エタンスルホン酸)(HEPES)を用いた宿主細胞培地です。
- 細胞を細菌の挑戦に備えましょう。
- 哺乳類のHeLa細胞から培地を吸引ポンプで除去します。500μLのRT HeLa細胞培地を加えて細胞を洗浄し、攪拌し、吸引ポンプで培地を除去し、500μLの室温(RT)に適した感染培地(例:FCSなしの20 mM HEPESを含む宿主細胞培地)に置き換えます。
- 注: すべての洗浄工程では、素早く作業し、一度に最大4枚のカバースリップまで処理して、細胞の乾燥を防ぎましょう。
- チャレンジは、HeLa細胞に細菌を用いて細胞の20〜50%に感染させました。
注: 各細菌種ごとに適切な時期とMOIを決定する必要があります。一般的に、37°Cで30分、MOIは10です。- S. flexneriの場合は、2つの方法のいずれか(ステップ2.3.1.1または2.3.1.2)でHeLa細胞に挑戦してください。
- 非PLL処理細菌(20μLのOD600 =1/ウェル、500μL培地)を細胞に13000×gで10分間スピンします。
- PLLコーティングされた細菌(OD600 15μL=24ウェルプレート1/ウェル、500μL培地)をRTで15分間追加し、細菌が細胞に定着できるようにします。
- 定着した細菌がいる細胞を37°Cの組織培養インキュベーターに30分間置き、感染を待つ。
注: 短時間の場合は、組織培養インキュベーターではなく37°Cの水浴にプレートを置き、15分間S . flexneri 感染を同期させます。
- 細胞を洗浄して感染を止めましょう。
- 細胞を洗浄し余分な細菌を除去するには、吸引ポンプで培地を取り出し、新鮮に予温された37°CのHeLa培養培地(DMEM、10% FCS、NEAA)を1mL追加します。ミディウムをくるくると回し、取り除いて新しいメディウムに替えます。これを2回繰り返し、細胞に新しい培地を残します。
- S. flexneriや他の細胞内細菌の場合、HeLa細胞と洗浄液の感染後、培地を50 μg/mLのゲンタマイシンを含む標準的な組織培養培地に置き換え、細胞外細菌を殺菌し、さらなる細胞侵入を防ぎます。
注: 細胞外細菌のために培地に抗生物質を加えないでください。
- 細菌と細胞を組織培養インキュベーターで望む時間だけ培養します。
注:S. flexneriの場合、感染は細胞の種類によって最大6時間かかることがあります。HeLa細胞の場合、感染を1.5〜2時間進めてから外因性ストレスを加えてSG形成を誘導します。カコ2感染の場合、シゲラが細胞間に広がる場合は、30分から6時間感染した後、外因性ストレスを加えます。この時点で細胞は外因性ストレスを加えずに固定され、細菌感染によるSG形成を評価することができます。
3. 応力顆粒形成の固定および免疫蛍光解析
注: 制御と実験カバースリップを同時に処理し、染色の違いが後の画像解析に影響を与えることを防ぎます。対照サンプルには、SG誘導治療の有無感染およびなしの感染サンプルと、SG誘導治療の有無にかかわらず感染したサンプルが含まれています。
- 吸着ポンプで培地を完全に除去し、PBS中に0.5mLのRT 4%パラホルムアルデヒド(PFA)を加えてサンプルを固定します。RTで30分間孵化します。
注意: PFAはハンドラーや環境に有害です。ハンドラーを適切に保護し、化学廃棄物を処分しましょう。
注: あるいは、15分間固定した後、-20°Cの予冷メタノールに10分間置き換えて、SGマーカーの細胞質局在を保持する方法もあります。 - PFAをピペットで除去し、適切な廃棄容器に処分してください。カバースリップは1 mLのトリスバッファー生理食塩水(TBS:25 mM Tris、pH 7.3;15 mM 塩化ナトリウム、NaCl)で洗浄します。洗う際に皿のシェイカーで優しく振ってカバースリップを2分間孵化させます。