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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
この記事では、流体力学的流れに基づいて粒子の閉じ込めのためのマイクロ流体ベースの手法を提案する。我々はそれによって統合されたマイクロデバイスの任意の粒子の閉じ込めとマイクロマニピュレーションを可能にする、フィードバック制御のメカニズムを使用して流体よどみ点での安定した粒子のトラッピングを示しています。
無料のソリューションで単一の粒子を閉じ込めると、操作する機能は、基本と応用科学のための鍵となる技術です。 、光磁気、電学、および音響技術に基づいて粒子捕獲のための方法は、分子から細胞レベルまでの物理学と生物学の大きな進歩につながっている。この記事では、我々は、単に流体力学流体の流れに基づいて、粒子の捕捉と操作のための新しいマイクロベースのテクニックを紹介します。この方法を使用して、我々は、長い時間スケールのための水溶液中でマイクロナノスケールの粒子の捕集を示しています。流体力学的トラップは、それによって流体よどみ点(ゼロ速度の点)と平面伸張流動を発生させる、二つの相反層流の流れが収束クロススロットのチャネル形状で統合されたマイクロ流体デバイスで構成されています。この装置では、粒子は流体のよどみ点での粒子の位置を維持するために流れ場のアクティブ制御によるトラップの中心に限定されています。このように、粒子が効果的にカスタムビルドのLabVIEWコードで実装されたフィードバック制御のアルゴリズムを使用して自由溶液中で閉じ込められている。制御アルゴリズムは、粒子追跡、粒子重心位置の決定、および圧力レギュレータを使用してオンチップの空気弁にかかる圧力を調節することによって流体の流れのアクティブな調整が続いてマイクロ流体デバイスにおける粒子、のための画像取得で構成されています。この方法では、オンチップの動的計量バルブ機能は、それによってよどみ点の位置と粒子のトラッピングの細かいスケールの制御を可能にする、コンセントのチャネルで相対的な流量を調節する。マイクロ流体ベースの流体力学のトラップは、粒子捕獲のための方法としていくつかの利点を示す。流体力学的トラップは、トラップされたオブジェクトの物理的または化学的特性上の特定の要件なしに、任意のパーティクルが可能です。さらに、流体力学的なトラッピングは、代替の力場ベースのトラッピング方法を使用して困難である濃縮若しくは混雑した粒子の懸濁液中の"単一の"ターゲットオブジェクト、の閉じ込めが可能になります。流体力学的トラップは、実装する簡単なユーザーフレンドリーであり、粒子のトラッピングと長い時間分析を容易にするために、既存のマイクロ流体デバイスに追加されることがあります。全体的に、流体力学的トラップは、表面固定化することなく閉じ込め、マイクロマニピュレーション、および粒子の観察のための新しいプラットフォームであり、小さな粒子の自由ソリューションのトラップで潜在的に摂動的、光学的、磁気的、電気フィールドが不要になります。
流体力学的トラップは、二層ハイブリッド(ポリジメチルシロキサン(PDMS)/ガラス)粒子閉じ込めのためのマイクロ流体デバイスで構成されています。 1-2は、マイクロ流体デバイスの作製を記述し、ステップ3-4デバイスの設計と操作について議論繰り返します。
1。 SU - 8モールド作製(ビデオには示されていません)
2。マイクロ流体デバイスの作製
手順3〜4上記のマイクロ流体デバイスを用いた流体力学的トラップの実装について説明します。
3。流体力学的トラップの実験セットアップ
4。流体力学的トラップの手順
LabVIEWコード:フィードバックコントローラの使用上の注意
自動化された粒子のトラッピングは、カスタムLabVIEWコードを使用して実装線形フィードバック制御のアルゴリズムを使用して実現されます。 LabVIEWコードは、CCDカメラから画像をキャプチャし、積極的に、オンチップの動的空気弁の位置(部分的にオープン/クローズ状態)を調節する圧力調整器、に電位(電圧)を送信する。一つの出口ラインの弁のような位置の変化、流体流量Isはそれによってよどみ点を再配置すると流体力学的トラップを有効に、調整。フィードバックループの各ステップは順次であり、反復的に画像のキャプチャ(10-60 Hz)の速度で実行されます。 LabVIEWコードは、各フィードバックループのサイクルの間に次の手順を実行します。
経過1)時間、2)から粒子の重心(x、y)は捕捉粒子の位置、3)トラップの中心の位置、4)距離:LabVIEWのコードは、トラップ粒子中に取り込まれた各画像については、次のデータが記録さトラップセンター、5)圧力は、オンチップバルブに適用される。さらに、コードでもAVIファイル形式での捕捉粒子の映画を記録します。
5。代表的な結果
我々は、流体力学的トラップを使用して、様々なサイズ(100、540、830nmの、及び2.2μmの直径)の蛍光ポリスチレンビーズを捕捉。図1(a)はマイクロ流体デバイスでのクロススロットの接合部にトラップされた粒子の像を示しています。捕捉粒子の軌道がトラッピングイベント中または記録されたムービーファイルから捕捉粒子を追跡し、ローカライズすることでLabVIEWのコードで記録された重心位置のデータから直接決定することができる。図1(b)出口チャネル方向に沿って捕捉粒子(2.2μmの蛍光ポリスチレンビーズ)の軌跡を示しています。ビーズは、当初は3分間(四角)にトラップされ、その後、出口チャンネル(円)の1つに沿ってトラップし、エスケープから放出される。圧縮流れの軸(入口チャネル方向、データは示していない)に沿って粒子軌道は、図1(b)に示すように伸長流の軸(流出の方向)に沿って粒子軌道に似ています。コンセントのチャネル方向に沿って閉じ込められたビーズ(2.2μmの直径)のためのトラップの中心から粒子の変位のヒストグラムを図1(c)に示されています。この作業で説明されているフィードバック制御のアルゴリズムを使用して、捕捉された粒子は入口と出口のチャネルの方向に沿ってトラップの中心の± 1μm以内に制限されます。
流体力学的トラップのために使用されるマイクロ流体デバイスの概略図を図2に示されています。統合されたマイクロ流体デバイスは、流体層と制御層から構成されており、この資料に記載したように標準的な多層ソフトリソグラフィを用いて製造されています。流体層はバッファとサンプルのチャネルだけでなく、流体力学的捕捉を容易にするクロススロットのチャネルのジオメトリが含まれています。制御層は流体層の出口チャンネルのいずれかの上に位置する空圧バルブで構成され、そして制御と流体層が薄いエラストマー膜によって分離される。デバイスの動作中に、制御層のバルブは、それによって出口チャネルに収縮を誘発する、流体層に薄い膜を強制的に窒素ガスを、加圧しています。ダイナミック空気弁は、出口のチャネルで相対的な流量を調整し、よどみ点の微細構造制御を可能にする制御層、にかかる圧力を変更することにより、変数の金額で出口チャネルを収縮。

図1:粒子捕獲。流体力学的トラップに閉じ込められた単一のビーズの()イメージ。トラップの中心にビーズに加えて、いくつかのトラップしていないビーズがトラッピング領域で示されています。コンセントのチャンネル(正方形)に沿って捕捉粒子の(b)の軌跡。粒子がトラップ(矢印)から解放されるとき、それは出口のチャンネル(丸)の一つに沿ってエスケープします。(C)出口チャネルに沿ってトラップの中心からのトラップされたビーズ(2.2μmの直径)の変位のヒストグラム。

図2:流体力学的トラップのためのマイクロ流体デバイスの模式図は、流体力学的なトラップは2層マイクロ流体デバイスを使用して構築されます。流体層は、サンプル入口で構成され、F私たちのバッファーインレット、二廃棄物のアウトレット。制御層は流体層の出口チャンネルのいずれかの上に位置する空気膜のバルブで構成されています。反対の出口チャネルの狭窄は、空気弁のオフセット圧力を提供します。典型的なチャネル寸法は、100から500ミクロンの範囲です。地域では()、サンプル入口は2つのバッファの入口でフォーカスの流れです。地域では(B)、反対側の入口ストリームは、トラップが発生するクロススロットの接合部に収束する。空気弁(C)は、コンセントのチャネルのいずれかの上に配置されている。よどみ点の位置は、このバルブに圧力を調節することによって変調される。
この記事では、流体力学的流れに基づいて粒子の閉じ込めのためのマイクロ流体ベースの手法を提案する。我々はそれによって統合されたマイクロデバイスの任意の粒子の閉じ込めとマイクロマニピュレーションを可能にする、フィードバック制御のメカニズムを使用して流体よどみ点での安定した粒子のトラッピングを示しています。
我々は有用な議論のためのイリノイ大学アーバナシャンペーン校でKenisグループを感謝し、寛大にクリーンルーム施設の使用を提供する。
この作品は、グラント第4R00HG004183 - 03(チャールズM.シュレーダーとMelikhan Tanyeri)の下、独立PIの賞にNIHの経路によって賄われていた。
この作品は、エリックM.ジョンソン- Chavarriaに大学院研究フェローシップを通じて、全米科学財団によってサポートされていました。
| 21ゲージ鈍い針 | Zephyrtronics | ZT-5-021-1-L | PDMS 3 mlプラスチックシリンジのポート穴を打ち抜くため |
| BD Biosciences | 309585 | オイルSiウェーハでバルブを充填するため | |
| 大学ウェーハ | 3”P(100) 片面ポリッシュ 380 μm 試験グレード | ||
| カバーガラス | VWR 国際 | 48404-428 | 24 x 40 mm #1.5 |
| DAQ カード | National Instruments | PCI 6229 | |
| 蛍光ビーズ | Spherotech, Inc. | FP-2056-2 | 2.2 μm Nile red |
| Fluorinert | 3M | FC 40 | フッ素系キャリアオイル |
| 倒立顕微鏡 | オリンパス株式会社 | IX-71 | |
| LabVIEW | National Instruments | Version 9.0f3 (32bit) | |
| 実体顕微鏡 | Leica Microsystems | MZ6 | PDMS制御層を流体層に整列させるため。 |
| 機械式対流式オーブン | VWR 国際 | 1300U | 2 層のモノリシック PDMS スラブを作成するためのベーキング装置用。 |
| マイクロ流体チューブとコネクタ | Upchurch Scientific | 1/16 x .020 PFA チューブとスーパーフランジレス継手 | |
| PDMS | GE Healthcare | RTV 615 A&B | |
| プラズマチャンバー | ハリック・サイエンティフィック・プロダクツ社 | PDC-001 | |
| 圧力変換器 | プロポーションエア | DQPV1 | |
| スピンコーター | スペシャルティコーティングシステム | G3P-8 スピンコート | |
| フォトレジスト | MicroChem Corp. | SU 8 2050 | |
| シリンジ ポンプ | ハーバード 装置 | PHD 2000 プログラマブル | |
| 端子台 | ナショナルインスツルメンツ | BNC 2110 | 圧力調整器へのアナログ出力と読み出し用。 |
| UVコリメート光源・露光装置 | OAI | モデル30 強化光源 |