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方法論記事

イメージング質量分析のための卵巣がんコミュニケーションのモデリング:転移性卵巣腫瘍の発生における低分子化学コミュニケーターを同定する方法

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2023年4月30日

この記事について

要約

出典: Zink, K. E. et al. Capturing Small Molecule Communication Between Tissues and Cells Using Imaging Mass Spectrometry. J. Vis. Exp. (2019)

このプロトコルは、卵巣外植片を卵管がん細胞と共培養することによるサンプル調製の技術について説明しています。これらのサンプルは、イメージング質量分析法(IMS)を使用して視覚化され、腫瘍の発生につながる細胞と組織間の小分子交換を検出します。

プロトコル

動物が関わるすべての手続きは、地元の施設動物管理委員会とJoVE獣医審査委員会によって審査されています。

1. 共培養のためのITO処理スライドのセットアップとインキュベート

  1. 分割されていない共培養
    1. ホットプレート上でアガロースを70°Cで液化します。
    2. 8ウェルディバイダーを、インジウムチノキシド(ITO)処理スライドの上に置きます(図1A)。仕切りのゴム底はスライドへの接着を助けますが、アガロースめっき中は、ウェル間の漏れや混合を防ぐために、連続して穏やかな下向きの圧力を加えるようにしてください。
    3. 15 mLのコニカルチューブで細胞を採取し、遠心分離(800 rpmで5分間)し、1x DMEM培地で150 μLあたり50 k細胞に再懸濁します。異なる細胞密度が最適である場合は、このステップで細胞懸濁液が目的の最終密度の2倍であることを確認してください(たとえば、300 μL中に50,000個の細胞を最終濃度にすると、このステップでの細胞密度は150 μL中に50,000個の細胞になります)。
    4. 細胞培養をプレーティングする前に、ウェルの中央に卵巣外植片を添加します(図1B)。
    5. プレーティングの直前に、個々の2 mLチューブで各細胞培養にアガロースを添加します。各ウェルについて、200 μLの細胞懸濁液と200 μLの液化アガロースを2 mLチューブに入れます。例えば、4つのウェルの場合、800 μLの細胞懸濁液と800 μLの2%アガロースを組み合わせます。多少の混合物が残りますが、必要以上に多めに作ることで、ピペッティング中の気泡を防ぐことができます。
      1. その細胞培養物をプレーティングする直前に、個々の細胞培養物にアガロースを添加します。アガロースは1分以内に冷えるので、すぐに盛り付ける準備をしてください。
    6. 直ちに300 μLの細胞/アガロース混合物を各ウェルに加えます(図1C)。図1Cは、3つの細胞条件と1つの培地条件を示しており、それぞれが卵巣の有無にかかわらずプレーティングされています。
    7. スライドを37°Cおよび5%CO₂で加湿インキュベーターでインキュベートします。
  2. 分断された共文化
    1. 薄くて滑らかなプラスチックから仕切りを切ります(図2A).
      手記:この実験では、平らで薄いため、滅菌済みの使い捨て培地洗面器の側面を使用します。井戸の斜辺にぴったりと収まるように幅を広く切ります (~13 mm)。
    2. ホットプレート上でアガロースを70°Cで液化します。
    3. 8ウェルディバイダーをITO処理したスライドの上に置きます(図2B)。仕切りのゴム底はスライドへの接着を助けますが、アガロースめっき中は、ウェル間の漏れや混合を防ぐために、連続して穏やかな下向きの圧力を加えるようにしてください。

2.スライドの乾燥とMALDI-TOF MSの準備

  1. 4日後(または任意の時点)後、アガロースプラグとスライドからチャンバーディバイダーを取り外します(図1D)。平らなヘラでアガロースの側面をチャンバーからそっと取り外し、アガロースのプラグを動かさないように注意しながら、チャンバーをゆっくりと上に引っ張ります。それらが動く場合は、互いに触れ合わないようにゆっくりと位置を変えます。
  2. スライドを37°Cのオーブンに約4時間置き、1時間ごとに90°回転させます
    手記: スライドの回転は、サンプル全体に均一な熱分布を確保するために重要です。
  3. 乾いたら、スライドをオーブンから取り出します(図1E)。
  4. 噴霧器(図1F)を使用して、温度= 30°C、流速= 0.2 mL / min、パス回数= 8、方向= CC、ノズル距離= 40 mm.
    でマトリックス溶液を塗布します。 手記:マトリックス噴霧器の代わりに、芸術的なエアブラシを使用して液体マトリックスを塗布できます。同じマトリックス溶液を使用してスプレーすることもできますが、約2倍の溶液が必要です。スライドを垂直に吊るすようにクランプした状態で、マトリックス層が見えるまで、約1フィート離れた90°の角度からスライドにスプレーします。
  5. 1 μL のキャリブラント (ターゲット<500 Daの場合はリンレッド)、ターゲット<5,000 Daの場合はペプチド混合物(材料表を参照)を添加して、スライド上のスポットを空けます。Phosphorus Redはマトリックスとの混合を必要としませんが、ペプチド混合物はイオン化を助けるためにマトリックスと1:1の混合物を必要とします。キャリブラントが乾くのを待ちます。
  6. スライドの各角に油性マーカーを使用してXを描き、カメラまたはスキャナーを使用して1,200dpiの光学画像を撮影します。

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結果

figure-results-1
図1:未分割共培養のサンプル調製のワークフロー。 (A)ITOコーティングされたスライドの導電面に8ウェルチャンバーを接着します。(B)共培養条件のために、半分にした卵巣を井戸の中央に置きます。(C)300μLのアガロース/細胞懸濁液をウェルに直接加えます。気泡がないこと、および卵巣がウェルの中央に残っていることを確認してください。ピペッティングしたアガロースが卵巣を乱した場合は、アガロースが冷える前にピペットの先端をそっと使用して卵巣を中央に配置します。(D)4日間のインキュベーション後(または最適化された時間)、8ウェルチャンバーをスライドから取り出します。アガロースがチャンバーに付着したままの場合は、へらを使用してアガロース...

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開示事項

利益相反は宣言されていません。

材料

この記事で使用された材料の一覧
名前会社カタログ番号コメント
デンビルC1017-O細胞を収集するには
ミリポアPEZGS0816Millipore Millicell
から再利用 EZスライドチャンバースライド
シグマ・アルドリッチ34998から4L溶射マトリックス用溶媒
エッペンドルフ5810 Rセルを収集して削除するには
上澄み
ブルカー・ダルトニック8201344乾燥したスライドにマトリックスをスプレー
ブルカー・ダルトニック8201346乾燥したスライドにマトリックスをスプレー
ギブコ11995年065月アガロース混合培地
ジェネシー・サイエンティフィック22から282アガロースアリコート用
ブルカー8237001共培養インキュベーションのためのプラットフォーム
シグマ・アルドリッチA9414-10Gのめっき用培地と混合
コーニング4870プラスチック仕切りの切断に使用されます
分割されたチャンバー
ブルカー・ダルトニック8206195中質量範囲用キャリブラント
シグマ・アルドリッチ343-242-5G低質量範囲用キャリブラント
シムガ・アルドリッチE2758細胞培養培地サプリメント
ペプロテック株式会社100から15細胞培養培地サプリメント
セルグロ30-005-CR細胞培養培地サプリメント
シグマ・アルドリッチ11074547001細胞培養培地サプリメント
ギブコ〒25030-081細胞培養培地サプリメント
ギブコ15140-122細胞培養培地サプリメント
フィッシャーテクノロジーズA116-50マトリックスソリューションに追加されました
HTXテクノロジーマトリクスの適用用
名 の

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低分子交換共培養法卵管細胞卵巣組織外植片アガロース包埋MALDI-TOF分析マトリックス塗布空間分解能