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1. Mtb感染単球由来細胞のフローサイトメトリー染色
>注:次の手順はBSL-3施設で実行する必要があります。フローサイトメトリー染色は、チューブの代わりに96ウェルプレートで行うことができます。
- 結核菌、Mtb感染細胞(および非感染コントロール)を6ウェルプレートのウェルから剥離し、ウェルあたり1 mLのFACSバッファーと37°Cおよび5%CO2で少なくとも30分間インキュベートします。
- 細胞が剥がれていることを確認するために、数回ゆっくりとピペットで上下させます。可能であれば、顕微鏡で細胞の剥離を確認してください。各ウェルから細胞懸濁液をスクリューキャップ付き微量遠心チューブに移し、チューブを200 x gで5分間回転させます。ピペッティングで上清を慎重に捨てます。
- 各チューブ内の細胞ペレットをFACSバッファーで2回洗浄し、細胞を200 x gで5分間遠心します。
- TLR2 (AF647)、CD206 (APC-Cy7)、CD163 (BV605)、CD80 (BV650)、CCR7 (BV711)、CD86 (BV786)、CD200R (PE)、CD64 (PE-Dazzle 594)、HLA-DR (PE-Cy5) (表 1) を含む蛍光色素結合抗ヒト抗体の約 50 μL カクテルで、細胞 (約 0.5 x 10 6 細胞/チューブ) を、生存率色素 Zombie-UV と組み合わせて、暗所で 4 °C (冷蔵庫) で 30 分間染色します。
- 染色した細胞を400μLのFACSバッファーで2回洗浄し、細胞を200 x gで5分間遠心します。
- 染色した細胞を200 μLの固定緩衝液(調製済み)で暗所RTで30分間固定し、マイコバクテリアが完全に不活性化されるようにします。
- 細胞を400μLのFACSバッファーで2回洗浄し、200 x gで5分間遠心して、余分な固定バッファーを除去します。
- 固定細胞を400 μLのFACSバッファーに再懸濁し、サンプルを新しい1 mL微量遠心チューブに移してから、BSL-3ラボから取り出してBSL-2のフローサイトメトリーに取り出します。染色した細胞をサンプル取得まで+4°Cで保存してください.
手記: BSL-3実験室から取り出す前に、チューブに70%エタノールをスプレーします。ホルムアルデヒドは毒性(発がん性)であり、クラスIIのバイオセーフティキャビネットで取り扱う必要があります。ホルムアルデヒド廃棄物は別の化学廃棄物に捨てます。
>2. Mtb感染単球由来細胞のフローサイトメトリーデータ取得と解析
>注:ステップ2.1〜2.2は、上記のフローサイトメトリー染色の前に実行する必要があります。細胞凝集や細胞固定後のタンデム色素の解離の問題を回避するため、一次抗体染色後4〜10時間以内に、Mtb感染細胞と非感染細胞の両方のサンプル取得を行います。
- 上記のフローサイトメトリー染色の前に、染色パネル(表1)にリストされている各蛍光色素標識抗体の蛍光シグナルを、コンペンセーションビーズ(ポジティブとネガティブの両方)を使用してコンペンセーションします。
- ヒトマクロファージの染色のために抗体希釈液を滴定し、各蛍光色素に最適なシグナルを得ます。
- 未染色の細胞を使用して、ネガティブな細胞集団のゲートを設定するために必要なバックグラウンド蛍光のレベルを決定し、染色された細胞を可視化することができます(マクロファージは高い自己蛍光性を持っています)。
- フローサイトメーターで最低50,000細胞/サンプルを、データ取得に推奨されるソフトウェアを使用して取得します。
- フローサイトメーターから取得ファイルをフローサイトメトリー標準(FCS)形式3.1でエクスポートします。
- フローサイトメトリー解析ソフトウェアでFCSファイルを解析します。
- マクロファージは、その前方散乱および側方散乱(FSCおよびSSC)特性に従ってゲートし、Zombie-UV生存率色素を用いた生細胞/死細胞ゲーティングにより死細胞を除外します。
- H37Rv-GFPに感染したマクロファージをFITCチャネルで可視化します。
- 陽性染色した細胞の頻度と、すべてのマーカーの幾何平均蛍光強度(MFI)を特定します(表1)。
>表1:フローサイトメトリーに使用される抗体のリスト。
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| レーザー | フィルター | 蛍光色素 | 表現型 | 機能 | クローン | カタログ番号 | 会社 |
| 639 | 670/30 | AF647 | TLR2 | 病原体認識受容体 | TL2.1 | 309714 | バイオレジェンド |
| 639 | 780/60 | APC-Cy7 | CD206 | マンノース受容体 | 15-2 | 321120 | バイオレジェンド |
| 405 | 610/20 | BV605 | CD163 | スカベンジャー受容体 | GHI/61 | 333616 | バイオレジェンド |
| 405 | 670/30 | BV650 | CD80 | 共刺激分子 | 10日間2日 | 305227 | バイオレジェンド |
| 405 | 710/50 | BV711 | CCR7 | ケモカイン受容体 | G043H7 | 353228 | バイオレジェンド |
| 405 | 780/60 | BV785 | CD86 | 共刺激分子 | IT2.2 | 305442 | バイオレジェンド |
| 488 | 530/30 | GFPの | MTBの | 細胞内細菌 | | | |
| 561 | 586/15 | PE | CD200Rの | 抑制性受容体 | OX-108 | 329306 | バイオレジェンド |
| 561 | 14分の620 | PE /ダズル594 | CD64 | IgGのFcガンマ受容体-I | 10.1 | 305032 | バイオレジェンド |
| 561 | 661/20 | PE-Cy5 (PC5) | HLA-DR | MHCクラスII分子 | L243 | 307608 | バイオレジェンド |
| 355 | 450/50 | BUV395 | 生存率染料 | 生/死細胞マーカー | ゾンビUV | 423108 | インビトゲン |