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サンプル採取を含むすべての手順は、研究所のIRBガイドラインに従って実行されています。
>注:このプロトコルは、新鮮または凍結された分離された末梢血細胞および全血でテストされています。
1. 細胞染色
>注:スペクトルのオーバーラップがほとんどない蛍光色素のペアを選択することは、他の蛍光色素検出器での蛍光色素の高波及によるデータの拡散を減らすために重要です。すべての細胞サブセットを最適に同定するには、抗体ペアPE-BV421やPE-APCなど、量子収率の高い蛍光色素を使用する必要があります。
- 生鮮および冷凍PBMCの染色
- 100 μL の PBMC (1 x 106 セル) を 96 ウェル V 底プレートに移します><。
手記: 1 x 106 未満の任意の数のセルを使用しても、同様の結果が得られます。
- 350 x gでRTで3分間遠心分離し、細胞ペレットを乱さずに上清を慎重に吸引します。各ウェルに、タンパク質上の遊離アミンと10分間反応して死細胞を標識する生/死固定色素を含むリン酸緩衝生理食塩水(PBS)を100 μL加えます。
- すべての抗体(蛍光色素A中の抗CD3.-CD56、TCRγδ、蛍光色素B中の抗CD4、CD8、CD19、CD14)を含む混合物を各サンプル30μL調製します。抗体の濃度を表1および表2に示します。この段階では、異なる標的分子および異なる蛍光色素に対する滴定抗体も添加できます(例:表3).
手記: 抗体の濃度は、メーカーやロット番号によって異なります。したがって、最適な信号を得るために予備テストを行う必要があります。PBS、PBS/0.5%ウシ血清アルブミン(BSA)、PBS/0.2%アジ化ナトリウム、またはPBS/0.5%BSA/0.1%アジ化ナトリウムを使用し、抗体を希釈するために同様の結果を得た。また、細胞を30 μLとは異なる容量で染色することもでき、この方法論を既存の染色プロトコルに容易に統合できます。
- 350 x gでRTで3分間遠心分離し、細胞ペレットを乱さずに上清を慎重に吸引します。抗体カクテルを各ウェルに加え、気泡が発生しないように慎重に再懸濁します。暗闇の中でRTで30分間インキュベートします.
手記: サンプルを4°Cで染色すると、同様の結果が得られます。
- 150 μLの染色バッファーを添加し、350 x gで室温で3分間遠心分離し、細胞ペレットを乱さずに上清を慎重に吸引します。細胞を200 μLのPBSに再懸濁し、フローサイトメーターでデータを取得します。染色量を変更する場合は、余分な抗体の洗浄に使用した元の抗体ミックスの少なくとも20倍に希釈してください.
手記: 染色した細胞は、PBS/2%パラホルムアルデヒド内に固定し、4°Cの冷蔵庫で一晩保存した後、翌日フローサイトメーターで取得することができます
注意: パラホルムアルデヒドは、飲み込むと有害であり、皮膚の炎症を引き起こす可能性があります
2. 抗体滴定
>注:抗体滴定は、高品質で再現性のあるデータを取得するための最も重要なステップです。抗CD3、-CD8、-CD14、-CD19、および-TCR γδの滴定は、陽性ピークと陰性ピークを最適に分離する抗体の濃度を最大染色指数によって導き出す標準的な手順に従います。染色指数曲線の立ち上がり側のピークまたはピークに近い希釈液を選択する必要があります(図 1A-C)。抗CD4抗体は、CD4陽性集団のピークをCD3単一陽性集団とCD3+/CD8+ T細胞との間に配置し、CD3単一陽性シグナルに近づけるように滴定して、CD8dim集団(CD8+ γδ T細胞およびNK T細胞)をよりよく識別します。同様に、CD56滴定は、NK CD56+細胞をCD3+とCD3-集団の間に位置付けることを目的としています。
- 最大染色指数曲線
注:抗CD3、-CD8、-CD14、-CD19、および-TCR γδの滴定は、陽性ピークと陰性ピークを最適に分離する抗体の濃度を最大染色指数曲線によって導き出す標準的な手順に従います。他のマーカーに対する抗体をパネルに添加する場合は、それらも最大染色指数曲線で滴定する必要があります。
- 96ウェルプレートの10ウェルに40 μLの染色バッファーを充填して、2倍抗体希釈液を調製します。最初のウェルで、最終容量を80 μLの染色バッファーに増やし、目的の抗体をメーカーが推奨する濃度の4倍の濃度で添加します。
- よく混合し、40 μLを2番目のウェルに移します。よく混ぜて、他のすべてのウェルに対してこの手順を繰り返します。
- PBMCまたは全血の10サンプルを、前述のプロトコルに従って、10種類の2倍希釈抗体のうち30μLで染色します。
- フローサイトメーターでデータを取得し、各希釈液からのシグナルをプロットします(図1A)。
- 各抗体濃度の陰性集団と陽性集団をゲートします。抗体の濃度を上げると、バックグラウンドが高くなる可能性があります。したがって、それに応じてネガティブゲートのサイズを変更します。
- 各抗体濃度について、ネガティブ集団の蛍光強度の中央値と標準偏差、および陽性集団の蛍光強度の中央値に関する情報を抽出します。各抗体濃度について、(陽性集団の蛍光強度中央値 - 陰性集団の蛍光強度中央値)÷(陰性集団の蛍光強度の標準偏差の2倍)(図1B)で染色指数を計算します。
- 抗体希釈分の割合で表される抗体濃度に対する染色指数と抗体濃度をプロットし(例:1:10希釈 = 0.1)、最大染色指数値で抗体の濃度を特定します(図1C)。
- 抗CD4および-CD56抗体滴定
注:抗CD4および-CD56抗体の滴定は、2-蛍光色素パネルの他のマーカーの以前の滴定に依存します。抗CD4抗体の場合、滴定は、ダブルCD8+/CD3+シグナルとCD3シングルポジティブポピュレーションの間に抗CD4シグナルを配置することを目的としています(図1D)。
- 前述したように、抗CD4抗体とCD56抗体を2倍希釈法で滴定し、その間に追加の濃度を追加して、CD4+ T細胞とNK細胞を他の細胞集団から分離できる濃度範囲を細かく特定します。
- ダブルCD8+/CD3+シグナルとCD3シングルポジティブ集団の間に抗CD4シグナルを配置して、抗CD4抗体を滴定します(図1D)
手記:CD4+ T細胞をCD8+ Dim集団から明確に分離するためには、特別な注意を払う必要があります。
- 抗CD4抗体の滴定と同様の戦略に従って、CD3陰性集団とCD3陽性集団の間にNK細胞を配置することにより、抗CD56抗体を滴定します。
>3. ゲーティング戦略
- リンパ球細胞集団と単球細胞集団を同定し、死んだ細胞と残存する赤血球の大部分を分析から除去します。
- リンパ球と単球を含む全集団を、前方散乱角と側方散乱光角(FSC-A対SSC-A)に基づいて選択します。前方散乱高さと前方散乱幅(FSC-H対FSC-W)および側面散乱高さと側面散乱幅(SSC-H対SSC-W)を使用して、セル凝集体を解析から除去します。
- 生死識別マーカーを使用して、明るい陽性の死細胞と残存赤血球を分析から除外します。異なるFSC-AおよびSSC-Aプロファイルに基づくリンパ球および単球のゲート。
- リンパ球集団の2-蛍光色素7マーカーゲーティング戦略.
手記:CD3陽性サブグループ内では、CD4、CD8+、およびγδT細胞は、CD4、CD8、およびγδ受容体のみを標的とする抗体を使用して分離できます。同様に、CD3陰性サブグループ内では、CD19、CD56、およびCD14に対する抗体を用いて、B細胞、NK細胞、および単球をそれぞれ一意に同定することができる。
- リンパ球ゲートを選択し、このプロトコルで使用される2つの蛍光色素のうちの1つを各軸に持つドットプロットを作成します(図2B)。
- ドットプロットの右上隅にあるCD3+/CD8+ダブルポジティブ細胞として同定されたCD8+ T細胞のゲート。NKT細胞を含む可能性のある薄暗いCD8集団を除外します。CD8+ T細胞とCD3単一陽性集団の間の集団として同定されたCD4+ T細胞のゲート。γδ T細胞のゲートオンは、高CD3細胞として同定されました。γδT細胞をCD8陽性細胞とCD8陰性細胞で再分割します。
- CD3陽性細胞とCD3陰性細胞の間の集団として同定されたNK細胞上のゲート。NK細胞をCD8陽性とCD8陰性で再分割します。ドットプロットの右下隅にあるCD3陰性CD19+集団として同定されたB細胞のゲート。
- 単球ゲートを選択し、このプロトコルで使用される2つの蛍光色素のうちの1つを各軸に示したドットプロットを作成します(図2C)。CD3-/CD14+集団のゲート。
>表1:PBMCの2フルオロクロム免疫細胞染色(BV421-PE併用)に使用した抗体パネル。
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| ターゲット | クローン | 蛍光色素 | 売り手 | 濃度 | 目的 |
| CD3 | UCHT1 | BV421 | BDの | 1月20日 | 血筋 |
| CD56 | NCAM16.2 | BV421 | BDの | 1/900 | |
| TCRγδ | B1 | BV421 | バイオ | 1月30日 | |
| CD4 | RPA-T4 | PE | BDの | 1/450 | |
| CD8 | RPA-T8 | PE | BDの | 1月20日 | |
| CD14 | M5E2 | PE | BDの | 1月15日 | |
| CD19 | HIB19 | PE | BDの | 1/300 | |
| 死んだ細胞 | | L/Dブルー | LT(リトリー | 1/300 | 生死差別 |
| BD = BD Biosciences, Bio = BioLegend, LT = Life Technologies |
>表2:PBMCの2フルオロクロム免疫細胞染色(APC-PE併用)に使用した抗体パネル。
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| ターゲット | クローン | 蛍光色素 | 売り手 | 濃度 | 目的 |
| CD3 | UCHT1 | APCの | BDの | 1月20日 | 血筋 |
| CD56 | NCAM16.2 | APCの | BDの | 1月60 | |
| TCRγδ | B1 | APCの | バイオ | 1月30日 | |
| CD4 | RPA-T4 | PE | BDの | 1/450 | |
| CD8 | RPA-T8 | PE | BDの | 1月20日 | |
| CD14 | M5E2 | PE | BDの | 1月15日 | |
| CD19 | HIB19 | PE | BDの | 1/300 | |
| 死んだ細胞 | | L/Dブルー | LT(リトリー | 1/300 | 生死差別 |
| BD = BD Biosciences, Bio = BioLegend, LT = Life Technologies |
表3:多発性骨髄腫患者の凍結PBMCを染色するために使用した抗体パネル。
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| ターゲット | クローン | 蛍光色素 | カタログ | 売り手 | 濃度 | 目的 |
| CD3 | UCHT1 | BV421 | 562426 | BDの | 1月20日 | 血筋 |
| CD56 | NCAM16.2 | BV421 | 562751 | BDの | 1/900 | |
| TCRγδ | B1 | BV421 | 331217 | バイオ | 1月30日 | |
| CD4 | RPA-T4 | PE | 555347 | BDの | 1/450 | |
| CD8 | RPA-T8 | PE | 555367 | BDの | 1月20日 | |
| CD14 | M5E2 | PE | 555398 | BDの | 1月15日 | |
| CD19 | HIB19 | PE | 555413 | BDの | 1/300 | |
| CCR7 | G043H7 | AF647 | 353217 | バイオ | 1月30日 | 区別 |
| CD45RA | ハイ100 | APC-H7 | 560674 | BDの | 1月60 | |
| CCR4 | 1G1 | PE-Cy7 | 561034 | BDの | 1月60 | thサブセット |
| CCR6 | G034-E3 | BV605 | 353419 | バイオ | 1月30日 | |
| CXCR3 | 1C6/CXCR3 | AF488 | 561730 | BDの | 1月30日 | |
| CD57 | NK-1 | PE-CF594 | 562488 | BDの | 1/900 | アクティベーション/枯渇 |
| HLA-DR | G46-6 | BV510 | 563083 | BDの | 1月30日 | |
| CD16 | 3G8 | BUV395 | 563784 | BDの | 1月30日 | NK、単球活性化 |
| デッドセル | L/Dブルー | L-23105 | LT(リトリー | 1/300 | 生死差別 |