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方法論記事

濃縮水性ウイルスと農業人獣共通病原体のガラスウールフィルター

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DOI:

10.3791/3930

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2012年3月3日

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この記事について

サマリー

グラスウールフィルタは、世界中の研究グループの数によって水系ウイルスを濃縮するために使用されている。ここでは、グラスウールフィルタを構築するための単純なアプローチを示し、フィルタはまた、水性、ウイルス、細菌や原生動物病原体を濃縮するのに有効であるを示しています。

要約

疑われる汚染水の病原体のレベルを評価する上で重要な最初のステップは濃度である。濃縮方法としては、例えば、サンプリングプログラムは、複数の病原体のグループを対象としている場合は、複数の方法が必要であることを意味しジアルジアやクリプトスポリジウム 1、米国環境保護庁方式1623特定の病原体のグループの特定の傾向にあります。現在の方法のもう一つの欠点は、装置であるウイルス2を濃縮1MDSカートリッジフィルタ付きVIRADEL方法は、例えば、複雑で高価になることができます。この記事では、水中の病原体を濃縮するためのガラスウールフィルターを構築する方法について説明します。フィルター溶出した後、濃縮物は、文化的または分子的手法による病原体の検出と列挙に続いて遠心分離等の第2の濃度ステップ、に適している。フィルタはいくつかの利点があります。建設が容易であり、フィルタは次のように構築することができます特定のサンプリング要件を満たすためにニューヨークサイズ。フィルタ部品はそれが可能な深刻なプロジェクトの予算に影響を与えることなく、多数のサンプルを収集しながら、安価である。大量の試料(100〜1000 L)はサンプルの濁度から詰まりの速度に応じて濃縮することができる。フィルタは、非常にポータブルであり、このようなポンプ及び流量計として、最小限の機器で、それらが完成した飲料水、地表水、地下水、農業排水をサンプリングするためのフィールドで実装することができます。最後に、ガラスウールのろ過は、1つの方法が必要となるように、病原体のさまざまな種類の濃縮効果があります。ここでは、水系、人間のエンテロウイルス、S almonellaサルモネラ、クリプトスポリジウム 、鳥インフルエンザウイルスを濃縮することでフィルタの効果について報告する。

プロトコル

1。ガラスウールの準備

  1. フィルタの各バッチの前と行った後、10%漂白剤溶液を用いて作業領域を滅菌する。
  2. 手袋とガウンを着用します。少なくとも20分間121°C、15 psiでオートクレーブでバケットを殺菌。滅菌したバケットにグラスウールを配置します。
  3. 逆浸透水のガラスウールを飽和させ、15分間浸漬しましょう​​。
  4. バケツからの逆浸透水を排出します。
  5. 1 M HClでグラスウールを飽和させ、15分間浸漬しましょう​​。
  6. バケットから1 M HClを排出します。
  7. 逆浸透水のガラスウールを洗浄します。
  8. 混和します。
  9. pH試験紙を用いてpHをチェックし、中性のpHが達成されるまでリンス逆浸透水を繰り返します。
  10. すすぎ水を注ぐ。
  11. 1 M NaOHでグラスウールを飽和させ、15分間浸漬しましょう​​。
  12. バケットから1 M NaOHを排出します。
  13. R中性pHが達成されるまで逆浸透リンスEPEAT。
  14. すすぎ水を注ぐ。
  15. バケットの代わりに、ガラスウールの洗濯機は、設計のガラスピペットワッシャー(図1)に類似している、構築することができます。
  16. pHを6.8に調整した緩衝生理食塩水(PBS)、滅菌リン酸で完全にグラスウールをカバーしています。
  17. すぐに準備されたガラスウールを使用して、または4℃で保存それは、最大2週間まで保存できます。使用する前に、それは時間の経過とともに上昇するようpHが中性であることを確認してください。 pHが中性でない場合は、滅菌リン酸を使用して再リンス液(pH 6.8)緩衝生理食塩水。

2。ガラスウールフィルタを組み立てる

  1. PVCキャップに11月16日インチの穴を開けると男性アダプタナイロン継手は、キャップにねじ込むことができるようにスレッドをタップします。このステップは、最初のアセンブリが​​必要である。その後、キャップは、長年使用することができます。テフロンを適用します。ナイロン継手スレッドとキャップのネジにテープで固定します。
  2. グラスウールの小片と塩ビ管を詰める。タイトなパックに、車のエンジンバルブのように、金属製のプランジャーを使用しています。パッキンが大きな力を必要としません。タイトな十分なグラスウールが所定の位置に留まるように梱包し、チャネルが形成されません。ただし、これをしっかりと水がフィルターを通って流れることができないパックはありません。フィルタは40から60のpsiの圧力で水栓に接続されているときに適切に梱包する場合は、分あたり4〜5リットルの流量は達成可能でなければなりません。このプロトコルで指定された塩ビ管のサイズは、約85グラムを洗浄し、充填したガラスウールは、パイプごとに使用されています。風袋洗浄したガラスウール入りトップローディングバランスとパックの空の塩ビ管パイプの質量は85グラムを増加させるまで。
  3. 接続されているオスアダプタナイロン継手PVCキャップにポリプロピレンメッシュを挿入します。
  4. 塩ビ管のねじ部分にテフロンテープを適用します。
  5. PVC pにPVCキャップのネジイペとラベルつのフィルタ端の流入と、もう一方の端流出​​。これは、溶出ステップの後に重要である。どちらの端には流入は関係ありませんというラベルが付いています。
  6. 注射器をひっくり返したカテーテルを使用してフィルタに液(pH = 6.8)緩衝生理食塩水、滅菌リン酸60mLのを押してください。過剰反対側の端を出てきます。
  7. ラップは、漏れを避けるためにパラフィルムでしっかりと終了します。フィルタは、4℃で30日間まで保存することができます

3。サンプリング

  1. 0.525パーセントのNaClO(すなわち、標準的な家庭用漂白剤の10%溶液)で30分間の項目を循環または浸漬することにより、サンプリングに使用されるチューブを滅菌する。次亜塩素酸塩溶液を排出することによって、これをフォローし、逆浸透水の1リットル〜2%の株式無水チオ硫酸ナトリウム溶液25mlを加えることによって行われた0.05%チオ硫酸ナトリウムとの中和。
  2. 7.5より大きいpHの試料水については、HClで6.5〜7.0にpHを調整します。塩酸濃度は0.25の範囲で指定できます1 M 4リットルにM 0.5 M HClは水の周囲のpHと緩衝能力に応じて、一般的に2つの800リットルのサンプルで十分です。蠕動ポンプまたはベンチュリ(図2)を使用して、サンプリング中に塩酸を注入します。ポンプの速度またはターゲットのpHを達成するためにベンチュリー開度を調整します。フィールドのpHメータを使用してサンプルラインの出口でのpHを測定します。
  3. グラスウールフィルター目詰まりであれば、高濁度水からプレフィルターを使用しています。 (プレフィルターとその住宅の仕様は、材料のリストをオンラインにあります。)病原体は、それがガラスウールフィルタ(下記参照)と一緒に溶出されている必要がありプレによって捕捉粒子に付着することができるので。
  4. 2〜4リットル/分の流量を調整します。典型的なサンプル量は200〜1500リットルです。
  5. 最大48時間まで4℃でプラスチックの滅菌袋のガラスウールフィルターとストアを外します。

4。溶出

  1. リングに貼りグラスウールフィルターポリプロピレンボトルに下向きのサンプル流入端に立っている。サンプルフローの方向の反対を溶出させる。
  2. フィルタに9.5のpHは0.05 Mグリシンの滅菌3%牛肉エキス80 mLを押してください。
  3. 15分間待ちます。
  4. フィルタに9.5のpHは0.05 Mグリシンの滅菌3%牛肉エキスの別の80 mLを押してください。
  5. 泡は、フィルタ入口から出てくるまで、徹底したエアフィルターを押してください。
  6. 1 M HClで7.0〜7.5に溶出液のpHを調整します。
  7. ストア4で溶出°Cより長い期間の最大24時間のために、または-20°Cで。
  8. 1が使用されている場合、プレフィルターを溶出させる。を外し、ハウジングカートリッジの上部と滅菌手袋をはめた手で固定プレを保持しながら住宅内のすべての残留水を捨てる。
  9. 住宅カートリッジからプレフィルターを取り外し、15 "x 6"のジップロック袋にそれをスリップ。
  10. 0.05 M gに滅菌3%牛肉抽出物200mLを注ぐジップロックの袋にしっかりとシールに9.5のpHを有するリシン。
  11. 表面全体が牛肉エキスに接触して確保するために袋詰めプレを数回反転します。
  12. 時折反転および袋プレフィルターをマッサージし、15分間待ちます。
  13. ジップロックを開きます。プレフィルターの周りグリップバッグはしっかりと、できるだけ多くの牛肉エキスと絞り出すと、滅菌手袋をはめた手でプレフィルターを引き出します。
  14. ポリプロピレン瓶に牛肉エキスの溶出液を注ぎます。
  15. 1M HClで7.0〜7.5に溶出液のpHを調整します。
  16. ストア4で溶出°Cより長い期間の最大24時間のために、または-20°Cで。プレ溶出液を別々に病原体のために分析やガラスウールフィルター溶出液と組み合わせることができます。

5。代表的な結果

病原体 水の濁度レベル(NTU) 量シード/ L、B、C、D %回収率±1 SD 数の独立した試験
エンテロウイルス、ポリオセービンIII 0.5 500 81パーセント±11 7
エンテロウイルスポリオセービンIII 0.5 5000 67パーセント±12 8
エンテロウイルス、ポリオセービンIII 215 500 59パーセント±32 7
エンテロウイルス、ポリオセービンIII 215 5000 38パーセント±22 6
エンテロウイルス、ポリオセービンIII 447 500 56パーセント±18 8
エンテロウイルス、ポリオセービンIII 447 5000 63パーセント±37 8
クリプトスポリジウム 0.5 5 38パーセント±14 7
クリプトスポリジウム 0.5 50 53パーセント±19 8
泣くptosporidiumクリ 215 5 40パーセント±16 7
クリプトスポリジウム 215 50 30パーセント±6 6
クリプトスポリジウム 447 5 33パーセント±13 8
クリプトスポリジウム 447 50 28パーセント±11 8
サルモネラ菌 0.5 5 29パーセント±24 7
サルモネラ菌 0.5 500 56パーセント±16 8
サルモネラ菌 215 5 32パーセント±24 7
サルモネラ菌 215 500 34パーセント±11 6
サルモネラ菌 447 5 34パーセント±18 8
サルモネラ菌 447 500 31パーセント±24 8
  1. ネフェロメ濁度単位
  2. ゲノムコピー/ Lとして、定量PCRによって列挙されたエンテロウイルス
  3. C.parvumのは、オーシストと免疫蛍光法により列挙
  4. S. entericaのは、コロニー形成ユニットとして、文化によって列挙

様々な水の濁度と病原体密度の表1のガラスウールの濃度。

病原体 水のサンプルの場所 量シード/ L %レコ非常に
鳥インフルエンザH5N2 Sundi湖、アンカレッジ自治区 2500 42.9パーセント
鳥インフルエンザH5N2 ミントフラッツ、フェアバンクスノーススターボロー 2500 36.7パーセント
鳥インフルエンザH5N2 Portageの谷、アンカレッジ自治区 2500 7.8パーセント
鳥インフルエンザH5N2 ポッターマーシュ、アンカレッジ自治区 2500 41.5パーセント
鳥インフルエンザH5N2 柳湖、ユーコン-コユークク川自治区 2500 15.5パーセント
  1. ゲノムコピー/ Lとして、定量PCRによって測定し

アラスカ州の5つのサイトからの水を使って鳥インフルエンザウイルスの表2のガラスウールの濃度。

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図1ガラスウールワッシャーの図。これはすすぎから時間を節約し、バケットの代わりに使用できます。コンセプトは、ガラスピペットワッシャーに似ています。

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蠕動ポンプにより、酸注入と図2のガラスウールろ過。ポンプチューブは、水の蛇口、ガラスウールフィルタの間にサンプルラインに酸を導入する "T"コネクタに注意してください。 pH調整は、サンプリングされた水は、pH> 7.5を持っている場合にのみ必要です。

グラスウールフィルタは、濁度レベルと病原体の密度(表1)の広い範囲で水から病原体を濃縮するのに有効である。これをテストするには、脱塩素水道水20リットルは、濁度の望ましいレベルを達成するために乾燥したシルト壌土(0、1.27、または2.75グラム/ L)と混合し、その後、様々な密度で病原体を播種した。水グラスウールフィルターに通した、溶出液中の濃縮された病原体は、列挙され、この値は、回収率の計算で分母であった。 、回収率計算の分母である水に病原体を播種量は、最初の病原体を列挙し、負の溶出液に病原体を播種することにより決定した。負の溶出液は、フィルターを介してシーディング20リットルのサンプルを渡して溶出することにより調製した。負の溶出液中に播種し、病原体を定量化するグラスウールフィルタによって作成されたマトリックスの違いから生じる可能性が病原体列挙の違いを回避することができます。定量PCRによる病原体を定量化するこのステップの重要性はランバーらに説明されています。3。 20リットル陰性対照サンプルは、回収率の計算を混乱させることができるネイティブな病原体の存在がなかったかを判断するためにガラスウール濾過によって濃縮した。 10μmの公称孔径プレワット濁度レベルが≥215 NTUたときなどに使用。

ポリオウイルスは、ランバーらで説明しています。3セカンダリ濃度および核酸抽出手順と、プライマーおよびプローブを用いたリアルタイム定量PCRによって定量した。 クリプトスポリジウムは、ポリオウイルスの二次濃縮操作によって作成され、最終的な濃縮されたサンプル量(FCSV)で定量した。オーシストは免疫蛍光(MeriFluor クリプトスポリジウム及びジアルジアの検出キット、メリディアンライフサイエンス社、シンシナティ、オハイオ州)により可視化した。 サルモネラ菌は、XLD寒天上にメッキによりFCSVで定量した(Remel、オーバーランドパーク、カンザス州)と、コロニー形成カウントユニット。

グラスウールフィルタは、鳥インフルエンザウイルス(表2)に集中するのに有効である。低病原性鳥インフルエンザウイルス(H5N2)は、アラスカ州のいくつかの場所から水に播種し、abovを説明したように回収率が計算されたE。二次濃縮および核酸の手順は、ポリオウイルスと同様に行われた。ウイルスは、スパックマンらに記載のプライマーとプローブを用いて、定量PCRにより定量した4。

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ディスカッション

グラスウールフィルタは、そのような完成した飲料水7、地下8,9、地表水10、海の水11、排水12として水のさまざまなソースからの人間の腸管系ウイルスを濃縮するためにいくつかの研究チームが3,5,6で使用されており、農業排水13。ここでは、それぞれのフィルタはまた、鳥インフルエンザウイルスを濃縮することで効果的なだけでなく、細菌や原生動物病原体サルモネラ (血清型Typhimuriumの)とクリプトスポリジウムです報告します。 Deboosere らは最近、鳥インフルエンザウイルス14のグラスウールの濃度を報告した。

フィルタは、水行列の広い範囲で使用可能な、移植性の高い、安価な、そして水中の病原体の多くの種類を集中するのに有効であるという点で有利である。彼らは、研究のニーズに応じて、任意のサイズに構築することができます。駆除後のイオン、フィルターハウジング...

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開示事項

利害の競合は、宣言されません。

謝辞

我々は、ビデオのナレーションのためにウィリアム·T·エッカートに感謝します。グラスウールプロトコルの開発は、米国環境保護庁(EPA)STARグラントR831630によって資金を供給腸リスク(WAHTER研究)のためのウィスコンシン州の水と衛生試験の一部であった。アラスカのサンプルは、USGSからの財政支援とA.リーブス、A.ラミー、AとB Meixellによって収集された。貿易、製品または会社名のいずれかを使用するだけの記述を目的としており、米国政府による是認を意味するものではありません。

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材料

この記事で使用された材料の一覧
名前会社カタログ番号コメント
試薬またはアイテムの名前 会社 カタログ番号
塩酸 フィッシャー·サイエンティフィック A144-500
水酸化ナトリウム フィッシャー·サイエンティフィック BP359-212
リン酸緩衝生理食塩水
塩化ナトリウム
リン酸カリウム、二塩基性
リン酸カリウム、一塩基

フィッシャー·サイエンティフィック
フィッシャー·サイエンティフィック
フィッシャー·サイエンティフィック

BP358-212
BP363-500
BP362-500
次亜塩素酸ナトリウム、すなわち家庭用漂白剤 クロロックス(株)
チオ硫酸ナトリウム、無水 フィッシャー·サイエンティフィック S 475から212
牛肉エキス、乾燥 ベクトン·ディッキンソンアンドカンパニー 211520
グリシン フィッシャー·サイエンティフィック G46-500
油sodocalcicグラスウール
または
R-11 unfacedグラスファイバー断熱材
Isover

REF = "http://www.jm.com"ターゲット= "_blank">ジョンズマンビル
Bourre 725 QN


ポリプロピレンメッシュ ネッティング工業 xN4510
2 "X4" SCH 80スレッドPVCパイプニップル グレンジャー 6MW35
2 "SCH 40 PVCキャップ グレンジャー 5WDW3
オスアダプタナイロン継手(1/2 "X1 / 2") 米国プラスチック(株) 62178
溶出液1リットルのサンプルボトル フィッシャー·サイエンティフィック 03から313-4F
60mLのシリンジ"http://www.fishersci.com"ターゲット= "_blank">フィッシャー·サイエンティフィック NC9661991
pHのストリップ ワットマン 2614 991
プレフィルター、ポリプロピレン、10インチのカートリッジ、10μmのマクマスター - カー 4411K75
プレフィルターハウジングコー​​ル·パーマー S-29820から10

参考文献

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