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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
皮質機能は、多数のニューロン集団のレベルで発生するので、脊椎動物の中枢神経系の機能を理解することは、多くのニューロンからの記録が必要になります。ここでは、単一セルと単スパイク解像度、ディザリングされたランダムアクセスのスキャンと閾値上の神経活動を記録する光学的方法を説明します。この方法は、高時間分解能で、最大100からニューロンに蛍光体のカルシウムシグナルを記録します。最尤アルゴリズムは、体蛍光カルシウムシグナルから基礎閾値上神経活動をdeconvolves。この方法は、確実に高い検出効率と誤検知率の低さとスパイクを検出し、神経集団を研究するために使用することができます
脊椎動物の中枢神経系における情報のシグナリングは、多くの場合、神経細胞ではなく、個々のニューロンの集団によって運ばれる。また、閾値上スパイク活動の伝播は、ニューロンの集団が含まれます。皮質機能に対処する実証研究では、直接こうして高解像度の神経細胞の集団からの録音を必要とします。ここでは、光学的手法および単一セルと単スパイクの分解能で、最大100からニューロンへの神経活動を記録するためのデコンボリューションアルゴリズムを記述する。この方法では、皮質ニューロンにおける閾値上電気スパイク(活動電位)に関連付けられている細胞内の体細胞内カルシウム濃度の一過性増加の検出に依存しています。光学録音の高時間分解能は音響光学偏向(AODs 1)を用いて高速なランダムアクセスのスキャン技術によって達成される。不透明な脳TISにおける高空間分解能でのカルシウム感受性色素結果の二光子励起2を訴える。蛍光カルシウム録音からスパイクの再建は最尤法によって達成される。同時電気生理学的および光学録音は我々の方法が確実に、(> 97%スパイク検出効率)のスパイクを検出する偽陽性スパイク検出(<0.003スパイク/ s)、および高い時間精度(約3ミリ)3率の低さがありますことを示しているスパイク検出のこの光学的な方法は 、in vitro および in vivo における 3,4麻酔動物の神経活動を記録するために使用することができます。
1。光学装置(図1)
2。実験手順
3。スパイク検出効率を最大化するためにオンラインソフトウェアツール

この方程式は、相対的な蛍光変化への変数の変化に伴うフォトンショットノイズのポアソン分布を表しています。ΔF/ F =(G * Nλ(t)は、-G * N&ラムBDA、Gは光電子増倍管と他のすべての電子部品の累積利得を表し、0)/ G * Nλ、0。フォトンショットノイズに加えて、ノイズ発生源が(動きのアーチファクト)があるので、この式は正しくvivoでの録音のために検出された光子の数を決定しないことに注意してください。それにもかかわらず、この方程式は、ノイズを推定するために生体内で録音するのに便利です。
4。 Reconstructio蛍光シグナルからスパイクタイミングのn(デコンボリューション)
5。代表的な結果
記録された蛍光体細胞のカルシウムシグナルの高い信号対雑音比で成功スパイク検出のヒンジ。単に高励起率(高いレーザパワー)を使用すると、生物学的物質(光損傷)にphotoeffectsの悪影響をもたらすことができます。ディザリングされたランダムアクセスでは光損傷をスキャンすると、ベースラインの蛍光とスパイク誘発カルシウム蛍光シグナルの減少の減少として現れる。スパイク誘発シグナルの減少はすぐにスパイクを検出するために失敗することがあります。蛍光シグナルからスパイク検出が高い励起強度の非常に小さな窓しかありません。ハイエンドでは、このウィンドウが下端に蛍光シグナルが低い信号対雑音比を有し、光損傷によって制限されます。スライス面下約100μmで録音するときに急性スライスにおける皮質ニューロンのために私達は約400,000-1,500,000フォトン/ sの光子率をもたらすレーザーパワーを使用します。高を使用している場合親和性の指標 - ここオレゴングリーン488 BAPTA - 1 - この信号は個々のスパイクを検出するために十分である。図。 3Eは非常に低い励起率、検出ウィンドウ内の記録の一例であり、非常に高い励起レートで1で記録した蛍光シグナルの例を示しています。
単一セルと単スパイク分解能で神経活動を記録するために他の技術に比べて、ランダム·アクセス·スキャンが同じ、地元住民からのニューロンの多くから録音することができ、ディザリングとテトロード/多電極録音に比べて例えば低侵襲で。したがってディザリングされたランダム·アクセス·スキャンが閾値上活動6(図4A)、神経細胞(皮質可塑性)の人口における神経活動の変化によって合図相互情報量を測定するために多くのニューロンからの神経活動を記録し、閾値上の活動の伝播に使用することができニューロンは14の個体(図4B)を介して
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図1ディザリングされたランダム·アクセススキャンセットアップの光学設計。

図2アライメントとテスト:異なる条件下で記録された蛍光シグナルの分布。 A)は、より高い光電子増倍管のゲインが、ないレーザ光が全くレーザー光電子増倍管と低ゲイン、B)は、分布があるため、暗電流を光電子増倍管の幅が広い。 C)にレーザーで光電子増倍管と高ゲインで記録。 Bとは、このディストリビューションに示すにおけるディストリビューションの違いは、励起光がPMT検出器に到達したことを示すことになる。 D)の蛍光シグナルの分布は、ニューロン細胞体から高利得で記録。他のノイズ源が寄与していない場合、この分布はショット雑音光子から生じる。
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図は、3つのディザリング原理の1サイクルのニューロン細胞体の位置を検出して選択する)フルフレーム蛍光画像A、B)スキャン·パス、C)がイラスト;各ソーマ(円)いくつかの場所では、次回にビームを移動する前に記録されている2つのD / Aチャネルの出力のソーマ、D)のイラスト。各ニューロンソーマは、蛍光信号は、各ソーマで4つの異なるスポット(S1〜S4)から記録されている。各スポットの位置は、そのx座標とy座標で与えられる。すべてのスポットやすべてのニューロンのxとyの位置が連続的にデジタル·アナログ変換器に送信されます。ビームは2ニューロンの細胞体との間を移動している間、信号は(空白)を取得されていません。 E)の蛍光シグナルの例は。それぞれの例は(電気生理学的細胞接着型の記録で測定)1スパイクへの応答を示していることに注意してください。

図4コルティを学ぶcalはディザリングされたランダム·アクセス·スキャンを使用して機能する。 A)は、多数のニューロン集団によって合図相互情報量を測定します。上の画像は、急性脳スライスとレイヤ4(L4)の同じ皮質カラムに配置された2つの刺激ピペットの顕微鏡写真を示す。中央のグラフは、刺激の各繰返しの神経反応を示しています。下のグラフは、ニューロンの記録された人口によって合図シャノンの相互情報量を示しています。皮質ニューロンの集団間の閾値上スパイク活動のB)測定伝播(信号伝播)。上のグラフは、実験設計を示し、中央の画像は、蛍光画像を示し、破線はバレルの境界を示し、下のグラフは、視床皮質線維(三角形)の電気刺激に応答して、検出されたスパイクを示しています。
特別な利害関係は宣言されません。
皮質機能は、多数のニューロン集団のレベルで発生するので、脊椎動物の中枢神経系の機能を理解することは、多くのニューロンからの記録が必要になります。ここでは、単一セルと単スパイク解像度、ディザリングされたランダムアクセスのスキャンと閾値上の神経活動を記録する光学的方法を説明します。この方法は、高時間分解能で、最大100からニューロンに蛍光体のカルシウムシグナルを記録します。最尤アルゴリズムは、体蛍光カルシウムシグナルから基礎閾値上神経活動をdeconvolves。この方法は、確実に高い検出効率と誤検知率の低さとスパイクを検出し、神経集団を研究するために使用することができます
私たちは、批判的に原稿を読み取るための博士ランディChitwoodに感謝します。この作品は、ホワイトホール財団とHJKにアルフレッド·P·スローン財団の補助金によって支えられている。
| 試薬の名称 | 会社 | カタログ番号 | コメント(オプション) |
| 光学部品はレーザーから順にリストされています | |||
| タイタン:サファイアレーザー | コヒレント社 | カメレオンウルトラ2 | ハイパワー出力を推奨(900 nmでの> 2W) |
| 色消しレンズf = 30mmの | トールラボ | AC254-030-B | 650-1050 nmの反射防止(AR)コーティング |
| 色消しレンズf = 100mmの | トールラボ | AC254-100-B | アーカンソー650-1050 nmの |
| レンズf = 75ミリメートル | トールラボ | LA1608-B | アーカンソー650-1050 nmの |
| レンズf = 175ミリメートル | トールラボ | LA1229-B | アーカンソー650-1050 nmの |
| 色消しレンズf = 300ミリメートル | トールラボ | AC254-300-B | アーカンソー650-1050 nmの |
| 色消しレンズf = 100mmの | トールラボ | AC254-100-B | アーカンソー650-1050 nmの |
| 色消しレンズf = 100mmの | トールラボ | AC254-100-B | アーカンソー650-1050 nmの |
| 音響光学偏向 | Intraactionコープ | ATD 6510CD2 | |
| 反射型回折格子 | ニューポート | 53-011R | 65 MHzの帯域幅を持つAODsに100本/ mm、45 mradの角度をスキャン |
| 21.6ミリメートルブリュースタープリズム | ラムダリサーチ光学株式会社 | IBP21.6SF10 | |
| 色ガラス | ショット | BG-39||
| ダイクロイックミラー | クロマ·テクノロジー株式会社 | Z532RDC | |
| 光電子増倍管モジュール | 浜松市 | H9305-03 | |
| DAC-ADCボード | ナショナルインスツルメンツ | PCI-6115 | |
| オレゴングリーン488 BAPTA-1 AM | インビトロジェン | O-6807 |