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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
高品質の透過型電子顕微鏡画像を取得することは、特に植物細胞の場合、水で満たされた大きな液胞と曝気された空間が豊富にあるため、困難です。タンデム高圧凍結と急速凍結置換により、TEM用の植物試料の調製時間が大幅に短縮され、超微細構造保存性に優れた試料が得られます。
1940透過型電子顕微鏡(TEM)ので、生物学的材料の超高分解能画像で生物を提供している。しかし、理由もアーチファクトのない試料の調製の経験を求めて、面倒で時間がかかるのプロトコルにより、TEMはユーザーフレンドリーな技術とはみなされません。 TEMのための伝統的なサンプル調製は、細胞構造を維持するために化学固定剤を使用した。高圧凍結することにより細胞の超微細構造の完全性に有害な氷の形成を制限し、非常に速い冷却速度を生成するために、高圧下での生体サンプルの低温固定である。高圧凍結し、凍結置換は、現在TEM用樹脂切片における最高品質のモフォロジーを製造するための最適な方法である。これらのメソッドは、通常、薄い切片のTEMのための従来の処理に関連する成果物を最小限に抑えます。低温固定した後、サンプル中の凍結された水が液体で置き換えられる低温での有機溶媒は、プロセスは、凍結置換と呼ばれる。凍結置換は、典型的には、専用の高価な設備で数日間にわたって行われる。最近の技術革新ではなく通常の2日間で、プロセスは3時間で完了することを可能にする。これは、典型的には、浸潤およびセクショニングの前にエポキシ樹脂中に包埋を含む試料調製のいくつかのより多くの日が続く。ここでは、植物試料の固定は時間内で達成されることを可能にする、高圧凍結急速凍結置換を組み合わせたプロトコルを提示する。プロトコルは、容易に他の組織または生物を操作するために適合させることができる。植物組織が原因曝気スペースと水の氷のない凍結を妨げる水で満たされた空胞の存在のために、特別な関心事である。また、化学的固定化のプロセスは、組織内の深いへの化学物質の浸透を妨げ、細胞壁のために、植物では特に長いです。植物組織は、したがって粒子フィルタであるularly挑戦が、このプロトコルは、信頼性があり、最高品質のサンプルを生成する。
細胞の超微細構造の私たちの知識は、数ナノメートル1の範囲の内容を解決することができ、電子顕微鏡から主に来る。サンプル調製は時間がかかり、面倒なプロトコルを必要とし、開業医からいくつかの専門知識を要求するように分解能TEMで非常に強力であるにもかかわらず、ユーザーフレンドリーとはみなされません。サンプルの伝統的な固定は、樹脂中に埋め込み、次いで重金属で染色した超薄切片を作製するために切片化、脱水を含むさらなる処理の前に、アルデヒドおよび四酸化オスミウムの使用を組み合わせている。しかしながら、化学的な固定は、最終的にいくつかの細胞区画2に影響を与える膜へのタンパク質凝集及び脂質1の損失、および変更を含むアーティファクトを生成することが知られている。これらのアーティファクトは、主に、室温3、4、5で固定し、脱水の遅い速度に起因する。
、7。HPFが低下し、20度の水の凝固点を低下させる氷結晶の核生成及び成長を遅くし、細胞成分を本質的に6固定されているように、生物学的サンプル中の水の粘度を増大させることであるミリ秒単位の非常に高圧(210 MPa以上2,100バール)の下で、液体窒素とサンプルの温度、。適切に行われると、HPFは、細胞の超微細構造に大きな損傷を引き起こす可能性があり、大きな氷結晶の形成を防止する。 HPFは、生物学的溶質7の典型的な濃度で100〜200ミクロンの厚さのサンプルを固定するために使用することができる。多数の物理学の口コミHPF、 たとえば 1、7,8の基礎となる原則があります。
HPF後、試料を低温でインキュベートする(-78.5°C〜-90° C)は、一般的に数日間、四酸化オスミウムなどの化学固定剤を含有する液体有機溶媒の存在下で行われる。この低い温度では、サンプル中の水、有機溶媒、典型的にはアセトンまたはメタノール1,9によって置換される。したがって、このプロセスは、凍結置換(FS)と呼ばれている。次いで、試料を次第に温め、この時間の間、通常は四酸化オスミウムおよび酢酸ウラニル9と、固定されている。低温での架橋は1を固定化された分子を固定するという利点を有する。 FSしたがって、改良された超微細構造の保存をもたらし、特に、室温で通常の化学的固定により固定したものに比べて優れた品質、抗原性の良好な保存のサンプルを生成し、未結合の細胞成分10,11の損失を減少させた。
最もFSは、典型的には数日間まで、長期間にわたって行われる。これは、特にトゥルーである植物標本12、13、14の電子。マクドナルドやウェッブによって開発された最近のプロトコルは大幅に数時間から15数日からFSのための時間を削減します。スーパークイックFS(SQFS)でサンプルが90分で処理されている間、それらの急速凍結置換(QFS)手順では、FSは、3時間かけて行われる。これらの方法により作製したサンプルの品質は、従来のFSプロトコルによって得られたものに匹敵する。私たちは、HPF後に植物試料の下流処理のためQFSプロトコルを採用しています。 QFSおよびSQFSではなく、高価な市販のFSマシンの一般的なラボ機器を使用するため、これは、時間だけでなく、お金ではないだけを保存することが証明されています。
植物組織は、多くの場合、TEMの準備をすることは非常に挑戦的である。平均して、植物細胞、細菌細胞または動物細胞のいずれよりも大きくしている。疎水性のワックス状のキューティクル、厚い細胞壁、有機酸、加水分解酵素とフェノールcを含む大きな水で満たされた空胞の存在総細胞体積16の最大90%を占め、曝気スペースの存在は、深刻なシステム17の熱伝導率を低下させることができるompounds。さらに、植物の場合には、試料の厚さは、ほとんどの場合は20μm、化学的固着の使用の制限を超えています。これらの厚さで、水の低い熱伝導率は、サンプルの中心に凍結速度を超える-10,000°C /秒のを防止する。その速度は、有害な六角形の氷の形成(10〜15ナノメートルよりも低い密度と大きな氷結晶)8を回避するために必要とされる。サンプルの適切な凍結およびその後のFSの両方に同時に、これらの課題を提示。それにもかかわらず、低温固定は植物試料を固定するための最良の方法です。ここで植物組織試料のHPF-QFSのためのプロトコルが提示される。これは、モデル種のシロイヌナズナに焦点を当て、またベンサミアナタバコで使用されてきた。典型的な結果は、HPF-QFSはSAを生成することを実証わずかな時間での伝統的なHPF-FSに匹敵する品質のmples。適切な調整で、このプロトコルは、他の比較的厚い生物学的試料のために使用することができる。
注:QFS手順は、ユーザが十分な注意と注意を必要とし、私たちは、適用上の注意と注意事項としてここにこれらの安全上の注意を強調表示します。
HPFラン用1.Preparation
Receiviのため2。準備ngの冷凍サンプル
サンプルの3。高圧凍結
フリーズ交代のため4。準備
5。クイックFS
注:のOsO 4の漏れが誤って他の予防措置にもかかわらず、発生した場合にはドラフト内でQFSの実行を行います。
6ポストFS処理
以下に示す結果は、HPFのためWohlwendコンパクト02( 図1A)を使用して得られている。この装置の1つの主な利点は、試料キャリア及びその所有者の使いやすさである。他の楽器を使用する場合は、マクドナルド、2人のユーザーが、他の凍結を行い、FSへの転送が9をクリオバイアルながら試料を調製する試料調製とHPF、1を行うべきであると推奨しています。しかし、Wohlwend標本キャリアやホルダーは、独立して操作するための単一のユーザ( 図2A、B、E、FおよびG)のために十分に簡単である。しかし一つは、いくつかの試験は、貴重なサンプルを操作する前に、HPF機器に精通するために実行する実行する必要があることに言及すべきである。経験のあるユーザーは、時間のいくつかの(10以上)のサンプルを修正することができるはずです。しかしながら、このプロトコルで提示原理は、市販のHPF機のいずれかと共に使用することができる。
たぶんHPF-QFS手順の最も重要な部分は、試料キャリア( 図2C)にロードするためのサンプル調製である。これは直感的ではないかもしれないが、それは研究者がほとんどで支配しているプロトコルのステップである。 HPF機は堅牢で、かつ適切な使用とメンテナンスで、サンプル間のばらつきの少ない圧力と温度の予想される変化を生成する必要があります。試料が不十分準備中に処理される場合には、他のステップはそう被害を買い戻すん。彼らは培地で培養していないし、その細胞壁は、細胞の良好な強度を与えるように植物組織は、プロセスのこの段階で、操作は簡単です。これは、サンプルが、親植物からの除去から生じる超微細構造の変化を避けるために、ストレスや負傷応答を制限するために迅速に処理されることにもかかわらず重要である。サンプルを収容できる最小の試料キャリアは、効率的かつ一貫性のあるHPF( 図を確実にするために使用されるべきであるUREの2C)。最後に、試料キャリアはいっぱいあるが( 図2D)オーバーフローしていない必要があります。充填された試料キャリアが容易に( 図2 H及びI)を冷凍するためのHPF機に挿入される。
QFSプロトコルにおける最初のステップは、初心者のために挑戦することができますので、ユーザーが手順( 図3A-E)で快適になるまで二人は一緒に仕事することをお勧めします。液体窒素と固定剤の四酸化オスミウムおよび酢酸ウラニルを取り扱う際には注意を常に注意する必要があります。 QFS中の温度変化の典型的な曲線を図2Jに示されている。約-80℃〜-196℃の液体窒素の温度、より急速に温度が上昇する。これは、凍結置換が9起こると考えられている周りに-78℃〜-90℃の温度である。 QFSプロトコルにおける一つの挑戦的なステップは、FSの2時間後に、ドライアイスの除去である。アットこのステップでは、サンプルの取り扱いを誤ると、温度のスパイクを生成することができます。このため、ヒータブロック迅速cryogloveを使用してQFSチャンバから持ち上げされるべきであり、ドライアイスを迅速に第2の容器中に注ぎ出した。
HPFは、 ベンサミアナタバコの葉とシロイヌナズナの葉と胚を含むさまざまな植物組織を固定するために使用されてきた。それが原因で最も細胞の大きな中心液胞に成熟した葉から試料を固定するために挑戦している。若い葉は小さい空胞が含まれているが、毛状突起は通常、非常に密に充填されている。毛状突起の存在が困難酵母ペーストでサンプルをパックするために作るが、これは正しく葉の表面とペーストの間に閉じ込められた空気の量を最小化するために行われることを保証するために注意しなければならないことができる。閉じ込められた空気は、HPFの間に熱伝達を妨げ、固定の質が低下します。これは、任意のサンプルについても同様です。
HPFとQFSのサンプルは、viのために調製することができる後浸潤や樹脂で埋め込むことにより、TEM下ユーイング。 65〜100ナノメートルの薄切片を切片化することによって調製することができる。典型的な結果を図4に示す。示されている画像は、シロイヌナズナの葉サンプルから全てである。原形質膜は、典型的には良好な固定( 図4A、C及びE)の符号円滑かつ細胞壁に押し付けられている。葉緑体( 図4A、D、FおよびH)およびチラコイド( 図4B)、ミトコンドリア( 図4DおよびF)、ゴルジ( 図4、G)、微小管( 図4E)およびリボソーム(特に図4C)を含む他の細胞小器官でもあるはっきりと見えると中央の大きな空胞( 図4A)は無傷のままである。氷結晶による損傷( 図4D)、および原形質分離( 図4H)を含むアーティファクトHPF-QFS結果中に悪い扱い。鉛の沈殿物はまたセクションの染色の際に形成することができるS( 図4F)。

図1:Wohlwend小型02高圧冷凍庫(A)接続されたコンピュータ端末との低温固定するために使用Wohlwendコンパクト02 HPF機。サンプルは、凍結のための機械(小さな円)の前に挿入されます。温度曲線は、ユーザが所望するように、各実行するためのコンピュータ画面上に生成することができる。(B)HPF実行するための典型的な温度-圧力曲線。黄色、紫色線は、それぞれ、温度および圧力を表す。両方の曲線の急な斜面に注意してください。高い圧力は約400ミリ秒維持される。 x軸上の各間隔が50ミリ秒を表す。データはDSIM12ソフトウェア用EasyScopeIIで収集した。ストレージOに使用する(C)絶縁されたボックスとカバー直ちに凍結後のfの凍結試料は、好都合上HPF機を配置することができる。これは、液体窒素が充填されている。丸いアルミ容器は、凍結バイアルを保持します。

図2:HPFのための準備組織サンプル。その閉じた構成における(A)コンパクト02 HPF機用の試料ホルダ。(B)試料ホルダーが開いている。(C)タイプの試料キャリア0.2ミリメートルウェル内のリーフ·サンプル。このキャリアの反対側は0.1mmで深さ(D)は、酵母ペーストで覆われた葉のサンプル。キャリアが完全なく溢れないことに注意してください。(E)試料ホルダ内の試料キャリア。(F)試料は、B型キャリアで覆われている。このキャリアは、一方の平面を持ち、反対側にもその0.3ミリメートルの深さである。ここで平坦な表面を試料挟むように使用されます。(G)のサンプルホルダーを閉じて、HPF機に挿入するための準備ができました。(H)試料ホルダーは、凍結のために挿入されるHPF機器の前面にあるオリフィスHPF機に投入。(I)の温度と圧力プローブ/ホルダー。(J)QFS実行の典型的な温度曲線(EasyLogソフトウェアを使用して収集されたデータ)。温度が毎秒記録した。ランの開始時にスパイクが使用されるプローブの電子機器によるもので、実際の温度測定値を反映していない。

図3:QFSで使用される機器 QFSは、発泡スチロールの箱またはアイスバケットなどの任意の断熱容器で実施することができる(A)を<。/ strong>は1〜2センチメートル深いドライアイスの層がここにQFS室の底、発泡スチロールの箱をカバーしています。(B)13mmの穴にヒータブロックがQFS中に家のサンプルに使用されます。デジタルデータロガーとの温度プローブは、ヒーターブロック中に配置されている。(C)サンプルはブロックに配置され、液体窒素中でヒータブロックを冷却した後、液体窒素を注ぎ出し、そしてアセンブリ全体QFSチャンバ内に配置されているドライアイス(D)試料が覆われるようにQFSチャンバはドライアイスで充填されている。ドライアイスで全体のヒーターブロックをカバーへの不利な点はありません。(E)ボックスがカバーされてからサ ンプルがQFS手順全体を通して攪 拌されるドラフト内でロータリーシェーカー上に移動させる。

フィギュア4:シロイヌナズナはHPF-QFSして調製葉ツァイス天秤座200 HT FE MCにTEMによってHPF-QFSにより調製し、画像化された試料について得られた結果を、(A)細胞壁を持つ葉緑体(CH)を示す媒質高倍率画像と隣接する細胞の細胞質。液胞(V)は、電子高密度材料を含んでいる。 =0.5μmのスケールバー。(B)の葉緑体の高倍率画像。スケールバー= 100nmである。(C)は 、隣接するセル間のセル壁の高倍率画像。分岐した原形質連絡が見える(矢印)である。液胞によって細胞壁に押し付け、滑らかな細胞質膜に注意してください。細胞質は密にリボソームが満載されています。 Vは液胞である。液胞膜は、滑らかで連続的である。スケールバー= 200nmである。(D)氷のダメージ(アスタリスク)の領域に近い葉緑体(CH)での良好な固定の領域を示す低倍率画像。スケールバー= 0.5程度である。(E)細胞WALの高倍率ビューlおよび微小管。葉緑体(CH)とミトコンドリア(M)の良好な保存を示すスケールバー= 100nmである。(F)画像。大きな黒い沈殿物をクエン酸鉛で切片を染色からのものである。スケールバー=1μmである。ゴルジ(GA)の(G)高倍率ビュー。スケールバー= 200nmである。(H)が不十分な葉緑体および原形質分離(黒矢印)のディテールの欠如を示すサンプルを保存した。スケールバー=1μmである。
著者らは開示するものは何もない。
高品質の透過型電子顕微鏡画像を取得することは、特に植物細胞の場合、水で満たされた大きな液胞と曝気された空間が豊富にあるため、困難です。タンデム高圧凍結と急速凍結置換により、TEM用の植物試料の調製時間が大幅に短縮され、超微細構造保存性に優れた試料が得られます。
カリフォルニア大学バークレー校の博士ケントマクドナルドの優しさと寛大さが大幅に高く評価されています。私たちは、非常に有用な提案のための匿名査読に感謝します。バーチ·スミスラボは、テネシー大学からのスタートアップ資金によってサポートされています。
| Wohlwend HPF Compact 02 高圧凍結機 | Technotrade International, Inc | HPF02 | 凍結と圧力曲線を表示するオシロスコープを内蔵しています。表示にはPC(別売)が必要です 凍結パラメータの |
| DN 3 x 0.5 mm アルミニウム apecimen キャリア | Technotrade International, Inc | 290 | |
| 試料キャリア、P=1,000、DN 3 x 0.5 アルミニウム、タイプ A | Technotrade International, Inc | 241-200 | |
| 試料キャリア、P=1,000、DN 3 x 0.5 アルミニウム、タイプ B | Technotrade International, Inc | 242-200 | |
| ストレージデュワー 20.5 L、MVE ミレニアム 2000 XC20 | チャート | ||
| ベイカー酵母 | 古いほど良い、過剰なガス(CO2)生産を避けるために | ||
| つまようじ | |||
| 熱電対データロガー EL-USB-TC | OMEGA Engineering Inc. | OM-EL-USB-TC | 交換用バッテリーは別途購入 |
| 温度プローブ | 電子顕微鏡科学 | 34505 | |
| ヒーターブロック 12/13 mm | |||
| ロータリーシェーカー | フィッシャーサイエンティフィック | 11-402-10 | |
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