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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
この方法は、細菌の食作用と酸化的バーストを同時に測定することにより、顆粒球の機能を評価する技術を示しています。画像ベースのフローサイトメトリーにより、相対的な機能容量が異なる活性化顆粒球の3つの異なるサブセットを同定することができました。
顆粒球は、細菌やウイルスの感染に対する体の自然免疫反応において重要な役割を果たします。顆粒球の機能を測定する方法は存在しますが、一般的に提供できる情報は限られています。例えば、ほとんどの既存のアッセイは、1回の固定長インキュベーション後に活性化される顆粒球の数のパーセンテージを提供するだけです。問題を複雑にしているのは、ほとんどのアッセイは、検出技術の制限により、機能の1つの側面のみに焦点を当てていることです。本報告では、細菌の顆粒球食作用と酸化的バーストの同時測定技術について述べる。これらの機能を同時に測定することにより、活性化顆粒球の3つのユニークな表現型が特定されました:1)低活性化(最小限の食作用、酸化バーストなし)、2)中程度の活性化(中程度の食作用、いくつかの酸化バースト、ただし2つの機能イベントの共局在化なし)、および3)高活性化(高食作用、高酸化バースト、食作用と酸化バーストの共局在化)。不活化顆粒球からなる4番目の集団も同定されました。10分、20分、および40分のアッセイインキュベーションを使用して、活性化された顆粒球表現型の再分布に対するアッセイインキュベーション時間の影響を評価しました。4回目のインキュベーションは、コントロールとして氷上で完了した。連続時間インキュベーションを使用することにより、アッセイは、処理が顆粒球機能に空間的にどのように影響するかを検出できる可能性があります。すべてのサンプルは、定量イメージング(QI)オプション、オートサンプラー、および複数のレーザー(488、642、および785 nm)を備えた画像ベースのフローサイトメーターを使用して測定しました。
顆粒球は抗原の侵入に対する防御の第一線を提供し、体の自然免疫系の一つの成分を表している。顆粒球機能を評価するための従来の方法は、それが困難な顆粒1-4を変更したかをまとめて把握すること、別個の方法を使用して、食作用能力または酸化的バーストに焦点を当てた。流れの分野における進歩は、フローサイトメトリーのハイスループット様式5のセルの高解像度、マルチカラー撮像が可能な卓上型機器の生産をもたらした。従来のフローサイトメトリーでイメージングを組み合わせる能力は、既存のフローサイトメトリー法内革新および免疫系に関する新しい情報を抽出するために必要な技術的プラットフォームを提供進歩を表す。
過去10年間で、私たちの研究室では、特に、鋭く、様々な栄養と運動療法パットの効果が注目されている先天性の免疫機能6-9でRNS。この原稿で実証方法は、臨床免疫学の分野内で実用的な意味を持っている。本発明の方法は、同時に細菌粒子と酸化的バーストの食作用を測定するための画像ベースのフローサイトメトリーのパワーを活用しています。このアプローチを用いて、分析の画像ベースの部分で提供さ変数を使用して活性化顆粒球を分離することができる。これらのサブセットは、個々の顆粒球上の細胞の画像を評価するた後だけに識別可能であった。さらに、アッセイのインキュベーション時間は3活性化サブセット10との間の遷移に影響を与えた。これにより、複数のインキュベーション時間の使用は、特定の実験的治療後の顆粒球機能の変化を試験するための方法を可能にすることができることはもっともらしい。本稿の目的は、同時にoxidatで食作用を測定するために画像ベースのフローサイトメトリーを用いて顆粒球機能を評価する方法を実証することであったIVEはバースト。
注:このメソッドに記述されているすべての血液採取手順はヘルシンキ宣言に従って行われ、被験者のためのUNT治験審査委員会(IRB)により承認された。すべての被験者は正常な体重、彼らは明らかに健康であることを確実にするために、本発明の方法で使用された血液採取のための書面による同意を与えた、と無病。
1.試薬ソース&準備
2.血液サンプル採取
3.食作用アッセイ法

図1.取得方法&テンプレート。サンプルは、画像ベースのフローサイトメーター(A)で得た。買収時には、CD66b-APC対明視野アスペクト比のドットプロットを使う、スパイク、キャリブレーションビーズから分離顆粒球に生成されたG INSPIRE V。100.2.292.0ソフトウェア(B)。赤、(640ナノメートル; 100 NW)、SSC(785ナノメートル、8.5ミリワット)レーザ、5000顆粒球の最小値は青オートサンプラー、(60 mWの488 nm)を使用して、各サンプルについて、取得した。ヒストグラムの数は、レーザーの設定とデータの他の側面収集を監視するために取得中に存在していることに注意してください。これらのヒストグラムはすべてオプションと実験室の標準的な操作手順は、品質管理として、それらを必要とする場合にのみ必要である。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
4.サンプル収集と分析

図2.分析テンプレート。この図は、焦点(A)であった細胞を同定するために生成された一連のプロット、単一細胞(B)、顆粒球(C)。追加のプロットは活性化顆粒球対非アクティブな顆粒球の3つのサブセットを同定するために使用した。取得した画像ファイルはすべて分析はアイデアV.6ソフトウェアを使用して完成させた。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
画像ベースのフローサイトメトリーを使用すると、我々は、3つの異なる活性化サブセット( 図3)への活性化顆粒球の均一な集団を分離させた。この方法では、最も効果的な方法は、3活性化サブセットを酸化的バースト対( 黄色ブドウ球菌 )(DHE)(;図4図3)食作用のために明るいディテール強度をプロットしている解決します。また、IDEASソフトウェアの共局在ウィザードを使用することは非常に活性化顆粒球の特徴的な兆候である、同時食作用および酸化的バーストの存在の定量化を可能にする。

活性化顆粒球サブセットの図3の同定は、細胞表面マーカー(CD45 + / 66bが+)を用いて顆粒球の同定後、娘プロットは明るい細部INTENで生成された酸化的バーストのための明るいディテール強度対食作用のためにsity。このアプローチは、中程度のアクティブ、非アクティブ(紫)、ローアクティブ(赤、A)、(青、B)の割合は、高活性な(黄色、C)顆粒を使用することを決定した。このゲーティング技術は、種々の活性化顆粒球サブセットの相対的な存在量に関するアッセイインキュベーション時間の効果を評価するために使用した。 「ハイアクティブ」顆粒球の割合が最も高いが、40分間インキュベーション後に存在していた。取得した画像ファイルはすべて分析はアイデアV.6ソフトウェアを使用して完成させた。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
活性化顆粒球の三つの異なるサブセットの存在を示すことに加えて、それは、アッセイインキュベーション時間は、各活性化顆粒球サブセットの相対量に影響を与えたことが実証された。具体的には、40分株式会社ubationは「高アクティブ」顆粒球の最大の割合をもたらした。少なくとも三つのアッセイインキュベーション期間を含めることによって、所与の臨床治療が、顆粒球の一時的な活性化状態を変化させる方法を決定することも可能である。これは、食作用および酸化的バーストの同時測定の関数として、異なる活性化顆粒球のサブセットを識別するために画像ベースのフローサイトメトリーを使用して最初の公表された方法である。

細胞マーカーの図4の代表的な画像は 、ハイアクティブ(A)として分類された細胞の画像ギャラリー、適度な活性(B)、及び、ローアクティブ(C)は、この図に示されている。 黄色ブドウ球菌の生体粒子はCH03である、酸化的バーストは、CD66bはである、側方散乱がCH06である、核のための7AADがCh05である、CH04であるCH11、およびCD45はのCh12である。また、酸化的バースト(CH04)対食作用(CH03)の共局在マージ画像が表示される。マージ画像で黄色のエリアその食作用および酸化的バーストを示すが同時に同じ解剖学的空間で発生している。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
著者らは開示するものは何もない。
この方法は、細菌の食作用と酸化的バーストを同時に測定することにより、顆粒球の機能を評価する技術を示しています。画像ベースのフローサイトメトリーにより、相対的な機能容量が異なる活性化顆粒球の3つの異なるサブセットを同定することができました。
本研究は、ノーステキサス大学からマクファーリン博士への研究開始助成金(RIG)によって部分的に資金提供されました。著者らは、この研究の完了に対する直接的な資金提供を受けておらず、利益相反は報告されていません。
| Vacutainers | BD 採血に使用される | BD ライフサイエンス | |
| WBC 固定液 / RBC 溶解液 | eBioscience | 00-5333-57 | |
| CD66b-APC | eBioscience | clone G10F5 | |
| CD45-APCeFluor780 | eBioscience | clone 2D1 | |
| S. aureus Bioparticles | Life Technologies | A10010 | |
| ジヒドロエチジウム | Sigma-Aldrich | D7008 | |
| N-エチルマレミド | Sigma-Aldrich | 4259 | |
| 7AAD | EMD ミリポア | ||
| 血液学的分析装置 | Mindray | BC-3200 | |
| 96チャンネルピペット | Integra Biosciences | ViaFlo | |
| ビーズバス インキュベーター | LabArmour | BeadBath | |
| イメージング フローサイトメーター | EMD ミリポア | アムニス FlowSight | |
| INSPIRE ソフトウェア | EMD ミリポア | アムニス INSPIRE | |
| IDEAS ソフトウェア | EMD ミリポア | アムニス IDEAS | |
| X-ピアス ピアケーブルプレートシーラー | Excel Scientific, Inc. | X-Pierce | |
| Dell Precision Workstation | デルコンピュータ | IDEAS | 分析にさまざまな使用 |