ここでは、角膜上皮創傷治癒中のHSP27の機能を評価するために、熱ショックタンパク質27(HSP27)特異的な低分子干渉RNAを使用するプロトコルを提示します。RNA干渉は、さまざまな細胞タイプのタンパク質機能を調べるために、遺伝子発現を効果的にノックダウンするための最良の方法です。
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方法論記事
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ここでは、角膜上皮創傷治癒中のHSP27の機能を評価するために、熱ショックタンパク質27(HSP27)特異的な低分子干渉RNAを使用するプロトコルを提示します。RNA干渉は、さまざまな細胞タイプのタンパク質機能を調べるために、遺伝子発現を効果的にノックダウンするための最良の方法です。
Small Interfering RNA(siRNA)は、タンパク質をコードする遺伝子の短期的なサイレンシングに最も広く使用されているRNA干渉法の一つです。siRNAは、mRNA転写産物を特異的に標的としてその分解を誘導するために作成された合成RNA二本鎖であり、さまざまな細胞プロセスにおける新しい経路を特定するために使用されてきました。角膜上皮創傷治癒におけるリン酸化熱ショックタンパク質27(HSP27)の役割に関する報告はほとんどありません。本明細書では、培養されたヒト角膜上皮細胞を、スクランブルされたコントロール-siRNAトランスフェクト群とHSP27特異的siRNA-トランスフェクトグループに分けた。その後、スクラッチ誘発性指向性創傷アッセイ、ウェスタンブロッティング、およびフローサイトメトリーを実施した。HSP27は、上皮細胞のアポトーシスと遊走に関与する可能性のある角膜上皮創傷治癒に関与していると結論付けています。ここでは、サンプル調製と研究プロトコルの段階的な説明を提供します。
それらは同時に縁と角膜上皮の基底層の細胞に置き換えられている間に角膜上皮細胞(のCEC)を連続的に、涙液膜に流されている。1様々な外因性ストレスが、のCECのアポトーシスおよび落屑を誘発することができる。2熱ショックタンパク質(HSP)高度に保存され、分子サイズに係る二のファミリーに分類することができる。3最大HSPファミリーは、HSP90、HSP70およびHSP60を含み、より小さいファミリーはHSP27を含む4 HSP27のリン酸化が細胞の生存に重要な役割を果たすことが知られていますそして、理由アクチンリモデリングにおけるこのタンパク質の役割の細胞移動のために必要とされる。5-7。したがって、我々は、上皮創傷治癒のin vitroモデルでCECの移行とアポトーシスにおけるHSP27のリン酸化の潜在的な役割をテストしようとしました。
RNA干渉(RNAi)小さいまたは短い干渉RNAのいずれかを使用して(siRNA)がGEを持っていますそれが潜在的に可能にするように両方の基礎および応用生物学のnerated関心は、目的の任意の遺伝子の発現をノックダウンする。8ここで、我々はCEC創傷治癒およびアポトーシスに対するHSP27の寄与を評価するために、HSP27特異的siRNAを使用しました。細胞における遺伝子ノックダウンのための従来のRNAi法は、siRNAを作成するために組み立てることができる2つの未修正の21-merのオリゴヌクレオチドを含む合成RNA二重鎖を、使用しています。我々は、この本研究で使用したRNAi siRNAは、細胞をトランスフェクトするための単純かつ非常に効率的な方法であり、この試薬は、種々の不死化細胞株と連動します。この本研究では、我々は、傷誘導性の方向性創傷アッセイ、ウェスタンブロッティング、siRNAトランスフェクションアッセイ、免疫蛍光アッセイを含む、この分析のために使用される方法を、デモンストレーション、およびフローサイトメトリー。
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1.細胞株
2.ウェスタンブロット分析上皮スクラッチ傷を作成した後
3. siRNAのトランスフェクションアッセイ10
siRNAでトランスフェクトされた細胞11 4.ウエスタンブロットアッセイ
5.スクラッチによって誘発される細胞遊走12の指向の傷つけアッセイ評価
アポトーシスの6.フローサイトメトリー分析
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リン酸化HSP27の発現が有意に無傷HCECs 13と比較して創傷スクラッチした後、5から10に増加し、30分。ウェスタンブロット分析は、Baxの発現が有意にHSP27特異的siRNAでトランスフェクトHCECs( 図1A-E)で増加したのに対し、リン酸化HSP27及びリン酸化Aktの発現は両方の有意に減少したことが明らかになりました。 ( 図1A-Bリン酸化HSP27の発現は、対照siRNAをトランスフェクトした細胞と比較して、それぞれ、30%および10 nMの中で40%とHSP27特異的siRNAでトランスフェクトした細胞の50 nMの減少したが、リン酸化HSP27の発現が減少しませんでした)。また、非リン酸化HSP27の発現は、10 nMの20%及び30%減少したsiRNAをトランスフェクトされた細胞、それぞれが、非リン酸化HSP27の発現は減少しなかった( 図1A HSP27特異的およびCの50 nMの
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この本研究では、 in vitro アプローチを使用して、角膜上皮創傷における HSP27 の潜在的な役割を評価しました。重要なステップには、ストレスを受けた細胞におけるHSP27の機能を観察するためのHSP27ノックダウンのためのsiRNAトランスフェクションが含まれていました。特に、角膜上皮創傷治癒中の上皮細胞遊走とアポトーシスにおけるHSP27の役割は、これらの実験によって明らかになりました。ラットHSP27特異的siRNAを使用して血管平滑筋細胞をトランスフェクションした以前の研究10 とは異なり、siRNAトランスフェクション技術を使用してヒトCECの遺伝子発現を改変し、HSP27特異的遺伝子発現を効果的にノックダウンし、HSP27機能を研究しました。使用したターゲット配列、細胞密度、最終siRNA濃度、インキュベーション時間に違いはありましたが、メーカーが推奨するプロトコルに明示的に従いました。代替方法に関しては、HSP27ノックアウトマウスを使用して、HSP27リン酸化が上皮遊走および細胞アポトーシスに関与するかどうかを示すことができます。しかし、HSP27のリン酸化は上皮創傷治癒中...
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著者らは、この研究で言及した任意の材料または方法には金融や独自の利害関係はありません。
この研究は、医学、ソウル、韓国の蔚山大学の大学の学生の研究助成(13-14)と牙山生命科学研究所、ソウル、韓国からの助成金(2014から464)によってサポートされていました。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| バイオロジカルセーフティキャビネット | CHC LAB Co.Ltd, 大田(韓国) | CHC-777A2-06 | クラスII A2型 |
| Stealth RNAi™ siRNA | Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA | RNAi siRNA; scrambled control-siRNA and HSP27-specific siRNA | |
| BEGMTM | Lonza, Inc., Walkersville, MD | CC-3171, CC4175 | Bronchial epithelium growth medium |
| プロテアーゼ阻害剤 | Sigma-Aldrich、Inc.、セントルイス、ミズーリ | 州P8340、P7626 | 1 μM ペプスタチン A, 1 μMロイペプチン、0.1 μM アプロチニン |
| ・ブラッドフォードタンパク質アッセイ | バイオ・ラッド・ラボラトリーズ、ヘラクレス、CA | #500-0001 | Bradford protein assay |
| ニトロセルロースフィルター | アマシャム、リトルチャルフォント、英国 | RPN3032D | ウェスタンブロッティングメンブレン |
| 非リン酸化HSP27 | Abcam Inc., Cambridge, MA | ab12351 | 1:1,000 希釈 (Total HSP27) |
| Phosphorylated HSP27 (Ser85) | Abcam Inc., Cambridge, MA | ab5594 1 | :1,000 希釈 HSP27 を Ser85 |
| Lipofectamine® RNAiMAX reagent | Invitrogen, Carlsbad, CA | 13-778-075 | Transfection reagent |
| Phosphorylated Akt (Ser473) | Cell Signaling Technology, Danvers, MA | No. 4060 | 1:1,000 dilution Akt was phosphorylated at Ser473 (cell survival marker) |
| Non-phosphorylated Akt | Cell Signaling Technology, Danvers, MA | No. 4061 | 1:1,000 希釈 (Total Akt) |
| Bcl-2-associated X protein | Cell Signaling Technology, Danvers, MA | No. 4062 | 1:1,000 (抗アポトーシスタンパク質マーカー) |
| GAPDH | Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA | No. 4063 | 1:1,000 ローディングコントロールマーカー(ハウスキーピング遺伝子) |
| セイヨウワサビペルオキシダーゼ結合ヤギ抗ウサギ抗体 | Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA | NCI1460KR | 1:10,000 dilution |
| OPTI-MEM | Invitrogen,カールスバッド、CA | 31985 | フェクション用還元血清培地 |
| 画像解析ソフトウェア | Olympus, Inc., Tokyo, Japan | Image-Pro Plus 5.0 | |
| Skimed粉乳 | Carl Roth GmbH + Co. KG、カールストルーエ、ドイツ | T145.2 | |
| Tris | Amresco LCC、Inc. ソロン、オハイオ州 | No-0497 | |
| 塩化ナトリウム | Amresco LCC, Inc. Solon, OH | No-0241 | |
| 6ウェル培養プレート | Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA | 140675 | 直径35.00mm/井戸 |
| 24ウェル培養皿 | Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA | 142475 Orbital | |
| shaker | N-Bioteck, Inc., Seoul, South Korea | NB1015 | |
| ウシ血清アルブミン | Santa Cruz Biotechnology, サンタクルス, CA | sc-2323 | |
| BDFACSCantoTM II | BD Biosciences, Franklin Lakes, NJ | Flow cytometry | |
| X-Ray Film | Kodak, Rochester, NY | Medical X-Ray Cassette with Green 400 Screen | |
| ウェスタンブロッティングルミノール試薬 | Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA | sc-2048 | |
| FITC Annexin V アポトーシス検出キット I | BD Biosciences, Franklin Lakes, NJ | 556547 |
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