私たちは、人間の腸オンチップmicrophysiologicalシステムを使用して長期間のためのin vitroプロトコルへの共培養腸microbiomeと腸絨毛を説明します。
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私たちは、人間の腸オンチップmicrophysiologicalシステムを使用して長期間のためのin vitroプロトコルへの共培養腸microbiomeと腸絨毛を説明します。
ここでは、人間の腸オンチップmicrophysiologicalデバイスにおけるマイクロ加工腸絨毛を有する多種のヒト腸microbiomeの長期共培養を行うためのプロトコルを記述します。私たちは、生理的機械的変形と流体せん断流れは絶えず蠕動運動を模倣するために適用されるマイクロ流体デバイス、内腸管腔毛細血管組織界面を再現します。ルーメンマイクロチャネルにおいて、ヒト腸上皮のCaco-2細胞は、「無菌」絨毛上皮を形成し、小腸絨毛を再生する培養されます。前培養した微生物細胞は、宿主微生物の生態系を確立するために、ルーメン側に接種します。微生物細胞は、絨毛の先端面に付着した後、流体の流れ及び機械的変形は、新鮮な培養培地を常時供給して未結合細菌(ならびに細菌性廃棄物)である定常状態の微小環境を生成するために再開される連続的に除去されます。拡張された共培養Fの後ROM日週に、複数の微小コロニーを無作為に絨毛の間に位置することが見出されており、両方の微生物および上皮細胞は、培養中で少なくとも1週間生存し、機能しています。私たちの共培養プロトコルは、健康と病気を組織内の人間microbiomeの役割のin vitroでの研究に容易にすることができる様々なヒトの臓器、中に見出すことができる他のホストmicrobiome生態系のための汎用プラットフォームを提供するように適合させることができます。
ヒトの腸は、微生物種の驚くほど多様な配列(<千種)と驚異的な微生物細胞の数(ヒト宿主細胞よりも10倍以上)と遺伝子(ヒトゲノムよりも100倍以上)の1を保有します。これらのヒトmicrobiomesは、栄養素および生体異物を代謝免疫応答を調節し、腸のホメオスタシス2を維持する上で重要な役割を果たしています。驚くべきことではないが、これらの多様な機能を考えると、共生腸microbiomeは広く健康と病気3を変調します 。したがって、腸のmicrobiomeとホスト微生物の相互作用の役割を理解することは、胃腸(GI)の健康を促進し、腸の障害4のための新しい治療法を探求するために非常に重要です。しかし、 インビトロでの腸モデル( 例えば、静置培養) 中に存在するのは時間の短い期間(<1日)微生物細胞が過剰に増殖し、腸の障壁を損なうためにホストmicrobiome共培養を制限します機能5。植民地と人間の腸microbiomeの安定維持が困難であるため、代理動物モデル( 例えば、無菌6または遺伝子操作マウス7)はまた、一般的にホスト腸microbiomeのクロストークを研究するために使用されていません。
これらの課題を克服するために、我々は最近、生きているヒトの腸5,8で発生したホスト腸microbiome相互作用をエミュレートする「ガット・オン・チップ」microphysiologicalシステム(左図1A)バイオミメティック人間を開発しました。腸オンチップマイクロデバイスは、柔軟な、多孔質、細胞外マトリックス(ECM)は、ヒトの腸上皮のCaco-2細胞が並んでコーティングされた膜、腸管腔毛細血管組織界面( 図1Aを模倣することによって分離された2つの並列マイクロ流体チャネルが含まれています、右)9。真空駆動型の環状リズミカルな変形は通常induc変更を模倣する生理学的な機械的変形を誘発します(右図1A)蠕動運動によって編。興味深いことに、のCaco-2細胞は、100以上の時間のための腸オンチップで栽培されたとき、彼らは自然にタイトジャンクション、頂端ブラシの境界線、基底陰窩に限定増殖性細胞と3次元(3D)腸絨毛を形成し、粘液産生は、薬物代謝活性( 例えば、シトクロムP450 3A4、CYP3A4)、および強化されたグルコースの再取り込み8を増加させました 。この「無菌」微小環境では、プロバイオティクスラクトバチルス・ラムノサス GGまたは2週間まで5,10のための宿主上皮細胞とプロバイオティクス細菌の混合物の治療上の形成がする共培養が可能でした。
本研究では、長期間腸オンチップデバイスでホスト腸microbiome共培養を実行するための詳細なプロトコルを記述します。加えて、我々はこのホスト-microbiome共培養Pの広範なアプリケーションのために考慮すべき重要な問題と潜在的な課題を議論しますrotocol。
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ガット・オン・チップデバイスの1微細加工
注:ガット・オン・チップは、透明、ガス透過性シリコーンポリマー(ポリジメチルシロキサン、PDMS)製のマイクロ流体デバイスである、二つの平行なマイクロチャネルを含む(1ミリメートル幅×150μmの高さ×1センチ長さ)柔軟で区切ら多孔性(細孔径が10μm、気孔する細孔間隔で25ミクロン)PDMS膜5,9。提供の手順以下の腸・オン・チップ(左図1A)を製造します。
マイクロエンジンの2.成長ガット・オン・チップデバイスでered腸絨毛
ガット・オン・チップマイクロデバイス3.ホスト腸Microbiome共培養
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in vitroでのヒトの腸ホストmicrobiomeのエコシステムをエミュレートするために、それはあります このような蠕動運動のような力学や流体の流れのような生理的条件下で腸内細菌とヒト腸上皮細胞の安定した長期の共培養を再構成するための実験プロトコルを開発するために必要。ここでは、生体模倣腸オンチップマイクロデバイスを利用します ( 図1A)共培養in vitroでの週間以上の期間に、人間の絨毛を生きていると直接接触して微生物細胞を生きます。腸上皮細胞は自発的に高分化絨毛を形成する場合に生理学的に関連する流体の流れおよび環状機械的変形5の存在下で2チャンネルのマイクロ流体デバイスの1チャネルにおける多孔質のECMコーティングされた膜の一方の側に培養しました。マイクロ加工絨毛はformati含むヒトの小腸絨毛の構造と機能を複製します頂端刷子縁が並ん円柱上皮細胞、移行および絨毛先端、粘液産生、強化された薬物代謝活性、および増加したグルコースの再...
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ホストmicrobiomeの相互作用を理解することは、医療を進めるために重要です。微生物細胞は、主にin vitroで哺乳動物細胞を過増殖しているためしかし、プラスチック皿または静的ウェルプレートで行われる伝統的な細胞培養モデルは、以上1-2日のために生き腸内微生物とヒト腸細胞の安定な共培養をサポートしていません。過剰成長微生物集団は急速に続いて深刻な腸のバリア機能を損なうおよび腸上皮細胞死を引き起こす代謝性廃棄物( 例えば、有機酸)の過剰量を生成する、酸素と栄養素を消費します。したがって、栄養素の枯渇を引き起こす微生物の異常増殖および微生物の廃棄物の蓄積を防止することが共培養微小環境に(数日から数週間から)長期間実行可能なホストmicrobiome共存を維持するために重要です。
、microphysiologicalをこれらの課題を克服するために、腸オンチップ装置5,8は、完全に分化したヒト腸絨毛を形成し、 インビトロでの腸管腔の定常状態の微小環境を維持するために開発されました。腸オンチップマイクロ流体...
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ドナルド・E・イングバーは、Emulate Inc.の創設者であり、同社の株式を保有し、科学諮問委員会の議長を務めています。他の著者には財務情報は開示されていません。
GFP標識大腸菌株を提供してくださったSri Kosuri氏(ハーバード大学Wyss Institute)に感謝します。この研究は、協力協定番号W911NF-12-2-0036に基づく国防高等研究計画局、契約 #HHSF223201310079C に基づく食品医薬品局、およびハーバード大学のWyss Institute for Biologically Inspired Engineeringによって支援されました。この文書に含まれる見解と結論は著者のものであり、陸軍研究所、陸軍研究所、食品医薬品局、または米国政府の公式政策を明示または黙示的に表すものと解釈されるべきではありません。米国政府は、本書の著作権表記にかかわらず、政府の目的で転載物を複製および配布する権限を与えられています。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| 25 mM グルコースと 25 mM HEPES を含む Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) | Gibco | 10564-011 | 37 °C でウォームアップします。水浴の中のC。 |
| Difco Lactobacilli MRS broth | BD | 288120 | 121 °でオートクレーブを実行します。Cで15分間。 |
| ポリ(ジメチルシロキサン) | ダウコーニング | 3097358-1004 | 15:1(w / w)、PDMS:硬化剤 |
| Caco-2BBEヒト結腸直腸癌ライン | ハーバード消化器疾患センター | ヒト結腸直腸腺癌 | |
| 熱不活化 FBS | Gibco | 10082-147 | 20% (v/v) in DMEM |
| ペニシリン-ストレプトマイシン-グルタミン | Gibco | 10378-016 | 1/100 希釈液 DMEM |
| 4′,6-ジアミジノ-2-フェニルインドール二塩酸塩 | 分子プローブ | D1306 | 核染色 |
| ファロイジン-CF647 コンジュゲート (25 units/ml) | Biotium | 00041 | F-actin 染色 |
| Flexcell FX-5000 テンションシステム | Flexcell International Corporation | FX5K | 蠕動運動 (細胞ひずみ 10%、周波数 0.15 Hz) |
| 倒立落射蛍光顕微鏡 | Zeiss | Axio Observer Z1 | Imaging、DIC |
| 走査型共焦点顕微鏡 | Leica | DMI6000 | Imaging、蛍光 |
| UVO Cleaner | Jelight Company | Inc 342 | 腸チップ |
| I型コラーゲンの表面活性化 | Gibco | A10483-01 | チップへの細胞培養用細胞外マトリックスコンポーネント |
| マトリゲル | BD | 354234 | チップへの細胞培養用細胞外マトリックスコンポーネント |
| 1 ml 使い捨てシリンジ | BD | 309628 | 細胞および培地注入剤 |
| 25 G 5/8 ニードル | BD | 329651 | 細胞および培地注入剤 |
| シリンジポンプ | Braintree Scientific株式 会社。 | BS-8000 | への注入装置 |
| VSL#3 | シグマタウファーマシューティカルズ | 7-45749-01782-6 | 8種類の共生腸内微生物の製剤 |
| 強化クロストリジウム培 | BD | 218081 | 嫌気性細菌培養培地 |
| GasPak EZ アナエロビー容器システム インジケーター付き | BD | 260001 | 嫌気性ガス発生小袋 |
| 4% パラホルムアルデヒド | 電子顕微鏡 科学 | 157-4-100 | 染色用細胞の固定 |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | 細胞の透過化 |
| ウシ血清アルブミン | Sigma-Aldrich | A7030 | 細胞の染色用ブロッキング剤 |
| コロナ処理器 | Electro-Technic Products | BD-20AC | チップ製造用プラズマ発生器 |
| ステリフリップ | ミリポア | SE1M003M00 | 全培養液の脱気 |
| ディスポーザブル血球計算盤 | iNCYTO | DHC-N01 | 手動細胞計数用 |
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