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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
全反射蛍光顕微鏡を用いて、生きたマクロファージにおける前例のない高分解能のファゴソーム形成とクロージャを3次元で可視化するための実験設定について説明します。これにより、食細胞カップの基部、伸びる偽足、および食細胞の正確な部位を監視できます。
食作用は、微生物や細胞の破片を内在化して排除するために特殊な細胞が使用するメカニズムです。これは、粒子の周りの原形質膜の伸長の原動力であるアクチン細胞骨格の深い再配列に依存しています。さらに、大きな物質の効率的な飲み込みは、細胞内コンパートメントの局所的なエキソサイトーシスに依存しています。このプロセスは非常に動的であり、食作用カップの形成中に多数の分子プレーヤーが役割を果たすことが説明されています。しかし、これらすべての分子の時間と空間の正確な制御は、まだとらえどころのないままです。さらに、ファゴソームの閉鎖の最終ステップは、RNA干渉またはドミナントネガティブ変異体による阻害がしばしばファゴサイトークカップ形成の停止をもたらすため、観察が非常に困難でした。
私たちは、全反射蛍光顕微鏡法(TIRFM)と落射蛍光を組み合わせた専用の実験アプローチを設定し、カバースリップに緩く結合した粒子の周囲に成長するファゴソーム内の偽足の伸長とその先端を段階的に監視しています。この方法により、2つの異なる蛍光標識タンパク質について、生細胞内のファゴソームの閉鎖中の偽足の先端とそれらの融合を高解像度で観察することができます。
食作用は、その後、摂取された物質の内在化および分解につながる、認識で始まり、受容体表面への材料の結合の主要な細胞機能です。このような金型細胞性粘菌とアメーバのような単細胞真核生物は、細菌に供給するための食作用を使用していますが、高等生物はプロの細胞と進化してきました。マクロファージや樹状細胞は様々な組織や臓器中の病原体に対する防御の最前線であり、抗原提示およびサイトカイン産生1-4を通じて適応免疫系を活性化することが重要です。特定の状況下では食作用は、非専門の食細胞、 例えば、内皮細胞および上皮細胞によって行うことができます。このプロセスは、開発中と正常組織のターンオーバーおよびリモデリングのための成人期に恒常性を維持することが重要です。精巣または網膜におけるこのようなセルトリ細胞として最後に、専門的な食細胞色素上皮細胞は、非常に強力な食5です。
微生物や細胞破片の劣化が食細胞の表面上の貪食受容体のクラスタリングで開始を発生ファゴソームの形成。このようなFc受容体(FcRで)又は補体受容体(CRS)などのオプソニン受容体のクラスタリングを次の下流のシグナル伝達事象は十分に特徴づけられています。しかし、Toll様受容体(TLR)を含む非オプソニン受容体、レクチン、マンノース受容体およびスカベンジャー受容体多数のもあります。これらの受容体は、マンノースまたはフコース残基、ホスファチジルセリン、およびリポ多糖1,6-9などの粒子表面上の決定基を認識する。
病原体や細胞破片認識はに結合し、その後激しいと過渡アクチンの再構築につながる食細胞受容体のいくつかのタイプのクラスタリングを伴います。細胞内compartmenのパラレル、焦点エキソサイトーシスでtsが膜張力の解放に貢献し、大きな粒子の効率的な食作用のために重要です。アクチン重合および膜変形につながるシグナル伝達事象は、単一の貪食受容体をトリガーした実験モデルで解剖しました。 FcR媒介性の食作用の間に、低分子量GTPアーゼ(RAC、Cdc42の)によって調節される強いアクチン重合があります。その下流のエフェクターの中でも、ウィスコット・アルドリッチ症候群タンパク質(WASP)は、アクチンフィラメント1,2,4,10を核とアクチン関連タンパク質複合体2/3(ARP2 / 3)の活性化をもたらします。ホスファチジルイノシトール4、5-ビスリ ン酸(PI(4,5)P 2)の現地生産は、仮足の形成を駆動する初期のアクチンの重合のために重要です。 PI(3,4,5)P 3への変換は、仮足の拡張とファゴソームの閉鎖11のために必要とされます。いくつかの経路は、PI(4,5)P 2の消失に寄与する。ホスファチジルイノシトールリン酸キナの最初に脱落ファゴソームの逮捕のPI(4,5)P 2合成からSES(PIPKIs)。第二に、それがリン酸化することができると私はキナーゼ(PI3K)をPI3Kクラスによって消費され、PI(3,4,5)P 3 12で変換されました。ホスファターゼ及びホスホリパーゼの役割はまた、哺乳動物細胞および細胞性粘菌 13,14における食作用の間にPI(4,5)P 2の加水分解およびF-アクチンの除去に暗示されています。ホスホリパーゼC(PLC)δは、ジアシルグリセロールおよびイノシトール1,4,5- トリスホスフェートにPI(4,5)P 2を加水分解する。 PI(4,5)P 2およびPI(3,4,5)P 3ホスファターゼOCRL(ロウの眼脳腎症候群)もファゴソーム形成に関与しています。 F-アクチンとその解重合の正確な局所的形成は、しっかりと空間と時間に規制され、我々は細胞内区画の募集がローカルOCRLホスファターゼを提供することが重要であることが示されている、したがって、貪食カップの底部に局所のアクチン脱重合に寄与します 機構とファゴソームの閉鎖および膜の切断のために必要とされる分子の選手が不十分なため、ファゴソーム閉鎖のサイトを可視化と監視の難しさの定義されたままです。最近まで、食作用は難しいファゴソーム閉鎖のサイトのタイムリーな可視化を行う、彼らの背面にまたはその両側に粒子を内部固定または生きている細胞で観察されました。また、固定方法は、膜とバイアス仮足の拡張と閉鎖に結果の後退を引き起こす可能性があります。これとは対照的に、我々が設定し、ここで説明しているアッセイは、私たちは偽足拡張子と内部全反射顕微鏡(TIRFM)16に基づいて、生細胞13内食作用の閉鎖ステップを、可視化することができます。この光学技術は、透明との間の界面に薄い領域でのフルオロフォアを励起するエバネッセント波を使用していますので、蓋(カバーガラス)と液体(細胞培養培地)。励起深さの厚さは、原形質膜に近い分子事象の可視化を可能にする、固体表面から約100 nmです。 TIRFMは、高い信号対バックグラウンド比を可能にし、細胞の照明に起因収集ピンボケ蛍光および細胞毒性を制限します。 TIRFMを利用して、我々は、カバースリップは、ポリ - リジンで活性化した後、IgGのオプソニン化赤血球抗体(IgG-SRBC)でで被覆された「ファゴソーム閉鎖アッセイ」を開発しました。関心の一過性の蛍光標識されたタンパク質を発現しているマクロファージは、その後のIgG-SRBCを巻き込むために許可されています。細胞は、非共有結合ガラス表面に結合している標的粒子を切り離しながら、偽足の先端部を観察し、TIRFモードで記録することができます。 TIRFの買収は、VISを可能にする、3ミクロン以上のステージをシフトした後に、落射蛍光モードでの買収と組み合わされます貪食カップのベースのualization。そのようなプロセスの間にアクチンまたはダイナミンを阻害するもののような薬理学的薬剤の添加は、分子レベルでのプロセスを分析することも可能です。 ここでは詳細に説明されたプロトコルは、RAW264.7マウスマクロファージ細胞株およびオプソニン化粒子についてであるが、実質的に、それは、他の食細胞およびビーズなどの他の標的と適合させることができます。この方法は、時間と様々な貪食過程で仮足の拡張とファゴソームの閉鎖に関与する分子の選手の空間に規制のより良い特徴付けを可能にします。
注:Lifeact-mCherryを使用したプラスミドは、17の後に生成された博士ギョームMontagnac、キュリー研究所、パリ、一種の贈り物です。
1.細胞およびトランスフェクション
注:RAW264.7マクロファージをサブコンフルエント完全培地中(RPMI(ロズウェルパーク記念研究所)1640培地に増殖させ、10mMのHEPES、1mMピルビン酸ナトリウム、50μMのβメルカプトエタノール、2mMのL-グルタミン及び10%FCS( 100ミリメートルプレートにおけるウシ胎児血清))。これらは、エレクトロポレーションによって、蛍光標識されたタンパク質をコードするプラスミドでトランスフェクトされます。日常的に約5から6×10 6個の細胞をそれぞれトランスフェクションまたは同時トランスフェクション用プラスミド20μgのまたは10μgのトランスフェクトされます。エレクトロポレーションまたはリポフェクションに基づいて、トランスフェクションの他の手段は、代替的なアプローチとして使用できることに注意してください。
赤血球の2オプソニン
注:マクロファージ粒子対象のモデルとして、ヒツジ赤血球(SRBC)を使用します。通常、35ミリメートルガラスボトムディッシュあたり約7×10 6 SRBCをが使用されます。
カバーガラスの3ポリリシンコーティング
4.グラスボトムディッシュにSRBCをの非共有結合固定
5.貪食TIRFMによって可視化
本稿に記載された実験システムを図1に概略的に示されている。蛍光タグに融合した目的のタンパク質を発現するトランスフェクトRAW264.7マクロファージは、非共有結合的に固定したIgGオプソニン化ヒツジ赤血球(SRBC)と接触するように配置されていますカバースリップ上。マクロファージはそれを巻き込むためにカバースリップからSRBCを切り離すことができます。使用TIRF顕微鏡はTIRF領域からの信号の同時取得が3μm以上のZシフト後落射蛍光モードで偽足との信号の先端に対応することができます。
図2で説明したように、原形質膜100nm以下の領域からクリーンなTIRF信号を確実に全反射蛍光の臨界角を決定することが必須である。 図3は acquisitiの発展を表します「プロトコル・エディタ」と呼ばれるモジュールを介してパラメータにライブ集録ソフトウェアに含まれています。このモジュールは、それらが処理を実行する顕微鏡に送信される前に、ユーザーがワークフローを作成し、管理することができます。取得の終わりには、ユーザは、TIFFストリームを収集します。
図4に示すように、プラスミド( 例えば 、後に生成さLifeact-mCherryを、博士ギョームMontagnacの寄贈、キュリー研究所、パリでトランスフェクトRAW264.7マクロファージにおける「ファゴソーム閉鎖アッセイ」の代表的な生細胞TIRFM映画17)アクチン重合に従います。マクロファージは、一過性に発現するプラスミドは、カバーガラスに結合したIgG-SRBCを巻き込むさせました。偽足の先端が1 SRBCの周りにカバーガラスに並置されたように、F-アクチンリングがTIRFエリアで、それが閉じられるまで次第に狭く(上部パネル)を検出しました。並行して、ぼやけたFアクチン3ミクロン(下のパネル)の上にステージをシフトした後に、落射蛍光によって検出された信号は、貪食カップの基部に解重合に対応していました。透過光(右側のパネル)で確認されたように、取得の3分後に、SRBCは完全に、内在化しました。
したがって、この方法は、適切に偽足及び貪食カップの基部に発生する分子事象の極めて末端で起こる分子事象を区別するために使用することができます。

図TIRFMによって分析」ファゴソーム閉鎖アッセイ」の1略図 。ファゴソーム閉鎖アッセイは、一過性一つまたは二つの蛍光タグ化タンパク質を発現するマクロファージを用いて行われます。マクロファージは、非共有結合ポリリシンCOA上に固定されたIgGオプソニン化SRBCを上に堆積されますテッドはカバースリップ。画像は貪食カップのベースを検出するために、ファゴソーム閉鎖のとエピ蛍光モードでサイトを検出するために、TIRFモードで記録されている。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

図2:TIRFM の臨界角の決意。 (A)「ライブ取得」を使用して、蛍光標識タンパク質を発現する細胞は、(赤領域1)フィールドの中央に配置されています。 TIRFスタックオプションを使用すると、画像が異なる角度は0.01°(赤領域2)の増分で、5℃まで0°から始まる、1つの励起波長で取得した。(B)一連の画像は、ImageJのを使用して開かれていますカラープロファイラーソフトウェアとARの平均蛍光強度関心のegion(ROI)は「スタック」と「気絶する軸プロファイル」(赤領域1)を使用して、x軸の角度の関数でプロットされている。(C)は、プロット上の蛍光のピークのx位置に対応します臨界角:1.98°(黒色の点線)。この角度の後に任意の値を使用することができます。例としては、2.00°(赤線)を選択することができる。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

ライブ取得モジュールを用いて、 図3. ワークフロープロセス:「プロトコル・エディタ」。 (A)「プロトコル・エディター」ウィンドウで、ワークフローキャンバスが作成される。(B)このプロトコルは、顕微鏡を決めた回数を繰り返すことはアクションの「ループ」を含みますユーザーによる。例として:750(1)。一つのループが含まれる:TIRFモードでの関心の蛍光タンパク質のレーザー励起と「マルチチャンネル」買収。例として:レーザー491 nmの強度50%-TIRF角度2.00(2);対物レンズ3ミクロン(3)の「Z移動」。落射蛍光モードで「マルチチャンネル」買収(4);バックTIRF地域(5)と透過光(6)中の「スナップショット」を目的の「Z移動」。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

図4. F-アクチンは、一過性プラスミドLifeact-mCherryを(博士ギョームのMoの親切な贈り物を表現RAW264.7マクロファージを用いて行ったファゴソーム閉鎖。ファゴソーム閉鎖アッセイのサイトでのポイントとして蓄積され、17後に生成さntagnac、キュリー研究所、パリ、)。プラスミド信号はTIRFエリア(上)にし、落射蛍光モード(下)で取得しました。赤い矢印は、TIRF地域におけるアクチン蓄積を示しています。 3分の透過光像は、内在化SRBCを示し、提示されています。スケールバーは10μm。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

ムービー1:それは一過性発現プラスミドRAW264.7マクロファージを用いて行った貪食カップファゴソーム閉鎖アッセイのベースから除去されている間、F-アクチンは、偽足の先端およびファゴソーム閉鎖部位に蓄積されます 。 TIRFMを用いてプラスミドTIRFエリア(上)での撮像と落射蛍光モードで(下)は、代替を実施しました37℃で3分間の光年ごとに50ミリ秒。 このビデオを見るにはこちらをクリックしてください。
著者らは開示するものは何もない。
全反射蛍光顕微鏡を用いて、生きたマクロファージにおける前例のない高分解能のファゴソーム形成とクロージャを3次元で可視化するための実験設定について説明します。これにより、食細胞カップの基部、伸びる偽足、および食細胞の正確な部位を監視できます。
実験的なアプローチについての最初の議論をいただいたアレクサンドル・ベンメラ博士(フランス、パリ)と原稿を読んでくださったジャミル・ジュブライル博士に感謝します。Nadège Kambou と Susanna Borreill は、当研究室でこの手法を用いた実験を行ったことで知られています。この研究は、CNRS(ATIPプログラム)、Ville de ParisおよびAgence Nationale de la Recherche(2011 BSV3 025 02)、Fondation pour la Recherche Médicale(FRM INE20041102865、FRM DEQ20130326518 FMAの博士フェローシップを含む)からFNへの助成金、およびJMの博士フェローシップを含むAgence Nationale de Recherche sur le SIDA et les hépatites virales」(ANRS)からの助成金によって支援されました。
| 抗羊赤血球IgG | MP生物医学 | 55806 | |
| ウシ血清アルブミン熱ショック画分、pH 7、≥98% | シグマ | A7906 | |
| セルリフター | コーニング | 3008 | |
| キュベット 4 mm | セルプロジェクト | EP104 | |
| DPBS、カルシウムなし、マグネシウムなし | サーモフィッシャーサイエンティフィッシュ | 14190-094 | 室温 |
| エレクトロバッファーキット | セルプロジェクト | EB110 | |
| 100 mm TC処理 細胞培養ディッシュ | コーニング | 353003 | |
| 遺伝子X細胞パルサー | Biorad | 165-2661 | |
| ゲンタマイシン溶液 | Sigma | G1397 | |
| ガラス底皿 35 mm コーティングされていない 1.5 | MatTek Corporation | P35G-1.5-14-C Case | |
| iMIC | TLL Photonics | 油浸対物レンズ (N 100X, NA1.49)、CO2 付き加熱チャンバー、カメラ単一光子検出 EMCCD (ElectronMultiplying Charge Coupled Device)と1.5倍レンズ | |
| Poly-L-Lysine Solution 0.1% | Sigma | P8920-100ml | Dilution at 0.01% in water |
| RPMI 1640 ミディアム グルタマックス サプリメント | ライフテクノロジー | 61870-010 | |
| RPMI 1640 ミディアム、フェノールレッドなし (10 x 500 ml) | ライフテクノロジー | 11835-105 | 37°Cで温かく;使用前のCウォーターバス |
| 羊の赤血球(SRBC) | Eurobio | DSGMTN00-0Q | Alsever緩衝液に4°Cで保存されています。C使用前 |