多くの実験系は、免疫応答におけるT細胞の発達および機能を調節するメカニズムを理解するために利用されています。ここではレトロウイルス形質導入を用いた遺伝子アプローチは、調節経路を同定することに、経済的、時間効率的な、そして最も重要なのは、非常に有益である、記載されています。
多くの実験系は、免疫応答におけるT細胞の発達および機能を調節するメカニズムを理解するために利用されています。ここではレトロウイルス形質導入を用いた遺伝子アプローチは、調節経路を同定することに、経済的、時間効率的な、そして最も重要なのは、非常に有益である、記載されています。
Helper T細胞の発生と機能は、特定の病原体を排除しながら自己免疫を防ぐ適切な免疫応答を誘導するために、厳密に制御されなければなりません。ヘルパーT細胞の発生と機能を制御するメカニズムを理解するために、さまざまなモデル生物を含む多くのアプローチが利用されてきました。しかし、マウスモデルを用いた研究は、遺伝的、細胞的、生化学的システムが利用可能であるため、非常に有益であることが証明されています。多くの研究室で使用されているマウスの遺伝的アプローチの1つに、一次ヘルパーT細胞のレトロウイルス形質導入があります。これは、比較的容易であるため、強力なアプローチであり、分子生物学と免疫学の基本的なスキルを持つほぼすべての研究室にアクセスできます。したがって、野生型または変異型の複数の遺伝子のヘルパーT細胞の機能について容易に試験し、その重要性と作用機序を理解することができます。このアプローチを最適化し、ここでは、高力価レトロウイルスの産生、初代マウスヘルパーT細胞の単離、レトロウイルスによるそれらの形質導入、および異なるヘルパーサブセットへの分化のためのプロトコルについて説明します。最後に、このアプローチの使用については、ヘルパーT細胞の発生と機能を制御する経路を制御するためにマイクロRNA(miRNA)が利用するメカニズムの解明で説明しています。
免疫反応は、感染を排除するために高度に制御されなければなりませんが、自己免疫につながる自己組織への攻撃を防ぐ必要があります。ヘルパーT細胞は免疫応答の調節に重要な役割を果たしており、その発生と機能を理解するために多大な努力が払われてきました(最近のいくつかのレビュー1-3で示されています)。しかし、多くの疑問が残されており、ヘルパーT細胞の発生と機能を制御するメカニズムを研究するために多くのアプローチが利用されてきました。これらは、in vitro細胞培養システムの使用から動物全体まで多岐にわたります。細胞培養システム、特に細胞株を使用する細胞培養システムには、使いやすさと、高度な生化学分析を行うための大量の材料を生成する能力という利点があります。しかし、免疫応答で発生する実際の状態を再現する能力が限られていることに苦しんでいます。対照的に、全動物実験は関連性という利点がありますが、操作の難しさや正確な制御を行う能力に加えて、多額のコストと倫理的影響に苦しむ可能性があります。それにもかかわらず、今日のヘルパーT細胞研究の大部分は、細胞株が動物全体で発生する正確なステップを複製できないため、初代T細胞を含む全動物実験の使用を依然として必要としています。したがって、非常に情報量の多い費用対効果の高いアプローチを利用することが不可欠です。
遺伝学はヘルパーT細胞の発生と機能を研究するための強力なツールの一つですが、遺伝子ノックアウトや導入遺伝子を含む従来の方法は時間と費用がかかるため、小さな研究室では手の届かないことが多いです。しかし、レトロウイルス形質導入は、特定の遺伝子産物のメカニズムを研究するための強力で迅速、かつ費用対効果の高い遺伝的アプローチを提供します。そのため、ヘルパーT細胞の発生と機能を研究する論文で一般的に使用されています。
ヘルパーT細胞のレトロウイルス形質導入の手順を最適化しました。pMIG(Murine Stem Cell virus-Internal ribosomal entry site-Green fluorescent protein)レトロウイルス発現ベクターを利用しており、レトロウイルスの長末端反復(LTR)4から目的の遺伝子をクローニングして発現させることができます。さらに、挿入された目的遺伝子の下流には、内部リボソームエントリー配列(IRES)とそれに続く緑色蛍光タンパク質(GFP)遺伝子があるため、形質導入された細胞はGFPの発現を容易に追跡できます。このベクターはもともとマウス幹細胞ウイルス(MSCV)ベクターに由来し、LTRのリプレッサー結合部位に変異が含まれており、サイレンシングに耐性があるため、ヘルパーT細胞5,6を含む多くの細胞タイプで高発現しています。高力価レトロウイルスの作製には、ヒト胚性腎臓(HEK)293T細胞の簡単な一過性トランスフェクションプロトコルと、MIGベクターとレトロウイルスGAG、Pol、およびEnv遺伝子を発現するヘルパーウイルスベクターが必要です。このために、pCL-Ecoヘルパーウイルスベクター7は、高力価の複製、無能なレトロウイルスの産生にうまく機能します。
ここでは、レトロウイルス産生と初代マウスT細胞の形質導入のためのこれらのプロトコルが説明されています。また、このアプローチを使用して、ヘルパーT細胞の分化を制御する遺伝子発現のmiRNA制御を研究する結果の一部に加えて、miRNAは長さが約22ヌクレオチドの小さなRNAで、メッセンジャーRNAをコードするタンパク質の相同配列を標的とし、翻訳と誘導を抑制することにより、転写後的に遺伝子発現を調節しますメッセージの不安定性 8,9.miRNAは、発生遺伝子の制御に重要な役割を果たします。miRNAを産生できない胚は非常に早い段階で死滅するため、発生の最も早い段階で不可欠です10。さらに、miRNAは、多くの組織の後の発達において重要です。それらは、発生プログラム1に必要な遺伝子の発現を微調整することで機能すると考えられています。ヘルパーT細胞では、miRNAは複数の役割を果たし、制御性T細胞(Treg)の発達に必要です11-14。私たちは、Treg分化のmiRNA制御のメカニズムを解剖する手段としてレトロウイルス形質導入を使用しました15。このような研究を通じて、レトロウイルスを介した過剰発現によって重要な個々のmiRNAが決定されました。その後、これらのmiRNAによって制御される関連遺伝子を同定し、ヘルパーT細胞の分化におけるmiRNAによって制御される分子経路を理解しました。
これらのプロトコルで実行されるすべてのマウス作業は、動物のプロジェクトライセンス6965分の70の下で動物科学的手続法、英国に従って実施しました。
1.レトロウイルスの生産
進む前に遺伝的に改変された生物および哺乳動物細胞におけるレトロウイルスの使用を製造するために必要なすべての承認を取得。
プライマリナイーブCD4 + T細胞の2の単離
3.レトロウイルス活性化CD4 + T細胞の形質導入および特異的Tヘルパーサブセットへの分化
この実験系の成功は、T細胞および高力価のレトロウイルス調製物の純度の高い集団を必要とします。代表的な結果は、成功した実験の例として示されている。 図1ナイーブヘルパーT細胞単離プロトコールの各段階で前後選択集団の典型的な純度を示す。 図2及び図3は、GFPの発現を介して、レトロウイルス産生の分析を示しますトランスフェクトされたHEK 293T細胞において( 図2)および形質導入T細胞( 図3)。 HEK 293T細胞のトランスフェクション効率は、異なるレトロウイルス構築物で有意に変化し得るが、これは多くの場合、GFP + T細胞の数で観察レトロウイルス産生のレベルと相関しません。また、GFP + T細胞の数は、偏光状態に依存して変化し得ます。また、メートルGFPのEAN発現レベルと集積ウイルスコピーの数に応じて変化することができ、挿入された遺伝子、転写の組込み部位の効果、およびウイルスの転写に影響する転写後調節機構。
最後に、 図4は、miRNAののmiR-15bは/ 16が過剰発現されたときに我々は、ヘルパーT細胞の分化と観察しているいくつかの典型的な結果を示しています。これらの結果は、そのように真の効果は、ヘルパーT細胞の異なる調製物を使用して複数回の反復実験の統計分析によって実証されている必要があり、個々の実験内で発生することができ変動のいくつかを示しています。これらの実験において、Th2応答は、それらがTh1応答の傾向があるので、ここで使用されるC57BL / 6行目に観察することは困難です。同様に、IL-9染色は、バックグラウンドを上回る検出するのが困難であることができます。したがって、アイソタイプコントロールを行い、正しいGAを確保するために適切な補償を設定することが不可欠ですサイトカイン発現のティン。我々の結果では、我々は、miR-15bは/ 16が部品のRictorおよびmTOR 15の発現を抑制することを通じてシグナル伝達経路のmTORを阻害することにより、iTregの誘導を増強することを発見しました。 miR-15bは/ 16は時々、個々の実験でTh0の、のTh1およびTh17細胞の分化に影響を与えることができるが、複数回の反復実験で調べ有意な影響はありません。対照的に、のmiR-15bは/ 16過剰発現は有意に(18を参照する参照)TH9の分化を抑制しません。

分離の各段階でのヘルパーT細胞の図1.標準的な純度。示された抗原の結果代表的なフローサイトメトリーは、前方散乱(FSC)および側方散乱光(SSC)プロットに指定された生細胞のゲートから示されています。 (A)前後のCD4陰性選択。 CD4の発現プロファイル、CD8a、およびMHCIIが示されています。これらは、ヘルパーT細胞の濃縮および細胞傷害性T細胞およびMHCクラスIIを発現する細胞の損失を示します。良好な精製は、この段階で〜90%のCD4 + T細胞をもたらすはずです。 (B)CD25選択。左側にはCD4、CD8a、およびMHCIIの発現プロファイルであり、右側にCD4とCD25の発現は、事前と事後選択をプロファイルしています。この時点で> CD25陰性に選択された細胞の95%がCD4 + CD25であるべきです- 。 (C)CD62L選択。 CD4、CD8a、およびMHCII発現プロファイルは、左側に示されています。右側にはCD62LおよびCD44のための発現プロファイルは、ポスト、選択された細胞のCD4とCD62L発現プロファイルと一緒に前後のCD62L選択したセルについて示されています。 CD62L選択した後、実質的に全てのメモリセル(CD44 +)は、10〜15%のエフェクター細胞(CD62L 低)が含まナイーブヘルパーT細胞の高度に濃縮された集団を残して除去されます。すべてのためにFACSプロファイルは、特定のパラメータのための同等の設定とスケールが全体で維持しました。数字は、ゲート集団内の細胞の割合を表します。最初の選択後の細胞の大きさのわずかな減少は、プロトコル中の機械的ストレスにおそらくある。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

レトロウイルストランスフェクションHEK 293T細胞の図2分析。GFPの発現は、ウイルス培養上清を回収した後、非トランスフェクトまたはトランスフェクトし、分析のいずれかであったHEK 293T細胞において示されています。 GFP分析はFSCと最初のパネルでSSCプロット上のゲートからの生細胞で行いました。数値は、ゲート領域内のGFP +細胞の割合を表します。典型的なトンransfection効率は30から90までパーセントの範囲である。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

レトロウイルス形質導入されたヘルパーT細胞の図3.分析。GFPの発現は3日間Th0を、のTh1、Th2を、TH9、Th17細胞およびTregの偏光状態の分化した後、レトロウイルス形質導入ヘルパーT細胞において示されています。分析は、FSC / SSCパネルに示されているライブや活性化細胞にゲートされました。形質導入効率は、構造と偏光状態に応じて10-75%の間で変化することができます。同様に、GFP発現の平均蛍光強度が変化することができる。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
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異なる偏光条件でのヘルパーT細胞の分化に対するのmiR-15bは/ 16過剰発現の図4.影響。代表的サイトカインプロファイルは、 図3からの細胞のGFP +集団に示されている。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

表1: これらのプロトコルで使用されるバッファの Excelスプレッドシートとしてこの表をダウンロードするにはこちらをクリックしてください。
| ヘルパーT細胞の分極条件 | ||
| Th0を | 抗IL-4 | 5μg/ mlの |
| 抗IFN-γ | 5μg/ mlの | |
| Th1 | 組換えIL-12 | 20 ng / mlで |
| 抗IL-4 | 5μg/ mlの | |
| Th2の | 組換えIL-4 | 40 ng / mlで |
| 抗IFN-γ | 5μg/ mlの | |
| TH9 | 組換えTGF-β | 2.5 ng / mlで |
| 組換えIL-4 | 40 ng / mlで | |
| 抗IFN-γ | 10μg/ mlの | |
| Th17細胞 | 組換えTGF-β | 2.5 ng / mlで |
| 組換えIL-6 | 50 ng / mlで | |
| 抗IFN-γ | 5μg/ mlの | |
| 抗IL-4 | 5μg/ mlの | |
| 抗IL-2 | 5μg/ mlの | |
| Tregは | 組換えTGF-β | 2.5 ng / mlで |
| 組換えIL-2 | 5 ngの/ mlの | |
表2: ヘルパーT細胞サブセットの偏光状態。
その開発と機能は、多くの場合、重要な調節因子の発現レベルによって決定される遺伝子のレトロウイルス媒介過剰発現は、ヘルパーT細胞における機能を解析するための強力な方法です。大幅に内因性遺伝子のもの上記の発現レベルは、多くのアーチファクトを生じることがあるので、しかし、結果の慎重な解釈が必要です。従って、この技術は、機能の妥当性を確認するために他のものと組み合わされるべきです。例えば、過剰発現が可能な場合のsiRNAまたは遺伝子ノックアウトを使用して発現低下によって補完されるべきです。 miRNAにより、我々は、miRNA 15のための競合的阻害剤として作用した部位を標的人工のmiRNAを過剰発現したウイルスを使用することにより、ブロッキングのものと過剰発現実験を補完します。レトロウイルス形質導入された細胞はまた、RNAおよびタンパク質の分析を伴う生化学アッセイにおいて利用することができます。しかし、これらの実験の主な制限は、形質導入解像度の効率であります形質導入および非形質導入細胞の混合集団でulting。したがって、これらのアッセイは、最も可能性の高いGFP +集団のソートが必要になります。最後に、 インビトロ分化アッセイは、 インビボ実験と結合されるべきであり、これを達成することができる一つの方法は、養子マウスに形質導入したT細胞を転送し、それらの分化し、免疫応答に対する効果以下のことです。
このシステムの主要な制限の一つは、レトロウイルスキャプシドにパッケージングすることができるRNAゲノムの大きさです。我々の経験では、良好なウイルス産生を与えるMIGレトロウイルスシステムの最大挿入サイズは3〜3.5キロバイトです。それらが悪いウイルス力価を与えるしたがって、より大きな遺伝子は、このシステムを用いて分析することができません。このシステムは、遺伝子研究の広範囲に有用であるのでしかし、ほとんどの遺伝子は、このサイズよりも小さいです。
これらprotoco内のレトロウイルス形質導入すると、いくつかの選択肢LSが使用されています。多くの研究者は、安定したレトロウイルス遺伝子(例16を参照)を発現するパッケージング細胞株を利用しています。しかし、我々は、PCL-エコヘルパーウイルスベクターの同時トランスフェクションを用いて標準HEK 293T細胞を使用して最高の力価を得ました。ナイーブヘルパーT細胞の単離は、磁気ビーズと細胞分離カラムのプロトコルではなく、細胞選別によって達成することができ、これは、細胞ソーターへのアクセスを必要とし、ソート時間のコストは、典型的には、ビーズ試薬よりも高いです。最後に、異なるサブセットにヘルパーT細胞を区別するために使用される活性化条件のバリエーションが存在します。例えば、長すぎるために細胞のTCR刺激は、Tregの誘導条件への曝露の前に誘導16を阻害することができます。レトロウイルス発現細胞の刺激により誘導される細胞分裂を必要とするので、これは問題となり得ます。それにもかかわらず、我々はO / N ACTIVで、このプロトコルを使用して効率的なTregの誘導を発見しましたレトロウイルス形質導入に先立ってエーション。
これらのプロトコルの中で、成功したアプリケーションは、いくつかの要因が必要です。高力価のレトロウイルス調製物は、非常に高い品質のDNAと正確に準備された2×HBS HEK 293T細胞の効率的なトランスフェクションを必要とする重要です。トランスフェクトされたDNAの良好な発現は、細胞があまりに疎または密である場合、細胞が活発に増殖している、これが阻害されることを必要とするので、また、HEK 293T細胞の細胞密度はトランスフェクションの時点で約50%であることが必要です。トランスフェクション時の最適な密度の細胞を、ウイルス回収ステップの間にいくつかの点で合流に達する必要がありますが、彼らはすべての方法最後の収集まで、高力価のウイルスストックを生産継続します。ヘルパーT細胞の効率的な分化は、良好なセルの品質がので、単離された細胞は、 図1に示した純度であることを確認が必要である。同様に、細胞の品質は、マウスFRに依存しますそれらは単離されたOM。これらの研究のために、我々は6〜8週齢のC57BL / 6マウスを使用しています。古いマウスは少ないナイーブ細胞を持つことができ、他の株は、それらの分化に異なる場合があります。上述したように、例えば、BALB / cマウスは、C57BL / 6マウス17よりTh2応答をより受けやすいように、C57BL / 6 T細胞はTh2応答を誘導することは困難です。また、分化条件のいずれかが研究室に研究室から若干異なる場合があり、そして様々な偏光条件でのサイトカイン濃度を滴定する必要があるかもしれないので、遺伝子の過剰発現の効果は、サブ最適な条件で明らかになるであろう。最終的に、細胞増殖の過剰発現遺伝子の作用や偏光状態は、目的の遺伝子のように測定することの効果は、偏光試薬のタイミングおよび濃度を最適化する必要ができる形質導入効率に影響を与えることができます。すべてのこれらの要因を最適化すると、このシステムでの有益な結果をもたらすはずです。
著者らは、この作品の出版に相反する利害関係はありません。
この作業は、バイオテクノロジーおよび生物科学研究評議会(BBSRC)の助成金(BB/H018573/1)およびBDバイオサイエンスの助成金によって支援されました。
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| RPMI | Sigma | R8758 | |
| DMEM | Sigma | D5671 | |
| ペニシリン ストレプトマイシン溶液 | Σ | P4333 | |
| L-グルタミン | Σ | G7513 | |
| &β;-メルカプトエタノール | Σ M3148 | ||
| DPBS | Σ | D8537 | |
| MIG ベクトル | Addgene | Plasmid 9094 | |
| pCL-Ecoベクター | Addgene | Plasmid 12371 | |
| Cell strainer | BD Falcon | 352350 | |
| Magnetic beads mouse CD4 cell kit | Invitrogen (Dynabeads) | 11415D | |
| ストレプトアビジンビーズ | Miltenyi Biotech | 130-048-102 | |
| MS細胞分離カラム | Miltenyi Biotech | 130-042-201 | |
| LS細胞分離カラム | Miltenyi Biotech | 130-042-401 | |
| CD25 Biotenylated MAb | BD Biosciences | 85059 | クローン7D4 |
| CD62Lバイオテニル化MAb | BD Biosciences | 553149 | クローン MEL-14 |
| ポリブレン (臭化ヘキサジメトリン) | Sigma | 107689 | |
| Anti-CD3 | eBiosciences | 16-0031-85 | clone 145-2C11 |
| 抗CD28 | eBiosciences | 16-0281-85 | クローン37.51 |
| 抗IL-4 | BD Biosciences | 559062 | クローン 11B11 |
| 抗IFN-γ | BD Biosciences | 559065 | クローン XMG1.2 |
| 抗IL-2 | BD Biosciences | 554425 | cloneJES6-5H4 |
| 組換えIL-12 p70 | eBiosciences | 14-8121 | |
| 組換えIL-4 | BD Biosciences | 550067 | |
| 組換えTGF-β | eBiosciences | 14-8342-62 | |
| 組換えIL-6 | eBiosciences | 14-8061 | |
| 組換えIL-2 | eBiosciences | 14-8021 | |
| PMA | シグマ | P8139 | |
| イオノマイシン | シグマ | I0634 | |
| ブレフェルジン A | eBiosciences | 00-4506 | |
| パラホルムアルデヒド | シグマ | 16005 | パラホルムアルデヒドは有毒ですので、取り扱いには十分な注意を払ってください |
| Foxp3染色バッファーセット | eBiosciences | 00-5523 | |
| 抗CD4 FITC | eBiosciences | 11-0041 | クローンGK1.5 |
| 抗CD8a perCP-cy5.5 | eBiosciences | 45-0081-80 | 53-6.7 |
| 抗MHCII PE | eBiosciences | 12-0920 | クローンHIS19 |
| 抗CD25 PE | eBiosciences | 12-0251-82 | クローンPC61.5 |
| 抗CD62L PE | eBiosciences | 12-0621-82 | クローンMEL-14 |
| 抗CD44 APC | eBiosciences | 17-0441 | クローンIM7 |
| 反IFN-γ FITC | eBiosciences | 11-7311-81 | XMG1.2 |
| Anti-IL-4 PE | BD Biosciences 554435 | クローン11B11 | |
| Anti-IL-9 PEまたはAPC | eBiosciences/Biolegend | 50-8091-82/514104 | クローンRM9A4 |
| Anti-IL-17a PE | BD Biosciences 559502 | クローンTC11-18H10 | |
| Anti-Foxp3 APCまたはPE | eBiosciences | 17-5773-82/12-5773-80 | クローンFJK-16s |
| NaCl | Σ | S7653 | |
| KCl | Σ | P9333 | |
| Na2HPO4-2H2O | Σ71643 | ||
| デキストロース/グルコース | ΣG7021 | ||
| HEPES、遊離酸 | ΣH3375 | ||
| NH4Cl | Σ | A9434 | |
| EDTA | シグマ | D2900000 | |
| KHCO3 | Sigma | 237205 | |
| CaCl<サブ >2 | シグマ | C5670 |