有限要素解析は、荷重がかかった構造物の機械的性能を調査するためによく使用されるツールです。ここでは、ゼブラフィッシュの顎の生体力学のモデリングにその使用を適用します。
有限要素解析は、荷重がかかった構造物の機械的性能を調査するためによく使用されるツールです。ここでは、ゼブラフィッシュの顎の生体力学のモデリングにその使用を適用します。
骨格の形態形成は、発生中に厳密に制御された細胞の振る舞いを通じて起こります。多くの細胞タイプは、機械的な緊張に応答してその振る舞いを変化させます。骨格関節は動的な機械的負荷を受けます。有限要素解析(FEA)は、材料や構造が機械的な入力にどのように反応するかを予測できる計算手法であり、エンジニアリングでよく使用されます。システム全体(この場合はゼブラフィッシュの顎の骨格)を小さな「有限要素」のメッシュに分割することにより、FEAを使用して、外部荷重に対する構造の機械的応答を計算できます。結果は、最大主ひずみと最小主ひずみの位置を示す「ヒートマップ」など、さまざまな方法で視覚化できます(正の主ひずみは引張を示し、負の主ひずみは圧縮を示します。最大値と最小値は、最大株と最小株を参照します。これらは、顎のどの領域、したがってどの細胞が顎の動き中に特に高い張力または圧縮負荷を受ける可能性が高いかを特定するために使用でき、したがって、機械的ひずみと細胞の挙動との関係を特定するために使用できます。このプロトコルでは、ゼブラフィッシュの下顎を実例として、筋骨格系の共焦点画像データから有限要素モデルを生成する手順を説明します。このプロトコルは、1)筋骨格系コンポーネントの染色、2)筋骨格系コンポーネントのイメージング、3)3次元(3D)表面の構築、4)有限要素のメッシュの生成、5)FEAの解決、最後に6)魚の顎の動きで見られる実際の変位と比較することにより結果を検証するという一連のステップを通じて読者を導きます。
有限要素(FE)モデリングは、計算構造体1に作用するひずみの大きさと位置を計算し、マッピングすることができ工学的手法です。このモデルは、「有限要素」のメッシュで表される立体構造で構成され、分析の最終結果は、メッシュ、機械の大きさや位置の要素の構造及び数を含む多くの因子によって支配されます負荷や材料特性。材料特性は、負荷の与えられたタイプの下で、材料の挙動の特定の側面を説明します。試料を延伸したときポアソン比は、その長さの材料の幅の比例的減少を説明しながら、ヤング率(E)は、材料の弾性を記述する。 FEモデルは、「アカウントに構造に関する固有の入力データを取ることによって、モデルに作用する変位、応力、圧力、歪みなどの変数のさまざまを計算することができます; sの形状、位置、および負荷の大きさと特定の材料特性。
FEモデルは、広く工学2にますます3整形外科及び古生物学アプリケーション4のために使用されます。開発中の生体力学的力は、細胞応答5-8を活性化する多くの細胞における刺激として作用することが知られており、臓器システムを開発中での相対的な位置および機械的刺激の大きさの両方を予測するために有用であるが、現在、FEモデルはほとんど使用されていますゼブラフィッシュの開発のため。
軟骨および骨の両方が機械受容性材料であることが示されています。例えば、 インビトロでの圧縮は、張力が骨形成9のために必要であることが示されている一方で、軟骨形成経路を活性化することが見出されています。 FE解析(FEA)は、foの骨の間に骨格要素に作用するものを含め、生物試料に作用する菌株をモデル化するために利用されてきましたrmation 10。他の開発アプリケーションは、それが理論的な生体力学的な力11,12にさらされた後の関節の形状を予測するとひよこ膝関節の形態形成8の間に存在する株のパターンを表示するために、その使用を含みます。
このプロトコルは、開発組織の力学を理解することを視野に入れて共焦点画像から3次元サーフェス、メッシュおよび有限要素モデルを生成するの経験を共有することを目的としています。我々はまた、 生体内での実関節変位情報を取り込むのにFEモデルを検証する方法を示しています。我々は模範としてゼブラフィッシュ顎を使用しながら、同じ技術は筋骨格系の構造の3次元情報を、共焦点又は多光子イメージングにより得ることができるため、任意の小さな生物学的システムで使用することができます。
プロトコル内のすべてのステップは、ブリストル大学の動物のケアの福祉ガイドラインや英国内務省のものに従ってください。
筋骨格解剖学の1可視化
注:筋肉を定量化するために、筋肉の添付ファイルの正確な配置を識別するために、骨格要素の形状を可視化するために、免疫染色(セクション1.1)(筋肉を明らかにする)骨格筋ミオシンのための適切な年齢で魚やII型コラーゲン(可視化します軟骨)。筋肉の添付ファイル(1.2節)の位置を視覚化するために、GFP 15:軟骨と遅いミオシン重鎖レポーターsmyhcを可視化するためにmCherryを13,14:別の方法として、例えば、コラーゲンa1のレポーターCOL2A1トランスジェニック蛍光レポーターラインを使用して、筋骨格解剖学を視覚化します。
軟骨や筋肉をマーク代替行が等しく十分に仕事ができます。
2. 3Dサーフェスの生成
3. FEモデルで使用される筋力の計算
4.メッシュの生成
5.有限要素のModエル建設
顎変形/変位距離の6検証
筋肉( 図1A)および軟骨( 図1B)、またはトランスジェニックレポーター( 図1C)のイメージングのための免疫染色は、顎の3D構造は、関連する筋肉組織とともに、可視化することを可能にします。高解像度で画像化することにより、顎の三次元形状( 図2)と位置と負荷の配置( 図3)の両方を捕捉するモデルを構築することが可能でした。高速ビデオキャプチャを通して見たin vivoでの変位( 図4) に活用し、我々は、モデルの動きの範囲が現実的な範囲内であったことを確認しました。
実行するとFEモデルは、このような応力( 図5A)、最小および最大主ひずみ( - K 図5B)のようなデータの範囲を表示するために使用することができます。これらの結果は、3次元のあります 5I、5I '、' '、5E'(図5E関連するビュー( 図5F、5G、5J、5K) を得るために回転させ、デジタル切片( 図 5E、5I)モデルは、細部の微細パターンを見るために拡大することができますので、ensional '')を表示する方法を説明したモデルを通じて、応力、ひずみや圧力変化のパターン。モデル(図示せず)からの定量的データを抽出することも可能です。モデルを検証し、最も正確な材料特性を使用することにより、負荷および形状をメッシュFEモデルの開発の窓の間に細胞によって経験される機械的な環境の最良の推定値を探索するために使用することができます。モデルの結果は、直接細胞挙動と遺伝子発現の20の変化と比較することができます。
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図1:5 DPFでのゼブラフィッシュ下顎の筋骨格系の要素の代表的な画像 5dpf幼虫の下顎の代表的な共焦点スタックは、すべてのすべての骨格筋ミオシンを染色A4.1025の免疫染色トップに前方(A)(B)で示しますトランスジェニック記者のCOL2A1を表現するライブ幼虫からすべての軟骨(C)スタックをマークII型コラーゲンの免疫染色:GFP遅筋(緑):mCherryを軟骨(赤)とsmyhcをマーク。 IA:intermandibularis前部、PH:分度器hyoideus、AM:転下顎、HI:hyoideus HI、劣っ:hyoideus優れ、CH:胸骨舌骨筋、MC:メッケル軟骨、PQ:Palatoquadrate、CH:舌骨角のは、 拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。この図の。


図3: 制約と力のベクトルを示す代表的メッシュ (A)、口閉鎖と5 DPFの幼虫のための代表的なメッシュ。(B)口の開口部。白丸は、モデルが制約された場所を表し、ここでの寸法( 例えば、XおよびYまたはX、YおよびZ)。白い線が白い矢印で示される筋力のベクターを用いて、筋肉の位置を示します。レッドは、軟骨やイエローゾーン間を示します。この図は、以前ブラントら 15に発表された補足資料から変更されている。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

図4: 感度試験 FE-モデルが異なる軟骨およびゾーン間のヤング率のため5dpfゼブラフィッシュで顎変位をシミュレートします。 (ミクロンで閉じに開放)顎変位が顎にマークされています。カラーキーを使用して記録しました。各モデル(- L)が異なる軟骨の組み合わせ(C = 1.1、3.1、または6.1メガパスカル)またはゾーン間(0.25、0.5、0.75、または1 MPaでのI =)特性を有しています。 、すなわち 、水平方向の黒い矢印が(黒い縦の矢印で示す)メッケル軟骨の先端に顎変位の値を強調しています。5のビデオからMとNの静止画幼虫示す最小DPF、すなわち、顎は(M)を閉鎖し、最大重ね合わせた2(O)と(N)は、完全にオープンジョー- O上の白い線は(43ミクロンの)変位を表します。この場合、0.25(A)ベストマッチのゾーン間で1.1の相対的な軟骨特性活魚(O)で見られる変位。 ALこの図のパネルは、以前ブラントら 15で公開されている。 より大きな輸出自主規制を表示するには、こちらをクリックしてください。この図のイオン。

図5:FEモデルからの代表的なデータ 5 DPFの幼虫に適用されるすべての筋肉のFE-モデルシミュレーション(A - C)。 (A)ミーゼス(EMaxmin)(B)最小主ひずみ(E最小P、μɛ)(C)最大主歪(Eマックス。P.、μɛ)。顎の開口部の間の最大値と最小主ひずみのFE-モデルシミュレーション。 (D - K):最大主歪(EマックスP.、μɛ)(D)腹側顎図、(E)腹側ジョイントビュー(E)内はメッケル軟骨を通して近位-遠位セクションの位置を示しジョイントとゾーン間(E ')及び(E' ')において、それぞれ。 (F):横顎ビュー。 (G):横方向の関節ビュー。 (H - K):最小主ひずみ(EミンP、μɛ。)中の(H)腹側顎図、(I)腹側ジョイントビュー。 ( 私は )メッケル軟骨ジョイントを介して近位-遠位セクションの位置を示しており、(I ')および(I' ')は、それぞれ(J)でのゾーン間:横顎ビューを。 (K):横方向の関節ビュー。この図は、以前ブラントらに掲載されました。15。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
| 筋線維の数 | 筋線維面積( 平方 μm) | 筋肉群の面積(μmで2) | 力(N) | |
| 5 DPF intermandibularis前方 | 5 | 23.8 | 119 | 4.76e-6 |
| 5 DPF分度器hyoideus | 6 | 23.8 | 142.8 | 5.71e-6 |
| 5 DPF内転筋下顎 | 9 | 23.8 | 214.2 | 8.57e-6 |
表1: 筋肉の定量化。40 nNの個/μm2(参照17から採取された単位面積あたりの値)を使用して、DPF 5でIntermandibularis前部、転下顎と分度器Hyoideusの平均筋力を計算。 (Lorga ら 、2011)(n = 3)でした。
有限要素モデルは、骨形成10を受けるものと緊張下にある骨格要素の領域を関連付けるために、ならびに軟骨内骨化や関節の形態形成8,12,21時のひずみの下の領域をマッピングするために使用されてきました。他の研究はまた、共同開発11,12の間に変更を複製するための理論的な成長モデルを適用することができました。ここでは、比較的単純なシステム、ゼブラフィッシュ顎20のためのFEモデルを構築するためのプロトコルを示します。複数の組織を研究するために、このようなCTスキャン22、トランスジェニック系統の共焦点イメージングまたは免疫染色ゼブラフィッシュなどのFEモデルのための生の画像を収集する別の方法とは異なりできます。それは、したがって、軟骨に関連する筋肉の接続点に直接情報を提供することができます。脊椎動物のモデルの中ではゼブラフィッシュは、遺伝的および薬理学的操作に特に適しています。ゼブラフィッシュのためのFEモデルの生成頭蓋顔面の軟骨は現在、関節の形態形成におけるバイオメカニクスと遺伝学の間の相互作用のさらなる研究の可能性を開きます。
FEモデルを作成するプロセスの重要なステップの数があります。まず、システムの正確な三次元表現を生成しています。これは明らかに境界を定義するために十分な高解像度で撮影する必要があります。でも、高分解能イメージングとの良好な一面は、いくつかの領域を平滑化する必要があるかもしれ作ることに注意してください。もう一つの重要なステップは、負荷と正しい制約の正しい配置を定義しています。不十分な制約モデルは、解決に失敗し、負荷の不正確な配置は、異常な動きの原因となります。
生データから生成された表面( 図2B)をメッシュすることが困難であるように、生データのいくつかの処理( 図2)が必要です。我々は、ガウスフィルタを使用してデータ( 図2Cを濾過しました)、我々は3D表面に変換することができるきれいなアウトラインのセットを生成するために、曲線のいくつかの手動の平滑化を行いました。あまりにも多くの平滑化は、その機能の多くを失った「溶融」表面を生成することができます。小さすぎる要素サイズを選択すると、計算集約的である大きすぎるメッシュを作成するように正しい要素サイズを選択すると、反復的なプロセスです。しかし、あまりにも大きな要素サイズを選択すると、構造の正確な形状を再現するために失敗したメッシュを生成します。正しいメッシュは顎の正確な形状を捕獲し、正解に収束、顎の変位を用いて検証最小の要素サイズを有していました。また、異なる年齢及び種は実質的に異なる特性を有するように、より良い正確な変位をエミュレートするために、材料特性や負荷の計算を変更する必要があるかもしれません。
常に仮説モデルであり、aには限界があることを覚えておくことが重要ですssumptionsはFEモデルを実行するために作られました。 1つまたは少数のサンプルをモデル化する際には、個人間の小さな変動である可能性があるように代表的なサンプルが選択されることを確実にするために重要です。唯一の顎要素と筋肉の一部が含まれていたように、モデルは、ゼブラフィッシュ頭蓋顔面筋骨格系の簡易版です。そのため、制約は、モデル化された顎要素が頭蓋骨の残りの部分と接続する場所を考慮して配置されるように持っていたモデルは、人工的に「スペース」でそれを修正するために中央に拘束されました。この人工的な制約は、それ自体が分析されていなかった舌骨角のようなモデルから引き出された解釈に影響を与えませんでした。頭蓋顔面構造のより多くを含めることは、そのようなsternohyals及びその添付軟骨23、として特に他方のジョー開く筋肉がモデルに追加されたかもしれないが、制限は、有限要素ソフトウェアで実行する大きなモデルの機能が含まれています。
S = "jove_contentは">別の制限は、これは、ばね8を挿入することによって達成することができるものの、我々は、靭帯の挿入をモデル化していないことです。この場合には作られたもう一つの仮定は、モデルが直線的に振る舞うというものでした。モデルの株の大きさは、発行されたモデルのものと同等であったと株が3500を下回ると制約と筋肉の付着点から離れ-5000μɛの上にあることで、in vitroでの細胞10,24に適用されます。したがって、モデルの関連領域での株は線形モデルの許容範囲内にあると考えられました。軟骨は、線形材料として完全に動作しないと、以前のモデル25内の流体挙動の分析を可能に多孔質弾性材料としてモデル化されています。ローカルノードのクラスタ間で筋肉の付着点を拡散することは、ピーク力を分配し、より正確に特定の筋肉のための筋肉の挿入を表すことになります。
ENT "> FEの使用は、構造に作用するひずみと応力の評価を可能にする。それは頻繁に整形外科、古生物学、より最近では発生生物学を含む多くの生物科学分野で用いられている技術として。ここでは、ゼブラフィッシュのためのFEを構築する方法について説明します下顎。将来的にはこれらのモデルは、口蓋を含め、全体の顎を見て拡張することができる。同様の技術は、現在までにほとんどが動によって研究されてきた魚で脊椎の生体力学をモデル化するために使用することができます。著者らは、開示することは何もありません。
図3-5のいくつかのデータはJ.Biomech、48(12)、ブラントらから再版された、有限要素モデリングが原因で顎の開発、3112から22で筋肉の緊張の損失に接合形状と細胞の挙動の変化を予測します。 2015年、エルゼビア15からの許可を得て。
LHBは、ウェルカム・トラスト動的セルの博士課程のプログラムによって資金を供給されました。 KARは、MRCプロジェクトの助成金によって賄われていたMR / L002566 / 1(EJR及びCLHに授与)とCLHは、我々はまた、イメージング・アドバイスウォルフソンバイオイメージング施設に感謝したいと思いARUKグラント19479.によって賄われていました。
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| Coll2 | Abcam | ab34712 | II型コラーゲン抗体 - すべての軟骨を染色 |
| A4.1025 / MF20 | 発達研究 ハイブリドーマバンク | A4.1025 | 骨格マイソイン抗体 - すべての骨格筋をマークします |
| 低融点アガロース | Sigma | A9414-5G | ゼブラフィッシュ |
| MS222 (エチル 3-アミノ安息香酸メタンスルホン酸) | Σ | E10521-10G | 麻酔薬を作るため |
| トリプシン | フィッシャー | T/3760/48 | サンプル透過 |
| ダイライト 488 マウス IgG | サーモフィッシャー | 35502 | 二次抗体 |
| ダイライト 550 ウサギ IgG | サーモフィッシャー | 84541 | 二次抗体 |
| SP8/SP5 or SPE 共焦点 | ライカ | イメージング用 | |
| LAS Leicaキャプチャソフトウェア | Leica | Imagingソフトウェア | |
| Aviso (version 7.0.0) | FEI Visualization Science Group | 3D画像解析ソフトウェア (Section 2) | |
| Hyperworksパッケージの一部Hypermesh(バージョン10) | Altair Engineering | FEモデル生成ソフトウェア (Section 4-5) | |
| Abaqus (version 6.14) | SIMULIA | FE解析ソフトウェア (Section5.7-5.8) |