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Research Article
Wenze Cao*1,2,3, Li Song*1,2,3, Jingjing Cheng1,2,3, Na Yi1,2,3, Luyi Cai1,2,3, Fu-de Huang4,5, Margaret Ho1,2,3
1Research Center for Translational Medicine,Tongji University School of Medicine, 2Key Laboratory of Arrhythmias of the Ministry of Education of China, Shanghai East Hospital,Tongji University School of Medicine, 3Department of Anatomy and Neurobiology,Tongji University School of Medicine, 4Shanghai Advanced Research Institute, University of Chinese Academy of Sciences,Chinese Academy of Sciences, 5Sino-Danish College, University of Chinese Academy of Sciences,Chinese Academy of Sciences
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
このステップ バイ ステップのプロトコルは、ハエの数百をホストし、電気モーターで彼らの行動を同期自動マルチ シリンダー システムを用いたショウジョウバエ負の走動作を分析します。試金飛ぶ負走動作同期、デジタル記録および自己設計されていた RflyDetection ソフトウェアを使用して分析しました。
神経変性疾患は、運動能力、減らされた寿命、年齢依存性神経変性の進歩的な損失に頻繁に関連付けられます。これらの細胞のメカニズムを理解するには、イベント、および高度な遺伝学的ツールと多様な行動特徴、相互、キイロショウジョウバエ、これらの因果関係、モデルとして使用疾患を評価するため神経変性の表現型。ここでの神経変性に関連する運動障害のための徴候としてショウジョウバエ大人の負の走動作を分析する高スループット方法をについて説明します。自動機設計、ドライブ飛ぶ同期の後で分に秒の経過とともに負の走動作の記録をできるように、初期の電気衝動を使用するために開発。デジタル録画したビデオからの画像の統計データ操作の自己設計されていた RflyDetection ソフトウェアで処理されます。1 つのフライに基づいて手動で制御される負走アッセイとは異なり、この高速、高精度、高スループット プロトコルにより、データ集録からハエの何百ものよりも、同時に事前に効率的なアプローチを提供すること、神経変性疾患に関連付けられている運動の赤字の基になるメカニズムを理解します。
さまざまなプロトコルおよび方法は、ショウジョウバエ成人登山行動を分析するために開発されています。かなり骨の折れる、伝統的な分析はほとんど 1 つのフライを入れている個々 のバイアルが含まれます、同期1,2,3,4のハエを叩く手動力を使用します。退屈な時間のかかる、高スループットの大規模研究には不向きで、ハエだけでなく、その他の制限をタップするために使用マニュアルの力の潜在的な変化です。アッセイを改善するために同じ時間5時多数のハエを高スループット分析が可能迅速な反復負走 (リング) アッセイを開発されました。ただし、アッセイはまだ飛ぶアクションを同期に手動で発揮力が必要です。改訂前の測定の時にリングの試金の私達のバージョンには、自動的に飛ぶ同期6を駆動する電気モーターによって制御される複数のフライを含むバイアルをホスティング金属ベースが含まれています。録音時に同期が、記録された後すぐにクライミング場を用いて自己設計されていたソフトウェア。私たちの自動化されたリングの試金、1 つずつ、1 つのフライからのデータ収集に手間と労力のかかるプロセスを排除しより効率的なデータ取得プロセス。さらに、自動リング アッセイは、機構の基になるアルツハイマーを明らかにする研究、パーキンソン病、高効率7,8,9 でのアプローチを検証の数で採用されています。.
この記事では、RNAi ハエを駆動DDC Gal4を使用して自動化されたリングのアッセイを示しています。DDC Gal4はドーパミン作動性 (DA) とセロトニン神経細胞で具体的に表現する Gal4 ライン10神経変性を伴う運動障害に関連付けられているターゲット遺伝子の効果を分析するための素晴らしいツールをこうして表します。さらに、我々 はUA Dicer2UAS-Dicer2;を生成するための RNAi の効率を高めるフライラインを組み込むDDC Gal4ライン ツールします。私たちを使用する選択 RNAi ハエはオーキシリン(aux) RNAi v16182 (auxR16182)、我々 は以前の効果を展示する識別した遺伝子飛ぶ運動8。auxGFPハエもaux過剰発現に及ぼす影響を分析するため用意しています。自動リング試金を使用してフライ負走を測定、結果を提示し、結果から取得で何か影響を議論する方法を紹介します。
1 飛ぶコレクション
2。リング測定を自動化
3。データ分析
この記事では、フライの負の走動作を評価する自動リング アッセイの使用を示します。以前リング アッセイとは異なり、我々 の分析含む飛ぶアクションを同期に電気の力を提供し、数百のハエを分析自動化装置同時に (図 1)。Dicer2; の解析DDC > auxR16182 、DA ニューロンのaux式、フライの自発運動に重要示唆しているハエは、男女ともにハエの 6 のタイム フレームで登山距離、年齢依存的な低下を示した。DA ニューロン、 auxGFP過剰発現に影響していないよう登坂力と共同auxR16182およびauxGFP DA ニューロンで発現救出 RNAi 表現型 (図 2および図 3)。検証に加えて自動リング アッセイ DA ニューロン変性に関連付けられているモーターの欠陥を評価するための高スループットで効率的な方法として、これらの結果もこの自動化されたアプローチがある可能性を特定するに役に立つパーキンソン病のリスク因子し、神経変性職務上の手掛かりを提供します。

図 1。自動リング装置。(AとB) フロントと装置の背面ビュー: (6) フレーム (3)、透明プラスチック バイアル (4)、バー (5) 泡、金属ベースの管、マイクロ ステップ ドライバー (7)、電子コント ローラー (8) を確保するためのネジ、垂直鋼棒 (2) ソケット (1)スイッチ (9)、小型モータ (10)、小さな電気モーター (11) に接続されているレバー。長方形の金属フレームのサイズは、46 cm × 26 cm × 16 cm、10 透明なプラスチック バイアル (直径 14.5 cm 高さ 2.1 cm) ネジを使用して保護を保持しています。装置をオンに最初 (8) が点灯するスイッチ (9) をクリックして (7) と (10) その結果。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 2。代表の分析 RflyDetection による画像のスナップショットします。スナップショット イメージは RflyDetection ソフトウェアにインポートし、インターフェイスで各アイコンのアクション、右側のテキストで示されます。上部と下部の基準計画を設定した後、ソフトウェアは自動的に検出し、バイアル内フライの位置をマークします。6 登山距離 (cm) 各フライの s と各バイアルの平均値がテーブルに表示されます。これらの数字は、さらに統計分析のための統計解析ソフトウェアにインポートされます。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 3。統計バー グラフの年齢に依存して減少を示す登山能力を飛ぶは、 aux式が DA ニューロンのダウンレギュ レートします。自動リング試金が次の遺伝子型を運ぶハエの負の走動作の分析に使用された: auxR16182/+ (ないの Gal4) UA Dicer2;DDC Gal4ハエw1118 (コントロール)、 UA mCD8GFP (コントロール) auxR16182auxGFPとauxR16182; auxGFP (救助) に渡った。男性と女性の両方のハエ登ったときaux式の DA ニューロンの減少した時間をかけて大幅に遅くなることに注意してください。歩行障害は、 aux式を再導入時に救出されました。5、15、25、35 日間の古いのハエを評価しました。男性 (A) と (B) のメスの成虫が個別に表示されます。遺伝子型ラベルの異なるバーの色に対応する伝説は、右側に表示されます。データのとおり、平均 ± SEM. p-意義の値 (アスタリスクで示されている * p < 0.05 * * p < 0.01、* * * p < 0.001、ns: オブジェクトを示すアスタリスクの下意義、バーが描画されません比較) mCD8GFPコントロールまたはaux RNAi ボンフェローニの多重比較検定一方通行 ANOVA を使用して比較することを求めた。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
著者が明らかに何もありません。
このステップ バイ ステップのプロトコルは、ハエの数百をホストし、電気モーターで彼らの行動を同期自動マルチ シリンダー システムを用いたショウジョウバエ負の走動作を分析します。試金飛ぶ負走動作同期、デジタル記録および自己設計されていた RflyDetection ソフトウェアを使用して分析しました。
ブルーミントンの在庫センターとウィーンショウジョウバエRNAi のはえの在庫センターに感謝しますリング装置のためのパテントは、中国科学院上海高等研究所に帰属します。RflyDetection ソフトウェアは、フー ・ ド ・黄にすべきである要求 (著者リスト参照)。この仕事は基本的な研究プログラムの中国国家からの補助金によって支えられた (973 プログラム 2013CB945602)、国家自然科学基金、中国の (31270825 および 31171043)。Ho 研究室メンバーのディスカッションとコメントに感謝いたします。
| Forma Environmental Chamber | Thermo | 3949 | |
| 二酸化炭素ボンベ | FuLian GAS Technology | GB/T6052 | |
| HDR ビデオカメラ | SONY | HDR-CX220E | |
| 双眼実体顕微鏡 | Xin Zhen | SMZ-168BL | |
| 電子スケール | MinQiao | SL1002N | |
| 冷蔵庫 | ハイアール | SC-350 | |
| 寒天粉末 | Sinopharm | 10000561 | |
| グルコース | Sinopharm | 10010518 | |
| コーンミール | Sinopharm | 5464654 | |
| ブラウンシュガーLiuCaiYuan | 45467936 | ||
| インスタントドライイースト | AB MAURI | 20886 | |
| AuxR16182 | VDRC | 7187 | |
| UAS-Dicer2 | Bloomington | 24650 | |
| UAS-mCD8GFP | Bloomington | 32185 | |
| DDC-Gal4 | Fude Huang | ||
| AuxGFP | A gift from Henry Chang |