粒子衝突の後大麦アリューロン細胞の構造において、記者から一時的な遺伝子発現の測定のため改良されたプロトコルが表示されます。96 ウェル プレート酵素試金研削自動穀物の組み合わせは、プロシージャの高スループットを提供します。
粒子衝突の後大麦アリューロン細胞の構造において、記者から一時的な遺伝子発現の測定のため改良されたプロトコルが表示されます。96 ウェル プレート酵素試金研削自動穀物の組み合わせは、プロシージャの高スループットを提供します。
大麦糊粉層は、植物におけるホルモン調節遺伝子発現の重要なモデル システムです。アリューロン細胞における遺伝子は発芽に必要なまたはアブシジン酸 (ABA) によるストレス反応に関連する遺伝子が活性化しながら初期苗開発はジベレリン (GA) によってアクティブ化されます。GA と ABA シグナル伝達のメカニズムは、酵素試金を使用して測定結果の一時的な式で粒子衝突によるアリューロン細胞にレポーター遺伝子コンストラクトを導入することで尋問することができます。改良されたプロトコルは部分的に自動化および穀物の均質化ステップと酵素試金が合理化される既存の方法よりもはるかに多くのスループットを許可します。穀物のサンプルの均質化が、自動組織ホモジナイザーを使用して行われ、GUS (β-グルクロニダーゼ) の試金は 96 ウェル プレート システムを使用して実行されます。代表的なプロトコルを使用して示唆されたホスホリパーゼ D の活性が転写因子 TaABF1 を ABA によるHVA1遺伝子発現の活性化に重要な役割を果たす可能性があります。
オオムギ糊粉層、植物1におけるホルモン調節遺伝子発現の研究の確立されたモデル システムです。特に、発芽や苗の早期開発のために必要な遺伝子の数はアブシジン酸 (ABA) によるストレス反応に関連する遺伝子が活性化しながらジベレリン (GA) によってアクティブ化されます。GA と ABA シグナル伝達経路が絡み合っている ABA および逆1にいくつか GA 活性化遺伝子の発現が阻害されると。
ジョージア州/ABA シグナル伝達経路で特定俳優の役割の結果を許可する記者の構成要素の過渡式に続いて、粒子の爆撃によってエフェクター遺伝子構造の導入をされている理解のための重要な戦略下流遺伝子発現が決定されます。ガス(β-グルクロニダーゼ) などルシフェラーゼレポーター遺伝子の使用エフェクター コンストラクトを受けた細胞内遺伝子発現の高感度で定量的に計測が可能します。たとえば、転写因子 TaABF15,6エフェクター コンストラクトの導入確立、ABA で誘導される遺伝子HVA1などによる TaABF1、 Amy32bなどの遺伝子の ga 処理で誘導しながら追加されなくなります。粒子衝突実験的戦略としては、ジョージア州/ABA シグナル伝達経路の多様な側面を調査する複数の研究所で使用されています。このような作業は、ga 処理で誘導2の ABA 誘導遺伝子3、活性化のため重要なプロモーター同定し、蛋白質キナーゼ4の発見につながっているし、転写因子を調節する5これらの遺伝子の表現。
既存プロトコル2,3,4,5,6パーティクルガンと一時的な遺伝子発現のそれに続く測定は、各一連の砲撃労働集約的、します。ほとんどの穀物は乳鉢と乳棒で手作業で均質化し、酵素試金は個別に実施します。この原稿は部分的に自動化および均質化手順を合理化する改善されたプロトコルを報告し、GUS のかなり多くのスループットを許可する試金の同じ実験でテストされる処置の多数を許可および/または、統計的に信頼性の高い結果を得るため、それぞれの治療のためより複製の包含。転写因子 TaABF1 および GA, ABA、およびその他の規制の分子によって規制されているHVA1やAmy32bの記者構成要素の式の代表的な結果が表示されます。
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1. エフェクターとレポーターの遺伝子の準備を構築します。
2. 大麦の爆撃の準備
3. 砲撃のプラスミッド DNA の準備
4. パーティクルガン無胚オオムギ子実の
5 衝撃された穀物からの可溶性タンパク質抽出
6. 穀物抽出物からルシフェラーゼ活性の測定
7. 穀物抽出物から GUS 活性の測定
8. データ分析
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ここで説明する手法は、大麦アリューロン細胞に任意のテスト遺伝子コンストラクトを導入する使用ことができます。実験遺伝子の表現のレベルがあります便利な測定 (図 2)。ここで大きく説明より高いスループット プロトコルは、研削のシードと酵素試金のステップの効率を高めます。このメソッドは、ABA で誘導される遺伝子HVA17をアクティブにする転写因子 TaABF15,6の能力を評価に使用されています。ここで示した代表的な結果にHVA1::GUS記者コンス トラクターはUBI::TaABF1エフェクター構成 (図 3 a) と共にアリューロン細胞に導入されました。TaABF1をしながらちょうど 0.01 のHVA1
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パーティクルガンによるエフェクター遺伝子の導入構築、記者構造の過渡式続いて GA/ABA シグナル伝達経路と結果ホルモン調節遺伝子で特定の俳優の役割を解剖するための重要な戦略式です。
ただし、大麦アリューロン細胞2,3,4,5,6でこのような実験を行うための既存のプロトコルは非常に労働集約的であります。各グループはほとんどさらされている穀物は、乳鉢と乳棒、均質化の手をする必要があります、結果の抽出物は、ガスとルシフェラーゼ活性のため個別に試金されます。現在のプロトコルは、したがって同じ実験に含めることができる、各治療に含めることができる合理的に生物の複製の数を制限する別の治療数を制限します。これらの制限は複数の治療法を比較する包括的かつ同時遂行がより難しくそれ。このような比較は、治療の間の遺伝子発現の違いはさ...
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著者が明らかに何もありません。
著者は、グレイソン バトラーとマーガレット ・ バレットを実験、ジュディ石粒の均質化についてのアドバイスを蛍光についてのアドバイスをリン ・ ハナムの遂行に助けに感謝します。この作品は全米科学財団 (IOB 0443676) 支えられた制度開発賞 (アイデア) から国立科学研究所の一般医療 [許可番号 P20GM0103423、健康の国民の協会からの補助金コルビー大学自然科学部
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| GeneElute HPプラスミドMaxiprepキット | Sigma | NA0310-1KT | |
| UV-vis分光光度計 | Nanodrop | ND-1000 | |
| ヒマラヤ大麦粒/ | / | さまざまなハルレスオオムギ(4°Cで暗闇に保管;C) | |
| コハク酸ナトリウム | ΣS2378 | 液用試薬 | |
| 塩化カルシウム(二水和物) | ッシャー | C79-500 | 液用試薬 |
| 吸収液 | 自家製 | / | 20 mM コハク酸ナトリウム、20 mM 塩化カルシウム、pH 5.0。使用前にオートクレーブ滅菌してください。 |
| クロラムフェニコール | シグマ | C0378 | 70%エタノールで10 mg / mLのストック溶液を調製します。 |
| バーミキュライト | フィッシャー | NC0430369 | バーミキュライトプレートに使用されます。 |
| 濾紙サークル(90 mm) | Whatman | 1001 090 | バーミキュライトと爆撃前の穀物調製に使用されます |
| バーミキュライトプレート | 自家製 | / | ガラスシャーレにバーミキュライト50mLを加えます。バーミキュライトの上に90mmの紙の円を置きます。オートクレーブ。 |
| 鉗子(細い先のとがったもの) | フィ | ッシャー13-812-42 | 麦粒の種皮を除去するために使用されます。 |
| 鉗子(超極細点) | フィッシャー | 12-000-122 | 大麦粒の種皮除去に使用します。 |
| 金マイクロキャリア(1.6 μm) | BioRad | 1652264 | |
| macrocarriers | BioRad | 1652335 | |
| 塩化カルシウム(二水和物) | Fisher | C79-500 | 2.5 Mのストック溶液を調製し、1 mLのアリコートを-20°Cで保存します。 |
| スペルミジン | Sigma | S0266 | 100 mMのストック溶液を調製し、500 μ-20°CのLアリコート。C(2ヶ月以内に使用)。 |
| 破裂ディスク(1550 psi) | BioRad | 1652331 | |
| 停止スクリーン | BioRad | 1652336 | |
| マクロキャリアホルダー | BioRad | 1652322 | |
| Biolistic粒子送達システム | BioRad | PDS-1000/He | |
| リン酸ナトリウム一塩基性一水和物 | Sigma | S9638 | 1Mリン酸ナトリウムpH 7.2 |
| リン酸二塩基性 | シグマ | S9763 | 1Mリン酸ナトリウムpH 7.2 |
| 1Mリン酸ナトリウムpH 7.2 | 自家製 | / | 6.9gのリン酸ナトリウム一塩基性一水和物と7.1gのリン酸二塩基性ナトリウムを組み合わせます。100mLに水を加えます。NaOHを添加してpH7.2を得ます。 |
| ジチオスリエトール(DTT) | Sigma | 43819 | に溶解し、1 mL アリコートで -20°C で保存します。 |
| ロイペプチン | シグマ | L2884 | 水に10mg / mLに溶解します。.-20°Cで保管します。C. |
| グリセロール | シグマ | G5516 | に50%溶液を調製します。 |
| 粉砕バッファー | 自家製 | / | 10 mLの1 Mリン酸ナトリウムpH 7.2、500 μ1 M DTTのL、100 μ10 mg / mLロイペプチンのL、および50%グリセロールの40 mL。100mLに水を加えます。 |
| ステンレス製スチールビーズ (5 mm) | Qiagen | 69989 | |
| 2.0 mL チューブ | Eppendorf | 22363352 | この特定のモデルのチューブは、ホモジナイザーでの使用をお勧めします。 |
| ビーズホモジナイザー (TissueLyser) | Qiagen | 85210 | |
| 12mm x 75 mm ガラス試験管 | フィッシャー | ||
| ・ルシフェリン | ・ゴールドバイオ | LUCK-100 | 25 mM のストック溶液を準備し、1 mL のアリコートを -20°C で保存します。 |
| ATP | Sigma | A7699 | 100 mM ストック溶液を準備し、250 μ-20°CのLアリコート。 C. |
| 1Mトリス硫酸塩pH 7.7用の | トリスベース | Sigma | T1503 |
| 硫酸 | シグマ | 258105 | 1Mトリス硫酸塩pH 7.7用の試薬。 |
| 1M Tris sulfate pH 7.7 | 自家製 | / | 12.1 g Tris base を 100 mL の水に溶解します。硫酸でpHを7.7に調整します。 |
| 塩化マグネシウム | Sigma | M9397 | 水に2 Mまで溶解します。 |
| ルシフェラーゼアッセイバッファー(LAB) | 自家製 | / | 1 M Tris sulfate pH 7.7, 500 μ2 M 塩化マグネシウムの L、1 mL の 1 M DTT、および 200 μ0.5 M EDTAのL。50 に水を追加します。ミリリットル。 |
| ルシフェラーゼアッセイ混合物 | 自家製 | / | 15 mLのLABを組み合わせる、800 μ25 mMルシフェリンのL、200 μ100 mM ATPのL、および4 mLの水。これにより、十分なアッセイ混合物(20 mL)を100ルシフェラーゼアッセイ用。 |
| ルミノメーター (Sirius) | Berthold | / | |
| 4-methylumbelliferyl-β-D-glucuronide (MUG) | Goldbio | MUG1 | DMSOに溶解して100 mMにします。 |
| アジ化ナトリウム | Sigma | S8032 | 水に2%のストック溶液を調製し、1mLのアリコートを-20°Cで保存します。 |
| 96ウェルプレート(標準) | Fisher | 12565501 | |
| GUSアッセイバッファー | 自家製 | / | 2.5 mLのMUG、5 mLの1 Mリン酸ナトリウムpH 7.2、400 &muを組み合わせます。0.5 M EDTAのL、1 M DTTの1 mL、100 μ10 mg / mlロイペプチンのL、20 mLのメタノール、および1 mLの2%アジ化ナトリウム。.100mLに水を加えます。 |
| TempPlateシーリングフィルム | USAサイエンティフィック | 2921-1000 | |
| 96ウェルプレート(黒) | Costar | 3916 | |
| ナトリウム | グマS7795 | に200mM溶液を準備します。 | |
| 4-メチルウンベリフェロン | Sigma | M1381 | 100 μ水中のM溶液。1mLのアリコートを-20°Cで凍結します。 C. |
| マイクロプレート用尿素検知リーダー | Bio-Tek | FLX-800 |
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