この資料は、物理と化学の高スループット操作キューが模倣した生体内で細胞微小と多重化人工細胞微小環境 (MACME) 配列を準備する詳細な方法についてを説明します単一セルのプロファイリングとひと多能性幹細胞 (hPSCs) に最適な携帯電話環境を識別します。
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| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| ポリスチレン (PS) | Sigma | #182435 | 平均 Mw: 290,000, 平均 Mn: 130,000 |
| ポリメチルグルタリミド (PMGI) | MicroChem | G113113 | |
| ゼラチン (GT) | Σ | G2625 | 豚の皮から、タイプ A |
| シルガード 184 シリコーンエラストマーキット | Doe Corning Toray | #1064291 | PDMS 硬化剤とシリコーンエラストマーベースは、このキットのコンポーネントです。 |
| OpenSCAD | これは、マイクロ流体デバイスの金型を設計するために使用される無料の3Dコンピュータグラフィックスソフトウェア(http://www.openscad.org/)です。 | ||
| AutoCAD 2014 | Autodesk | ナノファイバーアレイの作製に使用されるマスクの設計に使用される3Dコンピュータグラフィックスソフトウェア(https://www.autodesk.com/products/autocad/overview)です。 | |
| 3Dプリンター、AGILISTA-3000 | キーエンス | ||
| 紫外線硬化型樹脂、AR-M2 | キーエンス | アギリスタの3Dプリントに使用されています。 | |
| 酢酸 | Sigma | #338826 | ≥99.99% |
| 酢酸エチル | Sigma | #270989 | 無水、99.8% |
| テトラヒドロフラン (THF) | Sigma | #401757 | |
| MSP-30T | 真空装置 | マグネトロンスパッタリングマシン | |
| Nunc OmniTray | サーモフィッシャーサイエンティフィック | #242811 | ナノファイバーアレイを作成したポリスチレン製ベースプレートです。このプレートサイズは通常127.7 x 85.5 mmです。 |
| ガン型コロナ放電機 | 神光電機&計装 | CFG-500 | この便利なデバイスは、プロトコルのステップ1.5「MACMEアレイの組み立て」でPDMS層の底面を活性化するためのコロナを生成するために使用されます。 |
| 5mLシリンジ | テルモ | SS-05SZ | |
| ステンレス製鈍針 (23ゲージ) | Nipro | #2166 | 外径は0.6mm、長さは32mmです。 |
| 高電圧電源 | TechDempaz | ||
| 1-Ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide, hydrochloride | 同人堂 | W001 | |
| N-ヒドロキシスクシンイミド | Sigma | #56480 | |
| Matrigel hESC-Qualified Matrix | Corning | #354277 | このタンパク質は、プロトコールでは基底膜ゲルマトリックスと呼ばれています。 |
| CellAdhere ビトロネクチン、ヒト、溶液 | STEMCELL Technologies | #07004 | |
| TeSR-E8 | STEMCELL Technologies | #05940 | ヒトES細胞およびiPS細胞のメンテナンスのためのフィーダーフリー、ゼノフリー培地 |
| Y-27632 | 和光純薬工業 | #253-00513 | |
| TrypLE発現酵素(1X)、フェノールレッド | サーモフィッシャーサイエンティフィック | #12605028 | これは、接着性哺乳動物細胞の解離のための組換えトリプシン様プロテアーゼです。 |
| Click-iT EdU イメージングキット with Alexa Fluor 647 Azides | サーモフィッシャーサイエンティフィック | C10086 | プレート蛍光染色における増殖細胞の蛍光標識は、このキットの製品マニュアルに沿って実施しました。 |
| Annexin V, Alexa Fluor 594 conjugate | Thermo Fisher Scientific | A13203 | |
| 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) | Thermo Fisher Scientific | D1306 | |
| Oct-3/4 抗体 (C-10) | Santa Cruz Biotechnology | sc-5279 | |
| Donkey Anti-Mouse IgG H&L (DyLight 488) | abcam | ab96875 | オンプレート蛍光細胞染色に用いる二次抗体です。 |
| ECLIPSE Ti-E | Nikon | CFI Plan Fluor 4倍/0.13 N.A.対物レンズ(ニコン)、CCDカメラ(ORCA-R2、浜松)、水銀ランプ(インテンシライト、ニコン)、XYZ自動ステージ(Ti-S-ERエンコーダ付き電動ステージ、ニコン)、4つの蛍光チャネル用フィルターキューブ(DAPI、GFP HYQ、TRITC、Cy5;ニコン) | |
| NIS-Elements Advanced Research | Nikon | 自動画像取得に用いる顕微鏡イメージングソフトウェアです。 | |
| CellProfiler, Version 2.1.0 | これは、細胞画像解析(http://cellprofiler.org/)用の無料のオープンソフトウェアです。 | ||
| R | SOM解析は、本ソフトウェアのkohonenパッケージで行います。これは無料で利用できます(https://www.r-project.org/)。 | ||
| Cluster 3.0 | これは、オープンソースのクラスタリングソフトウェア(http://bonsai.hgc.jp/~mdehoon/software/cluster/software.htm)です。教師なし階層クラスタリングは、このソフトウェアで実行されます。 | ||
| Java TreeView | このオープンソースソフトウェア(http://jtreeview.sourceforge.net/)は、クラスタリングデータをヒートマップと樹状図として視覚化するために使用されます。 | ||
| H9ヒト胚性幹細胞 | WiCell Stem Cell Bank | WA09 |
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