挑戦している宿主細胞に細菌によって分泌されるエフェクターを監視する蛍光タンパク質ベースのアプローチ。これは蛍光タンパク質とタイプ III の分泌システムとの互換性がないのためにです。ここでは、最適化された分割 superfolder GFP システムはホスト植物の細胞に細菌によって分泌されるエフェクターの可視化に使用されます。
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| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| シロイヌナズナトランスジェニックライン | Park, E., Lee, H. Y., Woo, J., Choi, D. &Dinesh-Kumar, S. P. スプリット蛍光タンパク質フラグメントを使用したIII型分泌によるPseudomonas syringaeエフェクターの時空間モニタリング.植物細胞。日本赤十字・赤十字 29 (7), 1571-1584 (2017) | ||
| CYTO-sfGFP1-10 | ABRC | CS69831 | |
| NU-sfGFP1-10 | ABRC | CS69832 | |
| PT-sfGFP1-10 | ABRC | CS69833 | |
| MT-sfGFP1-10 | ABRC | CS69834 | |
| PX-sfGFP1-10 | ABRC | CS69835 | |
| ER-sfGFP1-10 | ABRC | のCS69836 | |
| GO-sfGFP1-10 | ABRC | CS69837 | |
| PM-sfGFP1-10 | ABRC | CS69838 | |
| オルガネラ標的 sfGFP1-10OPT プラスミド | Park, E., Lee, H. Y., Woo, J., Choi, D. &Dinesh-Kumar, S. P. スプリット蛍光タンパク質フラグメントを使用したIII型分泌によるPseudomonas syringaeエフェクターの時空間モニタリング.植物細胞。29 (7), 1571-1584 (2017) | ||
| CYTO-sfGFP1-10 | Addgene | 97387 | |
| NU-sfGFP1-10 | Addgene | 97388 | |
| PT-sfGFP1-10 | Addgene | 97389 | |
| MT-sfGFP1-10 | Addgene | 97390 | |
| PX-sfGFP1-10 | Addgene | 97391 | |
| ER-sfGFP1-10 | Addgene | 97392 | |
| GO-sfGFP1-10 | Addgene | 97393 | |
| PM-sfGFP1-10 | Addgene | 97394 | |
| ER-sfCherry1-10 | Addgene | 97403 | |
| ER-sfYFP1-10 | Addgene | 97404 | |
| CYTO-sfCFP1-10 | Addgene | 97405 | |
| sfGFP11-tagged T3SS-based effector delivery system | Park、E.、Lee、HY、Woo、J.、Choi、D.&Dinesh-Kumar, S. P. スプリット蛍光タンパク質フラグメントを使用したIII型分泌によるPseudomonas syringaeエフェクターの時空間モニタリング.植物細胞。29 (7), 1571-1584 (2017) | ||
| pBK-GW-1-2 | Addgene | 98250 | pAvrRpm1:GW:HA-sfGFP11:AvrRpm1t;カナマイシン(25 ug / ml) |
| pBK-GW-1-4 | Addgene | 98251 | pAvrRpm1:GW:HA-2xsfGFP11:AvrRpm1t;カナマイシン(25 ug / ml) |
| pBK-GW-2-2 | Addgene | 98252 | pAvrRpm1:AvrRPM1sp:GW:HA-sfGFP11:AvrRpm1t;カナマイシン(25 ug / ml) |
| pBK-GW-2-4 | Addgene | 98253 | pAvrRpm1:AvrRPM1sp:GW:HA-2xsfGFP11:AvrRpm1t;カナマイシン(25 ug / ml) |
| pBG-GW-1-2 | Addgene | 98254 | pAvrRpm1:GW:HA-sfGFP11:AvrRpm1t;ゲンタマイシン(25 ug / ml) |
| pBG-GW-1-4 | Addgene | 98255 | pAvrRpm1:GW:HA-2xsfGFP11:AvrRpm1t;ゲンタマイシン(25 ug / ml) |
| pBG-GW-2-2 | Addgene | 98256 | pAvrRpm1:AvrRPM1sp:GW:HA-sfGFP11:AvrRpm1t;ゲンタマイシン(25 ug / ml) |
| pBG-GW-2-4 | Addgene | 98257 | pAvrRpm1:AvrRPM1sp:GW:HA-2xsfGFP11:AvrRpm1t;ゲンタマイシン(25 ug / ml) |
| Bacterial strains | |||
| Agrobacterium tumefaciens GV3101 | Csaba KonczおよびJeff Schell、TL-DNA遺伝子5のプロモーターは、新しいタイプのAgrobacteriumバイナリベクターによって運ばれるキメラ遺伝子の組織特異的発現を制御します。モルゲンジェネ。204,383-396 (1986);ゲンタマイシン(50 ug/ml)およびリファンピシン(50 ug/ml) | ||
| Pseudomonas syringae pv. Tomato CUCPB5500 | Kvitko, B. H. et al. Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 type III分泌エフェクター遺伝子のレパートリーにおける欠失は、エフェクター間の機能的重複を明らかにしています。PLoSパトグ。5 (4) (2009).;リファンピシン(100 ug / ml) | ||
| <ストロング>培地成分 | |||
| <ストロング>植物発芽培地 | 2.165g / Lムラシゲ&を追加スクーグパウダー、ショ糖10g / Lを水に。pH 5.8に調整し、2.2 g / Lのフィタジェルを追加します。.オートカルブ。 | ||
| ムラシゲ&ビタミン | Duchefa Biochemie | M0222 | 、4°Cで保存します。 |
| スクロー | Duchefa Biochemie | S0809 | |
| Phytagel | Sigma-Aldrich | P8169 | |
| LB培地 | 10 g / Lトリプトン、5 g / L酵母抽出物、10 g / L NaClを水に加えます。固体培地の場合は、15 g/Lのマイクロ寒天培地を加えます。オートクレーブ 溶液を55°Cに冷まします。C、必要に応じて抗生物質を追加します。 | ||
| トリプトン | BDバイオサイエンス | 211705 | |
| 酵母抽出物 | BDバイオサイエンス | 212750 | |
| NaCl | デュチェファ生化学 | S0520 | |
| マイクロ寒天 | デュチェファ生化学 | M1002 | |
| <強い>キングスB培地 | 10 g/L プロテアーゼ ペプトン #2、1.5 g/L 無水 K2HPO4、15 g/L の寒天を水に。オートクレーブ。55°Cまで冷却します。Cおよび滅菌15 ml/Lグリセロール、5 ml/L MgSO4を培地に加えます。必要に応じて抗生物質を追加します。 | ||
| プロテオース・ペプトン | BD バイオサイエンス | 212120 | |
| 無水 K2HPO4 | Sigma-Aldrich | 1551128 USP | |
| グリセロール | ・デュチェファ・バイオケミー | G1345 | |
| MgSO4 | Sigma-Aldrich | M7506 | |
| バクト寒天 | BD バイオサイエンス | 214010 | |
| <強>マンニトール-グルタミン酸(MG)液体培地 | 10 g/Lのマンニトール、2 g/LのL-グルタミン酸、0.5 g/LのKH2PO4、0.2 g/LのNaCl、および0.2 g/LのMgSO4を水に加えます。pH 7 に調整 | ||
| マンニトール | Duchefa Biochemie | M0803 | |
| L-グルタミン酸 | Duchefa Biochemie | G0707 | |
| KH2PO4 | Sigma-Aldrich | NIST200B | |
| 浸透バッファー | 10 mM MES (2-(N-モルフォリノ)-エタンスルホン酸)、10 mM MgCl2、150 µMアセトシリンゴン。pH 5.6;使用前に新しいバッファーを準備してください。 | ||
| MES | Duchefa Biochemie | M1503 | 100 mM(pH 5.6)のストックを水で調製します。フィルター滅菌します。 |
| MgCl2 | Sigma-Aldrich | M8266 | 水に100 mMストックを調製します。オートクレーブ。 |
| アセトシリンゴン | Sigma-Aldrich | D134406 | DMSOで150 mMのストックを調製します。 |
| 共焦点顕微鏡 機器/材料 | |||
| 710レーザー走査型共焦点システム | Carl Zeiss | ||
| Axio observer Z1 倒立顕微鏡 | Carl Zeiss | ||
| ヨウ化プロピジウム | ThermoFisher | P1304MP |
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