ここでは、設計し、高スループット ゼブラフィッシュ胚配列 96 ウェル プレートにそのようなテンプレートの利用に関する詳細な手順が続くテンプレートを配列複写するゼブラフィッシュ胚を作製するためのプロトコルを提案する.
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この記事について
サマリー
要約
ゼブラフィッシュ、よく発達生物学、環境毒物学および人間の病気で使用される国際的に認められた淡水生物関連研究分野。大規模な産卵、胚の透明度、迅速かつ同時開発など、独自の機能によりゼブラフィッシュ胚大規模な化学物質の毒性評価にしばしば使用と薬物スクリーニング。大人のゼブラフィッシュの産卵、胚の選択、およびウェル プレートに胚を配列複写する、典型的なスクリーニング プロシージャが含まれます。そこから、胚は、露出と、化学物質の毒性にさらされてまたは薬・化合物の有効性は表現型の観察に基づいて比較的迅速に評価できます。これらのプロセスの中で配列複写する胚はスループット レベルを制限する最も時間のかかる、労働集約的な手順の 1 つです。このプロトコルは 3 D プリントの計測テンプレートの使用と相まって真空操作この面倒な手順をスピードアップする革新的なアプローチを提案する.本プロトコルでは、計測テンプレート、実験的セットアップの詳細な手順については、代表的な結果が続くの全体のデザインについて説明します。実装された場合、このアプローチはさまざまな科目をテストとして zebrafish の胚を用いた研究アプリケーションで有利証明する必要があります。
概要
人気のモデル生物としてゼブラフィッシュ、薬および毒物学1,2,3,4の分野で広く使用されます。体外のプラットフォームと比較して、ゼブラフィッシュを提供多くの大きい生物の複雑さ、1 つまたは 2 種類の細胞が提供できなかった。モデル、ゼブラフィッシュの大産卵、迅速かつ同時の萌芽期の開発および高い臓器全体の生物をことのほか、透光性は大規模な毒性または薬/化合物5をスクリーニングするためにこのモデルのユニークな利点を与えています。毎週 1 組大人のゼブラフィッシュのによって生成される胚の数は他の全体の動物モデルを上回るし、高スループット スクリーニングに適したになっています。
ゼブラフィッシュを用いた典型的なスクリーニング プロシージャには、大量アダルト ゼブラフィッシュ産卵、胚の選択と適切な容器の水浸漬による暴露を受ける場所に胚を配列複写するなどの手動作業にはが含まれます。胚の開発は監視され、死亡率、孵化率、異常など観測可能なエンドポイントがしばしば手動で評価され、化学物質の毒性の徴候の効果の予備的な id として使用薬や化合物。以前審査手続きをスピードアップするための自動化された画像とコンピューター支援画像解析などのアプローチの検討しています。たとえば、顕微鏡画像処理機能の高いコンテンツでは 96/384 ウェル プレート6からの様々 な発達段階でゼブラフィッシュ胚に対して自動明視野または蛍光イメージングを実行する適応されています。顕微鏡と相まってマイクロ流体デバイスは、ゼブラフィッシュ脳神経7のイメージングのための現在の操作を通じて幼虫を配置する使用されました。これらのアプローチは、伝統的な手作業と比較してイメージの獲得の効率を大きく改善できます。また、生成される画像の数が多い、画像解析ツールも開発されているデータ処理速度を上げる劉らと Tuらによって示されるように8,9。
画像処理と画像解析のスループット レベルが増加すると、検診率制限ステップは 96 または 384 ウェル プレートにそれらを配列複写を意味する通常の暴露のゼブラフィッシュ胚の準備過程であることが明らかになった。このボトルネックのステップを解決するためにビジョンを統合したロボットは、チャートらによって開発されました。十我々 ではなく洗練された11手動処理ですが楽器を交換する以前、このようなテクニックを実装するための深い学習曲線があります。そのため、簡単に使用できるアプローチ ゼブラフィッシュ スクリーニングのスループット レベルをさらに向上させる一つの重要な要因になるし、この作品の主な目的は、提供します。
この作業には、設計し、3 D 印刷テンプレートを配列複写する胚を作製しました。そのような計測テンプレートは、標準の 96 ウェル プレートに適合の井戸にゼブラフィッシュ胚をわなに掛けるに設計されました。胚を選択して個々 も一つずつにそれらを配列複写するのではなく、1 つが胚および配列すべて 96 胚多層板に一度に行います。このテンプレートは、次のプロトコルを使用して、1 つは大幅語のブーストのスクリーニング能力は少なくとも 10 倍、手動操作と比較して、多層板に胚を配列複写の効率を向上できます。下記プロトコルには、テンプレート、ゼブラフィッシュの産卵、採卵を配列複写と配列複写のための全体的なデザインが含まれています。図 1計測テンプレートの全体的なデザインを示しています。図 2は、部品 3 と 4 で説明されているテンプレートを使用してステップバイ ステップのプロトコルの概要を示しています。
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プロトコル
1. デザイン ・ テンプレートを配列複写するゼブラフィッシュ胚の作製
-
8、12、96 ウェル レイアウト標準の 96 ウェル プレートに適合する計測テンプレートをデザインします。寸法は上の胚のわなに掛ける事室図 1 aに示したを使用 (「補足のファイル」も参照)。
- まあ、わなに掛ける事の図 1 bと1 Dに表示されるディメンションを使用します。
- 図 1の下の真空チャンバーの寸法を使用します。
- 図 1 bの中の空気の寸法を使用/コンセント。
- (0.1 mm 精度) と 3 D プリンターを使用して、テンプレートを印刷するには印刷に使用する推奨される樹脂材料表を参照してください。
注: 0.1 mm 精度の 3 D プリンターに適している計測テンプレートの作製 (材料の表を参照してください)。テンプレートの表面の推奨色はダークグレーや黒です。
2. ゼブラフィッシュ胚産卵
- 交尾ボックス産卵前に 1 日あたり男性と女性の魚の 2 つのペアを配置します。別の男性と透明なプラスチックの分周器で女性。
- 男性と女性の魚を混ぜて朝仕切りを取る。
- 男性と女性の魚を外し、細かいメッシュのストレーナを用いたゼブラフィッシュ胚を収集します。ウォッシュ 250 mL 卵と胚水 (材料の表を参照してください)。
- シャーレ (直径 90 mm) Holtfreter のソリューションで収集した胚を転送 (材料の表を参照) を外し、顕微鏡を使用して死んだと未受精卵の胚。
- 28.5 ° C のインキュベーターで胚を配置します。4 h でポスト受精 (hpf)、胚を観察し、死者と不健康な胚を削除します。胚は、次のステップの準備が整いました。
3. テンプレートを配列複写の準備
- 500 mL の脱イオン水で 2-3 回テンプレートを洗浄し、乾燥炉 (45 ° C) 5 分のためにそれを置きます。
- (図 2、ステップ 1) フィルム シールの部分と下部室をテープします。
- テンプレートの下部にエアアウトレットを真空ポンプに接続します。
注: 真空ポンプ用推奨最大真空は 0.1 Mpa です。使用真空の強度に注意してください。負圧が強すぎる場合は、圧力を下げるシールのフィルムに、十字形の穴をカットします。
4. 96 ウェル プレートにゼブラフィッシュ胚を配列複写します。
- 図 2,手順 2 で示したようテンプレートに約 150 胚を置くプラスチック転送ピペットを使用して。
- 手順 3.3 でシール フィルムでシールした商工会議所で負圧を生成する空気アウトレットに真空ポンプを接続します。
- までそれぞれよく 1 つの胚に陥れた (図 2,ステップ 3) テンプレート全体を水平方向に振る。
注: Holtfreter のソリューションは、胚は、各井戸に閉じ込められている前に干上がって、わなに掛ける事の商工会議所で追加の Holtfreter のソリューションを追加し、この手順を繰り返します。 - 余分な Holtfreter のソリューションとウェルズ (図 2,ステップ 4) にはめがない胚は廃棄します。
- 切り、真空ポンプを外します。
- テンプレート (図 2,ステップ 5) に対して標準の 96 ウェル プレートを逆さまに配置、両方同時に (図 2,ステップ 6) を回転させます。
- テンプレートの下部をタップまたは接続空気圧縮ガス散布するコンセントがテンプレートから 96 ウェル プレート (図 2,ステップ 6) に閉じ込められたすべての胚を転送することができます。
- 4.1 に 4.8 追加ウェルプレートを準備する手順を繰り返します。
- シールのフィルムを外し、下へ将来の使用のための 500 mL の脱イオン水と 3 回上からテンプレートを洗います。
注: テンプレートをきれいにするのに、エタノールのような有機溶剤を使用しないでください。
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結果
図 3は、一般的な 3 D 印刷の計測テンプレートを示しています。このテンプレート原料として感光性樹脂を使用し、3 D プリンターによって作られました。黒いペンキの層は、胚の色にコントラストを提供するために適用されました。96 ウエル (8 に 12) の位置は、標準の 96 ウェル プレートに合うように設計されました。同様に、384 (16 で 24) もテンプレートも設計することができます、同じメソッドを使用して作製しました。上下の部屋はより良いフィットを提供するために標準的な 96 ウェル プレートよりやや大きかった。溝も、配列中に余分な胚を保持するために設計されました。
緩やかな速度で 2 ~ 3 版のみを手動で準備が 30 分以内で 3 D プリントされた計測テンプレートを使用して 20 のプレートを準備でした。手動、ロボット、および計測テンプレート操作の比較を表 1...
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ディスカッション
ゼブラフィッシュ胚を配列複写する 3 D 印刷テンプレートの実装を成功させるために細心の注意を必要とするこのプロトコルの 2 つの重要なステップがあります。
計測テンプレートのデザインの最も重要な要因は、わなに掛ける事も。各ウェルに閉じ込められて 1 つだけ胚があることを確認して、1 つは直径およびわなに掛ける事の井戸の深さ、スルーホールの直径に細心の注意を払う必要があります。推奨直径は典型的な胚 (卵膜を含む) の直径の 1.5 倍から 2 倍以内です。よくたまり深さべき内 2 回 (絨毛膜を含む) 典型的な胚の直径の同じ胚の重なりを避けるために。スルーホールの直径に約典型的な胚 (卵膜を含む) の直径の半分穴から負圧で圧迫されて胚を避けるため。デザインの複雑さのため、3 D 印刷技術は計測テンプレートの作製に適しています。
計測テンプレートの本質は 96 または 384 ウェル プレートと合う位置すなわち指定された場所に個々 の胚をわなに掛けることです。代わりにそれらを損傷することがなく個々 の胚を保持す...
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開示事項
著者は記述されていた 3 D 印刷テンプレートに特許を満ちています。
謝辞
この作品は「青春 1000plan」プログラム、同済大学と NSFC グラント # 21607115 からスタートアップ資金、21777116 (Lin) によって支えられました。
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材料
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| ゼブラフィッシュ施設 | Shanghai Haisheng Biotech Co., Ltd. | Z-A-S5 | |
| 嵌合ボックス | Shanghai Haisheng Biotech Co., Ltd. | ||
| ウォッシュボトル、500 ml | Sangon Biotech | F505001-0001 | |
| ナトリウム | Vetec | V900058-500G | |
| 塩化カリウム | Sinopharm Chemical Reagent Co.,Ltd | 10016318 | |
| 塩化カルシウム | Sinopharm Chemical Reagent Co.,Ltd | 20011160 | |
| 重炭酸ナトリウム | Vetec | v900182-500G | |
| メチレンブルーハイドレート | TCI | M0501 | |
| 塩酸 | Sinopharm化学試薬有限公司 | 10011008 | |
| 海塩 | インスタントオーシャン | SS15-10 | |
| ペッター | ッシャーブランド | 13-675M | |
| 制御ドロップパスツールピペット | フィッシャーブランド | 13-678-30 | |
| 顕微鏡 | オリンパス | SZ61 | |
| 生化学インキュベーター | Shanghai Yiheng Scientific Instrument Co., Ltd. | LRH-250 | |
| 3Dプリンター | UnionTech | Lite600 | |
| 感光性樹脂 | UnionTech | UTR9000 | |
| 真空ポンプ | 上海裕康科学機器有限公司 | SHB-IIIA | |
| の付着力PCRの版は | Solarbio | YA0245 | |
| 96の井戸の版 | Costar | 3599 | |
| 多8チャネル ピペット30 - 300 μl | Eppendorf | 3122000.051 | |
| 圧縮ガスダスター | 上海Zhantu化学有限公司 | ST1005 | |
| DI水 | Thermo | GenPure Pro UV/UF | |
| 乾燥オーブン | Shanghai Yiheng Scientific Instrument Co., Ltd. | BPG-9106A | |
| システム水 | 施設からの水sウォーターシステム | ||
| 卵水 | 希釈60mg」インスタントオーシャン」海塩と 0.25 mg/L メチレンブルー 1 L DI 水 | ||
| Holtfreter' | 7.0 gの塩化ナトリウム(NaCl)、0.4 gの重炭酸ナトリウム(NaHCO3)、0.1 gの塩化カリウム(KCl)、0.235 gの塩化カルシウム(CaCl2.2H2O)を1.9 LのDI水に溶解します。HClを使用してpHを7に調整し、Di水を使用して容量を2Lに調整 |
参考文献
- Howe, K., et al. The zebrafish reference genome sequence and its relationship to the human genome. Nature. 496 (7446), 498-503 (2013).
- Leslie, M. Zebrafish larvae could help to personalize cancer treatments. Science. 357 (6353), 745-745 (2017).
- Lin, S., et al. Understanding the Transformation, Speciation, and Hazard Potential of Copper Particles in a Model Septic Tank System Using Zebrafish to Monitor the Effluent. ACS Nano. 9 (2), 2038-2048 (2015).
- Lin, S., et al. Aspect ratio plays a role in the hazard potential of ceo2 nanoparticles in mouse lung and zebrafish gastrointestinal tract. ACS Nano. 8 (5), 4450-4464 (2014).
- Baraban, S. C., Dinday, M. T., Hortopan, G. A. Drug screening in Scn1a zebrafish mutant identifies clemizole as a potential Dravet syndrome treatment. Nature Communications. 4, (2013).
- Lin, S., et al. High content screening in zebrafish speeds up hazard ranking of transition metal oxide nanoparticles. ACS Nano. 5 (9), 7284-7295 (2011).
- Kuipers, J., Kalicharan, R. D., Wolters, A. H. G., van Ham, T. J., Giepmans, B. N. G. Large-scale Scanning Transmission electron microscopy (nanotomy) of healthy and injured zebrafish brain. Journal of Visualized Experiments. (111), (2016).
- Liu, R., et al. Automated Phenotype Recognition for Zebrafish Embryo Based In vivo High Throughput Toxicity Screening of Engineered Nano-Materials. PLoS One. 7 (4), (2012).
- Tu, X., et al. Automatic Categorization and Scoring of Solid, Part-Solid and Non-Solid Pulmonary Nodules. in CT Images with Convolutional Neural Network. Scientific Reports. 7, 8533(2017).
- Mandrell, D., et al. Automated zebrafish chorion removal and single embryo placement: optimizing throughput of zebrafish developmental toxicity screens. Journal of Laboratory Automation. 17 (1), 66-74 (2012).
- Lin, S., Zhao, Y., Nel, A. E., Lin, S. Zebrafish: An in vivo model for nano EHS studies. Small. 9 (9-10), 1608-1618 (2013).
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