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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
組織化学的手法と組み合わせる画像解析システムを使用して、冬の休眠中に甘果オウトウ (セイヨウミザクラL.) 卵巣原基のデンプン含量を定量化する手法を提案します。
微小構造におけるでんぷんの変化は、受粉から受精・結実の発症に生殖期を含むいくつかの植物発達過程における主要なイベントに関連付けられます。しかし、花芽分化の進行中にでんぷんの変化知られていない完全に、花原基の特に小さい構造のデンプン含量を定量化の難しさのために主に。ここでは、に関するさまざまなフェーズとデンプン含量の変化を可能にする顕微鏡に接続されている画像解析システムを使用して甘いチェリー (Prunus avium l.) の卵巣原基における澱粉の定量化のため手法について述べる秋から春に休眠。この目的のため、花芽の休眠状態は冬時間の別の瞬間に、制御された条件に譲渡の芽の芽の成長を評価することによって決定されます。卵巣原基における澱粉の定量化, 花芽が順番に収集、固定、パラフィンに埋め込まれた、断面、私で染色2Kl (ヨウ素-ヨウ化カリウム)。準備は顕微鏡の下で観察を行い、背景から澱粉を明確に区別する画像解析によって分析します。デンプン コンテンツ値は検討フレームの澱粉含量の推定として各画素の光学濃度の合計を考慮したステンド グラスの澱粉に対応するイメージの光学密度を測定することによって取得されます。
温帯木本は、その成長と発展を調節することによって、季節に適応します。彼らは春と夏の間作成し、彼らは冬1で休止状態に行く秋の間に成長を停止します。休眠により低い冬の温度で生き残るために、低温春2の適切な芽のための前提条件です。温帯果実生産・林業における休眠の重要な意味は、多様な取り組みを決定し、休眠期間3を予測するにつながっています。実証実験条件と開花のデータに基づいて統計的に予測を強制的に撮影を転送するは、フルーツの木の種を推定する研究を可能にする休眠打破の日付を決定する現在のアプローチ、各品種のための要件をゾッと。ただし、生物学的プロセスに基づく休眠状態を確認する方法不明3のままです。
甘果オウトウ (セイヨウミザクラl.) などの温帯果樹の開花は年に一度が発生し、約 2 週間続きます。ただし、花を区別し、前の夏4の間に約 10 ヶ月前を開発開始します。花原基は、冬の間に芽内休眠する秋の間に成長を停止します。この期間の各品種は、適切な開花4特定温要求量を蓄積する必要があります。冬の間に芽のフェノロジーの変化の欠乏にもかかわらず花原基が、休眠中に生理活性や低温処理温度の蓄積、最近デンプン蓄積の動的な関連付けられているまたは短縮卵巣原基の細胞内で休眠決定5の新しいアプローチを提供しています。ただし、サイズが小さいと卵巣原基の場所特別な方法論が必要です。
澱粉の木本種6の主要なストレージの炭水化物であります。したがって、でんぷんの変化は彼らの開発の7、8をサポートする炭水化物を必要とする花の組織の生理活性に関連しています。生殖のプロセス中に別のキー イベントも葯減数分裂9スタイルや胚珠の受精10まで花粉管の成長など、別の花の構造の澱粉含量の変化に関連しています。組織化学的技術は、休眠中、花原基のそれぞれの特定の組織にデンプンの検出を許可します。ただし、難易度は、そのデンプン含量の組織、品種、または年間次の蓄積/減少のパターンは時間の経過や澱粉を比較するようにの定量化に残ります。これは、組織分析手法11利用の少し量のためです。代わりに、顕微鏡12にリンクされている画像解析は、植物組織の13の非常に小さいサンプルの澱粉の定量化をことができます。
カロース14、チューブ15などの植物組織内の異なったコンポーネントの含量を定量化する特定の染色領域のサイズを測定することにより澱粉の16顕微鏡と画像解析を組み合わせたアプローチは使用されました。汚れ。でんぷん用簡単に検出できるヨウ化カリウム ヨウ素を使用して (私2KI) 反応17。この方法は非常に具体的です。私2KI デンプン粒のラミナー構造内主体しの暗い青や赤茶色の色を18の澱粉のアミロース含量によってを形作る。私と染色2KI 汚れ示す澱粉と背景組織画像解析システム19による明確なデンプン検出と後続の定量化が可能との間のコントラストが適切な。この染料は化学量論が、ヨウ素の蓄積は17を変わることができる高い澱粉分子の長さに比例。したがって、ピクセルの数として表された染色領域のサイズが内容が反映されない正確に澱粉、澱粉含量の高い違いは同じようなサイズのステンド グラス エリアとフィールドの間見つけることができるので。代わりに、デンプン含量はアプリコット8,13のさまざまな組織で報告されているように、顕微鏡から得られた黒と白の画像にステンド グラスの顆粒の光学密度を測定することによって評価される場合があります。,19、アボカド10、20、およびオリーブ21。
ここで、理解と予測のための新しいツールを提供している秋から春甘果オウトウ、卵巣原基組織の澱粉含量の定量を休眠状態の測定を組み合わせた手法を説明します。生物学的メカニズムの研究に基づく休眠、休眠とリンク。
1. 休眠決定と植物資料集
2. 植物デンプン定量仕込み
3. 澱粉含量の定量
休眠研究は、低温の要件を満たしているとき瞬間の定量を必要とします。フィールド条件 (図 1 a) の下で冬の間に季節の変更の欠乏にもかかわらず彼らは低温下で一定期間を経過するまで、桜の木は適切な状態で成長の容量を回復しません。冬の間の管理された条件室 (図 1 b) にシュートの正規の転移は、花芽の休眠状態の評価を許可しました。花芽の成長の評価は、芽の重量の増加を測定することによって行われていた。一方、休眠中に変更できることを確認適切な条件 (図 1) の 10 日後休眠を克服したら、芽が膨らんだし、成長室 (図 1) でのバーストします。この分析の結果は、確立する芽の休眠状態を許可されます。異なる温度が冬の間に発生して、休眠は、年によっては異なる日付で克服されました。一方、研究の最初の年の間に、1 月に発生した休眠打破の 2 年目提示より穏やかな冬。したがって、低温の履行後、2 月に約 3 週間が発生しました。
甘果オウトウは、スパーズ、栄養芽は、頂芽、側芽が花蕾 (図 1と1 D) で花芽を負いません。未分化の芽は、夏の終わりに花や植物の芽に分化を開始し、芽、多数緑の鱗によって保護され、覆われて黒い外側スケール (内部にいくつかの花の原基が残って冬季に休眠を入力するとき図 1と図 2 a)。花蕾の解剖を示した (図 2 a) の中の小さな花の原基。各花のつぼみには、5 人に 1 人の個々 の花原基 (図 2 b) が含まれています。各花原基の小さなサイズにもかかわらず、花のすべての部分が区別され、識別することができます: 雌しべ、葯、花弁と萼片 (図 2)。化学技術の使用 (アルコール: 酢酸 [3:1] 固定、パラフィン ワックスを埋め込む、ミクロトーム切片、およびデンプンのヨウ素による汚損) (図 2 D 観察する原基組織花内デンプンの分布を許可).
各セクションは、卵巣原基における澱粉を定量しました。1337 μ m2、40 倍の倍率での 4 つの措置は、甘果オウトウ卵巣原基 (図 3 a) の澱粉の一般的なレイアウトを表されます。澱粉はあと背景と明確に区別された2KI (図 3 b) を染色します。澱粉はされた赤、緑、および青のしきい値のすべてのデンプン粒を観察するまでは、定義された色パラメーター (図 3) に基づくシステムで作成されたバイナリ イメージで覆われていた色を調整することで画像解析システムによって識別されます。得られるデンプン含量の値 (図 3 D) の黒と白のイメージのマスクの下のすべてのピクセルの光学濃度の測定の結果であった。
デンプンの定量では、澱粉 (図 4) 冬の間に動的の一貫したパターンを明らかにしました。一貫して、初冬のデンプンの量は、最大量まで 120,000 と 140,000 の間値両方の年で光学濃度値は 40,000 未満3を発表しました。一方、最大値は、(図 4 b) の 2 年目 2 月に発生した (図 4 a) の最初の年の 1 月に達されました。両年とも背筋が寒くなる履行を休眠の顔色とこれらの結果を対照的には、デンプンの最大量が付随して発生しました。
このアプローチ、休眠に関連してデンプン含量の変化をフレームに、付随して卵巣組織 (図 5 b) のデンプン定量を休眠状態 (図 5 a) の決定が必要です。

図 1: 甘い桜の花芽の休眠状態の決定のための実験の設定です。(A) 枝、冬の間に閉じられ、暗い茶色の鱗で覆われて休眠芽が表示。(B) このパネルは、芽の成長室に転送を示しています。1 月中旬には、いくつかの品種の芽の休眠のまま閉じたまま (白い矢印)、他が成長することができる間膨らんだ芽 (黒矢印) を表示します。(C) このパネルは横方向に位置する休眠花芽と拍車の根尖部の位置にある単一植物の芽の撮影の詳細を示しています。(D) このパネルを示しています撮影の詳細成長室で 10 日後休眠が克服された一度芽の腫脹を示します。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 2: 植物のデンプン定量仕込みします。(A) このパネル多数スケール (sc) によって保護されて 2 つの花原基 (fp) を示す花芽の横断セクションを示しています。(B) 3 つ花原基 (fp) は、花のつぼみに集まります。(C) このパネルが花原基の横断セクションを示していますすべての渦巻きと分化: 萼片 (se)、花びら (pe)、葯 (、)、および雌ずい (pi)。卵巣原基は、雌しべ (矢印) の基地で区別されます。花原基の (D)、中段だった収集 1 月に固定、パラフィンに埋め込まれた、断面と私に染まった2デンプンの氣 (ダークブラウン)。このパネルには、卵巣原基 (矢印) が表示されます。スケール バーは、500 μ m パネルAとBとCとDのパネルで 200 μ m です。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 3: 澱粉の甘果オウトウ卵巣原基における定量化します。このパネル (A) 卵巣原基の中央セクションを示しています私に染まった2KI、どの澱粉中の 4 つのフレームを示す内容を測定しました。(B) このパネルは、卵巣原基の詳細を示しています。デンプン粒は、ダークブラウンに染色します。このパネル (C) 青の異なる色合いに対応する澱粉の擬似カラー画像が表示されます。(D) このパネルは、黒と白の元のイメージ (青)2KI ステンド澱粉をカバー私バイナリ イメージ マスクを示しています。光学濃度は、マスクで覆われて元の画像のピクセルでのみ測定されます。スケール バーは、パネルを100 μ m とB - Dのパネルで 20 μ m です。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 4: 甘果オウトウ卵巣原基のデンプン定量の代表の結果は異なる冬温度条件の 2 年間春秋から毎月収集します。寒い冬を持っていた (A) このパネル ショー 2010-2011 年の結果身も凍る履行 (スノーフレーク) は、澱粉の最大量と付随して、1 月で発生しました。(B) このパネルは、穏やかな冬があった 2012 年結果を示しています。2 月、付随してデンプンの最大量に背筋が寒くなる履行 (スノーフレーク) が発生しました。値は、平均 ± 標準誤差平均です。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 5: 芽と甘果オウトウ卵巣原基のデンプン定量の休眠状態を評価するために実験的なデザインのスキーム。(A) このパネルは、休眠状態の定量のワークフローを示しています: 植物材料の準備、プロセス、および得られた結果。(B) このパネル デンプン定量のワークフローを示しています: 澱粉、澱粉のイメージ分析検出およびデンプン定量の顕微鏡観察用の芽の組織化学的準備。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
著者が明らかに何もありません。
組織化学的手法と組み合わせる画像解析システムを使用して、冬の休眠中に甘果オウトウ (セイヨウミザクラL.) 卵巣原基のデンプン含量を定量化する手法を提案します。
著者は、マリア ・ エレーロと Eliseo リバスを役に立つ議論のアドバイス感謝してありがとうございます。この作品は Ministerio デ Economía y Competitividad によって支えられた、欧州地域開発基金、欧州連合 [許可番号 BES 2010 037992 e. f.];セルバンテス ナシオナル ・ デ ・危惧 y テクノロジー Agraria y Alimentaria [許可番号 RFP2015-00015-00 RTA2014-00085-00、RTA2017-00003-00];大統領府・ デ ・ アラゴン -欧州社会基金、欧州連合 [Grupo Consolidado A12-17R]。
| 精密スケール | ザルトリウス | CP225D | |
| 実体顕微鏡 | ライカマイクロシステムズ | MZ-16 | |
| 乾燥ストーブ | メモリ | U15 | |
| パラフィン埋め込みステーション | ライカマイクロシステムズ | EG1140H | |
| 回転式ミクロトーム | ライヒェント・ユング | 1130/バイオカット | |
| ミクロトームブレード | フェザー | S35 | ステンレス鋼 |
| 明視野顕微鏡 | ライカ マイクロシステムズ | DM2500 | |
| デジタルカメラ | ライカ マイクロシステムズ | DC-300 | |
| 画像解析システム | ライカ マイクロシステム | ズ Quantiment Q550 |