ここでは、プロトコルを提案単一リポソームの脂質膜を渡るプロトン透過の分子機構の研究例としてシトクロムbo3を使用します。電気化学、蛍光顕微鏡、単一小胞、含む単一または複数の酵素のルーメン内の pH の変化を組み合わせることを検出および分析できる個別に。
ここでは、プロトコルを提案単一リポソームの脂質膜を渡るプロトン透過の分子機構の研究例としてシトクロムbo3を使用します。電気化学、蛍光顕微鏡、単一小胞、含む単一または複数の酵素のルーメン内の pH の変化を組み合わせることを検出および分析できる個別に。
電子のプロトン ポンプの酵素は ATP の生産に使用されるプロトン動機力を作成する、膜プロトン透過経路にチェーン カップル酸化還元反応を転送します。両親媒性膜タンパク質性の取り扱いには特に注意が必要ですし、プロトン透過経路のような膜輸送プロセスを勉強するとき、天然脂質環境に再構築は不可欠であります。ここで、例として大腸菌由来シトクロムbo3を取って膜酸化還元酵素のプロトン ポンプ機構の調査のために使用されている方法は詳細します。内腔のキノン プールとモニターの pH 変化の酸化還元状態を制御するは、電気化学および蛍光顕微鏡に組み合わせてです。酵素のコンテンツは、単一の酵素やトランスポーター リポソームあたりにスケール ダウンすることができますしながら蛍光顕微鏡の空間分解能によるリポソームの何百も同時に測定できます。それぞれ単一の酵素分析は、それ以外の場合全体の人口の行動によって隠されるかもしれない酵素機能動態のパターンを明らかにできます。我々 は、自動画像解析用スクリプトの説明を含めます。
酵素機構と反応速度論については、測定値が統計平均を表す酵素分子の数百万人に何千人もの人口を持つアンサンブルまたはマクロ レベルで通常取得されます。それは、ただし、酵素など複雑な高分子の行動における不均一性を発揮、アンサンブルのレベルで観察される分子メカニズムが必ずしも当てはまらないすべての分子のために知られています。最後の二十年の1中に新興の方法の様々 な個々 の分子スケールのような逸脱が広く単一酵素の研究によって確認されました。特に、個々 の酵素活動を蛍光検出は、酵素活動2,3の不均一性を調査したり、いわゆるメモリー効果 (低の期間によって成功した高い酵素活性の期間を発見に使用されています活動と逆)4,5。
多くの単一の酵素の研究は、酵素表面または空間的固定連続観測の視野で十分な長さのままに別の方法でに固定されている必要があります。酵素カプセル化リポソーム表面酵素または蛋白質蛋白質の相互作用の6,7による悪影響を防止しながら酵素固定化を有効にするのに示されています。また、リポソームは、その天然の脂質二分子膜環境の8,9,10で単一膜蛋白質を研究するユニークな可能性を提供しています。
膜タンパク質、トランスポーター、クラス蛋白質は脂質二重膜 (例えばリポソーム)11に再構成されたときにだけ勉強することができます動作、セル膜を渡る物質の方向転流を練習します。 12,13。たとえば、プロトン透過経路、原核生物と真核生物の電子輸送鎖のいくつかの酵素によって展示は ATP 合成に使用されるプロトン動機力を作成することによって細胞呼吸において重要な役割を果たしています。この場合、多くの場合このプロセスの詳細なメカニズムは、とらえどころのないままがプロトン ポンプ機能は電子伝達と結合されます。
最近では、プロトン ポンプの大腸菌(シトクロムbo3) ターミナル ユビキノール酸化酵素の単一の酵素の活性を研究する電気化学とカップル蛍光検出する可能性を示した14リポソームに再構成しました。これEからリポソームの内腔 pH 感応膜不浸透性蛍光色素のカプセル化によって達成されました。大腸菌極性脂質 (図 1 a)。タンパク質の量は、ほとんどリポソームは (ポアソン分布) によるとないまたは 1 つだけ溶解酵素の分子をも含んだに最適化されていました。シトクロムbo3の 2 枚の基板は、ユビキノンをソリューションでリポソームと (アンビエント) 酸素を形成脂質ミックスに追加することによって提供されました。リポソームは半透明な超滑らかな金電極、6 mercaptohexanol の自己組織化膜で覆われているまばら吸着します。最後に、電極は簡単な分光電気化学セル (図 1 b) の下部にマウントされています。キノン プールの酸化還元状態の電気化学的制御により、柔軟にトリガーしたり、または pH 感受性色素によってプロトン透過の結果としてリポソームのルーメン内の pH の変化を監視するために使用中にいつでもでも酵素反応を停止する 1 つ、酵素。使用して 2 番目、脂質バインド蛍光染料、サイズおよび個々 のリポソームのボリュームの蛍光強度を決定することができます、このように酵素のプロトン ポンプ機能の定量化。この手法を使用すると、特にわかったシトクロムbo3分子がプロトン動機力をすばやく消える自然リーク状態に入ることができます。この記事の目的は、詳細に単一リポソーム測定の手法を紹介します。
アクセスが制限されています。このコンテンツを表示するにはログインするか、トライアルを開始してください。
1. 脂質/UQ-10/FDLL ミックスの準備
注: E. 大腸菌脂質リポソームの調製に使用は避けようとユビキノン 10 (酵素基質) と長波長蛍光色素標識脂質 (リポソーム サイズ決定) の前に徹底的に混合をする必要があります、再構成。
2. シトクロムbo3の再構成
注: シトクロムbo3 エシェリヒア属大腸菌からの浄化、Rumbleyらからプロトコルに従ってください。15ネイティブに折り返されている酵素試料の高純度を確保するため、Rumbleyらによって記述されたアフィニティ精製ステップ後サイズ排除クロマトグラフィーを追加します。15
3. 半透明電極の作製
注: 金の滑らかな表面は平坦界面を有するシリコンウェハから 99.99% 金の 30 nm 厚層のテンプレート除去法によって得られます。半透明蛍光観察を許可することはする必要がありますので、金の層の小さい厚さは重要です。金蒸着 (PVD 物理蒸着法) の詳細見つけることができます他の場所で16とだけテンプレート除去はここで覆われています。また、超滑らかなゴールド チップ購入できます他の場所 (材料の表を参照してください)。
4. 自己組織化単分子膜 (SAM) 金表面の改質
5. 電気化学プロテオリポソーム アクティビティのテスト
メモ: 酵素の電気化学の活動は密接に詰まったたくさんのリポソーム層 (手順 5) 検証最初、下の小胞のカバレッジは、リポソーム (手順 6) の内腔の pH 変化を測定する実験では単一の小胞使用されます。
6 酵素のプロトン蛍光顕微鏡によるポンプの検出
7. 蛍光画像の解析
注: 典型的な実験は 2 つのチャネル、すなわち、それぞれの時間ステップ (例えば2.6 秒) 画像のセットを生成 (期間 * 2/2.6) の画像。設定が記録される単一の酵素の実験中にこのような画像の例は、研究データ リーズ リポジトリ21を介してアクセスできます。画像処理は、フィジー (ImageJ) とプログラミング言語ソフトウェア (ソフトウェアをスクリプトとして詳細については材料の表を参照するくださいと今後は呼ばれる) 高度な数学的分析を使用していくつかの手順で構成されます。
8. 深海蛍光の検量線を実行します。
注: 深海蛍光比を小 pH に変換するには、検量線確立されなければならない最初金透過率、フィルター品質など実験の特定の条件を考慮とします。この手順は一回実行される、セットアップと測定パラメーターは手順 6 でそのまま限り校正データを使用できます。
、、 pKを、 R、とRbがフィッティングします。アクセスが制限されています。このコンテンツを表示するにはログインするか、トライアルを開始してください。
6MH のサムと金変更カバー スリップ (電極) の品質は、電気化学インピー ダンス分光法による各実験の前にチェックされます。図 2 aは、リポソームが吸着した前後に電気化学インピー ダンス分光法を用いて代表的なコール ・ コール プロットを示しています。サムの品質で十分な場合、インピー ダンス分光法は半円形のコール ・ コール プロットの結果ほぼ純粋な容量性動作を示す必要があります。コール ・ コール プロットで半円の直径 2.5 3.0 μ F/cm2の範囲にあるべき電極表面の二重層容量に等しくなります。容量変更しないでください大幅リポソーム吸着容量のわずかな増加が注意した (高リポソーム カバレッジ、図 2 a下) または低インピー ダンスでのわずかなシフトを観測できます。周波数 (低リポソーム カバレッジ、図 2 a上)。
アクセスが制限されています。このコンテンツを表示するにはログインするか、トライアルを開始してください。
記載されているメソッドは、プロトン ポンプ リポソームに再構成することができます呼吸膜タンパク質の研究に適してキノン プールと電子を交換することができます。プロトン ポンプ機能は、pH に敏感な (レシオ) 染料リポソーム ルーメン (図 1 a) でカプセル化を使用して単一酵素レベルで監視できます。
メソッドは、サム18電極と電子を交換する脂質二重膜に組み込まれて、ユビキノン (または他のキノン) の能力に依存します。SAM 修飾金電極のプロパティは非常に固有です。リポソームは、吸着、サムと SAM に痩せて急速な酸化とリポソームのキノン プールの縮小を有効にする必要がありますする必要があります。重要なは、電極とリポソームとの相互作用は脂質の膜の整合性を損なわない十分に弱い必要があります。さらに、実験システムの詳細に応じていることが望ましい酸素還元などの側の金触媒反応に SAM の防ぐことができます。最後に、SAM を使用する潜在的なウィンドウ内で安定している必要があります...
アクセスが制限されています。このコンテンツを表示するにはログインするか、トライアルを開始してください。
著者が明らかに何もありません。
著者は、BBSRC (BB/P005454/1) の金融支援を認めます。NH は、VILLUM 財団若手研究者プログラムによって資金を供給されました。
アクセスが制限されています。このコンテンツを表示するにはログインするか、トライアルを開始してください。
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| 6-メルカプト-1-ヘキサノール (6MH) | シグマ | 451088 | 97% |
| 8-ヒドロキシピレン-1,3,6-トリスルホン酸 (HPTS) | BioChemika | 56360 | |
| アルミホルダー (電気化学セル) | カスタムメイド | 30x30x7 mm; 内径 26 mm; 穴径 15 mm | |
| 補助電極 | プラチナ線 | ||
| クロロホルム | VWR化学薬品 | 83627 | |
| 大腸菌極性脂質 | Avanti | 100600C | 25 mg/mL クロロホルム |
| エポキシ | EPO-TEK | 301-2FL | 低蛍光エポキシ |
| フィジー (ImageJ 1.52d) | 必要なプラグイン: StackReg および TurboReg (http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/stackreg/) | ||
| フィルターキューブ (「ATTO633」) | Chroma Technology Corporation | 例:620/60 nm;DM:660 nm;Em:700/75 nm | |
| フィルターキューブ(「HPTS1」) | Chroma Technology Corporation | 例:470/20 nm;DM:500 nm;Em:535/48 nm | |
| フィルターキューブ(「HPTS2」) | Chroma Technology Corporation | 例:410/300 nm;DM:500 nm;Em:535/48 nm | |
| フィルターキューブ(「テキサスレッド」) | Chroma Technology Corporation | 例:560/55 nm;DM:595 nm;Em:645/75 nm | |
| 蛍光色素標識脂質(FDLL) | ThermoFisher Scientific | T1395MP | TexasRed-DHPC(&λ;EXC 595 nm;&ラムダ;em 615 nm) |
| 蛍光色素標識脂質 (FDLL) (代替) | ATTO-TEC | AD 633-161 | ATTO633-DOPE を代替 (& ラムダ;EXC 630 nm;&ラムダ;em 651 nm) |
| ゲルろ過カラム | GE Healthcare | 28-9893-33 | HiLoad 16/600 Superdex 75 pg、追加のタンパク質精製用 |
| ガラスカバースリップ | VWR International | 631-0172 | No 1.5 |
| ガラスシリンジ | Hamilton | 1725 RNR | 250 µL |
| ガラスバイアル | Scientific Glass Laboratories Ltd | T101/V1 | 容量 1.75 mL |
| Gold | GoodFellow | 99.99% | |
| グラミシン | Σ | G5002 | |
| 硫酸水銀 参照電極 | 放射計 (ハッシュ) | E21M012 | |
| 微量遠心機 | エッペンドルフ | Minispin NL040 | |
| 顕微鏡 | ニコン | エクリプスTi | |
| 顕微鏡カメラ | Andor | Zyla 5.5 sCMOS | |
| 顕微鏡ランプニ | コン | Intensilight C-HGFI | |
| NIS-Elements AR 5.0.2 | コン | 顕微鏡取得ソフトウェア | |
| n-Octyl β-D-glucopyranoside | メルフォード研究所 | B2007 | |
| Nova 1.10 | Metrohm | ポテンショスタット制御ソフトウェア | |
| Objective | Nikon | Plan Apo λ 60x/1.4 oil | |
| OriginPro 2017 | OriginLab | プロットソフトウェア | |
| Oリング(電気化学セル) | Orinoko | 内径:16 mm; 断面積:1.5 mm | |
| プラスチックチューブ | Eppendorf | 3810X | 1.5 mL |
| ポリスチレンマイクロビーズ | Bio-RAD | 152-3920 | Biobeads, 20-50 mesh |
| ポテンショスタット | メトローム Autolab | PGSTAT 128N | |
| ポテンショスタット | CH 機器 | CHI604C | |
| スクリプティングソフトウェア | Matlab | R2017a | 必要なツールボックス: 'Image Processing Toolbox', 'Parallel Computing Toolbox', 'Curve Fitting Toolbox', 'System Identification Toolbox','Optimization Toolbox'Silicon |
| wafers | IDB Technologies Ltd | Si-C2 (N<100>P) | Ø 25 mm、525 um厚 |
| テフロンセル(電気化学セル) | カスタムメイド | 外径:26 mm; 内径:13.5 mm | |
| テンプルストリップ超フラットゴールド表面 | Platypus Technologies | AU.1000.SWTSG | すぐに使える超フラットゴールド表面(厚さ100nm以下オンデマンド) |
| 薄いマイクロピペットチップ | Sarstedt | 70.1190.100 | または同様のゲルローダーチップ200µL |
| ユビキノン-10 | シグマ | C-9538 | |
| 超遠心分離機 | ベックマン・コールター | L-80XP | Ti 45 ローター付き |
| 超音波浴 | フィッシャー・サイエンティフィック | FB15063 |
アクセスが制限されています。このコンテンツを表示するにはログインするか、トライアルを開始してください。
このJoVE記事のテキストまたは図の再利用許可をリクエスト
許可をリクエスト