免疫組織化学、西部の分析、および RNA 抽出のための組織の処理のためのプロトコル、ショウジョウバエ蛹網膜を解剖するための手術方法を提案する.
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免疫組織化学、西部の分析、および RNA 抽出のための組織の処理のためのプロトコル、ショウジョウバエ蛹網膜を解剖するための手術方法を提案する.
ショウジョウバエ蛹網膜は、開発中に地形形成過程の研究のためのエクセレント モデル システムを提供します。繊細なショウジョウバエ蛹網膜の解剖のための信頼性の高いプロトコルを提案します。私たちの外科的アプローチは、蛹を開き目脳錯体を正確に抽出するすぐに利用できるレーザーマイクロダイ セクション ツールを利用しています。これら固定、免疫組織化学と網膜を受けるし、顕微鏡スライド上にマウントでき、目標は細胞または細胞レベル下の構造を検出する場合をイメージします。また、固定されていない網膜脳組織から分離された、適切なバッファーで分離でき (それぞれ、タンパク質や遺伝子の発現を評価する) の蛋白質のゲル電気泳動や mRNA の抽出のために利用します。重要な練習と忍耐、レーザーマイクロダイ セクション プロトコルを習得する必要がありますが、プロトコルにより主に破損していない網膜の比較的簡単な分離、一度マスター。
ショウジョウバエ網膜は、ハニカム格子1,2,3,4に配置された色素細胞に囲まれた約 750 個ので構成されます。各 ommatidium には、8 つの光受容器ニューロン、レンズ分泌 4 つの錐体細胞、2 つの主な色素細胞が含まれています。各 ommatidium の周辺には、格子の色素生産細胞、感覚毛のグループ。分裂の性質などステレオタイプの六角形配置によりショウジョウバエ蛹網膜は細胞接着5,6を含む地形形成過程の研究のためエクセレント モデル システムを提供します。 7,8,9,10とアポトーシス11,12,13,14,15。
いくつかの公開されているプロトコルはショウジョウバエ蛹16,17,18から目脳錯体を抽出する空気の圧力を利用します。説明されたプロトコルはここで代わりに慎重にレーザーマイクロダイ セクション ツールを利用し、破損していない網膜組織を得ることが目標と目脳錯体を正確に分離します。これは重要なために利用する場合は網膜形態、タンパク質や遺伝子発現解析網膜への損傷は、細胞ストレスまたは死は、細胞の表現型および遺伝子発現を変更で起因できるので。さらに、10 〜 15 分、年齢と切り裂かれた眼組織の発達段階の変動を最小限に抑えるという目標を促進することで、練習後、6 に 10 目脳錯体を分離できます。
固定、染色、および下記全体マウント プロトコル、ショウジョウバエの目の蛍光顕微鏡検査のための準備に適しています。網膜は、抗体は興味の蛋白質をターゲットに培養することができます。たとえば、単接合部品に抗体を活用して、細胞の頂端の外周を可視化できるようにセルの種類を含む特性、形状と配置評価19ことできます。、固定する前に目は西部の分析のための蛋白質または qRT PCR 用 RNA、RNA シーケンスを抽出するための脳から代わりに切断することができます。
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1. ティッシュの準備
2. 目脳錯体の解離
3. 蛍光抗体法により組織の処理
4. ウェスタンブロッティング用眼組織の準備:
5. に備えて眼組織の RNA の抽出:
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蛹の目は、そのドライブ形態の発達過程を調査するためのエクセレント モデルとして機能する簡単にアクセスできる組織です。ここで、私たちは網膜を解剖したが、頂アドヘレンスジャンクション (図 3 a, C) またはアポトーシス (図 3)25時にアクティブが Dcp 1 カスパーゼ (図 3 D) を検出する蛍光を使用します。明らかに募集と (18 h APF) から初代培養細胞の形態形成などを含む主要な形成プロセスの中に細胞を観察することがこれらのアプローチ、格子のインターカレーション細胞それぞれの ommatidium (18-24 h APF) 周りの確立、第三紀ニッチ (21-24 h APF) は、セル サイズと形状 (18 h から 40 h APF)、アポトーシス (18 〜 33 h APF) から変更します。これらの形成のイベントのタイミングは温度に依存しが異なります...
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ここで説明したショウジョウバエ蛹目郭清法 10 〜 15 分以内 6 に 10 目脳錯体の分離できます。しかし、忍耐と実践は、解剖テクニックをマスターし、品質と解離の速度を向上させるために不可欠です。今回は短い郭清によりそれぞれの目が約同じ発達段階、データ セット内の網膜の式表現型あるいは遺伝子の可変性を減らすこと。我々 のプロトコルを念入り涙やシャーリング、目への損傷が応力経路の活性化を誘導したりもできるためのリスクを最小限に抑えながら繊細な網膜組織を分離するため代替プロトコルは、マスターの少ない練習を必要があります、しながら細胞死。初心者最初のマスター 40 h APF に若い目を解剖する前に培養した蛹の郭清にお勧めします。あることを確認常に十分な蛹コレクション (手順 1.3) で使用できるすべての実験 (ステップ 1.1) の交差する複製の設定をお勧めします。網膜は、研究者に関心の明確な形態形成イベントによって、蛹の発育中に縦長の様々 で解剖することができます。これらは募集とアポトーシス (18 〜 33 h APF) から、セル サイズと形状 (18 h から 40 h APF) に変更 (21-24 h A...
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原稿には、ザック ドラムと有用なコメントのための我々 のレビューをありがとうございます。この作品は、R15GM114729 によって支えられました。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| Adobe Photoshop | Adobe | 画像処理ソフト | |
| Bamboo splints, 6" | Ted Pella Inc | 116 | |
| ベータ メルカプトエタノール | Sigma-Aldrich | M3148 | |
| β-グリセロール リン酸 | Sigma-Aldrich | 50020 | |
| 黒 解剖皿 | SYLG170またはSYLG184 (細かく挽いた木炭粉末で黒く着色) で縁まで充填されたガラス ペトリ皿。室温で24〜48時間放置して重合します。 | ||
| ブレードホルダー | ファインサイエンスツール | 10053 | |
| ウシ血清アルブミン | Sigma-Aldrich | A7906 | |
| cOmplete, EDTAフリープロテアーゼ阻害剤カクテル錠 | ロシュ | 4693132001 | |
| 共焦点顕微鏡 (ツァイス LSM 501) | カールツァイス | または類似の顕微鏡 | |
| ジエチルピロカーボネート (DEPC) | シグマアルドリッチ | 40718 | |
| 両面テープ | 3M | 665 | |
| ショウジョウバエ食品培地、栄養豊富な | 7.5%スクロース、15%グルコース、2.5%寒天、20%ビール酵母、5%ペプトン、0.125%MgSO4.7H2O、0.125%CaCl2.2H20 | ||
| ショウジョウバエ食品培地、 標準的な | ブルーミントンショウジョウバエストックセンターのコーンミールレシピ。(https://bdsc.indiana.edu/information/recipes/bloomfood.html) | ||
| エチレンジアミン四酢酸 | Sigma-Aldrich | E6758 | |
| PBS | 中の 4% フォルマデヒド | ||
| 蛍光顕微鏡(TCS SP5 DM顕微鏡) | ライカマイクロシステム | ズまたは類似顕微鏡 | |
| Forceps | ファインサイエンスツール | 91150-20 | 鉗子は頻繁に研ぐ必要があります。 |
| ホルムアルデヒド | Thermo Scientific | 28908 | |
| ガラス製9ウェル皿 | コーニング | 7220-85 | 別名9ウェルディッシュ |
| ガラスカバースリップ (22 x 22 mm) | Fisher Scientific | 12-542-B | |
| ガラス顕微鏡スライド (25 x 75 x 1 mm) | Fisher Scientific | 12-550-413 | |
| ガラスシャーレ | Corning | 3160-100BO | |
| Glycerol | Sigma-Aldrich | G5516 | |
| Image Studio ソフトウェアバージョン 5.2.5 | LI-COR Biosciences | ウェスタンブロットの定量のための画像処理ソフトウェア。 | |
| Laemmli サンプルバッファー | Bio-Rad | 161-0737 | 2X 濃縮タンパク質サンプルバッファー、メーカーの指示に従ってベータメルカプトエタノールを添加します。 |
| レーンマーカーによるサンプルバッファの削減 | ThermoFisher Scientific | 39000 | 5X 濃縮タンパク質サンプルバッファー。 |
| マイクロセントリグリューグルチューブ | Axygen | MCT-175-C | |
| マイクロダイセクションハサミ | Fine Science Tools | 15000-03 | |
| マイクロウェルトレイ (72 x 10 & micro;L wells) | Nunc | 438733 | |
| PBS中の0.5%N-プロピルガレートおよび80%グリセロール封 | 入剤 | ||
| N-プロピルガレート | Sigma-Aldrich | P3130 | |
| ヌクレアーゼフリーPBS(0.1%DEPC中のPBS、pH 7.4) | PBSに適量のDEPCを加え、よく混合し、室温で一定攪拌しながら一晩インキュベートします。少なくとも20分間オートクレーブします。4°Cで保管します。C | ||
| PBS(リン酸緩衝生理食塩水pH 7.4) | Sigma-Aldrich | P5368 | 製造元の指示に従って調製 |
| PBS+pi (PBSとプロテアーゼおよびホシャターゼ阻害剤) | 10mM NaF、1mMβ-グリセロールリン酸および1mM Na3VO4 PBS、pH 7.4. | ||
| PBT | 0.15% TritonXおよび0.5% ウシ血清アルブミン PBS、pH 7.4 | ||
| ピンホルダー | ファインサイエンスツール | 26016-12 | |
| 一次抗体:ヤギ抗GAPDH | Imgenex | IMG-3073 | ウェスタンブロッティング用。1:3000で使用 |
| 一次抗体:ウサギ抗切断Dcp-1 | 細胞シグナル伝達 | 9578S | 免疫蛍光用。1:100で使用 |
| 一次抗体:ラット抗DEcad | Developmental Studies Hybridoma Bank | DCAD2 | 免疫蛍光用。1:20に使用 |
| 一次抗体:ラット抗DEcad | DOI:10.1006/dbio.1994.1287 | DCAD1 | タダシ・ウエムラからの贈り物。1:100で使用します。 |
| RNA抽出キット:Relia Prep RNAtissue Miniprep kit | Promega | Z6110 | |
| Rnase Decontamination Reagent (RNase Away) | Molecular BioProducts | 7002 | |
| Scalpel blades | Fine Science Tools | 10050 | スケープルブレードの小片を折ってブレードホルダーに固定します。 |
| 二次抗体:488-conjugated ロバ抗ラットIgG(H + L) | Jackson ImmunoResearch | 712-545-153 | 免疫蛍光用。1:200で使用 |
| 二次抗体:cy3-標識ヤギ抗ウサギIgG(H + L) | Jackson ImmunoResearch | 111-165-144 | 免疫蛍光用。1:100で使用 |
| 二次抗体:HRP標識ヤギ抗ラットIgG(H + L) | 細胞シグナル技術 | 7077 | スタンブロッティング用。1:3000で使用 |
| 二次抗体:HRP標識ウサギ抗ヤギIgG(H + L) | ジャクソン免疫研究 | 305-035-003 | スタンブロッティング用。1:3000 |
| 塩化ナトリウム | Sigma-Aldrich | S3014 | |
| フッ化ナトリウム | Sigma-Aldrich | 215309 | |
| バナジウム酸ナトリウム | Sigma-Aldrich | 50860 | |
| 分光光度計 (NanoDrop) | ThermoFisher Scientific | 2000c | |
| 実体解剖顕微鏡(M60またはM80) | ライカマイクロシステム | ズまたは類似の顕微鏡 | |
| シルガード(黒) | ダウ・コーニング | SYLG170 | |
| シルガード(透明) | ダウ・コーニング | SYLG184 | カラー ブラック、細かく挽いたチャコールパウダー |
| ティッシュ:キムテック | キムテック | 34120 | |
| トリトンX | シグマ・アルドリッチ | T8787 | |
| Trizma 塩酸塩 pH7.5 | Sigma-Aldrich | T5941 | |
| タングステン針、ファイン | ファインサイエンスツール | 10130-10 | ピンホルダーへの挿入 |
| タングステンニードル、頑丈な | ファインサイエンスツール | 10130-20 | ピンホルダーWTLB |
| (ウェスタン組織溶解バッファー) | への挿入150 mM NaCl、1.5% Triton X-100、1 mM EDTA、20% グリセロール、10 mM NaF、1 mM β-グリセロールリン酸、1 mM Na3VO4 50 mM Tris-HCl (pH 7.5) 中。10 mL溶液あたり1つのcOmpleteプロテアーゼカクテルテーブルを補充します。 | ||
| イーストペースト | (地元のスーパーマーケット) | 約大さじ2杯のフライシュマンのアクティブドライイースト(または類似のもの)を~20mLの蒸留H2Oに溶かしました |
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