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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
新しく切除されたヒト乳癌腫瘍は、新鮮な組織処理プロトコルに従ってテラヘルツ分光法およびイメージングを特徴とする。組織位置決めは、効果的な特性評価を可能にする一方、将来の術中アプリケーションに適時に分析を提供することを考慮する。
この原稿は、パルステラヘルツイメージングと分光法を用いて、新たに切除されたヒト乳房腫瘍を処理、特徴付け、画像化するためのプロトコルを提示する。このプロトコルは、通常の入射率でテラヘルツ伝送モードを使用し、30°の斜めの角度でテラヘルツ反射モードを使用します。収集された実験データは、電界の時間領域パルスを表す。切除された組織上の固定点を透過するテラヘルツ電界信号を処理し、解析モデルを介して、組織の屈折率および吸収係数を抽出する。ステッパーモータスキャナを利用して、テラヘルツ放射パルスは、異なる組織領域の平面画像を提供する腫瘍上の各ピクセルから反射される。画像は、時間または周波数領域で表示することができます。さらに、各画素における屈折率および吸収係数の抽出データは、腫瘍の断層テラヘルツ画像を提供するために利用される。このプロトコルは、癌性組織と健康組織の明確な分化を示す。一方、プロトコルに付着しないと、気泡が存在し、流体が腫瘍表面に残ることによる騒がしい画像または不正確な画像が生じる可能性があります。このプロトコルは、乳房腫瘍の外科的マージン評価のための方法を提供する。
テラヘルツ(THz)イメージングと分光法は、過去10年間で急速に成長している研究分野です。0.1~4 THzの範囲で、より効率的で一貫性のあるTHzエミッタの開発が続く中、アプリケーションは1.THzが約束と著しい成長を示している分野の1つは、生物医学分野2である。THz放射は、固定組織3の分析に一般的に使用される電力レベルにおいて非イオン化および生物学的に安全であることが示されている。その結果、THzイメージングおよび分光法は、水分量などの様々な組織特徴を分類・分化して、火傷の損傷および治癒4、肝硬変5、および切除組織6,77における癌を示すために用いられてきた。,特に癌評価は、臨床的および外科的応用の可能性の広い範囲をカバーし、脳8、肝臓9、卵巣10、胃腸管11、および乳房7、12、13、14、15、16、17、18、1912,13,14,15,16の癌について調査されている。17,18,197
乳癌のTHzアプリケーションは、主にマージン評価を介して乳房温存手術、または乳房切除術をサポートすることに焦点を当てています。乳房全体を除去する完全乳房切除術とは対照的に、乳房切除術の目的は、腫瘍および周囲の健康な組織の小層を除去することである。切除された組織の外科的マージンは、サンプルがホルマリンに固定され、切り離され、パラフィンに埋め込まれ、顕微鏡上の4μm-5 μmのスライスに取り付けられると、病理学を介して評価されます。このプロセスは時間がかかることがあり、正のマージンが観察された場合は後で二次外科的処置が必要です。米国放射線腫瘍学会の現在のガイドラインは、この正のマージンを、表面レベルのマージンインク21に接触する癌細胞を有すると定義している。高吸収水和組織のTHzイメージングは、主に、迅速なマージン評価の外科的ニーズを満たすのに十分な組織タイプに基づいて、いくつかの様々な浸透を有する表面イメージングに限定される。外科的設定中のマージン状態の迅速な分析は、外科的費用とフォローアップ処置率を大幅に減少させるであろう。現在までに、THzはホルマリン固定、パラフィン埋め込み(FFPE)組織における癌と健康組織の区別に有効であることが証明されているが、新たに切除された組織における癌の確実な検出を提供するために追加の調査が必要である7。
このプロトコルは、バイオバンクから得られた新しい切除されたヒト組織サンプルに対してTHzイメージングおよび分光分析を行うためのステップを詳述する。切除されたばかりのヒト乳癌組織に基づいて構築されたTHzアプリケーションは、特に病院と統合されていない研究グループによって、公表された研究7,187、18、22、23ではほとんど使用されていません。,22,23切除された新しい組織の使用は、他の癌の適用にも同様にまれであり、ほとんどの非乳癌癌例は大腸癌24,25,25について報告されている。その理由の1つは、研究に使用されているTHzシステムが外科的ワークフローの一部でない限り、FFPE組織ブロックは、新たに切除された組織よりもはるかに簡単にアクセスして取り扱いやすいということです。同様に、ほとんどの市販の実験室THzシステムは、新鮮な組織を処理する準備ができておらず、細胞株の成長を使用する段階にあるか、動物モデルからの切除された組織を見始めただけです。THzを術中の設定に適用するには、分析が標準的な病理を行う能力を妨げないように、新鮮な組織のためにイメージングと特性評価のステップを事前に開発する必要があります。本来は術中を意図していないアプリケーションでは、新しい組織の特性評価は、生体内のアプリケーションと分化に向けて取り組むために取り組まなければならない困難なステップです。
この研究の目的は、商用THzシステムを使用して新しく切り出した組織のためのTHzアプリケーションのガイドラインを提供することです。このプロトコルは、マウス乳癌腫瘍13、17、19に対する19THzイメージングおよび分光法システム26上17で開発され、バイオ,バンク7、1818から得られたヒト外科7組織に拡張された。このプロトコルは乳癌に対して生成されたが、同じ概念を同様のTHz画像化システムおよび成功がマージン評価27に依存する手術で治療される他のタイプの固形腫瘍癌にも適用することができる。切除された組織に関してかなり少量のTHz結果が公表されているため、これはTHzイメージングおよび特性評価のための新鮮な組織処理のプロトコルに焦点を当てた著者の知識にとって初めての研究です。
このプロトコルは、アーカンソー大学の環境安全衛生部門が設定したすべての要件に従います。
1. 組織の取り扱い領域を設定する

図1:組織取り扱い領域の設定この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
2. THz透過分光のための新乳がん腫瘍の取り扱い
注意:生きた組織を扱う前に、ニトリルの手の手袋、目の保護ゴーグル、フェイスマスク、およびラボコートを着用してください。常に組織を処理し、手で直接それらに触れないように実験室のピンセットを使用してください。密閉容器の外側の新鮮な組織またはスキャン段階ですべての作業は、ステップ1.1で確立された組織の取り扱い領域で行われるべきである。
注:この研究で取り扱われたすべての組織は、Dulbeccoの修正イーグルの培地(DMEM)とバイオバンクからの抗生物質溶液に出荷されました。

図2:THz透過分光測定のための腫瘍断面化。(A)バルク腫瘍の写真。(B)バルク腫瘍から切り取られた腫瘍の小切片(0.5mm)の写真。(C)分光測定用に0.1mmのポリテトラフルオロエチレンスペーサーを用いて、2つの石英窓の間の液体サンプルホルダーに置かれたスライスされた腫瘍セクション。図は、Spieの許可を得てT.ボウマンら18から再公開されました。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
3. THz透過分光測定

図3:THz透過分光モジュールのセットアップ(A)伝送モジュールが搭載されたTHzコアチャンバー。(B)液体サンプルホルダーの写真。(C)測定のためにコアチャンバーの内部に置かれるサンプルホルダー。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
4. THz反射モードイメージングのための新鮮な乳癌腫瘍の取り扱い

図4:THzイメージング用の新鮮な腫瘍サンプル調製物。(A)濾紙に腫瘍を置いて乾燥させる。(B)過剰な液体を吸収するために、組織ワイプパッドを用いて、ポリスチレンプレート上に配置された腫瘍。(C)腫瘍は、方向を追跡し、気泡をチェックするために下から見た。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図 5: リフレクション イメージング用のシステム セットアップ(A)反射イメージングモジュールミラーベース。(B) スキャン段階。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
注:他の厚さやプレート材料はステップ4.5に適していますが、均一な厚さとTHz信号を妨げないように十分な吸収量が低い必要があります。

図6:ポリスチレンプレートの下側および上面からのTHz反射。(A)THz信号が1.2mmの厚いポリスチレン板に入り、反射した。(B)ポリスチレンからの一次および二次的なTHz時間領域信号を測定した。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
5. 組織病理学の手順の準備として、新鮮な組織の後処理

図7:THzイメージング後の腫瘍の後処理。(A)腫瘍は、段ボールホルダーに下向きに置かれ、組織マーキング染料で染める。(B)フィルターペーパーは、腫瘍の上に置かれ、接触を維持するためにテーピング。(C)10%中性緩衝ホルマリン溶液に浸漬し、パラフィルムで密封されたダンボールに固定された染色された腫瘍。Cこの図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
6. 有害廃棄物処理

図8:生物危険廃棄物袋の写真。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
7. THz画像を構築するためのデータ処理


は領域jの複素伝搬係数であり、ここで、ωは角周波数、cは真空中の光の速度、njjは屈折率の実部、αabs、jは吸収係数18である。領域1は空気、領域2はポリスチレンプレート、領域3は組織である。透過分光データを用いた組織の電気的性質の抽出

.ñは、 として
定義される複素屈折率であり、nは屈折率の実部分です。cは光の速度です。ωは角周波数です。αabsabsは吸収係数15である。バイオバンクから受け取ったヒト乳癌腫瘍検体の上記プロトコルに#ND14139したTHz画像化結果18を図9に示す。病理報告によると、#ND14139腫瘍は、左乳房乳房乳房乳房乳房切除手術を介して49歳の女性から得られたI/IIグレードの浸潤性乳管癌(IDC)であった。腫瘍の写真を図9Aに示し、図9Bの病理画像、およびプロトコルで(1)式を用いて得られたTHzパワースペクトル画像を図9Cに示す。病理画像の評価は、オクラホマ州立大学のコンサルティング病理学者によって行われました。THz画像を病理画像と相関させると、癌領域(すなわち、図9Cの赤色領域)が脂肪領域よりも高い反射を示していることは明らかであった(すなわち、図9Cの青色領域)。図9Cの癌領域の中心に近い青色の円は、イメージングプロセス中に腫瘍の下に気泡が存在したためであった。
上記の論示されたモデルを用いて得られた腫瘍の電気的特性に基づく断層画像も、各画素(合計で2,477ピクセル)に対して提示される。吸収係数(cm-1)データ(α-画像)と屈折率(n-image)の周波数0.5 THz及び1.0THzで得られた腫瘍の断層画像をそれぞれ図9D、9E、9F、9Gに示す。 9G周波数が増加するにつれて、癌と脂肪ピクセルの計算された吸収係数(cm-1)値が増加し、癌ピクセルは両方の周波数で脂肪よりも高い値を示した。これに対し、両組織の屈折率は、周波数が増加するにつれて減少した。なお、測定された位相は、撮像段階のレベリング、ポリスチレン板厚、ステッパーモータジッタのマイクロメートルスケール変動の影響を受け、周波数が増加することに留意すべきである。例えば、図9Eおよび9Gで観測された水平線は、走査プロセス中にステッパーモータによって導入された小位相シフトによるもので、低周波数では観測されなかった。

図9:THzイメージング技術を用いた乳がん腫瘍#ND14139の解析(A)腫瘍の写真。(B)腫瘍の低電力病理画像。(C)周波数範囲を超える THz 電力スペクトル画像 0.5 THz – 1.0 THz(D) THz 断層線吸収係数画像を 0.5 THz で取得した。Dこの画像は、腫瘍の生反射画像データから各画素で抽出された吸収係数データを用いて構築した。(E)1.0THzで得られる吸収係数画像(F)屈折率画像E(n-画像)0.5THzで得た。この画像は、腫瘍の生反射画像データから各画素で抽出された屈折率データを用いて構築した。(G)屈折率画像(n- 画像) 1.0 THzで得られた図。18この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図9で説明したTHzの結果は、記載されたプロトコルに従って正常に得られた。組織の取り扱いが不十分な場合、誤解を招く画像化結果を招く可能性があります。例えば、ヒト乳癌腫瘍に対する図10のTHz画像化結果は、不十分な乾燥の効果を示す#ND10405。組織における過剰なDMEM溶液は、図10B28における腫瘍のTHzパワースペクトル画像を支配し、図10A2828に示す病理画像と相関しなかった高反射を有する。28これは偽陽性の結果をもたらし、腫瘍における癌のより大きな存在を示唆した。図10C19、10D19に見られるように、DMEMは同様に高い屈折率10D19と水への吸収係数を示したので、イメージングの前に腫瘍を適切に乾燥させることが強く推奨されています。19

図10:フィルターペーパーを用いた乾燥を行わずにDMEM溶液から取り出した腫瘍イメージングに対する効果。(A)腫瘍#ND10405の低電力病理画像。(B) 周波数範囲を超える腫瘍#ND10405のTHzパワースペクトル画像 0.5 THz–1.0 THz(C) DMEM、PBS、および水の透過屈折率プロット 0.15 THz~3.5 THz(D) DMEMの伝送吸収係数(cm-1)プロット PBS、および0.15 THz~3.5 THzのC水と、図10A、10Bは、IEEEと図10Cの許可を得てT.ボウマンら28から再公開され、図10DはIOP出版の許可を得てN.Vohraら19から再公開されています。 Figure 10C
プロトコルへの不十分な付着の別の例は、図11に腫瘍#ND11713について示されている。この場合、発像手順のために腫瘍をプレートに配置した際に、ポリスチレンプレートと腫瘍の間の気泡は除去されなかった。この結果、図11BのTHz画像全体の低反射のスポットがいくつか得られ、図11Aの病理との正確な比較が妨げられた。したがって、プレートに腫瘍を置いた後に気泡が観察された場合は、ピンセットで押すか、腫瘍を持ち上げて、空気の隙間が取り除かれるまでゆっくりとポリスチレンに転がします。

図11:ポリスチレンプレートと腫瘍の間に気泡が存在することによって起こされるTHz画像のアーチファクト。(A)腫瘍#ND11713の低電力病理画像。(B) 0.5 ~1.0 THz の周波数範囲を超える腫瘍#ND11713の THz パワースペクトル画像。
同じサンプルに対する18透過分光結果18(#ND14139)を図12に示します。腫瘍切片は、ポイント
から
取り出し、図12Aで、プロトコルに従って特徴付けた。いずれも、図12Bの病理画像に従って腫瘍中の癌組織領域から採取した。両方の腫瘍切片の抽出吸収係数と屈折率を図12C,Dに示す。両方の点は、全体の周波数範囲のための良好な一致を示しました。図12Cおよび図12Dの0.15~2THzFigure 12Dの黒色の曲線は、文献23から得られたデータを表し、我々の研究で得られた結果を比較する。

図12:THz透過分光法を用いた乳がん腫瘍#ND14139の特徴付け。(A)腫瘍の2つの選択された点がマーク
され、
腫瘍の厚さ0.5mmの部分が透過分光測定のために切断されたところから、腫瘍の写真。(B)腫瘍の低電力病理画像。(C) 伝送吸収係数 (cm–1)プロットは、0.15 ~ 3.5 THz の点
と
.(D) 0.15 ~3.5 THz の点
と .
図は、Spieの許可を得てT.ボウマンら18から再公開されました。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
著者らは、利益相反はないと宣言している。
新しく切除されたヒト乳癌腫瘍は、新鮮な組織処理プロトコルに従ってテラヘルツ分光法およびイメージングを特徴とする。組織位置決めは、効果的な特性評価を可能にする一方、将来の術中アプリケーションに適時に分析を提供することを考慮する。
この研究は、国立衛生研究所(NIH)賞#R15CA208798によって資金提供され、一部は国立科学財団(NSF)賞#1408007によって資金提供されました。パルスTHzシステムの資金調達は、NSF/MRIアワード#1228958を通じて得られました。我々は、NIH補助金U42OD11158の支援を受けて、国立疾病研究インターチェンジ(NDRI)によって調達された組織の使用を認める。我々はまた、この研究で取り扱われるすべての組織に対する組織病理学的処置を行ったオクラホマ州立大学のオクラホマ動物疾患診断研究所との共同研究を認める。
| 70% イソプロピル アルコール | VWR | 89108-162 | 70% USP グレードのイソプロパノールと 30% USP グレードの脱イオン水が含まれています |
| アルコノックス粉末洗剤 | VWR | 21835-032 | ガラス、金属、ステンレス鋼、磁器、セラミック、プラスチック、ゴム、グラスファイバーから有機汚染物質を除去する濃縮洗剤 |
| バイオハザード バッグ | フィッシャー サイエンティフィック | 19-033-712 | Justrite FM承認のバイオハザード廃棄物容器交換用バッグ |
| 段ボールホルダー | N/A | N/A | ホルマリンに浸漬したときに組織イメージング面をそのまま保持するスクラップ段ボール |
| 遠心分離管 | VWR | 10026-078 | フラットキャップ付き遠心分離管、円錐底、ポリプロピレン、滅菌、標準ライン |
| 綿棒 | ウォルマート | 551398298 | Qチップ オリジナル綿棒 を染色するために使用されるティッシュ |
| エチルアルコール | VWR | 71002-426 | KOPTECH 純粋な(非変性)無水(200プルーフ/ 100%)エチルアルコール |
| 目の保護ゴーグル | VWR | 89130-918 | Kimberly-clark プロの安全メガネ |
| フェイスマスク | VWR | 95041-774 | DUKAL Corporation サージカルマスク |
| 濾紙 | シグマ アルドリッチ | Z240087 | Whatman グレード 1 セルロース フィルター |
| ホルマリン溶液 | シグマ アルドリッチ | HT501128-4L | 10% 中性緩衝ホルマリン |
| ヒトの新たに切除された腫瘍 (濾過性乳管癌 (IDC)) | 全国疾病研究交流 (NDRI バイオバンク | N/A | プロトコルは、必要な腫瘍の種類の NDRI と署名されています |
| IRADECON 漂白剤溶液 | VWR | 89234-816 | 希釈済み次亜塩素酸ナトリウム漂白剤溶液 |
| KIMTECH SCIENCEワイプ | VWR | 21905-026 | Kimberly-clarkプロフェッショナルキムワイプ |
| ラボコート | VWR | 10141-342 | このカタログ番号は、中型コート用です |
| ラボラトリーピンセット/鉗子 | VWR | 82027-388 | 組織を傷つけない限り、任意のラボ用ピンセットを使用できます |
| 液体サンプルホルダー(0.1mmテフロンスペーサー付き2つの石英窓) | TeraView、Ltd | N / A | 1 "直径、および0.1452"厚い石英窓 |
| ニトリルハンドグローブ | VWR | 82026-426 | このカタログ番号は、中型手袋窒素 |
| シリンダー | 用ですエアガス | NI UHP300 | NITROGEN UHP GR 5.0 SIZE 300 |
| ペーパータオル | VWR | 14222-321 | 11 "x 8.78"シート、1プライ |
| パラフィルム | VWR | 52858-076 | 柔軟な熱可塑性プラスチック。紙を巻き込んだ防水シートを巻いて自己接着を防ぎます。 |
| ペトリ皿 | VWR | 470210-568 | VWR シャーレ、滑り止め、モノプレート (未分割底部) |
| ポリスチレンプレート | ホームデポ | 1S11143A | ~ 11インチ x 14インチ x 0.05インチ ノングレアスチレンシート |
| ScanAcquire ソフトウェア | TeraView, Ltd | N/A | THz 反射イメージング測定用システムソフトウェア |
| ステンレス鋼薄型ブレード (#4689) | VWR | 25608-964 | Tissue-Tek Accu-Edge 使い捨てミクロトームブレード |
| ステンレス製金属トレイ | クイックメディカル | 10F | ポーラーウェア ステンレス製医療機器トレイ |
| ティッシュマーキング染料 | テッド・ペラ社 | イエローダイ #27213-1 レッドダイ #27213-2 ブルーダイ #27213-4 | 切除された組織サンプル を組織病理学研究所TPSに送るために使用されます |
| Spectra 3000 | TeraView, Ltd | N/A | THzイメージングおよび分光システム |
| TPS Spectra Software | TeraView, Ltd | N/A | THz透過分光測定用システムソフトウェア |