ここでは、ラクトバチルス細胞遊離上清(LCFS)の抗癌効果を理解する方法が提示されている。大腸癌細胞株は、3D培養でLCFSで治療した場合の細胞死を示す。スキャフォールドの生成過程はスキャフォールドに応じて最適化でき、提示される解析方法は、関係するシグナル伝達経路を評価するのに有用である。
方法論記事
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
10% Mini-PROTEAN TGX プレキャストタンパク質ゲル、15 ウェル、15 µl | Biorad | 4561036 | Pkg of 10 |
| Applied Biosystems MicroAmp Optical Adhesive Film | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 4311971 | 100 カバー |
| 10x トランスファーバッファー | Intron | IBS-BT031A | 1 L |
| 10X Tris-Glycine (w/SDS) | Intron | IBS-BT014 | 1 L |
| Axygen 2.0 mL MaxyClear Snaplock Microcentrifuge Tube, ポリプロピレン, 透明, 非滅菌, 500 チューブ/パック,10パック/ケース | Corning | SCT-200-C | 500 チューブ/パック, 10 パック/ケース |
| BD Difco Bacto Agar | BD | 214010 | 500 g |
| BD Difco Lactobacilli MRS Broth | BD | DF0881-17-5 | 500 g |
| CellTiter-Glo 3D 細胞生存率アッセイ | Promega | G9681 | 100μ96ウェルプレートのl / assay |
| 完全なプロテアーゼ阻害剤カクテル | Sigma-Aldrich | 11697498001 | 20錠のバイアル |
| コーニングリン酸緩衝生理食塩水、カルシウムとマグネシウムを含まない1倍、PH 7.4 ± 0.1 | コーニング | 21-040-CV | 500 mL |
| EMD ミリポア イモビロン-P PVDF トランスファーメンブレン | フィッシャーサイエンティフィ | IPVH00010 | 26.5cm x 3.75m ロール;細孔サイズ:0.45um |
| Falcon 5 mL丸底ポリスチレン試験管、セルストレーナースナップキャップ | 付き Corning | 352235 | 25/Pack、500/Case |
| Fetal Bovine Serum、認定、米国原産 | Thermo Fisher Scientific | 16000044 | 500 mL |
| iScript cDNA Synthesis Kit、25 x 20 µl rxns #1708890 | Biorad | 1708890 | 25 x 20 & マイクロ;L rxns |
| iTaq Universal SYBR Green Supermix | Biorad | 1725121 | 5 x 1 mL |
| Lactobacillus fermentum | Korean Collection for Type Cultures | KCTC 3112 | |
| L-Cysteine hydrochloride monohydrate | Sigma-Aldrich | C6852-25G | 25 g |
| メチルセルロース (3500-5600mPa·s、20°Cで水中の2%。C) | TCI | M0185 | 500 g |
| MicroAmp Fast Optical 96-Well Reaction Plate with Barcode, 0.1 mL | Applied Biosystems | 4346906 | 20 plates |
| Millex-GS Syringe Filter Unit, 0.22 & micro;m、混合セルロースエステル、33 mm、エチレンオキシド滅菌ミリ | ポア | SLGS033SB 250 | |
| PE アネキシン V アポトーシス検出キット、7-AAD | Biolegend | 640934 | 100 検査 |
| ペニシリン-ストレプトマイシン (10,000 U/mL) | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 15140122 | 100 mL |
| ヨウ化プロピジウム | イントロゲン | P1304MP | 100 mg |
| RIPA 溶解および抽出バッファー | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 89901 | 250 mL |
| RNeasy ミニキット (250) | Qiagen | 74106 | 250 |
| RPMI-1640 | Gibco | 11875-119 | 500 mL |
| トリプシン-EDTA (0.25%)、フェノールレッド | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 25200056 | 100 mL |
| 材料名/機器名/ソフトウェア | 会社名 | カタログ番号 | コメント/説明 |
| anti - p-IκB&アルファ;(B-9) | サンタクルーズ | sc-8404 | 200 µg/mL |
| 抗 BclxL (H-5) | サンタクルーズ | sc-8392 | 200 µg/mL |
| 抗 PARP 1 (C2-10) | サンタクルーズ | sc-53643 | 50 µl腹水 |
| 抗-&β;-アクチン(C4) | サンタクルーズ | sc-47778 | 200 µg/mL |
| BD FACSVerse | BD Biosciences | サンディエゴ、カリフォルニア州、米国 | |
| Synergy HTX マルチモードマイクロプレートリーダー | BioT | S1LFA | |
| CO2 インキュベーター | サーモフィッシャー | HERAcell 150i | |
| コニカルチューブ 15 ml | SPL | 50015 | |
| コニカルチューブ 50 ml | SPL | 50050 | |
| Corning Costar 超低アタッチメントマルチウェルプレート | Sigma-Aldrich | CLS7007 | |
| Corning Costar 超低アタッチメント マルチウェルプレート | Sigma-Aldrich | CLS3471 | |
| Costar 50 mL 試薬リザーバー、5/袋、滅菌済み | Costar | 4870 | |
| Countess Cell Counting Chamber スライド | サーモフィッシャー | C10228 | |
| Countess II FL Automated Cell Counter | invitrogen | ||
| EnSpire マルチモードリーダー | Perkin Elmer | Enspire 2300 | |
| Eppendorf Research Plus Multi Channel Pipette, 8-channel | Eppendorf | 3122000051 | |
| FlowJo software | TreeStar | Ashland, OR, USA | |
| ヤギ抗マウスIgG (H+L) | Jackson immunoresearch | 115-035-062 | 1.5 mL |
| ヤギ抗ウサギIgG (H+L) | Jackson immunoresearch | 111-035-144 | 2.0 mL |
| GraphPad Prism 5 | GraphPad Software | Inc., San Diego, CA, USA | |
| ImageJ | NIH | ||
| ImageQuant LAS 4000 mini | 富士フイルム | 東京, 日本 | |
| インキュベートシェーカー | ラボ コンパニオン | SIF-6000R | |
| Multi Gauge Ver. 3.0, | 富士フイルム | 東京、日本 | |
| 光学密度(OD)LAMBDA UV/Vis分光光度計 | Perkin Elmer | Waltham, MA, USA | |
| 位相差顕微鏡 | オリンパス | 東京 | |
| SPL 微量遠心チューブ 1.5mL | SPL | 60015 | |
| SPL マルチチャンネルリザーバー、12-Chs、PS、滅菌済み | SPL | 21012 | |
| StepOnePlus Real-Time PCR system | サーモフィッシャーサイエンティフィック | ウォルサム、マサチューセッツ州、米国 | |
| バイブレーションセル超音波液体プロセッサ | SONICS-ビブラセル | VC 505 | 500ワット 超音波プロセッサ |
| ビニール嫌気性チャンバー | COY LAB製品 |
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