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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
このプロトコルは、蛍光活性化細胞選別または免疫磁気ビーズ分離により、マウス腹腔内白色脂肪組織(WAT)デポから脂肪形成および線維炎症性間質細胞亜集団を単離するための技術的アプローチを説明しています。
白色脂肪組織(WAT)の間質血管画分(SVF)は、非常に不均一であり、成人期のWATの拡張とリモデリングに機能的に寄与する多数の細胞タイプで構成されています。この細胞の不均一性の影響を研究する上での大きな障壁は、in vitroおよびin vivo分析のためにWAT SVFから機能的に異なる細胞亜集団を容易に分離できないことです。シングルセルシーケンシング技術は最近、成体マウスの腹腔内WATデポにおいて、機能的に異なる線維炎症性および脂肪形成性PDGFRβ+血管周囲細胞亜集団を同定しました。線維炎症性前駆細胞(「FIP」と呼ばれる)は、炎症誘発性の表現型を発揮できる非脂肪原性コラーゲン産生細胞です。PDGFRβ+脂肪細胞前駆細胞(APC)は、細胞移植時にin vitroおよびin vivoの両方で高い脂肪形成を示します。ここでは、マウスの腹腔内WATデポからこれらの間質細胞亜集団を単離するための複数の方法について説明します。FIPおよびAPCは、蛍光活性化セルソーティング(FACS)またはビオチン化抗体ベースの免疫磁気ビーズ技術を利用することにより、単離できます。単離された細胞は、分子解析や機能解析に利用することができます。間質細胞亜集団の機能特性を単独で研究することで、細胞レベルでの生理学的または病理学的条件下での脂肪組織リモデリングに関する現在の知識が広がります。
白色脂肪組織(WAT)は、哺乳類のエネルギー貯蔵の主要な部位を表しています。この組織内では、脂肪細胞、または「脂肪細胞」が過剰なカロリーをトリグリセリドの形で貯蔵し、大きな単房性脂肪滴にパッケージ化されています。さらに、脂肪細胞は、エネルギー恒常性の様々な側面を調節する多数の因子を分泌する1,2,3。脂肪細胞はWATボリュームの大部分を占めています。ただし、脂肪細胞はWAT 4,5に見られる全細胞の50%未満しか占めていません。WATの非脂肪細胞コンパートメント、または間質血管画分(SVF)は、非常に不均一であり、血管内皮細胞、組織常在免疫細胞、線維芽細胞、および脂肪細胞前駆細胞(APC)集団が含まれています。
WATは、エネルギー貯蔵の需要の増加に伴ってサイズを拡大するという驚くべき能力において、非常に優れています。WATでの脂質の適切な保存は、非脂肪組織への有害な異所性脂質沈着から保護するため、この組織の可塑性を維持することが不可欠です6。カロリー過剰に反応して個々のWATデポがこの拡大を経験する方法は、肥満の状況におけるインスリン感受性の重要な決定要因です7。メタボリックシンドロームの肥満患者に観察される病理学的WAT拡張は、代謝的に好ましい皮下脂肪組織を犠牲にして、内臓WATデポの優先的な拡大によって特徴付けられます。さらに、肥満におけるインスリン抵抗性は、WATの病理学的リモデリングに関連しています。これは、既存の脂肪細胞の肥大成長(サイズの増加)、不十分な血管新生、慢性代謝炎症、細胞外マトリックス成分の蓄積(線維化)、および組織の低酸素症によって特徴付けられます8,9。これらの肥満のWAT表現型は、脂肪異栄養症(機能的WATの欠如)の状態で観察されるものと同様に、脂肪肝およびインスリン抵抗性と関連しています。対照的に、健康なWATの拡大は代謝的に健康な肥満集団で観察され、脂肪細胞過形成10を介した保護皮下WATおよびデポー拡大の優先的な拡大によって特徴付けられます。新しい脂肪細胞の動員は、脂肪細胞前駆細胞(APC)からのde novo脂肪細胞の分化(「脂肪形成」と呼ばれる)によって媒介されます。脂肪細胞の過形成は、比較的低い程度のWAT線維症および代謝性炎症と一致します6,11。WAT微小環境内の多数の細胞型は、肥満におけるWATの健康と拡張性に直接影響します12。そのため、WATに存在するさまざまな細胞タイプの機能を定義することは、この分野にとって依然として高い優先事項です。
過去10年間で、ヒトおよびマウスのWAT SVF13から天然APCを定義し、単離するためにいくつかの戦略が採用されてきました。このような戦略では、抗体ベースの細胞分離技術を用いて、一般的な間葉系幹細胞/前駆細胞マーカーの細胞表面発現に基づいてAPCを単離します。これらのアプローチには、蛍光標識抗体を用いた蛍光活性化細胞選別(FACS)や、免疫磁気ビーズ分離(すなわち、化学的に修飾された抗体)が含まれます。APCの単離を標的とする細胞表面タンパク質には、PDGFRα、PDGFRβ、CD34、およびSCA-1が含まれます。これらのアプローチは、APCの充実に役立っています。しかし、これらのマーカーに基づいて単離された細胞集団は、かなり不均一です。ごく最近のシングルセルRNAシーケンシング(scRNA-seq)研究では、マウスWAT 14,15,16,17の単離された間質血管画分(SVF)内の間質細胞の分子的および機能的不均一性が浮き彫りになっています。私たち自身のscRNA-seqおよび機能解析から、成体マウスの腹腔内WATの間質コンパートメントにおける機能的に異なる免疫調節および脂肪形成PDGFRβ+血管周囲細胞亜集団を同定し、特徴付けました15。線維炎症性前駆体(FIP)は、PDGFRβ+細胞の顕著な亜集団であり、LY6C発現(LY6C+ PDGFRβ+細胞)に基づいて単離することができる15。FIPは脂肪形成能力を欠き、さまざまな刺激に対して強い炎症誘発性反応を発揮し、コラーゲンを生成し、抗脂肪生成因子を分泌します15。これらの細胞の炎症誘発性および線維形成活性は、マウスの肥満に関連して増加し、これらの細胞がWATリモデリングの調節因子として関与しています。LY6C- CD9- PDGFRβ+亜集団は、脂肪細胞前駆細胞(APC)を表します。これらのAPCは、Ppargおよび他の脂肪形成促進遺伝子の発現に富んでおり、in vitroおよびin vivoで成熟脂肪細胞に容易に分化します15。ここでは、FACSを使用して成体マウスの腹腔内WATデポからこれらの異なる細胞集団を単離し、ビオチン化抗体を使用して免疫磁気ビーズを分離するための詳細なプロトコルを提供します。このプロトコルは、成体雄および雌マウスの複数の腹腔内WATデポから機能的に異なる脂肪前駆細胞亜集団を単離するために使用することができる15。これらの機能的に異なる細胞集団を単独で研究することは、健康と疾患における脂肪形成と腹腔内脂肪組織のリモデリングを調節する分子メカニズムの現在の理解に大きく貢献する可能性があります。
以下のプロトコルは、マウス精巣上体WATからの脂肪前駆細胞の単離を詳述しています。しかし、同じ手順を使用して、雄および雌マウス15の両方の腸間膜および後腹膜WATデポから対応する細胞を単離することができる。マウスでこれらのデポを同定し、単離する方法に関する詳細なプロトコルは、Bagchi et al.18に記載されています。このプロトコルは、6〜8週齢のマウスの使用に最適化されています。APCの頻度と分化能力は、加齢に伴って低下する可能性があります。
すべての動物のプロトコルと手順は、テキサス大学サウスウェスタンメディカルセンターの施設用動物使用およびケア委員会によって承認されています。
1. 性腺白脂肪組織からの間質血管画分(SVF)の単離
2. FACSを用いたAPCとFIPの分離
3. 脂肪形成画分と非脂肪形成画分の免疫磁気分離
4. 脂肪形成画分および非脂肪生成画分の純度をフローサイトメトリーで評価する
5. FIPおよびAPCの純度を評価するための定量PCRを用いた遺伝子発現解析
6. 細胞培養と分化
このプロトコルは、成体マウスの腹腔内WATデポから異なる間質細胞集団の単離を可能にする2つの戦略を説明しています。APCおよびFIPは、FACS(図1)またはビオチン化抗体による免疫磁気ビーズ分離(図2)によって単離できます。どちらのアプローチも、すべて市販の試薬と抗体を利用します。免疫磁気ビーズの分離は、gWAT SVFからの脂肪形成細胞と非脂肪形成細胞の分離につながります。フローサイトメトリー解析では、脂肪形成画分内の細胞の75%がLY6C-CD9-APCsを表していることが示されました。非脂肪生成画分の>75%がFIP(LY6C+細胞)を表していました。

図1:FACSによる性腺WATからのPDGFR β+間質細胞亜集団の単離。 (A)手順の概略概要:間質血管画分(非脂肪細胞)は、酵素組織消化および遠心分離によって成熟脂肪細胞から分離されました。次に、蛍光活性化セルソーティング(FACS)を使用して、内皮細胞(CD31+)および造血(CD45+)系統細胞を取り出し、LY6C+ PDGFRβ+細胞(FIP)およびLY6C-CD9-PDGFRβ+細胞(APC)を単離しました。(B)代表的なFACSコレクションゲート。パネルAは参考文献11から許可を得て転載しています。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図2:免疫磁気ビーズ分離による脂肪形成間質細胞と非脂肪形成間質細胞の分離。 (A)手順の概略概要:ステップ1:CD31+およびCD45+細胞が磁石に結合する。これにより、内皮細胞と造血系統細胞の両方が除去されます。CD31-細胞とCD45-細胞を含む溶出液を採取し、次にそれぞれLY6CおよびCD9を認識する抗体とインキュベートしました。ステップ2:CD9+およびLY6C+細胞が磁石に結合します。ステップ3:CD9-およびLY6C-細胞を含む上清(非結合画分)は、脂肪形成画分(APC)を表しているため、収集されました。ナノスフェアに結合した非脂肪原性CD9+およびLY6C+細胞を、FIPを含む非APC画分として溶出しました。(B)脂肪形成画分および非脂肪形成画分内のAPC(LY6C-CD9-)およびFIP(LY6C +)の頻度をそれぞれ評価するためのフローサイトメトリー分析。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
光学顕微鏡法および遺伝子発現解析により、FACによって単離されたAPCまたは6〜8週齢マウスのgWATからの磁気ビーズ分離により単離されたAPCは、性腺APC培養培地に細胞を最初にプレーティングしてから7〜10日以内に脂質含有脂肪細胞に高度に分化したことが実証されています(図3)。対照的に、非脂肪原性前駆体(線維炎症性前駆体、またはFIPなど)は線維芽細胞様のままであり、同じ培地(性腺APC培養培地)で維持しても脂肪細胞にはなり ませんでした(図3)。非APCs培養では、脂質蓄積を示さなかった細胞がほとんどないことに注意する必要があります(図3D)。これらは、細胞単離中のAPC汚染から生じる可能性があります。追加の洗浄により、この画分の純度が向上する可能性があります。

図3:成体マウスのgWATから単離されたPDGFR β+間質細胞集団のin vitro分化。 (A-D)6-8週齢のマウスgWAT SVFから免疫磁気ビーズ分離(A-B)またはFACS(C-D)によって単離された分化した間質細胞亜集団の代表的な明視野画像。画像は、Gonadal APC Culture Mediaで細胞をプレーティングした7日後に撮影しました。めっき後7〜10日以内に、APCは自発的に脂肪細胞の分化を起こします。倍率10倍。スケール = 250 μM. (E-F) A-Dに示されている分化培養物中の脂肪細胞選択的遺伝子のmRNAレベル。棒グラフは平均+SEMを表しており 、この図の拡大版を表示するにはここをクリックしてください。
| FIPの | 濃縮遺伝子(対APC) | フォワードプライマー 5'-3' | リバースプライマー5 '-3 ' |
| Ly6c1 | ACTGTGCCTGCAACCTTGTCT | GGCCACAAGAAGAATGAGCACの | |
| CD9の | GCGGGAAACACTCAAAGCCCATの | AAAGCTGTTTCTTGGGGCAGG | |
| 11 月 | GTTCCAAGAGCTGTGGAATGG | CTCTTGTTCACAAGGCCGAAC | |
| エフHDD1 | GGCCGCTCTAAGGTCTTCAAT | GTCAATAAAGCCGTCCCTTCC | |
| STMN4の | ACCTGAACTGGTGCGTCATCT | CTTGGGAGGGAGGCATTAAAC | |
| 第2幕 | AGCCCCCTAAAGGAAGAAACC | GGTCCTTGGCCACAGTCATTA | |
| IL33 | ATTTCCCCGGCAAAGTTCAG | AACGGAGTCTCATGCAGTAGA | |
| Ccl2 | CCACAACCACCTCAAGCACTTC | AAGGCATCACAGTCCGAGTCAC | |
| TGFB2 | GGTGTTGTTCCACAGGGGTTA | CGGTCCTTCAGATCCTCCTTT | |
| FN1の | GAGAGCACACCCGTTTTCATC | GGGTCCACCATGATGGTGACTT | |
| DPP4の | TGGTGGATGCTGGTGTGGATT | AAGGGGCCTCTCTTCTCTCTCTCTの | |
| Thy1(シー1) | TCTTCTTTCCCTTGCCCCTCTG | AGGTTGCAAGACTCTCGCTGT | |
| APCの | 濃縮遺伝子(対FIP) | フォワードプライマー 5'-3' | リバースプライマー5 '-3 ' |
| アグト | GTTCTGGGCAAAACTCAGTGC | GAGGCTCTGCTGCTCATCATT | |
| CXCL14の | TGGACGGGTCCAAGTGTAAGT | TCCTCGCAGTGTGGGTACTTT | |
| MMD2の | ATCTGGGAGCTGATGACAGGA | AGTGGGTACCAGCACCAAATG | |
| PDE11aの | CGAGCTTGTCAGGAAAGGAGA | TTCAGCCACCTGTCTGGAGAT | |
| Lrn1の | CAACATGGGAGAGCTGGTTTCの | GCACACTACGGAAAGCCAAAC | |
| プパルグ | GCATGGTGCCTTCGCTGA | TGGCATCTCTGTGTCAACCATG | |
| ファブップ4 | ACTGGGCGTGGAATTCGATGA | ACCAGCTTGTCACCATCTCGT | |
| LPLの | CATCGAGAGAGGATCCGAGTGAA | TGCTGAGTCCTTTCCCTTCTG | |
| CD36の | GAGTTGGCGGGAAACCAGTG | ガガートgcctccaaacacagc |
表1:FIPおよびAPCの単離を検証するために使用したqPCRプライマー配列
T.A.P.は、ノボ ノルディスクA/Sの従業員であり、株主です
このプロトコルは、蛍光活性化細胞選別または免疫磁気ビーズ分離により、マウス腹腔内白色脂肪組織(WAT)デポから脂肪形成および線維炎症性間質細胞亜集団を単離するための技術的アプローチを説明しています。
著者は、優れた技術支援を提供してくれたLisa HansenとKirsten Vestergaard、そして原稿の批判的な読み方をしてくれたP. Scherer、N. Joffin、C. Creweに感謝しています。著者らは、ここで説明するプロトコルの開発における優れたガイダンスと支援を提供してくれたUTSW Flow Cytometry Coreに感謝します。R.K.G. は、NIH NIDDK R01 DK104789、NIDDK RC2 DK118620、および NIDDK R01 DK119163 でサポートされています。J.P.は、Innovation Fund Denmarkから博士課程前賞を受賞しています。
| 機械的組織調製およびSVF分離 | |||
| 40および100 µm セルストレーナー | Fisher Scientific | 352340/352360 | |
| 1X リン酸緩衝生理食塩水 (PBS) | Fisher Scientific | 21040CV | |
| 5ml ポリプロピレンチューブ | Fisher Scientific | 352053 | |
| Digestion Buffer (for 10mL) | |||
| 10 ml HBSS | Sigma | H8264 | |
| 10 mg コラゲナーゼ D (1 mg/ml 最終 cc.) | ロシュ | 11088882001 | |
| 0.15 g BSA(1.5 % final cc.) | Fisher Scientific | BP1605-100 | |
| APCs and non-APCsの免疫磁気分離 | |||
| 5X MojoSortバッファー(MSバッファー) | BioLegend | 480017 | |
| 5 ml MojoSortマグネット(MSマグネット) | BioLegend | 480019 | |
| 100 µL MojoSort ストレプトアビジンナノビーズ | BioLegend | 480015 | |
| Purity Check and FACS | |||
| 10X Red Blood Cell Lysis Buffer | eBioscience | 00-4300-54 | |
| Fc block (Mouse CD16/CD32) | eBioscience | 553141 | |
| Antibodies | |||
| ビオチン CD45 | BioLegend | 103103 | 濃度: ≤ 0.25 & μ;10^6細胞あたりのg 種:マウスクローン:30-F11 |
| オチンCD31 | バイオレジェンド | 102503 | 濃度:≤ 0.25 µ10^6細胞あたりのg 種:マウスクローン:MEC13.3 |
| オチンCD9 | バイオレジェンド | 124803 | 濃度:≤ 0.25 µg 10^6細胞あたり 種:マウス クローン:MZ3 |
| ビオチン LY6C | BioLegend | 128003 | 濃度: ≤ 0.25 µ10 ^ 6細胞あたりのg 種:マウス、 クローン:HK1.4 |
| CD31-PerCP / Cy5.5 | BioLegend | 102419 | 、濃度:希釈、1:400 、種:マウス クローン:390 |
| CD45-PerCP / Cy5.5 | BioLegend | 103131 | 、濃度:希釈、1:400 種:マウス クローン:30-F11 |
| CD140b PDGFRβ-PE | BioLegend | 136006 | 濃度:希釈1:50 種:マウス クローン:APB5 |
| LY6C-APC | BioLegend | 128016 | 濃度:希釈1:400 種:マウス クローン:HK1.4 |
| CD9-FITC | BioLegend | 124808 | 濃度:希釈 1:400 種:マウス クローン:MZ3 |
| 細胞培養およびDifferentiation | |||
| Gonadal APC 培養培地 (500mL用) | |||
| 288 mL DMEM with 1 g/L glucose | Corning | 10-014-CV | |
| 192 mL MCDB201 Σ | M6770 | ||
| 10 mL Σ Fetal Bovine Serum (FBS)** lot#14E024 | Sigma | 12303C | |
| 5 mL 100% ITS premix | BD Bioscience | 354352 | |
| 5 mL 10 mM L-アスコルビン酸-2-2リン酸 | Sigma | A8960-5G | |
| 50 & micro;L 100 g/ml FGF-ベーシック | R&D systems | 3139-FB-025/CF | |
| 5 mL ペン/溶連菌 | Corning | 30-001-CI | |
| 500 µL Gentamycin | Gibco | 15750-060 | |
| **注:一次APCの脂肪形成能力は、商用FBSのロットごとに異なる場合があります。FBSの複数のロット/ソースをテストする必要があります。 |