ここでは、ヒト多能性幹細胞由来の小腸オルガノイドおよび結腸オルガノイドを作製、維持、および特性評価するための詳細な方法について説明します。これらの方法は、オルガノイドのプレーティングと継代に必要な作業時間を短縮し、再現性を向上させ、スケーラビリティを拡大するように設計されています。
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ここでは、ヒト多能性幹細胞由来の小腸オルガノイドおよび結腸オルガノイドを作製、維持、および特性評価するための詳細な方法について説明します。これらの方法は、オルガノイドのプレーティングと継代に必要な作業時間を短縮し、再現性を向上させ、スケーラビリティを拡大するように設計されています。
腸の地域仕様は、発達中の胃腸(GI)管の定義された領域に独自の形態と機能が付与されるプロセスを説明しています。腸内の局所的な特異性は、骨形成タンパク質(BMP)経路を含む複数の発生経路によって駆動されます。通常の地域仕様に基づき、ヒト胚性幹細胞(hES)と人工多能性幹細胞(iPSC)を含むヒト多能性幹細胞(hPSC)からヒト結腸オルガノイド(HCO)を作製する方法を開発しました。BMPシグナル伝達の3日間の誘導により、中腸/後腸管培養物を、ヒト結腸に存在するすべての主要な上皮細胞タイプを含む特別なATリッチ配列結合タンパク質2(SATB2)発現HCOに十分にパターン化し、共発達する間葉系細胞にもたらします。この重要なパターニング期間中のBMPの省略(またはBMP阻害剤NOGGINの追加)により、ヒト腸オルガノイド(HIO)が形成されました。HIOとHCOは、形態学的および分子的に、それぞれヒトの発育中の小腸と結腸に似ています。HIOとHCOはヒトの腸の発達を研究する上で有用であるにもかかわらず、HIOとHCOの生成は困難です。この論文では、HIOおよびHCOを生成、維持、および特性評価する方法を紹介します。さらに、プロトコルの重要な手順とトラブルシューティングの推奨事項も示されています。
ヒトの結腸発生の研究は、ヒトの胎児組織の使用に制限があるため困難です。動物モデルは、腸の発達を研究するためのマウスの遺伝的アプローチに非常に貴重であり、歴史的に使用されてきました。しかし、マウスとヒトの腸管発生の違いにより、マウスのモデルシステムとしての適用性は限られています。例えば、マウスの小腸や結腸での陰窩形成は出生後に起こりますが、ヒトは生まれつき完全に形成された陰窩1を持っています。さらに、ヒトの小腸と結腸には、小腸のモチリン(MLN)発現腸内分泌細胞2や結腸のムチン5B(MUC5B)発現杯細胞3,4など、マウスには見られない細胞タイプが含まれています。このため、結腸発生の初期段階を定義する動的な分子イベントを正確にモデル化する細胞培養システムを持つことが重要です。したがって、結腸特性を持つ細胞を生成するようにhPSCを指示することは、ヒトの結腸発生の研究のための強力なモデルを提供します。
プロトコルは、hPSCからの腸様オルガノイド6 および結腸様オルガノイド7 の再現性5、同期的、かつ効率的な形成を促進するために開発されました。これらのプロトコルは、胎児の腸と結腸の発達を模倣した段階的な分化手順を使用します(図1)。まず、ヒト多能性幹細胞から、Nodal模倣物であるアクチビンAで処理することにより、決定的な内胚葉を作製します。決定的な内胚葉を高レベルのWNTおよび線維芽細胞成長因子(FGF)に曝露すると、CDX2+ 中腸/後腸管スフェロイドへの形態形成が誘導されます。その後、中腸/後腸スフェロイドは細胞外マトリックス(ECM)に埋め込まれ、BMPシグナル伝達の一過性操作を通じてHIOまたはHCOのいずれかにパターン化されます。NOGGINを使用してBMPシグナル伝達を阻害するか、増殖培地のみを添加すると、ヒト近位小腸に似たHIOが形成されます。
BMP2を用いてBMPシグナル伝達を活性化することにより、中腸/後腸スフェロイドはHCOにパターン化され、HCOは上皮と間葉にパターン化を保持します7。HCOは、結腸が豊富なMUC5B発現杯細胞を含み、結腸特異的インスリン様5(INSL5)発現腸内分泌細胞を産生する能力があります。HCOから単離された間葉は、ホメオボックスA13(HOXA13)とHOXD13を発現し、これらはヒトの一次結腸間葉でも発現します8。パターニングステップは、分化プロトコルの7〜10日目に発生することを覚えておくことが重要です。この3日間の期間は、長期 のin vitro 培養後も維持される結腸パターニングを誘導するのに十分です。
以下で説明するプロトコルは、フィーダーフリーのhPSC培養に精通している研究者向けです。このタイプのhPSC培養に詳しくない研究者には、Stem Cell Technologiesやシンシナティ小児病院の多能性幹細胞施設(PSCF)が提供するようなhPSCに関するトレーニングコースをお勧めします。開始時のhPSCの品質は非常に重要であり、すべての下流ステップに影響を与える可能性があります。以下のプロトコルは、4日間培養され、分割の準備ができているhPSCから始まります。
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1. ヒト腸オルガノイドおよび結腸オルガノイドの作製
2. 逆転写定量的ポリメラーゼ連鎖反応(RT-qPCR)によるオルガノイドのパターニングの検証
3. 免疫蛍光法によるオルガノイドのパターニングの検証
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中腸/後腸誘導期におけるスフェロイドの生成の成功は、パターニングの成功を示しています。浮遊スフェロイドおよび単層上のCDX2のIF染色を行い、パターニングが正しいことを確認します。決定的な内胚葉(DE)段階での染色はDE誘導の有効性を示すことができますが、効率的なDE誘導なしにはスフェロイドの生成は不可能です。DE誘導の効率をテストするには、FOXA2およびSOX17のIF染色および/またはRT-qPCRを実施します。
パターニングの段階に続いて、HOX因子の発現は、パターニングが成功したことを示す最良の指標です。HOX因子は、主に腸および結腸間葉8,9で発現されます。したがって、HOX因子の発現は間葉のパターン化を反映します。前部HOX因子HOXD3のmRNAの発現は、NOGGINで処理されたHIOで最も高く、上皮成長因子(EGF)で処理されたHIOでは少なく、BMPで処理されたHCOで最も低いはずです。逆に、HOXA13および...
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hPSCをHIOとHCOに区別することは、各ステップで品質管理を必要とする複雑なプロセスです。開始時の hPSC は、DE への分化を開始する前に、最小限の分化を行う必要があります。DE分化のために播種されたhPSCの密度を最適化することは、プロトコールの成功にとって重要です。DE分化の品質を確保するには、FOXA2とSOX17のIFを実行して、DE分化の効率を決定します。DEの分化により、処理した細胞の80%以上がFOXA2およびSOX17に陽性で染色されるはずです。最適な密度が確立されると、この同じ密度を複数の実験に使用でき、同様の成功を収めることができます。DEの分化が成功した後、中腸/後腸誘導は非常に効率的であるはずです。ECMでプレーティングした後、中腸/後腸スフェロイドにBMP2をパターニングすると、スフェロイドからのオルガノイド形成効率が低下します(~15%)。したがって、HCO生成のためのECMバブルあたりのスフェロイドは、HIOと比較して2〜3倍多くなります。
DE分化の最適な密度は、細胞株によっ...
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著者には、開示すべき利益相反はありません。
Múnera 研究室は、NIH/NCI 5U54CA210962-02 South Carolina Cancer Disparities Research Center (SC CADRE)、NIH/NIGMS P20 GM130457-01A1 COBRE in Digestive and Liver Disease、NIH/NIDDK 1P30 DK123704-01 MUSC Digestive Disease Research Core Center から資金提供を受けています。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| 1%ウシ血清アルブミン(BSA)溶液 | 該当なし | 該当なし | 該当なし |
| 15 mL Corningチューブ | 隼 | 21008-918 | 該当なし |
| 30% ショ糖 | 該当なし | 該当なし | PBS製。 |
| 5%ノーマルロバ血清 | ジャクソン免疫研究所 | 017-000-121 | 該当なし |
| 50 mL Corningチューブ | 隼 | 21008-951 | 該当なし |
| アキュターゼ | サーモサイエンティフィック | A1110501 | 細胞剥離溶液;5 mLのアキュターゼを合計20本のチューブの10 mLチューブにアリコートし、-20°Cで保存します。Cは最長6ヶ月間。4度に配置します。使用前にCを一晩。 |
| アクチビンA | 細胞誘導システム | GFH6-100x10 | 凍結乾燥粉末を100µで再構成します。0.1% ウシ血清アルブミン (BSA) を含む滅菌 PBS 中の g/mL。アリコート38&マイクロ;LのアクチビンAを予冷した微量遠心チューブに入れ、-80°Cで保存します。C(チューブの有効期限は受領日から12ヶ月です)。 |
| アクチビン 1 日目培地 (RPMI 1640) | コーニング | MT10041CV | 非必須アミノ酸(NEAA、Corning 11140050)を使用し、4°Cで保存します。基本1日目の培地:500 mLのRPMI 1640および500 mLのNEAA。アクチビン1日目培地を調製するときは、13 mLの塩基性1日目培地、13およびマイクロを加えます。l アクチビン A (100 & micro;g/mL)、および2µBMP4 の l (100 & micro;g/mL)。ベース培地は最大3週間安定ですが、成長因子を添加した直後に使用する必要があります。 |
| アクチビン 2 日目培地 (RPMI 1640、0.2% FBS vol/vol) | ハイクローン | SH30070.03トン | 非必須アミノ酸(Corning 11140050)を使用し、4°Cで保存します。塩基性2日目培地:RPMI 1640 500 mL、NEAA 500 mL、0.2%血清1 mL。アクチビン2日培地を調製するときは、12.5 mLの塩基性2日目培地と12.5&マイクロを加えます。LのアクチビンA(100µg/mL)。ベース培地は最大3週間安定ですが、成長因子を添加した直後に使用する必要があります。 |
| アクチビン 3 日目培地 (RPMI 1640、2% FBS vol/vol) | ハイクローン | SH30070.03トン | 非必須アミノ酸(Corning 11140050)を使用し、4°Cで保存します。塩基性3日目培地:RPMI 1640 500 mL、NEAA 500 mL、および2%血清10 mL。アクチビン3日目培地を調製するときは、12.5 mLの塩基性3日目と12.5日目&マイクロを加えます。LのアクチビンA(100µg/mL)。ベース培地は最大3週間安定ですが、成長因子を添加した直後に使用する必要があります。 |
| Alexa Fluor 488 ロバアンチヤギ | サーモサイエンティフィック | A11055 | 1:500希釈(二次抗体) |
| Alexa Fluor 488 ロバ アンチラビット | サーモサイエンティフィック | A21206 | 1:500希釈(二次抗体) |
| Alexa Fluor 546 ドンキーアンチマウス | サーモサイエンティフィック | A10036 | 1:500希釈(二次抗体) |
| Alexa Fluor 647 ロバアンチマウス | サーモサイエンティフィック | A31571 | 1:500希釈(二次抗体) |
| ベース金型 | 漁夫 | 22-363-552 | 該当なし |
| 基本的な腸内培地(高度なDMEM) | ギブコ | 12491015 | 塩基性腸内培地を調製するときは、500 mLのDMEM、500 mLのN2(Gibco 17-502-048)、500 mLのB27(Gibco)、500 mLのL-グルタミンを加えて2 mM L-グルタミン(Corning A2916801)、5 mLの100 U / mLペニシリン-ストレプトマイシン(Gibco 15-140-122)、および7.5 mLの 1 M HEPES で 15 mM HEPES が得られます。ベース培地は最大3週間安定ですが、成長因子を添加した直後に使用する必要があります。 |
| Biorad CFX96 タッチリアルタイムPCR検出システム | バイオラッド | 該当なし | 他のqRT-PCRシステムも使用できます。 |
| 細胞回収ソリューション | コーニング | 354253 | ECM劣化ソリューション |
| CHIR99021 | リプロセル | 4000410 | 2.15 mLのDMSOを10 mMで添加して再構成します。50&マイクロを用意します。Lアリコートし、-20°Cで保存します。粉末を4度で保管します。C、光から保護されています。 |
| CTRL HIOパターニング媒体 | 該当なし | 該当なし | 塩基性腸培地と100 ng / mL EGF。 |
| DAPIの | シグマ・アルドリッチ | D9542 | 1:100希釈(二次抗体) |
| DE単層 | 該当なし | 該当なし | 単層は前のステップで生成されました(セクション4.4)。 |
| 分散 | ギブコ | 17105041 | 凍結乾燥粉末をアドバンスドDMEM(Gibco MT15090CV)に最終濃度1 mg/mLに再懸濁します。ミリポアフィルター滅菌チューブを使用して真空吸いして滅菌用の溶液をろ過します。10 mLのアリコート(1 mg / mL)を作成し、-20°Cで保存します。Cは最長6ヶ月間。4度に配置します。使用前にCを一晩。 |
| EGFの | サーモサイエンティフィック | 236-EG-01M | 100 ng/mL EGF を調製する場合、500 & micro を再構成します。滅菌PBS中のg / mL。次に、2 mLの滅菌PBSを1 mg EGFに加え、500µg/mL EGF 溶液。アリコート100&マイクロ;20本のチューブに入ったLのEGF。 |
| フィッシャーブランド 6cmシャーレ 透明蓋付き | 漁夫 | FB0875713A | 該当なし |
| フィッシャーブランドセルリフター | 漁夫 | 08-100-240 | 該当なし |
| フィッシャーブランド クラス B 透明ガラスねじ付きバイアル、クロージャー付き | 漁夫 | 03-338B | 該当なし |
| Fisherbrand 使い捨てホウケイ酸ガラスパスツールピペット | 漁夫 | 〒13-678-2D0 | 該当なし |
| Fluoromount G スライド封入媒体 | VWRの | 100241-874 | 該当なし |
| Gibco アドバンスド DMEM | ギブコ | 12-491-023 | 該当なし |
| ヤギ抗E-カドヘリン | R&Dシステム | AF648 | 1:400希釈(一次抗体) |
| ヤギ用抗SOX17 | R&Dシステム | AF1924 | 1:500希釈(一次抗体) |
| HCOパターニング培地 | 該当なし | 該当なし | 塩基性腸内培地、100 ng/mL EGFおよび100 ng/mL BMP2。BMP2を調製するときは、1 mLの滅菌4 mM HCl 0.1%BSAをBMP2バイアル(100µアリコート25&マイクロ;4本のチューブに入ったLのBMP4溶液。ベース培地は最大3週間安定ですが、成長因子を添加した直後に使用する必要があります。 |
| 血球計算器 | シグマ・アルドリッチ | Z359629 | 該当なし |
| ヒト多能性幹細胞(hPSC) | 多能性幹細胞施設 | 該当なし | マトリゲルでコーティングされた24ウェルプレート(Thermo Scientific 73520-906)に細胞を播種しました。 |
| 氷冷4%パラホルムアルデヒド溶液(PFA) | 該当なし | 該当なし | 該当なし |
| 氷冷リン酸緩衝生理食塩水(PBS) | 該当なし | 該当なし | pHは7.4でなければなりません。 |
| ImmEdge 疎水性バリアペン | ベクター研究所 | 101098-065 | 該当なし |
| 人工多能性幹細胞(iPSC) | 多能性幹細胞施設(シンシナティ小児病院医療センター) | 該当なし | 他のhESCまたはiPS細胞株を使用することもできますが、プロトコルは細胞株ごとに最適化する必要があります。 |
| ライカミクロトーム | 該当なし | 該当なし | 該当なし |
| LSM880 | 共焦点顕微鏡 | ||
| マトリゲル基底膜マトリックス | コーニング | 354234 | 該当なし |
| Matrigel hESC認定マトリックス | コーニング | 354277 | 4 x 6ウェルディッシュに十分な希釈マトリゲルを作るのに十分な量に対応する4 xマトリゲルアリコートを準備します。 |
| 中後腸誘導培地(RPMI 1640) | コーニング | MT10041CV | 非必須アミノ酸 (Corning 11140050)、2% FBS vol/vol (Hyclone SH30070.03T)、3 &M CHIR99021および500 ng / mL FGF4。ベース培地は最大3週間安定ですが、成長因子を添加した直後に使用する必要があります。 |
| 中央後腸スフェロイド | 該当なし | 該当なし | 該当なし |
| MilliporeSigma Steriflip滅菌使い捨て真空フィルターユニット | ミリポアシグマ | SCGP00525 | 該当なし |
| マウス抗CDX2 | バイオジェネックス | MU392-UCシリーズ | 1:300希釈(一次抗体) |
| マウスアンチFOXA2 | アブノヴァ/ノバス | H00003170-M01 | 1:500希釈 |
| mTeSR1完全増殖培地 | 幹細胞技術 | 85870 | 100 mLのmTeSRサプリメント(85870)を1つの400 mL mTeSR培地(85870)に加え、汚染を避けながら50 mLチューブにアリコートします。4°で保管してください。使用までC。 |
| マレーのクリアソリューション(BABBとも呼ばれます) | マレーズ | 該当なし | 1:2安息香酸ベンジルとベンジルアルコール。 |
| NOG HIOパターニング培地 | 該当なし | 該当なし | 塩基性腸培地、100 ng/mL EGFおよび100 ng/mL NOGGIN(ディスペンス25&マイクロ;250&マイクロのNOGGINのg。l 0.1% BSA を含む滅菌 PBS)。 |
| ヌクレオスピンRNA | タカラ | 740955.25 | 他のRNA単離キットを使用することもできます。 |
| Nunclon delta表面組織培養皿24ウェル(Nunc) | サーモサイエンティフィック | 73521-004 | 該当なし |
| マトリゲルでコーティングされたNunclon delta表面組織培養皿24ウェル | サーモサイエンティフィック | 73521-004 | 該当なし |
| Nunclon デルタ表面組織培養皿 6ウェル(Nunc) | サーモサイエンティフィック | 73520-906 | 該当なし |
| Nunclon delta表面組織培養皿 でコーティングされた6ウェル;マトリゲル。 | サーモサイエンティフィック | 73520-906 | 該当なし |
| HIO、CTRL HIO、およびHCOの成長培地 | 該当なし | 該当なし | 塩基性腸培地および100 ng / mL EGF(最終濃度) |
| リン酸緩衝生理食塩水、0.5% Triton X (PBS-T) | 該当なし | 該当なし | 該当なし |
| プライマー | インテグレーテッドDNAテクノロジーズ株式会社(IDT) | 該当なし | プライマーは、プロトコルの表2にリストされています。 |
| ウサギ用抗CDX2 | セル マーク | EPR22764Y | 1:100希釈(一次抗体) |
| ウサギ用抗SATB2 | セル マーク | 第281話 | 1:100希釈(一次抗体) |
| 組換えヒトBMP-4タンパク質 | R&Dシステム | 314-BP-010 | 凍結乾燥粉末を100µで再構成します。0.1% ウシ血清アルブミン (BSA) を含む滅菌 4 mM HCl 中の g/mL。4.17 mL HCl 溶液を 45.83 mL 分子水に加え、合計 50 mL の 1 M HCl に加えます。次に、200 & micro を追加します。L の 1 M HCl から 49.8 mL の分子グレードの水、合計 50 mL の 4 mM HCl に相当します。次に、50 mLの4 mM HClに0.05 g BSAを加え、ろ過して滅菌します。滅菌4 mM HCl 0.1%BSAを33マイクロ遠心チューブに分注し、-20°Cで保存します。100&μmを追加します。l の滅菌 4 mM HCl 0.1% BSA を BMP4 バイアル (10 & micro;g)100µでBMP4溶液を作る。g/mLです。 |
| 組換えヒトFGF-4タンパク質 | R&Dシステム | 235-F4-01M | 100µで再構成します。0.1%ウシ血清アルブミンを含む滅菌PBS中のg / mL。50 mLのPBSに0.05 gのBSAを加えて、0.1%BSAを作ります。フィルター 0.22 & マイクロ;BSAを滅菌するためのM BSA。10 mLの0.1%BSAを5本のチューブにアリコートします。10 mLの滅菌0.1%BSAに1 mgのFGF-4を加えます。アリコート250&マイクロ;Lを予冷した40本の微量遠心チューブに入れ、-80°Cで保存します。 |
| ROCK阻害剤 Y-27632 | トクリス | 1254 | 最終濃度は10 mM(10 mmol / L)です。DMSOに10 mMで再懸濁し、フィルター滅菌します。各バイアルに3 mLの滅菌PBSを加えます。アリクアウト 100 & マイクロ;L の ROCK 阻害剤を 30 チューブに入れ、-20 °C で保存します。 |
| SuperScript VILO cDNA合成キット | サーモサイエンティフィック | 11-754-250 | 該当なし |
| SuperFrost Plus顕微鏡スライド | |||
| Tissue Tek OCT コンパウンド | VWRの | 25608-930 | 該当なし |
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