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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
脂肪酸β酸化は、肝細胞を含む多くの異なる細胞型においてエネルギーを生成する役割を担う必須代謝経路である。ここでは、 14C標識パルミチン酸を用いて新たに単離した初代肝細胞における脂肪酸β酸化を測定する方法について述べる。
脂肪酸β酸化は、肝臓のエネルギー需要を満たすための重要な代謝経路であり、全身のグルコース恒常性を維持し、絶食状態での肝外器官機能をサポートするために不可欠なケトジェネシスおよび糖新生などの追加プロセスのための基質および補因子を提供する。脂肪酸β酸化は、ミトコンドリアおよびペルオキシソーム内で起こり、脂肪酸の取り込みおよび活性化、酵素発現レベル、補酵素AおよびNAD+などの補因子の利用可能性を含む複数のメカニズムによって調節される。肝臓ホモジネート中の脂肪酸β酸化を測定するアッセイでは、細胞溶解および補因子の超生理学的レベルの一般的な添加は、これらの調節機構の影響を隠す。さらに、ホモジネート中の細胞小器官の完全性は制御が困難であり、調製物間で大きく異なる可能性がある。無傷の初代肝細胞における脂肪酸β酸化の測定は、上記の落とし穴を克服する。このプロトコールは、 14C標識パルミチン酸と共にインキュベートされた新たに単離された初代マウス肝細胞の懸濁液中の脂肪酸β酸化の測定のための方法を記載する。数時間から数日の培養を避けることによって、この方法は、摂食マウスと比較して絶食マウスから単離された肝細胞において観察される脂肪酸β酸化の活性化を含む、元の肝臓のタンパク質発現レベルおよび代謝経路活性をよりよく保存するという利点を有する。
脂肪酸β酸化は脂質代謝に不可欠なプロセスであり、脂肪酸合成と食事からの摂取のバランスをとるための異化経路を提供する。このプロセスは、心筋、腎臓皮質、絶食肝臓を含む複数の臓器にエネルギーを生成し、食事から得られる脂肪酸、脂肪組織の脂肪分解、および内部トリグリセリドストア1,2を利用します。
β酸化経路を介した脂肪酸の酸化は、アセチルCoAとして放出される一度に2つの炭素による脂肪酸アシル鎖の逐次的な短縮をもたらし、このプロセスはミトコンドリアおよびペルオキシソームの両方で起こる。ほとんどの脂肪酸はβ酸化のみを受けるが、一部はこの経路に入る前に異なる炭素で酸化される。例えば、フィタン酸などの3-メチル置換脂肪酸は、α酸化経路に入る前にペルオキシソーム中のβ酸化によって1つの炭素の除去を受ける。同様に、一部の脂肪酸は、小胞体における末端メチル基の酸化(ω-酸化)によって最初にジカルボン酸脂肪酸に変換され、その後、β酸化3によってペルオキシソーム内で優先的に酸化される。
特定の細胞小器官に関係なく、脂肪酸は、β酸化経路を介して酸化されるためには、まず補酵素A(CoA)チオエステル、またはアシルCoAに変換されなければならない。ミトコンドリアマトリックス中の長鎖アシルCoAsのβ-酸化は、カルニチンパルミトイルトランスフェラーゼ1(CPT1)がアシル-CoAsのアシルカルニチンへの変換を触媒し、このプロセス4における律速酵素であるカルニチンシャトルを必要とする。一旦ミトコンドリアマトリックスに転移すると、アシルCoAsは再形成され、ミトコンドリアβ酸化機構の基質として役立つ。絶食状態では、肝ミトコンドリアにおけるβ酸化によって産生されたアセチルCoAは、主にケトジェネシスにチャネリングされる。ペルオキシソームは、非常に長鎖、分岐鎖、およびジカルボン酸のβ酸化の一次部位として役立つ。ペルオキシソームは、脂肪酸基質を輸入するためにカルニチンシャトルを必要とせず、代わりにATP結合カセット(ABC)トランスポーターの活性を介して対応するアシル-CoAsを輸入する1-35。ペルオキシソーム内では、アシルCoAsは、ミトコンドリア脂肪酸β酸化機構とは異なる専用の酵素セットによって酸化される。ミトコンドリアとペルオキシソームの両方はまた、脂肪アシル鎖を酸化するためにNAD+ および遊離CoAの供給を必要とする。肝臓中のCoAレベルは絶食に応答して増加することが示されており、この状態で起こる脂肪酸酸化の速度の増加を支持している6。さらに、ペルオキシソームにおけるCoA分解の増加は、ペルオキシソーム脂肪酸酸化7の選択的減少をもたらす。したがって、細胞内の脂肪酸酸化のプロセスは、脂肪酸の活性化、輸送、および酸化に関与する酵素の発現レベルおよび活性、ならびに複数の細胞内区画にわたる補因子および他の代謝産物の濃度によって調節される。
脂肪酸酸化を測定するために組織ホモジネートを使用する手順は、このプロセスを調節およびサポートする細胞アーキテクチャを破壊し、in vivo代謝を正確に反映しないデータの収集につながる。播種された初代肝細胞を用いた技術はこの系を保持するが、単離された細胞を長期間培養すると、動物内にまだ生きていたときに細胞内に存在していたin vivo遺伝子発現プロファイルが失われる結果となる8,9。以下のプロトコールは、[1-14C]パルミチン酸を用いて、初代肝細胞を単離し、単離直後および懸濁液中で脂肪酸β酸化に対するそれらの能力をアッセイする方法を記載している。このアッセイは、[1-14C]パルミチン酸10,11のβ酸化によって生成されるアセチルCoAのような酸可溶性代謝産物(ASM)または生成物に関連する放射能の測定に基づいている。
マウス(C57BL/6J、雄、9〜11週齢)に対するすべての実験手順は、ウェストバージニア大学の施設動物ケアおよび使用委員会(IACUC)によって承認された。
1. 肝細胞の単離

図1:灌流装置および灌流肝臓。 (A)肝臓をカニューレおよび灌流するために使用される針に接続された出口ラインを備えた蠕動ポンプ。(B)カニューレが成功したことは、肝臓の即時かつ均質なブランチングによって示される。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
2. 脂肪酸β酸化測定法
注:アッセイは3連で行われ、各反応混合物は750,000細胞、1.35 mg/mLウシ血清アルブミン(BSA)、100 μMパルミチン酸、および0.4 μCi[1-14C]パルミチン酸を最終容量2mLで含む。
警告: 放射性化合物は危険です。放射性物質の購入、取り扱い、保管、廃棄は、制度、州、連邦の規制に従って行う。
| バッファ/メディアコンポーネント | 量 | 最終濃度 | 指示 |
| ソリューション C | |||
| ティッカー | 1.79グラム | 480ミリアンペア月間 | 50mLに水を加える。 4°Cで保存 |
| MgSO4 七水和物 | 1.48グラム | 120ミリアンペア月間 | |
| KH2PO4 | 0.81グラム | 119ミリオンメートル | |
| クレブスヘンゼライトバッファー(KHB)、カルシウムフリー | |||
| ナクル | 7.0グラム | 120ミリアンペア月間 | 900 mLに水を加え、pHを7.4に調整し、最終容量を1 Lにします。 |
| NaHCO3 | 2.0グラム | 24ミリオン | |
| 1 M ヘップス pH 7.45 | 5キロリットル | 5ミリオン | |
| グルコース | 1 または 2 g | 5.6 または 11 mM | |
| ソリューション C | 10ミリリットル | ||
| バッファー 1 | |||
| ティッカー | 500キロリットル | 成分を混合し、フィルター滅菌します。4°Cで保存 | |
| 50 ミリグラム EGTA | 1.0キロリットル | 0.1 ミリアンペア時 | |
| バッファ 2 | |||
| ティッカー | 500キロリットル | 成分を混合し、フィルター滅菌します。4°Cで保存 | |
| 1 M CaCl2 二水和物 | 686 μL | 1.4ミリアンペア時 | |
| ゲンタマイシン溶液 | |||
| ゲンタマイシン硫酸塩 | 0.5グラム | 50 ミリグラム/ミリリットル | 10mLに水を加え、フィルター滅菌する。アリコートと-20°Cで保存 |
| コラゲナーゼ溶液 | |||
| コラゲナーゼIおよびIIブレンド | 10 ミリグラム | 7ミリグラム/mL | バイアルの全内容物を1.43mLの水に溶解する。 アリコートと-20°Cで保存 |
| M199 · | |||
| M199 · | 1ポーチ | 900mLに水を加え、pHを7.2〜7.4に調整する。最終容量を1Lにし、フィルター滅菌します。4°Cで保存 | |
| NaHCO3 | 2.2グラム | 26ミリオンメートル | |
| 1 M HEPES(細胞培養グレード) | 25ミリリットル | 25ミリオンメートル | |
| 余分なグルコース(給餌マウスのみ) | 1グラム | 11ミリオンメートル | |
| BSAソリューション | |||
| 脂肪酸フリーBSA | 400 ミリグラム | 20% (ワット/V) | 2mLの水に溶解する。 アリコートと-20°Cで保存 |
| 非放射性パルミチン酸溶液 | |||
| パルミチン酸 | 103 ミリグラム | 200ミリアンペア時 | 2mLのエタノールに溶解し、-20°Cで保存する |
| 1 M 過塩素酸 | |||
| 70% 過塩素酸 | 3.5ミリリットル | 1 M | 水で40mLに希釈する。室温で保存する |
表1:肝細胞単離および脂肪酸β酸化アッセイに必要な緩衝液、培地、およびその他の溶液
| 反応数 | M199±阻害剤 | 肝細胞懸濁液(μL) | 基質ミックス (μL) | ||||
| 容量 (μL) | エトモキシル | ||||||
| 1 | 750 | - | 37°Cで予温 | 750 | 37°Cで15分間プレインキュベート | 500 | 37°Cで15分間インキュベートする |
| 2 | |||||||
| 3 | |||||||
| 4 | + | ||||||
| 5 | |||||||
| 6 | |||||||
| 7 | + | すぐに停止する | |||||
| 8 | |||||||
| 9 | |||||||
表2:エトモキシルの存在下および非存在下で三連でアッセイされた肝細胞懸濁液についての実験セットアップの例。
ここで説明する肝臓灌流は、トリパンブルー排除によって推定されるように、典型的には3000万〜4000万個の細胞/肝臓を生じ、平均生存率は80%である(図2)。灌流バッファー 1 および 2 の調製に使用される Krebs-Henseleit バッファー (KHB) 中のグルコースの典型的な濃度は 11 mM です。絶食マウスから単離した肝細胞における脂肪酸β酸化を測定する場合、KHB中のグルコース濃度を下げて絶食状態をよりよく表すことができる。 図2に示すように、グルコース濃度を5.6 mMに下げても、肝細胞の収量または生存率に悪影響はない。
表2 は、CPT1の強力な阻害剤であり、したがってミトコンドリア脂肪酸酸化10、13の強力な阻害剤であるエトモキシルの存在下および非存在下で三連でアッセイされた肝細胞懸濁液についての典型的な実験セットアップを示す10、13。これまたは他のミトコンドリア脂肪酸酸化の阻害剤の存在下で、[1-14C]パルミチン酸酸化によって生成される任意の残留 14C標識産物は、ペルオキシソームにおけるβ酸化の第1サイクルに起因する可能性がある。したがって、全脂肪酸酸化に対するミトコンドリア脂肪酸酸化の寄与は、総脂肪酸β酸化(-エトモキシル)とペルオキシソーム(+エトモキシル)脂肪酸酸化7、14、15 の差として計算することができる(図3)。
肝細胞の場合、[1-14C]パルミチン酸のβ酸化の産物に関連する放射能の95%以上がASMに見出され、残りは14C-CO210として放出される。バックグラウンド放射能に関連する1分あたりのカウント数(CPM)は、[1-14C]パルミチン酸のバッチによって変化する。しかしながら、それらは、基質混合物と共に15分間インキュベートさせたサンプルで得られたCPMよりも依然として有意に低い(図3A)。予想されたように、絶食マウスから単離された肝細胞は、ミトコンドリアおよびペルオキシソーム脂肪酸β酸化の両方の速度の堅固な増加を示し、これらの経路の既知の活性化と一致する16、17、18、19。

図2:本明細書に記載の手順を用いて単離された肝細胞の生存率および収量。 肝細胞を雄マウスから単離し、自由摂取させたり、一晩16〜18時間絶食させたり、水に 自由 にアクセスしたりした。(A)肝細胞生存率および(B)肝臓当たりの収量。データは、SEMの個々の肝細胞調製物(円)に関する測定値の平均(バー)として報告され±、給餌および絶食マウスから単離された肝細胞は、不対の両側スチューデントのt検定を用いて比較された。* p < 0.05. この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図3:給餌および絶食雄マウスから単離し、懸濁状態でアッセイした肝細胞における脂肪酸β酸化能。 新たに単離された肝細胞を、基質混合物を添加する前に、エトモキシル(45μM、+Eto)またはDMSO(ビヒクル、-Eto)と共にプレインキュベートした。(a)各アッセイで導入された総CPMおよびバックグラウンド放射能を推定するために設定された反応のASM画分で回収された総CPM、総(−Eto)、ペルオキシソーム(+Eto)、およびミトコンドリア脂肪酸β酸化。これらのデータは、補正(バックグラウンド、細胞数、またはタンパク質レベル)またはその他の計算が適用される前に表示されます。(B)(A)におけるデータはバックグラウンドについて補正し、アッセイの全体積を、100万個の生細胞に正規化し、給餌および絶食マウスから単離された肝細胞においてパルミチン酸が酸化される速度として表した。(C)使用した推定750,000個の肝細胞/アッセイに対応する総タンパク質。(D)(A)のデータは(B)のように補正されたが、タンパク質のmgに正規化された。データは、SEMの個々の肝細胞調製物(円)に関する測定値の平均(バー)として報告され±、給餌および絶食マウスから単離された肝細胞は、不対の両側スチューデントのt検定を用いて比較された。* p < 0.05;** p < 0.01. この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
著者らは、開示する利益相反はありません。
脂肪酸β酸化は、肝細胞を含む多くの異なる細胞型においてエネルギーを生成する役割を担う必須代謝経路である。ここでは、 14C標識パルミチン酸を用いて新たに単離した初代肝細胞における脂肪酸β酸化を測定する方法について述べる。
この研究は、国立衛生研究所がロベルタ・レオナルディに助成金R35GM119528を供与した。
| (R)-(+)-エトモキシルナトリウム塩 | トクリスバイオサイエンス | 4539/10 | |
| [1-14C] - パルミチン酸、50–60 mCi/mmol、0.5 mCi/mL | American Radiolabeled Chemicals | ARC 0172A | |
| 1 M HEPES、滅菌 | 済み Corning | 25060CI | |
| 10 & micro;L:容積式ピペット用ディスポーザブルキャピラリー/ピストン | メトラー・トレド | 17008604 | |
| 1000 & マイクロ;L、200 µL、および10 µL ピペットとチップ | |||
| 5 mL、10 mL、25 mL 血清ピペット | |||
| 50 mL 滅菌遠心チューブ | CellTreat | 229421 | |
| 70% 過塩素酸 | フィッシャー サイエンティフィック | A2296-1LB | |
| BSA、脂肪酸フリー | フィッシャー サイエンティフィ | ックBP9704100 | |
| CaCl2 二水和物 | MilliporeSigma | 223506 | |
| D-(+)-グルコース | MilliporeSigma | G7021 | |
| EGTA | Gold Biotechnology | E-217 | |
| Ethanol | Pharmco | 111000200CSPP | |
| フィルター システム、0.22 μm PES フィルター、500 mL、滅菌 | CellTreat | 229707 | |
| 硫酸ゲンタマイシン | ゴールド バイオテクノロジー | G-400-25 | |
| HDPE、6.5 mL シンチレーション バイアル | フィッシャー サイエンティフィック | 03-342-3 | |
| 血球計算盤 | |||
| 皮下注射針 22 G、1.5 インチ | BD バイオサイエンス | 305156 | |
| イソフルラン | VetOne | 502017 | |
| KCl | フィッシャーサイエンティフィック | BP366-1 | |
| KH2PO4 | MilliporeSigma | P5655 | |
| Liberase TM Research Grade | MilliporeSigma | 5401119001 | 精製コラゲナーゼ I および II と中濃度のサーモリシン |
| M199 培地 | MilliporeSigma | M5017 | の定義されたブレンド |
| MgSO4 七水和物 | MilliporeSigma | M1880 | |
| 微量遠心分離機 | Fisher Scientific | accuSpin Micro 17 | |
| Microdissecting Scissors | Roboz Surgical Instrument Co | RS-5980 | |
| NaCl | Chem-Impex International | 30070 | |
| NaHCO3 | Acros Organics | 424270010 | |
| パルミチン酸 | ミリポアSigma | P0500 | |
| ペニシリン/ストレプトマイシン (100x) | Gibco | 15140122 | |
| リン酸緩衝生理食塩水 (PBS) | Cytiva Life Sciences | SH30256.01 | |
| 容積式ピペット MR-10, 10 µL | メトラー・トレド | 17008575 | |
| 50 mLコニカルチューブ用インサート付き冷蔵遠心分離機 | エッペンドルフ | 5810 R | |
| 丸底、14 mL、ポリプロピレン培養試験管 | フィッシャーサイエンティフィック | 14-956-9A | |
| シンチレーションカウンター | パーキンエルマー | TriCarb 4810 TR | |
| ScintiVerse BD カクテル | フィッシャーサイエンティフィック | SX18-4 | |
| 振とう水浴、容量30 L | 、ニューブランズウィックサイエンティフィック | モデルG76 | |
| 滅菌セルストレーナー、100 & マイクロ;m | フィッシャーサイエンティフィック | 22363549 | |
| 親指ドレッシング鉗子 | Roboz Surgical Instrument Co | RS-8120 | |
| Trypan Blue | Corning | 25900CI | |
| 可変流量蠕動ポンプ | フィッシャーサイエンティフィ | ック138762 | |
| ウォーターバス、2–2.5L容量 |