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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
培養ショウ ジョウバエ 脳外植体において静止期神経幹細胞を再活性化する方法が確立されている。この方法を用いて、神経幹細胞の静止、入口および退出の調節において、全身性シグナルの役割を組織内因性シグナルから切り離すことができる。
神経幹細胞(NSC)は、増殖、分化、アポトーシスを受け、さらには静止に出入りする能力を有する。これらのプロセスの多くは、NSC内因性遺伝プログラムとNSC外因性因子(局所的および全身的)との間の複雑な相互作用によって制御される。遺伝子モデル生物である ショウジョウバエのメラノガスターでは、神経芽細胞(NB)として知られるNSCsは、胚から幼虫への移行中に静止から増殖に切り替わります。この間、幼虫は卵の殻から出てきて這い回り始め、食事の栄養素を探します。動物の摂食に応答して、脂質貯蔵能力を有する内分泌器官である脂肪体はシグナルを生成し、循環血リンパに全身的に放出される。脂肪体由来シグナル(FBDS)に応答して、 ショウジョウバエ インスリン様ペプチド(Dilps)が産生され、脳神経分泌ニューロンおよびグリアから放出され、NBおよびそれらのグリアおよび気管ニッチにおけるPI3キナーゼ成長シグナル伝達の下流活性化をもたらす。これは、NBが静止から増殖にどのように切り替わるかについての現在のモデルであるが、FBDS外因性手がかりの性質は依然として解明されていない。NB外因性全身の手がかりが静止からの出口をどのように調節するかをよりよく理解するために、動物給餌前に初期の幼虫脳をインビトロで培養する方法が開発された。この方法を用いると、外因性因子を培養培地に供給し、NBがアッセイされて静止状態から脱退することができる。我々は、外因性インスリンが全脳外植体の静止からNBを再活性化するのに十分であることを見出した。この方法は大規模なスクリーンに適しているため、NBの静止と拡散の決定を調節する追加の外因性手がかりを特定することを目指しています。NSCの増殖決定を調節する遺伝子および経路は進化的に保存されているため、このアッセイの結果は、診療所における再生療法の改善に関する洞察を提供する可能性がある。
幹細胞は、再生医療での使用の可能性のために大きな関心事です1,2。多くの動物、特に長命の動物は、成体組織内で幹細胞を維持しています。これらの常在幹細胞は、組織の恒常性を維持するために機能し、身体的傷害または疾患後の修復に利用される3,4。成体動物におけるほとんどの幹細胞は静止状態であり、細胞周期停止および成長シグナル伝達の不活性化を特徴とする比較的休眠状態である5。外因性の手がかりに応答して、幹細胞は静止状態から抜け出し、細胞周期に入り、組織型に特異的な娘の子孫を生成し始める。例えば、効果的な免疫応答をマウントするために、抗原提示細胞は静止期のナイーブT細胞を誘導して細胞周期に入り、クローン的に拡張する6。骨格筋損傷に応答して、筋衛星幹細胞は細胞周期に入り、損傷した筋原線維を置き換えるために娘筋芽細胞を生成する5,7。静止幹細胞が外因性シグナルに応答することは明らかであるが、多くの場合、外因性手がかりの性質および手がかり誘導幹細胞活性化のメカニズムは不明のままである。静止幹細胞が外因性の手がかりにどのように反応し、細胞周期に入るかについてのより良い理解を得ることは、診療所におけるより良い幹細胞療法の開発に役立ち、科学的知識を増加させるでしょう。
何十年もの間、モデル生物は、発生中および成人期の幹細胞増殖を調節する遺伝子および細胞シグナル伝達経路を明らかにするために使用されてきた。ショウジョウバエでは、神経芽細胞(NB)として知られる神経幹細胞(NSC)が発達中分裂し、最終的に統合するすべてのニューロンとグリアが生成され、脳機能に必要な神経回路を形成します8,9。他の幹細胞と同様に、NBは自己再生するために非対称的に分裂し、場合によっては対称的に分裂して幹細胞プールを拡張する。NBは胚発生時に特定され、そのほとんどは母親の栄養貯蔵量の減少と同時に、終わりに向かって静止状態に入る(図1)。胚発生が完了すると、幼虫は孵化し、摂食を開始する。動物摂食に応答して、NBは静止から再活性化し、細胞分裂を再開する10、11、12、13、14、15、16。ショウジョウバエのCNSは比較的単純であり、NBは定義された時間に静止に出入りするため、ショウジョウバエを使用して静止、出入りの調節を調査することは理想的であることが証明される。

図1:発生時間にわたるCB NB(中枢脳神経芽細胞、赤)およびMB NB(キノコ体神経芽細胞、青)の相対増殖。 胚発生の終わりに、ほとんどのNB(赤い線)は増殖を停止し、静止状態に入る。孵化したばかりの幼虫が最初の完全な食事を消費するまで、静止は続きます。この方法論の焦点の時間は、赤い円(1、静止および2、再活性化)で示されます。MB NB(青)は、発達中枢脳NBのサブセットであり、発達中(脳半球あたり4つ)に継続的に分裂する。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
動物摂食に応答して、PI3キナーゼおよびTOR成長シグナル伝達経路は、NBsおよびそれらのグリアおよび気管ニッチにおいて活性になる10、11、15、16。食事性栄養素が取り出されるか、またはPI3キナーゼのレベルが低下すると、NBは再活性化に失敗し、グリアおよび気管の成長も減少する10,11,15,16。現在のモデルは、NB再活性化が脂肪体による幼虫の成長に結合され、動物摂食に応答して全身シグナルを放出すると仮定している12、17、18。このシグナルは、とらえどころのないままであり、脳内のショウジョウバエインスリン様ペプチド(Dilps)の発現および放出を促進する可能性が高く、NBおよびそれらのグリアおよび気管ニッチにおけるPI3キナーゼの下流活性化をもたらす。全身の手がかりの性質をよりよく理解するために、我々は培養された脳外植体において静止性NBを再活性化する方法を開発した。この方法を使用すると、NBsの再活性化を、動物全体の全身的手がかりの非存在下でアッセイすることができる。外因性因子は、培養培地に再供給され得、そしてチミジン類似体EdUの組み込みに基づいてアッセイされたNB再活性化である。この方法を用いて、我々は、外因性インスリンが脳外植体における静止性NBを再活性化するのに十分であると決定した。今後の研究は、脳外植体におけるNB静止を正または負に調節する追加因子を特定することを目的としている。
ショウ ジョウバエ 幼虫コレクション
注:開始する前に、イーストプレート、グレープペースト、フライコンドミニアムを準備してください。

図2:ショウ ジョウバエ の成虫の男性と女性の反転フライボトル(コンドミニアム)の視覚的表現。 ペットボトルには、酸素交換のために18G針で生成された小さな穿刺があります。瓶の口を寒天ブドウ果汁キャップで密封し、反転させて25°Cのインキュベーターに保管する。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
2. 培地・器具作製
3. 解剖と脳文化

図3:ショウ ジョウバエ の幼虫をSSMでガラスの時計皿に入れた。 鉗子は解剖のために適切に配置されています。幼虫の脳の位置(濃い灰色)は口のフック(黒)の後部にあり、両方とも幼虫の内部に示されている。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図4:脳培養および免疫染色。 (A)1mLのSSMを含む12ウェル培養皿中の全脳。次いで、培養皿を25°Cのインキュベーターに入れ、免疫染色中に脳外植体を保持する(B)72ウェルミニトレイに入れる。脳を洗浄し、溶液を10μLに設定したP20マイクロピペットを用いて移す。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
4. 増殖アッセイ、脳固定、抗体染色
5. 脳の取り付けとイメージング

図5:幼虫脳内の顕微鏡スライド、向き、および細胞型を示す模式図。 (A)幼虫脳が装着され、画像化の準備が整った顕微鏡スライドの視覚的表現。(B)組織の配向に使用するガイドラインも示されている。(C)共焦点顕微鏡でイメージング可能な顕微鏡スライド。(D)幼虫の脳内の細胞型のいくつかを示す漫画。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
6. データ解析
孵化したばかりのオレゴンR野生型脳を解剖し、シュナイダー培地(SSM)にインスリンを補給して24時間培養した。組織は、プロトコールに従って固定および染色された。NBsを検出するためにデッドパン(Dpn)に対して生成された一次抗体および細胞膜を標識するために落書きが用いられた。チミジン類似体5-エチニル-2'-デオキシウリジン(Edu)を添加し、S相の侵入およびNB再活性化を検出した。培養において24時間後に大型のEdu陽性およびDpn陽性NBが見出された(図6A-C)。次に、孵化したばかりのオレゴンR野生型脳を、インスリンを含まない補充シュナイダー培地で24時間培養した。培養で24時間後、我々は4つのキノコ本体NBと1つの腹側NBを除いて、大型のEdu陽性およびDpn陽性NBは見つからなかった(図6D-F)。キノコ体および腹側神経芽細胞は、胚から幼虫への移行の間に連続的に分裂する中枢脳神経芽細胞のサブセットである。我々は、外因性インスリンが、シュナイダーの培地で培養された脳外植体の静止から神経芽細胞を再活性化するのに十分であると結論付ける。
共焦点画像化の間、損傷を伴ういくつかの脳半球が時折観察された。我々が発見した損傷は、外植された脳組織の小さめから大型の穴から成っていた(図6G、H)。これらの組織は分析から除外した。24時間の時点に加えて、脳も48時間培養に成功した(データは示さず)。培養の48時間後、Dpn陽性EdU陽性CB NBの数のさらなる増加および組織損傷を有する脳の数の増加を見出した。これは、脳を長期的に培養することが実現可能である可能性が高いことを示唆している。ただし、組織の損傷を避けるためには細心の注意を払わなければなりません。

図6:共焦点イメージング。 (A-C)外因性インスリンは静止性NBを再活性化するのに十分である。 (A)インスリンの存在下での培養の24時間後にデッドパン(Dpn)およびEdu陽性NBを示す1つの脳半球の最大強度投影。(B)細胞膜をマークするScribble(Scrib)免疫染色を用いた同じ脳半球の単一のZスライス画像。(C)パネルBの差し込み図のNBの高倍率化右下のカラーマージ付きシングルチャンネルグレースケール画像。(D-F)NBは、外因性インスリンの非存在下で静止したままである。(d)インスリン非存在下での培養24時間後のDpnおよびEdu陽性NBsを示す1つの脳半球の最大強度投影。(E)Scrib免疫染色による同じ脳半球の単一のZスタック。(F)パネルE.の差し込み図のNBの高倍率化カラーマージ右下のシングルチャンネルグレースケール画像。矢印は、4 MB の NB の 1 つを示し、連続的に分割され、静止に出入りしません (図 1 を参照)。(G,H)損傷した脳外植の例は、分析には用いられない。(g)組織に大きな穴があいた1つの脳半球の単一のZスライス。(H)脳半球の単一のZスライスは、組織に小さな穴を示す。スケールバー:10μm。白い破線は正中線を示す。前部は上向きで、後部は下向きです。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
| 成分/量 | 1 L (~125 グレーププレート) |
| グレープジュース | 250ミリリットル |
| 蔗糖 | 25グラム |
| 水 | 750キロリットル |
| バクト寒天 | 18.75グラム |
| テゴセプト (10%) | 4 ミリリットル |
| プロピオン酸 | 5キロリットル |
表1:ブドウ皿を作るためのレシピ。 セクション 1.2 で説明されている手順に従います。
| 成分(開始濃度) | 5 mLを作るには | 最終濃度 |
| シュナイダーのショウジョウバエメディア | 3.89キロリットル | |
| ウシ胎児血清 (100%) | 500 μL | 10% |
| グルタミン (200 mM) | 500 μL | 20ミリオンメートル |
| ペニシリン(5000単位/mL)、ストレプトマイシン(50,000μg/mL) | 100 μL | 1000 U/mL ペン, 1 mg/mL ストレップ |
| インスリン (10 ミリグラム/mL) | 10 μL | 0.02 ミリグラム/mL |
| グルタチオン (50 ミリグラム/mL) | 5 μL | 0.05 ミリグラム/mL |
| 滅菌フード内で、滅菌技術を使用して、14mLの円錐形チューブにすべての成分を一緒に加える。使用時まで氷の上に置きます。 |
表2:シュナイダーのメディア(SSM)を補ったものを作るためのレシピ。 表は、5mLのSSMを調製するために必要なすべての成分の体積をリストする。
| 固定剤を作るためのレシピ | ||
| 成分(開始濃度) | 40 mLを作るには | 最終濃度 |
| EMグレードホルムアルデヒド16% | 10ミリリットル | 4% |
| PEM緩衝液 pH 7. | 29.96 ミリリットル | |
| トリトンX-100 | 40ミリリットル | 0.10% |
| すべての材料を一緒に混ぜる。1mLを微量遠心チューブにアリコートし、-20°Cで保存した。 解凍後にアリコートを再凍結しないでください。 | ||
| PEMバッファのレシピ | ||
| 成分(開始濃度) | 100mLを作るには | 最終濃度 |
| パイプ pH 6.8 (500 mM) | 20 ミリリットル | 100ミリアンペア月間 |
| 東経 (500 mM) | 2キロリットル | 10ミリオンメートル |
| MgSO4 (1 M) | 100ミリリットル | 1 ミリオン |
| 水 | 77.9 ミリリットル |
表3:固定液およびPEMバッファーを製造するためのレシピ。 表は、固定液およびPEM緩衝液を調製するための化学物質およびそれらのそれぞれの濃度をリストする。
著者は競合する利害関係を持っていません。
培養ショウ ジョウバエ 脳外植体において静止期神経幹細胞を再活性化する方法が確立されている。この方法を用いて、神経幹細胞の静止、入口および退出の調節において、全身性シグナルの役割を組織内因性シグナルから切り離すことができる。
我々は、LSAMP Bridges to Doctorate Program for Funding(CNK)並びにNIH/NIGMS(R01-GM120421及びR35-GM141886)を認める。図1のコナー・サイプ博士に感謝しています。また、Siegrist のラボメンバーの皆さんの継続的なサポートとメンターシップにも感謝します。特に、Chhavi SoodとGary Teetersが原稿を注意深く読み、コメントを提供してくれたことに感謝します。
| 10 µLピペットチップ | Denville Sci | P2102 | |
| 1000 µL ピペットチップ | Denville Sci | P2103-N | |
| 1000 & micro;L Pipettor | Gilson | P1000 | |
| 16% パラホルムアルデヒド (10 x 10 mL) | Electron Microscopy Sciences | 2912.60.0000 | 幼虫の脳の固定に使用 |
| 20 µL ピペット | Gilson | P20 | |
| 200 µL ピペットチップ | デンビル Sci | 1158U56 | |
| 24 ウェル マルチウェル培養プレート | フィッシャー サイエンティフィック | 50-197-4477 | |
| 35 mm ペトリ皿 | フィッシャー サイエンティフィ | ック08-757-100A | グレープ プレート 成分 |
| 4 >C冷蔵庫 | フィッシャーサイエンティフィ | ック | 抗体溶液での>24時間のインキュベーションに理想的な温度を提供します |
| 63倍 客観的 | レシア | ||
| アクティブドライイースト | ほとんどのスーパーマーケット | ||
| アガロース | フィッシャーサイエンティフィック | 214010 | グレーププレート 成分 |
| Click-iT EdU イメージング用細胞増殖キット、Alexa Fluor 647 色素 | サーモフィッシャー増殖 | 細胞を標識する | 科学的なC10340 |
| 共焦点顕微鏡 | ライカ | SP8 | |
| カバースリップ 22 mm x 22 mm x 1 mm、4オンスの10パック | フィッシャーサイエンティフィック | 12-544-10 | 2つのカバースリップは、顕微鏡スライドの端に瞬間的に接着されています。これにより、脳がイメージ化されながらアンチフェードに浮かぶことができるスペースが生まれます。 |
| カバースリップ、22 mm x 50 mm x 1 mm | フィッシャーサイエンティフィック | 12-545E | カバースリップは、顕微鏡スライド上の2つの正方形のカバースリップに配置され、イメージング中にアンチフェードの脳が動かないようにします。 |
| 解剖顕微鏡 | ツァイス | ステミ 2000 | |
| エタノール 200 プルーフ (100%)、デコンラボ、1ガロンボトル | フィッシャーサイエンティフィック | 2701 | 培養培地で24時間保持する前に幼虫を洗い流すために使用されます |
| ウシ胎児血清 (10%) | シグマ | F4135-100ML | 細胞培養培地用サプリメント。 |
| 解剖用ファインファイン鉗子 | ファインサイエンスツール | 11295-20 | 解剖に使用されるフォーセプト。研ぐと最もよく機能します。 |
| 交差のためのフライボトル | ジェネッシーサイエンティフィック | 32-130 | このボトルは、フライがブドウのプレートに卵を産むための容器として使用されます。 |
| ガラス解剖皿(3ウェル) | これらはもう利用できません | ||
| グルタチオン | シグマ | G6013 | 細胞培養中に酸化保護を提供します。 |
| ヤギ血清 | シグマ | G9023-10ML | ブロッキングエージェント |
| グレーププレート自家製 | 孵化したての卵を収集するための自家製グレープジュース/アガロースプレート | ||
| 画像J | Imagej.net/fiji/downloads | 無料ダウンロード: | 細胞のカウントとEduの再活性化に使用される https://fiji.sc イメージングプラットフォーム |
| インキュベーター | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 温度、湿度、光の露出が実験全体でまったく同じであることを確認します。 | |
| インスリン | シグマ | I0516 | 実験の独立変数 |
| 層流フード | 培地分注用 | ||
| L-グルタミン | シグマ | G7513 | 細胞培養中にサポートを提供 |
| Nunc 72ウェルマイクロウェルミニトレイ | フィッシャーサイエンティフィック | 12-565-154 | 免疫染色ステップは、このトレイで行われます |
| パラフィルム | フィッシャーサイエンティフィック | S37440 | 蒸発を防ぐためにプレートをシールするために使用されるフィルム |
| ペン連鎖球菌 | シグマ | P4458-100ml | 培養中の細胞の細菌汚染を防ぐために使用される抗生物質。 |
| リン酸緩衝液、pH7.4 | 自家製 | 自家製 | 固定および染色ステップ後に脳を洗浄するために使用される溶剤 |
| ピックファインサイエンスツール | 10140-01 | ブドウプレートから幼虫を拾うために使用されます | |
| プロピオン酸 | フィッシャーサイエンティフィック | A-258 | グレーププレート成分 |
| ウサギ405 | アブカム | ab175653 | 免疫染色 |
| ラット555 | Abcam | ab150166 | 免疫染色に使用される抗体 |
| Rb Scribble | クリス・ドウ | からの贈り物 | 免疫染色に使用される抗体 |
| Rt Deadpan | Abcam | ab195173 | 免疫染色に使用される抗体 |
| シュナイダース培養 メディウム | ライフサイエンス 21720024 | 細胞の成長と増殖を助ける栄養素が含まれています | |
| SlowFade Diamond退色防止剤 (5 x 2 mL) | Life Tech | S36963 | 蛍光色素の色退きを防ぐ試薬 |
| 滅菌水 | オートクレーブ Milli-Q水 自家製 | 溶液に必要 | |
| ショ糖 | フィッシャー | S2-12 | グレーププレート 成分 |
| スーパーフロスト 顕微鏡スライド | フィッシャーサイエンティフィック | 12-544-7 | |
| 瞬間接着剤 | ほとんどのスーパーマーケット | ||
| テゴセプト | ジェネシーサイエンティフィック | 20-259 | グレーププレート成分 |
| Triton-X 100 | シグマ | T9284-100ML | PBT |
| ウェルチの100%グレープグレープジュース | ほとんどのスーパーマーケット | グレーププレート成分 |