超解像顕微鏡は、減数分裂におけるシナプトン複合体内の成分の構成に関する詳細な洞察を提供することができます。ここでは、 カエノラブディティス・エレガンス ・シナプトン複合体の個々のタンパク質を分解するためのプロトコルを示します。
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| 100x/1.5 オイル対物レンズ | Olympus | UPLAPO100XOHR | UPLAPO100XOHR |
| 2-mercaptoethylamine (MEA) | Sigma-Aldrich | 30070-10G | MilliQ 水に溶解して 5 M 溶液、pH 8.7 HCl で調整 |
| 追加の640nmブースター | レーザーToptica | IBEAM-SMART-640-S-HP | |
| AlexaFluor 594、NHSエステル | ThermoFischer Scientific | A37572 | DMSOに溶解して1 mM溶液にし、1回の使用容量に分注し、凍結して-80°Cに保ちます。C |
| AlexaFluor 647、NHS エステル | ThermoFischer Scientific | A37573 | DMSO に溶解して 1 mM 溶液にし、1 回の使用容量に分注し、凍結して -80 °C に保ちます。C |
| anti-HA | Thermo Fisher Scientific | 2-2.2.14 | Mouse monoclonal, 1:250 (SMLM), 1:1,000 (STED Microscopy) |
| anti-HTP-3 | a gift from Abby F. Dernburg | MacQueen et al., 2005 | Chicken polyclonal, 1:250 (SMLM), 1:1,000 (STED Microscopy) |
| Caenorhabditis elegans strain YKM349 | Yumi Kim | Hurlock et al., 2020 | syp-5(kim9[syp-5::HA]) I; meIs8[pie-1p::GFP::cosa-1, unc-119(+)] II |
| CF6680, NHS エステル | Biotium | 92139 | DMSO に溶解して 1mM 溶液にし、1 回の使用量に分注し、凍結して -80 °C に保持します。C |
| 円形カバーガラス 12mm No. 1 | Menzel-Gläser;VWR | 631-0713 | |
| 円形カバーガラス 24 mm No. 1.5 | Carl Roth | PK26.1 | |
| シリンドリカルレンズ | Thorlabs | LJ1516RM-A, LK1002RM-A | |
| 卵バッファー (10x) | Edgar 1995 | 250 mM HEPES, 1.18 M NaCl, 480 mM KCl, 20 mM EDTA, 5 mM EGTA, pH 7.4 | |
| エタノール (分析用絶対) | Merck | 64-17-5 | |
| F(ab')2 fragment anti-chicken IgY Jackson | Immunoresearch | AB_2340347 | Donkey polyclonal, 1:100 (SMLM), 1:1,000 (STED Microscopy) |
| F(ab')2フラグメント抗マウスIgG | ジャクソン免疫研究 | AB_2340761 | ロバポリクローナル、1:100(SMLM)、1:1,000(STED顕微鏡) |
| フィッシャーブランド顕微鏡スライドT / F地面0.8-1.0ミリメートル厚 | フィッシャー科学 | 7107 | |
| ゲージワームピック30直径0.254ミリメートル - イリジウム10% | Kisker | 789265 | |
| グルコースオキシダーゼ/カタラーゼ酵素ミックス(GlOX/Cat) | ジョナスリース | からの贈り物ヘス、ムンド、ライトバーガー、&Ries、2018 | 20x、1916 U/mL グルコースオキシダーゼ (Sigma G7141)、42350 U/mL カタラーゼ (Sigma C3155)、 50 mM Tris-HCl pH 8.0、51% グリセロール、MilliQ 水。-20°Cで保存。 |
| イメージングバッファーベース | は、Jonas Ries | Hoess、Mund、Reitberger、&からの贈り物です。Ries, 2018 | 50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 10 mM NaCl, 10% D-Glucose. 1 回の使用量 (950 μL)、冷凍、および-80°Cに保たれます。 |
| Invitrogen ProLong ガラス 退色防止封入剤 | ThermoFischer Scientific | P36982 | |
| Leica Stellaris 8 STED FALCON | Leica | N/A | 顕微鏡には、最新世代の白色光レーザー、775nm パルス STED レーザー、FALCON Fluorescence Lifetime IMaging モジュール、 HC PL APO CS2 100x/1.40 オイル対物レンズ、ライカ HyD X 検出器。このシステムは、色素の特異的蛍光寿命を測定するFLIMモジュール強化Tau-STEDに対応しているため、色素の蛍光寿命やサンプル中の色素条件の違いに基づいてバックグラウンドシグナルを除去することができます。さらに、枯渇ドーナツのさまざまな領域での蛍光寿命の変動を考慮することにより、分解能が向上します。 |
| 長波チャネル発光フィルター | AHF Analysentechnik | F47-702 | 700/100 nm バンドパス |
| メタノール (分析用絶対) | メルク | 67-56-1 | |
| NaHCO3 | Sigma-Aldrich/Merck | S5761-500G | 100 mM NaHCO3, pH 8.3 |
| 近赤外線ファイバー結合レーザー | トプティカ | IBEAM-SMART-PT-CD | カスタムデザイン,808 nm - 75mW |
| 対物レンズ ピエゾ マウント (PIFOC) | Physik Instrumente | P-726.1.CD | 100 µm 移動範囲 |
| オルカフュージョン BT sCMOS カメラ | 浜松 | C15440-20UP | |
| PCR チューブ | Greiner Bio-One | 673283 | 0.2 mL |
| リン酸生理食塩水バッファー (PBS 10x) | N/A | 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4, pH 7.4 | |
| ピアス 16% ホルムアルデヒド (w/v)、メタノールフリー | ThermoFischer Scientific | 28906 | 16% ホルムアルデヒドを元のガラスアンプルから 1.5 mL チューブに移し、室温に保ちます。 |
| PlasmaPrep2 プラズマクリーナー | GaLa Instrumente GmbH | N/A | |
| Poly-L-lysine 臭化水素 | Sigma-Aldrich/Merck | P2636-25MG | 0.1% w/v 溶液を Milli-Q 水で調製し、-20°C でアリコートに保存しました。 |
| 一次ダイクロイック(照明反射) | AHF Analysentechnik | F73-866S | クワッドバンドパス@ 405、488、561、640 |
| ワッドノッチフィルター | AHF Analysentechnik | F40-072 | 405/488/561/640 nm |
| 象限フォトダイオード(QPD) | レーザーコンポーネント | SD197-23-21-041、LC301DQD-PV | |
| カミソリ刃ア | ポロHerkenrath Solinger | N / A | |
| 屈折型ビームシェイ | パーAdlOptica | PiShaper 6_6_VIS | |
| Roche Blocking Reagent | Roche | 11096176001 | 10x溶液を推奨に従って調製しました。凍結アリコートは-20°Cで保存されました。 |
| メスの刃(フェザーブランド#11、No.3) | ハインツヘレンツMedizinalbedarf GmbH | 1110911 | |
| メス除去ボックス | フィッシャーサイエンティフィック | 10002-50 | |
| 二次ダイクロイック(発光反射) | AHF Analysentechnik | F38-785S | 750 nmロングパス |
| ショートパスフィルター | セムロック | BSP01-785R-25 | 750 nm |
| 短波チャネル発光フィルター | AHF Analysentechnik | F37-677 | 676/37 nm バンドパス |
| 単一分子局在顕微鏡 | EMBL Imaging Centre | Diekmann et al., 2020 with modifications | この顕微鏡は、シングルモードファイバー結合レーザーエンジン、追加のブースターレーザー、屈折型ビームシェイパーによる広視野の落射照明を提供し、均一な照明場を提供します(Stehr et al, 2019)。広視野画像はsCMOSカメラでキャプチャされます スペクトルに重なり合う遠赤色色素のレシオメトリックイメージングのために、イメージスプリッターはカメラ上でスペクトル的に異なる2つの画像を生成します(分割ダイクロイック:665 nmロングパス、短波チャネル発光フィルター:676/37 nmバンドパス、長波発光フィルター:700/100 nmバンドパス)。追加の 405/488/561/640 nm クワッドノッチ フィルターと 750 nm ショートパス フィルターは 2 つのパスに共通であり、追加のレーザー ブロッキングを提供します). 複合シリンドリカル レンズは、3D イメージングに必要な非点収差を提供します. 時間内に 2 時間を超える取得 (200,000 - 250,000 画像を含む) で固定焦点を維持するために、 フォーカスロックは、近赤外線ファイバー結合レーザーの全反射によって実現されます カバーガラスから、その後の象限フォトダイオード(QPD)での高さに敏感な検出。QPD信号は対物レンズのピエゾmount. の閉ループ制御を提供しました この顕微鏡へのアクセスについては、https://www.embl.org/about/info/imaging-centre または連絡先を参照してください |
| ic-contact@embl.de シングルモードファイバー結合マルチレーザーエンジン | Toptica | iCHROME MLE-LFA-HP | 405、488、561、640nmで100mWの広視野落射照明を提供します |
| スプリッティングダイクロイック | AHF Analysentechnik | F48-665SG | 665 nmロングパス |
| スクエアカバーガラス22 x 22 mm No.1 | Menzel-Gläser;VWR | 630-2882 | |
| STAR 635P、NHS ester | Abberior | ST635P-0002-1MG | DMSOに溶解して1 mM溶液にし、1回の使用容量に分注し、凍結して-80°Cに保持しました。C |
| 実体顕微鏡 Stemi 305 Stand K LAB | Zeiss | N/A | |
| テトラミソール塩酸塩 | Sigma-Aldrich/Merck | T1512-2G | 1% (w/v) 溶液を Milli-Q 水で調製しました。冷凍アリコートは-20°C. で保存され、解凍されたアリコートは4°Cに保管されました。Cで、数ヶ月間使用します。 |
| テトラスペック ミクロスフェア | サーモフィッシャー サイエンティフィック | T7279 | 0.1 &マイクロ;m、蛍光ブルー/グリーン/オレンジ/ダークレッド |
| トリス生理食塩水バッファー (TBS 10x) | N/A | 200 mM Tris-HCl, 1.5 M NaCl, pH 7.5 | |
| TWEEN 20 | Sigma-Aldrich/Merck | P9416-50ML | 室温で元のパッケージに保管。 |
| WormStuff ウォームピック | キスカー | 789277 | |
| XY顕微鏡ステージ | Smaract | N / A | カスタムデザイン |
| Zebaマイクロスピン脱塩カラム | ThermoFischer Scientific | 89877 | 7K MWCO、75 & マイクロ;L |
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