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Research Article
Fatima Liaqat1, Richard Thiga Kangethe1, Rudolf Pichler1, Bo Liu1, Johann Huber2, Viskam Wijewardana1, Giovanni Cattoli1, Luca Porfiri1
1Animal Production and Health Section, Joint Food and Agriculture Organization (FAO)/International Atomic Energy Agency (IAEA) Centre of Nuclear Techniques in Food and Agriculture,International Atomic Energy Agency, 2Teaching and Research Farm Kremesberg, Clinical Unit for Herd Health Management in Ruminants, Department for Farm Animals and Veterinary Public Health,University of Veterinary Medicine, Vienna
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
この方法論では、ウシ単球由来樹状細胞(MoDC)の生成と、牛の潜在的な獣医用ワクチンの開発中の抗原候補の in vitro 評価へのそれらの応用について説明しています。
樹状細胞(DC)は、免疫系内で最も強力な抗原提示細胞(APC)です。彼らは病原体を探して生物をパトロールし、自然免疫応答と適応免疫応答をリンクすることにより、免疫系内で独自の役割を果たします。これらの細胞は、捕捉された抗原を貪食し、エフェクター免疫細胞に提示し、多様な免疫応答を引き起こす可能性があります。この論文は、ウシ末梢血単核球(PBMC)から分離されたウシ単球由来樹状細胞(MoDC)の in vitro 生成のための標準化された方法と、ワクチンの免疫原性の評価におけるそれらの応用を示しています。
PBMCからCD14+ 単球を単離するために磁気ベースのセルソーティングを使用し、インターロイキン(IL)-4および顆粒球-マクロファージコロニー刺激因子(GM-CSF)を完全培養培地に補充して、CD14+ 単球をナイーブMoDCに分化させました。未成熟MoDCの生成は、主要組織適合遺伝子複合体II(MHC II)、CD86、およびCD40細胞表面マーカーの発現を検出することによって確認されました。市販の狂犬病ワクチンを使用して未熟MoDCをパルスし、その後、ナイーブリンパ球と共培養しました。
抗原パルスMoDCとリンパ球共培養のフローサイトメトリー解析により、Ki-67、CD25、CD4、およびCD8マーカーの発現によるTリンパ球増殖の刺激が明らかになりました。定量的PCRを用いた IFN-γ および Ki-67のmRNA発現の分析は、MoDCがこの in vitro 共培養系においてリンパ球の抗原特異的プライミングを誘導できることを示した。さらに、ELISAを用いて評価されたIFN-γ分泌は、狂犬病ワクチンパルスMoDCリンパ球共培養において、非抗原パルスMoDCリンパ球共培養よりも有意に高い力価(**p < 0.01)を示した。これらの結果は、ワクチンの免疫原性を測定するためのこのin vitro MoDCアッセイの有効性を示しており、このアッセイは、 in vivo 試験を進める前に牛の潜在的なワクチン候補を特定するため、および市販ワクチンのワクチン免疫原性評価に使用できます。
獣医用ワクチン接種は、世界の畜産部門に影響を与える病気に対する保護を与えることにより、食料安全保障と動物福祉の改善に貢献するため、畜産と健康の重要な側面を表しています1。可能なワクチン候補の免疫原性を評価するための効果的な in vitro 法は、ワクチンの開発と製造のプロセスを加速するのに役立ちます。したがって、 in vitro 研究に基づく革新的な方法論で免疫アッセイの分野を拡大することは、免疫化と病原体感染に関連する免疫プロセスの複雑さを明らかにするのに役立つため、必要です。現在、定期的なサンプリング(血液や脾臓など)を必要とする in vivo 動物免疫およびチャレンジ試験が、候補ワクチンおよびアジュバントの免疫原性を測定するために使用されています。これらのアッセイは高価で時間がかかり、ほとんどの場合、動物の安楽死は試験の終わりまでに行われるため、倫理的な意味があります。
in vivoアッセイの代替として、末梢血単核細胞(PBMC)を使用して、in vitro2でワクチン誘導免疫応答を評価しています。PBMCは、70%〜90%のリンパ球、10%〜20%の単球、および限られた数の樹状細胞(DC、1%〜2%)で構成される不均一な細胞集団です3。PBMCには、B細胞、単球、DCなどの抗原提示細胞(APC)があり、感染や組織損傷の兆候を探して生物を常にパトロールします。局所的に分泌されるケモカインは、細胞表面受容体に結合することにより、これらの部位へのAPCの動員および活性化を促進する。単球の場合、ケモカインはDCまたはマクロファージのいずれかに分化するように運命を指示します4。DCが病原体に遭遇して捕獲するとすぐに、それらは二次リンパ器官に移動し、そこで主要組織適合遺伝子複合体(MHC)クラスIまたはクラスII表面タンパク質を使用して処理された病原体ペプチド抗原をそれぞれCD8+ T細胞またはCD4+ T細胞に提示することができ、したがって免疫応答を引き起こす5,6。
さまざまな病原体に対する防御免疫応答を調整する上でDCが果たす重要な役割は、特に感染性病原体に対するワクチンやアジュバントを設計する際に、細胞内免疫メカニズムを理解するための興味深い研究ターゲットになります7。PBMCから得ることができるDCの割合はかなり小さい(1%〜2%)ので、代わりに単球がin vitroでDCを生成するために使用されてきました8。これらの単球由来DC(MoDC)は、当初、がん免疫療法における可能な治療戦略として開発されました9。最近では、MoDCがワクチン研究に使用されており10、11、12、古典的な単球がMoDC産生の主要なサブタイプ(89%)です13。インビトロでのMoDCの産生は、インターロイキン-4(IL-4)、腫瘍壊死因子α(TNF-α)、またはIL-13などの他のサイトカインと組み合わせて与えられた顆粒球-マクロファージコロニー刺激因子(GM-CSF)の添加によって以前に達成されています14,15,16。
in vitro MoDCアッセイの成功は、抗原刺激成熟MoDCが検出された抗原のタイプに特異的な免疫応答の範囲とタイプを調節する能力に依存しています17。MoDCによって認識および提示される病原体の種類は、CD4+ Tヘルパー(Th)細胞のTh1、Th2、またはTh17エフェクター細胞への分化を決定し、病原体特異的分泌サイトカインプロファイルによって特徴付けられます。Th1応答は細胞内病原体に対して誘発され、食作用依存性保護を調節するインターフェロンガンマ(IFN-γ)および腫瘍壊死因子ベータ(TNF-β)の分泌をもたらす。Th2応答は寄生生物に対して誘発され、IL-4、IL-5、IL-10、およびIL-13分泌によって特徴付けられ、食作用に依存しない体液性保護を開始します。Th17は、IL-17、IL-17F、IL-6、IL-22、およびTNF-α 18,19,20,21の分泌によって媒介される細胞外細菌および真菌感染症に対する好中球依存性の保護を提供します。以前の研究に基づいて、すべての病原体が予想されるサイトカインプロファイルに含まれるわけではないことが指摘されています。例えば、皮膚MoDCは、リーシュマニア寄生感染に応答して、CD4+ T細胞およびCD8+ T細胞からのIFN−γ分泌を刺激し、したがって保護的炎症誘発性Th1応答を誘導する22。
また、サルモネラ菌リポ多糖(LPS)をプライミングしたニワトリMoDCでは、Th1応答とTh2応答の両方を活性化することにより、ネズミチフス菌に対する可変応答を誘導できることも示されていますが、サルモネラガリナラムはTh2応答のみを誘導し、MoDCクリアランス23に対する後者のより高い耐性を説明できる可能性があります。ブルセラ・カニス(B. canis)に対するMoDCの活性化は、イヌとヒトの両方のMoDCでも報告されており、これは人獣共通感染症の感染メカニズムを表している可能性があります24。B. canisでプライミングされたヒトMoDCは、重篤な感染に対する耐性を与える強力なTh1応答を誘導しますが、イヌMoDCは、Th1応答の低下を伴う優性Th17応答を誘導し、その後、慢性感染症の確立につながります25。ウシMoDCは、前者10に応答してウイルス抗体複合体を形成するため、免疫グロブリンG(IgG)と結合した口蹄疫ウイルス(FMDV)に対する親和性が非結合FMDV単独と比較して増強された。まとめると、これらの研究は、病原体感染中の免疫応答の複雑さを分析するためにMoDCがどのように使用されているかを示しています。適応免疫応答は、リンパ球増殖に関連する特異的マーカーの定量化によって評価することができる。分裂細胞でのみ検出される細胞内タンパク質であるKi-67は、増殖研究の信頼できるマーカーと見なされており26、同様に、活性化の後期にT細胞の表面に発現するCD25はリンパ球の増殖に対応します27,28。
この研究は、牛MoDCのin vitro生成のための標準化された方法と、それに続くワクチンの免疫原性をテストするために使用されるin vitro免疫アッセイでのそれらの適用を示しています。市販の狂犬病ワクチン(RV)を使用して、このアッセイの有効性を検証しました。Tリンパ球の活性化と増殖は、フローサイトメトリー、リアルタイム定量ポリメラーゼ連鎖反応(qPCR)、および酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)によって測定され、Ki-67やCD25などの確立された細胞活性化マーカーの分析とIFN-γ 28,29,30,31の分泌を通じて測定されました。MoDCアッセイ中に動物または人間の実験試験は行われません。
採血は、オーストリア保健食品安全庁(AGES)の倫理ガイドラインに従い、受け入れられている動物福祉基準32に準拠して、認定獣医サービスによって行われます。この研究は、オーストリア農業省から倫理的承認を受けました。MoDCの生成とその後のアプリケーションの実験計画を 図1に示します。
1.ナイーブMoDCの生産
注:全血サンプルは、ヘパリン化バキュテイナーによる頸静脈穿刺によって、病原体のない単一の子牛から取得されました(この研究では8本の9mL血液チューブを使用しました)。アイスボックスで血液を輸送します。後で使用するためにサンプルを2〜4°Cで保管するか、すぐに処理します。血液凝固を避けるために血液を回転させてください。真空容器を70%エタノールで滅菌します。以下のすべての実験は、1つの生物学的サンプルと6つの技術反復で実施されました。
2. MoDCエンドサイトーシス活性アッセイ
注:抗原取り込みアッセイまたはエンドサイトーシス活性アッセイは、ナイーブMoDCが異物を内在化する能力を測定します。前述のように、3%w/vサイトカインカクテルで培養し、5日間のインキュベーションで培養したナイーブMoDCを使用してアッセイを実行します34。
3. 抗原パルスMoDCの作製
注:狂犬病ウイルス(RV)に対する市販の臨床的に承認されたワクチンは、ナイーブMoDCを成熟抗原提示MoDCに分化させることができます。RVワクチン接種単回用量の0.1%(~1 μL)を使用して、抗原パルスMoDCを生成します。さらに、ナイーブMoDCを新しい24ウェルプレートに移すと悪影響を受けるため、ナイーブMoDCを生成するために使用したのと同じ培養プレート(ステップ1.3.8)でRVパルスMoDCを生成することが好ましい。
4. MoDCリンパ球共培養
注: in vitro MoDCリンパ球共培養システムは、抗原特異的リンパ球をプライミングするMoDCの能力を決定します。共培養の16日後の細胞の異なる処理群には、特異的、非特異的、および対照が含まれる。特定のグループは、RVパルスMoDCと共培養されたリンパ球として定義されます。非特異的グループは、非抗原パルスMoDCと共培養されたリンパ球として定義されます。対照群は、MoDCなしで培養されたリンパ球として定義される。
5. フローサイトメトリー解析
注:フローサイトメーターでサンプルを実行する前に、適切なマーカー/モノクローナル抗体で細胞を染色してください。フローサイトメトリー解析に使用する試薬(染色モノクローナル抗体およびアイソタイプコントロール)、キット、機器、およびソフトウェアの詳細については、 材料表 を参照してください。
6. メッセンジャーRNA(mRNA)発現解析
7. 酵素結合免疫吸着アッセイ
8.統計分析
この方法論は、in vivo研究を実施する前に候補ワクチン抗原を評価するためのウシMoDCのin vitro生成について説明しています。図1は、ウシMoDC生成の実験スキームと、インビトロアッセイへのMoDCの適用を示しています。磁気ベースの細胞選別技術を使用すると、50 mLの牛の血液から以前に分離された採取されたPBMCから約2,600万個のCD14+筋細胞を収集することができました。CD14+単球を含まない溶出細胞画分はリンパ球が豊富であり、ナイーブCD4+およびCD8+ T細胞の供給源として使用されました(CD14-リンパ球細胞画分)。
ナイーブ単球画分は、CD14細胞染色およびフローサイトメトリー後に観察されたように、98%のCD14+ 単球細胞で構成されていました(図2A、B)。精製されたナイーブ単球細胞を、3%サイトカインカクテル(GM-CSFおよびIL-4)の存在下で培養に供すると、その後5日間のインキュベーションで、DC様表現型に分化した。2600万個のCD14+ 単球の出発培養から、5日間のインキュベーション後に合計約1200万個のMoDCを得ることができました。ナイーブMoDCは、FITCデキストランのフローサイトメトリー分析を使用して観察されたように、機能的に抗原を取り込むことができました(図3)。さらに、ナイーブMoDCは、MHCクラスIIおよび共刺激CD86およびCD40細胞表面マーカーの発現を評価することによって表現型的に特徴付けられ、DC様表現型を検証しました(図4)。
ナイーブMoDCの抗原パルス刺激は、不活化RVの存在下で2日間培養することによって達成されました。ナイーブリンパ球(CD14− 細胞画分)の活性化は、抗原パルスMoDCリンパ球とその後のIL-2の補給との共培養によって達成された。9日目のMoDCリンパ球共培養では、RVパルスMoDCに形態学的変化が見られ、MoDC成熟の特徴である樹状突起の伸長が見られました(図5)。14日目に、リンパ球の活性化は、同じ動物から新たに産生されたRVパルスMoDCを添加して共培養を再刺激することによって増強されました。
非パルスMoDCリンパ球共培養と比較して、パルスMoDCリンパ球共培養の16日目に、CD4+およびCD8+ T細胞の両方でKi-67およびCD25活性化マーカーがアップレギュレーションされたことにより、リンパ球増殖の有意な増加(p < 0.01)が実証されました(図6)。成熟RVパルスMoDC共培養由来のCD8+ T細胞は、非特異的群と比較して、Ki-67の8倍のアップレギュレーション(p < 0.01)を示しました(図7A)。同じ共培養におけるCD4+ T細胞は、対照と比較してKi−67において7倍の増加(p < 0.01)を示した(図7B)。これは、RVプライミングMoDCがRV抗原をナイーブリンパ球にうまく提示し、その後、生きている動物で起こるのと同様に、in vitro条件でそれらを活性化する能力を示しています。フローサイトメトリーを用いた細胞の解析に加えて、共培養はqPCRおよびELISAにも供され、RNA転写(Ki-67およびIFN-γ)および細胞外分泌(IFN-γ)を用いたRV特異的リンパ球活性化をそれぞれ定量化しました(図8)。これらの追加の検出方法は、フローサイトメトリーの結果をさらに検証するための確認テストとしても使用できます。qPCRによって実証されたKi-67およびIFN-γのRNA発現およびELISAによって示されたIFN-γレベルは、非特異的処理群と比較して、抗原特異的共培養において同様の増加パターンを示し、リンパ球増殖を示した。したがって、qPCRおよびELISAの結果は、フローサイトメトリーの結果と相関した。qPCRは、GAPDHをキャリブレーターとして使用したすべての共培養において、IFN-γ発現が>30%増加し、Ki-67発現が>5%増加したことを示しました(図8A、B)。非特異的処理群と比較して、RVパルスMoDCリンパ球共培養からの培養上清を用いてELISAで有意に高い濃度の分泌IFN-γ(**p > 0.01)を測定しました(図8C)。

図1:ウシMoDCベースの インビトロ アッセイの実験デザイン。 (A)ウシPBMCからのCD14+ 単球およびCD14- リンパ球細胞画分の採取および細胞選別。 牛の血液は、PBMCを収集するために密度勾配遠心分離によって処理され、続いて免疫磁気細胞分離カラムを使用した磁気ベースの細胞選別が行われ、その後、補充されたRPMI 1640培地で採取されたCD14+ ナイーブ単球細胞画分が培養されます。(B)5日間のインキュベーションおよびMoDCリンパ球共培養を伴う3%サイトカインカクテル(GM-CSF + IL-4)を用いたMoDCの産生。0日目に、単球をサイトカインカクテルの存在下で培養し、48時間インキュベートして分化を誘導します。2日目に、培養物を同じサイトカインカクテルで再刺激し、続いて72時間インキュベートし、ナイーブMoDCを産生します。5日目に、ワクチン抗原(狂犬病ワクチン)をナイーブMoDC細胞培養物に添加し、続いて48時間インキュベートする。7日目に、抗原パルスMoDCとナイーブリンパ球(CD14- 細胞画分)との共培養を行い、続いてインキュベーションを行います。9日目に、IL-2が共培養に追加されます。14日目に、活性化/プライミングされたリンパ球の濃縮/再刺激は、抗原パルスMoDCの添加によって行われ、続いて48時間のインキュベーションが行われます。最後に、16日目に、リンパ球増殖アッセイのために細胞および培養上清を回収する。略語:MODC =ウシ単球由来樹状細胞;PBMC =末梢血単核細胞;GM-CSF =顆粒球-マクロファージ-コロニー刺激因子。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図2:抗CD14結合マイクロビーズを使用してPBMCから採取したウシCD14+ 単球の形態と純度。 (A)完全培養液中で37°Cで4時間インキュベートしてマイクロビーズを除去し、ポリリジンコーティングされたスライド上に固定し、修飾ギムザ染色剤で染色したウシ単球の形態。スケールバー = 50 μm。 (B)抗CD14抗体(赤)およびFITC結合マウスIgG1アイソタイプコントロール抗体(緑)を使用して観察された98.6%の純度レベルで溶出されたCD14+ 細胞画分を示すフローサイトメトリーヒストグラム。略語:PBMC =末梢血単核細胞;FITC cont = フルオレセインイソチオシアネートコントロール。この図は、Kangethe et al., 201811から修正されています。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図3: in vitroで生成されたウシMoDCのエンドサイトーシス活性。 ナイーブMoDCの5日目までのトレーサー分子(FITCデキストラン)の取り込みを示すフローサイトメトリーヒストグラム。MoDCはトレーサー分子(青色)を用いて37°Cで60分間インキュベートし、MoDCはトレーサー分子(灰色)をバックグラウンドコントロールとして氷上でインキュベートした。略語:MODC =ウシ単球由来樹状細胞;FITC=フルオレセインイソチオシアネート。この図は、Kangethe et al., 201811から修正されています。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図4: in vitroで生成されたウシMoDC特異的細胞表面マーカーの表現型。 (A)MoDCのゲーティング戦略、および(B)抗ヒツジMHC II mAb、抗ウシCD86 mAb、抗ウシCD40 mAbを含む3つの異なるDC特異的mAb(青色)で染色した5日目のナイーブMoDCのフローサイトメトリーヒストグラム。すべて対応するアイソタイプコントロール(赤)と比較した。略語:DC =樹状細胞;MODC = ウシ単球由来DC;MHC II = 主要組織適合遺伝子複合体II.この図は、Kangethe et al., 201811から修正されています。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図5:MoDCリンパ球共培養中の in vitro産生MoDCの成熟の兆候。 MoDCリンパ球共培養9日目の倒立顕微鏡による抗原パルスMoDCによる特徴的な伸長樹状構造の観察。(A)共培養リンパ球の非常にコンフルエントな領域内の成熟MoDC。(B)成熟MoDCは、共培養中のリンパ球が少ない領域で容易に区別できます。スケールバー= 50μm。略称:MODC = ウシ単球由来樹状細胞。この図は、Kangethe et al., 201811から修正されています。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図6:MoDCリンパ球共培養におけるリンパ球によるKi-67およびCD25発現に対するドットプロットに採用されたシーケンシャルゲーティング戦略。 (A)MoDCリンパ球共培養16日目から採取した細胞の完全なゲーティング戦略。(B)CD4+依存性リンパ球由来のKi−67発現を、(C)CD8+リンパ球由来のFMO対照(mAbなし)およびマウスIgG1−kアイソタイプ対照mAbと比較した。ゲート型(D)CD8+および(E)CD4+リンパ球上のCD25発現をマウスIgG1アイソタイプ対照mAbと比較した。治療群は、RVパルスMoDCと共培養されたリンパ球を特異的に表し、対照群はMoDCの非存在下で培養されたリンパ球を表す。略語:MODC =ウシ単球由来樹状細胞;FMO =蛍光マイナス1;RV =狂犬病ワクチン。この図は、Kangethe et al., 201811から修正されています。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図7:抗原によるプライミング後のCD4+およびCD8+リンパ球によるKi-67およびCD25発現のフローサイトメトリーデータ解析。 共培養16日目からのKi−67およびCD25発現。治療群(特異的)は、RVパルスMoDCで培養されたリンパ球として定義されます。非特異的グループは、非抗原パルスMoDCで培養されたリンパ球に対応します。対照群は、MoDCなしで培養されたリンパ球に対応します。横棒は、6つのテクニカル反復の平均を表します。(a)CD8 T細胞によるKi-67マーカーの細胞内発現および(B)CD4 T細胞による。(C)CD8 T細胞によるCD25マーカーの細胞表面発現および(D)CD4 T細胞による。略語:MODC =ウシ単球由来樹状細胞;RV =狂犬病ワクチン。この図は、Kangethe et al., 201811から修正されています。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図8:狂犬病ウイルス抗原でプライミングされたMoDCによるTh1マーカー(IFN-γおよびKi-67)の活性化(qPCRおよびELISAによって検出)。 6回の技術反復で1匹の動物から取得したデータ。水平バーは平均を表します。3つのPCR複製は、 GAPDH 参照遺伝子で正常化した後のナイーブリンパ球と比較して倍率変化として示されています。(A) IFN-γ 式、(B)Ki-67 発現。(C)ELISAで検出された3つの処理群間の培養上清中のIFN-γ分泌の比較。特定のグループは、RVパルスMoDCで培養されたリンパ球として定義されます。非特異的グループは、非抗原パルスMoDCで培養されたリンパ球に対応します。対照群は、MoDCなしで培養されたリンパ球に対応します。略語:MODC =ウシ単球由来樹状細胞;RV =狂犬病ワクチン。この図は、Kangethe et al., 201811から修正されています。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
| 試薬 | 最終濃度 | 反応あたりの体積 |
| dNTPsミックス(10 mM) | 1,000 μM | 1 μL |
| ランダムヘキサマープライマー (50 ng/μL) | 25 μM | 1 μL |
| RNAテンプレート | 0.1 – 1 μg/μL | χ μL (必要に応じて) |
| RNAseフリーウォーター | - | χ μL (必要に応じて) |
| 最終反応量 | - | 10 μL |
表1:マスターミックス組成物(RNAプライマーミックス)。
| 試薬 | 最終濃度 | 反応あたりの体積 |
| RT バッファ 10x | 1倍速 | 2 μL |
| マグネシウムCl2 25 ミリメートル | 5ミリメートル | 4 μL |
| DTT 0.1メートル | 10ミリメートル | 2 μL |
| RNAse阻害剤 40 U/μL | 2 U | 1 μL |
表2:2x PCR反応ミックス。 略語:RT =逆転写酵素;DTT = ジチオスレイトール。
| サイトカイン | 種 | アクセッション番号 | 順序 | 長さ | ティッカー |
| IFN-γ | ボスおうし座 | FJ263670 | F- GTGGGCCTCTCTCTTCTCAGAA | 234 | 80.5 |
| R- ガットカットガッガッガ | |||||
| キ-67 | ボスおうし座 | XM_015460791.2 | F-AAGATTCCAGCGCCCATTCA | 148 | 86.5 |
| R-TGAGGAACGAACGACTGG | |||||
| ギャップ | ボスおうし座 | サッスら, 2020 | F-CCTGGAGAAACCTGCCAAGT | 214 | 85.5 |
| R-GCCAAATTCATTGTCGTACCA |
表3:増幅に用いたプライマーセット50。
| 試薬 | 最終濃度 | 反応あたりの体積 |
| スーパーミックス | 1倍速 | 5 μL |
| フォワードプライマー (5 μM) | 250/ 125 nM | 1 μL |
| リバースプライマー (5 μM) | 250/ 125 nM | 1 μL |
| cDNA 1:10 希釈 | 1.25 ng | 2 μL |
| ヌクレアーゼフリー水 | - | 1 μL |
| 最終反応量 | - | 10 μL |
表 4: qPCR マスターミックス
| チューブ番号 | 標準の濃度 | 連続希釈 |
| 1 | 50 ng/mL | 50 μLの標準 + 350 μLの洗浄バッファー |
| 2 | 12.5 ng/mL | チューブ1から150 μL + 洗浄バッファー450 μL |
| 3 | 6.25 ng/mL | チューブ2から250 μL + 洗浄バッファー250 μL |
| 4 | 3.13 ng/mL | チューブ3から250 μL + 洗浄バッファー250 μL |
| 5 | 1.56 ng/mL | チューブ4から250 μL + 洗浄バッファー250 μL |
| 6 | 0.78 ng/mL | チューブ5から250 μL + 洗浄バッファー250 μL |
| 7 | 0.2 ng/mL | チューブ6から150 μL + 450 μLの洗浄バッファー |
| 8 | 0.1 ng/mL | チューブ7から250 μL + 洗浄バッファー250 μL |
| 9 | 0.025 ng/mL | チューブ8から100 μL + 洗浄バッファー300 μL |
表5:IFN-γ標準希釈シリーズ
補足ファイル1:相補的DNAの合成、リアルタイム定量的ポリメラーゼ連鎖反応(qPCR)、および酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)のためのプロトコル。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
補足図S1:サイトカインカクテルの濃度を変え、3日間または5日間の培養におけるMoDCの抗原取り込み能。 GM-CSFおよびIL-4を含むサイトカインカクテルの異なる濃度(5%w/vおよび3%w/v)を3日間または5日間の培養で試験し、高性能抗原取り込みMoDC(トレーサー分子FITCデキストランを使用)を生成するための最良の組み合わせを評価しました。 このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
補足図S2:ジプテリアトキソイド(DT)およびブルータングウイルス血清型4(BTV)によるCD4およびCD8プライミング。16日目に(A)DTおよび(C)BTVでパルスした後のCD8細胞によるKi−67の発現、および(B)DTおよび(D)BVTでパルスした後のCD4細胞によるKi−67の発現。DTおよびBVT(特異的)、(C、D)CD40L、および非特異的プライミングおよび対照処理でパルスした培養物との比較を行った。水平バーは平均を示します。*p < 0.05, **p < 0.01 マン・ホイットニー検定による。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
著者は開示する利益相反を持っていません。
この方法論では、ウシ単球由来樹状細胞(MoDC)の生成と、牛の潜在的な獣医用ワクチンの開発中の抗原候補の in vitro 評価へのそれらの応用について説明しています。
我々は、動物の健康状態の判定とBTVの提供を支援してくれたEveline Wodak博士とAngelika Loistch博士(AGES)、ウシの血液を提供してくれたBernhard Reinelt博士、リアルタイムPCR実験と言語編集に関する有益なアドバイスをしてくださったIAEAのBharani Settypalli博士とWilliam Dundon博士にそれぞれ感謝します。
| ACK Lysing Buffer | Gibco, Thermo Fisher | A1049201 | Ammonium-Chloride-Potassium Buffer for lysis of residual RBCs in harvested PBMC Fraction |
| BD Vacutainer Heparin Tubes | Becton, Dickinson (BD) and Company | 366480 | 10 mL, Additive sodium heparin 158 USP units, glass tube, 16 x 100 mm size |
| Bovine Dendritic Cell Growth Kit | Bio-Rad, UK | PBP015KZZ | 組換えウシIL-4およびGM-CSF |
| ウシIFN-&γで構成されるサイトカインカクテル;ELISAキット | Bio-Rad | MCA5638KZZ | Kitは、培養上清中のIFN-&γ;発現の測定に使用 |
| CD14抗体 | Bio-Rad | MCA2678F | マウス抗ウシCD14モノクローナル抗体、クローンCC-G33、アイソタイプIgG1 |
| CD25 | 抗体Bio-Rad | MCA2430PE | マウス抗ウシCD25モノクローナル抗体、クローンIL-A11、アイソタイプIgG1 |
| CD4 | 抗体Bio-Rad | MCA1653A647 | マウス抗ウシ CD4 モノクローナル抗体、クローン CC8、アイソタイプ IgG2a |
| CD40 抗体 | Bio-Rad | MCA2431F | マウス抗ウシ CD40 モノクローナル抗体、クローン IL-A156、アイソタイプ IgG1 |
| CD8 抗体 | バイオ・ラッド | MCA837F | マウス抗ウシ CD8 モノクローナル抗体、クローン CC63、アイソタイプ IgG2a |
| CD86 抗体 | Bio-Rad | MCA2437PE | マウス抗ウシCD86モノクローナル抗体、クローンIL-A190、アイソタイプIgG1 |
| CFX96 タッチリアルタイムPCR検出システム | Bio-Rad-Thermal | サイクラーPCRマシン | |
| Corning Centrifuge Tube | Falcon Corning | 352096 & 352070 | 15 mL および 50 mL、高透明度ポイプロピレン円錐底、目盛り付き、立体、シールスクリューキャップ、ファルコンチューブ |
| Cytofix/Cytoperm Plus | BD Bio Sciences | 555028 | BD golgiPlug による固定/透過化キット、フローサイトメーター細胞染色に使用 |
| エタノール | Sigma Aldrich | 1009832500 | Absolute 分析用 EMSURE ACS、ISO、リーグ。Ph Eur |
| ウシ胎児血清 (FBS) | Gibco, Thermo Fisher | 10500064 | Qualified, heat inactivated |
| Ficoll Plaque PLUS | GE Health care Life Sciences, USA | 341691 | Lymphocyte-isolation medium |
| FlowClean Cleaning Agent | Beckman Coulter, Life Sciences | A64669 | 500 mL |
| FlowJo | FlowJo, Becton, Dickinson (BD) and Company, LLC, USA | - | フローサイトメーター ヒストグラムソフトウェア |
| FlowTubes/ FACS (蛍光活性化シングルセルソーティング)チューブ | ファルコンコーニング | 352235 | 5 mL、立体、丸底ポリスチレン試験管、セルストレーナースナップキャップ付き、フローサイトメトリー分析に使用 |
| フルオレセインイソチオシナト-デキストラン | Sigma Aldrich, Germany | 60842-46-8 | FITC-dextran MW |
| Gallios Flow Cytometer | Beckman Coulter-Flow | Cytometer machine | |
| Hard-Shell 96-Well PCR Plates | Bio-Rad | HSP9601 | 96 well, low profile, thin wall, skirted, white/clear |
| Human CD14 MicroBeads | Miltenyi Bioteck, Germany | 130-050-201 | 2 mL microbeads conjugated to monoclonal anti-human CD14 antibody isotype IgG2a, used for selection of bovine monocytes from PBMCS |
| Kaluza | Beckman Coulter, | Germany-Flow | cytometer multicolor data analysis software |
| MACS Column | Miltenyi Bioteck, Germany | 130-042-401 | 細胞表面抗原に基づく様々なCD14細胞集団の分離のための磁気活性化細胞ソーティングまたは免疫マゼンティック細胞分離コロム |
| MHCクラスII DQ DR多型抗体 | バイオ・ラッド | MCA2228F | マウス抗ヒツジ MHCクラスII DQ DR 多型:FITC、クローン49.1、アイソタイプIgG2a、ウシと交差反応 |
| 微量遠心チューブ | Sigma Aldrich | HS4325 | 1.5 mL、円錐形の底部、 目盛り付き、立体管 |
| マイクロソフトパワーポイント | マイクロソフト | - | 実験デザイン |
| マウスIgG1ネガティブコントロールのグラフィックイラスト:CD14、CD40抗体 | バイオラッド | MCA928F | アイソタイプコントロールCD14およびCD40モノクローナル抗体のFITC |
| マウスIgG1ネガティブコントロール:CD86抗体 | バイオ・ラッド | MCA928PE | アイソタイプコントロールCD86モノクローナル抗体用PE |
| マウスIgG1ネガティブコントロール:CD25抗体 | バイオ・ラッド | MCA928PE | アイソタイプコントロールCD25モノクローナル抗体用RPE |
| マウスIgG2aネガティブコントロール:MHCクラスII抗体用FITC | バイオ・ラッド | MCA929F | MHCクラスIIモノクローナル抗体用アイソタイプコントロール |
| Nobivac狂犬病 | MSD動物衛生、 | UK-1 | およびマイクロ;> 2 I.U./mL 狂犬病ウイルス株を含む細胞培養不活化ワクチンの L/mL |
| 光学シール | Bi0-Rad | TCS0803 | 0.2 mL フラット PCR チューブ 8 キャップストリップ、光学、超透明、qPCR 装置に対応 |
| ペニシリン-ストレプトマイシン | Gibco、サーモフィッシャー | 15140122 | 100 mL |
| リン酸緩衝生理食塩水 (PBS) | Gibco、サーモフィッシャー | 10010023 | pH 7.4、1x 濃度 |
| Prism - GraphPad 5ソフトウェア | Dotmatics-Statistical | software | |
| 精製抗ヒト Ki-67 抗体 | Biolegend, USA | 350501 | モノクローナル抗体, 牛と交差反応, クローン ki-67 |
| 精製マウス IgG1 k アイソタイプ制御抗体 | Biolegend | 400101 | Ki-67 モノクローナル抗体 |
| READIDROP ヨウ化プロピジウム | BD バイオサイエンス | 1351101 | フローサイトメトリー、アミン反応性色素 |
| 組換えヒトIL-2タンパク質 | R&に使用される生細胞/死細胞マーカーD System, USA | 202-IL-010/CF | Interleukin-2, 20 ng/ml |
| RNeasy Mini Kit | Qiagen | 74106 | 全RNAの抽出に使用。RLTバッファー=溶解バッファー;RW1バッファー=厳格なグアニジン含有洗浄バッファー。RDDバッファ= DNaseバッファ;RPEバッファー=マイルドウォッシュバッファー;RNaseOUT = RNase阻害剤。 |
| RPMI 1640 Medium | Sigma Aldrich | R8758 | L-グルタミンと重曹を含む細胞培養培地 |
| SMART-servier メディカルアート | Les Laboratories Servier | - | クリエイティブ・コモンズ 表示 3.0 非移植ライセンスの下でライセンス |
| SsoAdvanced Universal SYBR Green Supermix | Bio-Rad | 172-5270 | 2x qPCR mix conatins dNTPs, Ss07d fusion polymerase, MgCl2, SYBR Green I supermix = supermix, ROX 正規化色素. |
| SuperScript III First-Strand Synthesis System | Invitrogen, Thermo Fisher | 18080051 | Kit for cDNA synthsis |
| Tissue Culture Test plate 24 | TPP, Switzerland | 92024 | 24 well plate, sterilized by radiation, growth enhanced treated, volume 3.18 mL |
| Trypan Blue Solution | Gibco, Thermo | Fisher | 15250061 0.4%, 100 mL, 細胞生存率 |
| を評価するための色素UltraPure DNase/RNase-Free Distilled Water | Invitrogen, Thermo Fisher | 10977023 | 0.1 µm膜ろ過蒸留水 |
| VACUETTE ヘパリン採血管 | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 15206067 | VACUETTEヘパリン採血チューブは、上部が緑色で、内壁に噴霧乾燥リチウム、ナトリウム、またはアンモニウムヘパリンが含まれており、臨床化学、免疫学、血清学で使用されています。抗凝固剤のヘパリンはアンチトロンビンを活性化し、アンチトロンビンが凝固カスケードをブロックし、全血/血漿サンプルを生成します。 |
| ウォーター | シグマ アルドリッチ | W3500-1L | 細胞培養に適した無菌ろ過バイオ試薬 |