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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
このプロトコルはRNAの分析および細胞培養のようなそれに続く適用を促進する大人のマウス脊髄からの浄化されたastrocytesそしてミクログリアの隔離を概説する。これには、単離された細胞の品質と収量の両方を向上させるように設計された詳細な細胞解離方法と手順が含まれています。
アストロサイトとミクログリアは、中枢神経系の発達、損傷反応、神経変性疾患において極めて重要な役割を果たしています。これらの非常に動的な細胞は、環境変化に迅速に応答し、形態、転写プロファイル、および機能の点で有意な不均一性を示します。健康と疾患におけるグリア細胞の機能に関する理解は大幅に進歩しましたが、異なる細胞集団を包括的に特徴付けるために、侮辱または損傷の文脈で実施される in vitroの細胞特異的分析の必要性が残っています。成体マウスから細胞を単離すると、病理学的条件下および特定の時点での細胞の分析が可能になるため、細胞株や新生児動物に比べていくつかの利点があります。さらに、脳病変を除いた脊髄特異的な単離に着目することで、実験的自己免疫性脳脊髄炎、脊髄損傷、筋萎縮性側索硬化症などの脊髄病態の研究が可能になります。このプロトコルは、成体マウスの脊髄からアストロサイトとミクログリアを分離するための効率的な方法を示し、機能的、分子的、またはプロテオミクス下流研究における潜在的なアプリケーションとの即時または将来の分析を促進します。
アストロサイトとミクログリアは、中枢神経系(CNS)で重要な役割を果たす汎用性の高いグリア細胞であり、神経機能の調節、中枢神経系の発達への寄与、血液脳関門の維持、その他の重要なプロセスへの参加などの役割を担っています1,2,3,4.これらのグリア細胞は、ホメオスタシスの維持における役割に加えて、損傷や修復のメカニズムにおいても極めて重要な役割を果たしています。ミクログリアは、侮辱や傷害に続く貪食、炎症、および遊走能力でよく知られています5,6,7。疾患におけるアストロサイトの応答も同様に多様であり、炎症、グリア瘢痕の形成、および血液脳関門の損傷への寄与を網羅しています8,9。中枢神経系におけるミクログリアとアストロサイトの有害および修復的な役割についての理解は深まっていますが、それらの構造と機能の両方に固有の不均一性は、さまざまな状況でそれらを研究するための堅牢なツールを必要とします。
健康と疾患におけるミクログリアとアストロサイトの役割についてさらに洞察を得るには、 in vivo と in vitro での研究を組み合わせたアプローチが必要です。 in vivo 法では、中枢神経系内のグリア細胞とニューロン間の複雑なクロストークを活用し、 in vitro の方法論は、特定の刺激下での単一細胞の機能や応答を評価する際に有用であることが証明されています。それぞれの方法には独自の利点があります。 in vitro 研究は、隣接する細胞からの直接的または間接的なインプットなしに、これらの細胞タイプの特定の役割を理解するために不可欠です。さらに、不死化細胞株を用いた in vitro アッセイは、無期限に増殖する能力、費用対効果、メンテナンスの容易さなど、一定の利点をもたらします。ただし、初代細胞は細胞株と比較して、正常な生理学的応答をより厳密に模倣していることに注意することが重要です。この生理学的関連性は、機能アッセイやトランスクリプトーム解析において非常に重要です。
特に成体マウスの脊髄から初代細胞を得る際の課題の1つは、サンプルの量と生存率にあります。成人の脊髄は、脳よりも小さく、かなりの量のミエリンを含んでいるため、独特の困難があります。新生仔動物または成体マウスの脳からの純粋で生存可能なグリア細胞の分離を詳述するいくつかの公開プロトコルがありますが10,11,12,13、これらの方法論は、脊髄に特異的な疾患や損傷の研究には適していない可能性があります。このプロトコルでは、成体マウスの脊髄から純粋で生存可能なミクログリアとアストロサイトを効率的に分離するための包括的な手順を提供し、細胞培養およびトランスクリプトーム解析におけるダウンストリームアプリケーションを促進します。このプロトコルは、10週から5ヶ月の成体マウスからこれらの細胞を単離するために使用され、条件付きノックアウトマウス、薬物反応、発生研究、加齢モデルを含む研究など、さまざまな状況でその有用性を実証しています。
すべての動物飼育および実験手順は、ジョージワシントン大学医学部および健康科学部(米国ワシントンD.C.;IACUC#2021-004)です。この研究では、生後10週間から5ヶ月の雌雄のC57BL/6J野生型(WT)マウスを使用し、ジョージワシントン大学に収容された商業サプライヤー( 資料表を参照)から調達しました。プロトコルのワークフローの概要を 図1に示します。
1.脊髄の準備
2. 酵素細胞解離
3. 機械的細胞解離
4.ミエリン除去
5. ミクログリアとアストロサイトの単離
6. in vitro アッセイ用細胞のプレーティング
注:細胞を播種せず、すぐに RNA 分析に使用する場合は、ステップ 8 に進みます。
7. 免疫組織化学
注:免疫組織化学分析は、培地を少なくとも1回交換した場合、少なくとも3日後に行うのが最善です。これにより、破片が除去され、細胞がカバーガラスに完全に付着します。
8. RNA抽出
注:理想的には、分析に十分な RNA を抽出するために、少なくとも 100,000 個の細胞が必要です。必要に応じて、2〜3個の脊髄の細胞を組み合わせることができます。
このプロトコルで概説されている方法は、成体マウス脊髄から純粋で生存可能なミクログリアおよびアストロサイトの単離を可能にし、 in vitro の機能的または組織学的アッセイやRNA分析など、さまざまなダウンストリームアプリケーションを促進します。
in vitro試験の単離が成功すると、数日間にわたって細胞が連続的に増殖します。成体細胞は、新生児動物から単離された細胞と比較して増殖速度が遅く、最初の数日間はいくつかの破片が存在する可能性があります。in vitro(DIV)で4日目までに、細胞は破片がほとんどなくなり、ほとんどの細胞がフラスコの底に付着します。アストロサイトはより長い突起を形成し始めますが、ミクログリアはより短い紡錘体を持つ楕円形を呈します(図2)。7 DIVまでに、アストロサイトは結合したコンフルエント層を形成し、ミクログリアはより少なく、より短いプロセスを示すはずです(図3)。
ACSA2ソート細胞をGFAPおよびO4で二重標識してアストロサイト培養におけるオリゴデンドロサイト汚染を評価し、CD11bソート細胞をIba1およびGFAPで二重標識してミクログリア培養におけるアストロサイト汚染を評価することで、純度を確認できます(表1)。
また、プロトコールが成功すれば、分解が最小限に抑えられ、十分な量で高品質のRNAが得られます(図4A)。単離された細胞から抽出されたRNAのエレクトロフェログラムは、顕著な18Sおよび28Sピークを示すはずです。細胞が過剰に解離したり、灌流と細胞選別に時間が長引いたりすると、RNAの分解につながる可能性があります(図4B)。酵素的および/または機械的解離が不十分であったり、ミエリンの除去が不十分であったりすると、細胞収量およびRNAが低下する可能性があります(図4C)。単離されたアストロサイトは、炎症マーカーを特定するために配列決定することができます。健康なアストロサイトと炎症活性化されたアストロサイト(例えば、実験的な自己免疫性脳脊髄炎動物のアストロサイト)を比較すると、健康なアストロサイトと炎症性アストロサイトの炎症経路の相対的な阻害が明らかになります(図4D)。

図1:脊髄調製、組織解離、細胞選別の概要。 この図は、組織の解離や細胞の選別など、脊髄の準備プロセスの概要を示しています。脊髄解剖後、組織は酵素的および機械的解離を受けます。ミエリンを除去し、細胞を抗ACSA2抗体または抗CD11b抗体で標識して、アストロサイトとミクログリアを標的とします。選別された細胞は、細胞培養やRNA解析に利用できます。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

図2: in vitro での4日間のアストロサイトとミクログリアの位相差画像(4DIV)。 (A)は、ACSA2+ソート細胞の代表的な例を示しています。(B)CD11b+細胞は、楕円形の細胞体と短い突起を示す。スケールバー = 50 μm。この図は、Ahn, J. J. et al.16 からの引用です。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

図3:in vitro (8DIV)での8日間のアストロサイトとミクログリアの蛍光画像。 (A)GFAP(緑)およびO4(赤)で標識されたACSA2+細胞は、最小限のO4染色を示し、アストロサイトの結合したコンフルエント層を形成します。(B)Iba1(緑)およびGFAP(赤)で標識されたCD11b+細胞は、GFAPの存在が最小限であることを示しています。スケールバー = 50 μm。この図は、Ahn, J. J. et al.16 からの引用です。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

図4:RNAサンプルの代表的なエレクトロフェログラム。 (A)細胞単離に成功した後、高収量で高品質のRNAが期待されます。(B)低収量、低品質のRNA、または(C)低収量で高品質のRNAは、細胞死、不十分な解離、または不十分な破片除去の場合に期待できます。(D)健康なアストロサイトと炎症性アストロサイトの特定の炎症経路のRNAシーケンシング解析により、炎症性アストロサイトと比較して、分類された健康なアストロサイトにおける炎症の相対的な抑制が明らかになりました。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。
| 細胞の種類 | 合計セル数 | 並べ替えられたセル | ソート済み/合計 (%) | 平均生存率 % |
| ACSA2の | 6.3×105 | 1.7×105 | 27 | 92 |
| CD11bの | 6.3×105 | 8.0×104 | 12.7 | 93 |
表1:ACSA-2およびCD11b細胞の選別後の細胞収量、純度、および生存率。 この表は、Ahn, J. J. et al.16 から引用したものです。
何一つ
このプロトコルはRNAの分析および細胞培養のようなそれに続く適用を促進する大人のマウス脊髄からの浄化されたastrocytesそしてミクログリアの隔離を概説する。これには、単離された細胞の品質と収量の両方を向上させるように設計された詳細な細胞解離方法と手順が含まれています。
ジョージ・ワシントン大学ゲノミクス・コアの Castle Raley 氏には RNA 解析を、Q2 Lab Solutions には RNA シーケンシング解析をお願いいたします。この研究は、National Institute of Neurological Disorders and Stroke [grant number F31NS117085] と Vivian Gill Research Endowment to Dr. Robert H. Miller の支援を受けた。 図 1 は BioRender.com で作成されました。
| 2,2,2-トリブロモエタノール | Sigma Aldrich | T48402 | |
| 24 ウェル組織培養プレート | Avantor | 10861-558 | |
| 2-メチル-2-ブタノール、98% | サーモフィッシャー | A18304-0F | |
| 4',6-ジアミジノ-2-フェニルインドール、二塩酸塩 | Invitrogen | D1306 | 1:1000 |
| 45% グルコース溶液 | コーニング | 25-037-CI | |
| 5 mLキャップ付きチューブ | エッペンドルフ | 30122305 | |
| 酢酸 | Sigma-Adlrich | A6283 | |
| 成人脳解離キット | Miltenyi | 103-107-677 | |
| 抗ACSA2マイクロビーズキット | Miltenyi | 130-097-679 | |
| 抗IBA1 | 和光 | 019-1974 | |
| バイオアナライザー | アジレントC57BL | /6J野生型(WT)マウスG2939BA | 技術 |
| ジャクソン研究所 | |||
| CD11b(ミクログリア)MicroBeads | Miltenyi | 130-093-634 | |
| Celltrics 30 & micro;mフィルター | シスメックス パルテック | 04-004-2326 | |
| 計数室(血球計算盤) | ハウサーサイエンティフィック社 | 3200 | |
| ウシ膵臓由来デオキシリボヌクレアーゼ | シグマ・アルドリッチ | D4527-40KU | |
| 蒸留水 | TMO | 15230001 | |
| DMEM/F12 | サーモフィッシャー | 11320074 | |
| RNA精製用DNase | Qiagen | 79254 | |
| ダルベッコのリン酸緩衝生理食塩水 | サーモフィッシャー | 14040117 | |
| ウシ胎児血清 | サーモフィッシャー | A5209401 | |
| GFAP抗体 (マウス) | Santa Cruz | sc-33673 | 1:500 |
| GFAP抗体 (ウサギ) | Dako | Z0334 | 1:500 |
| ヤギ抗マウス 594 IgG | Invitrogen | a11032 | 1:500 |
| ヤギ抗マウス 594 IgM | Invitrogen | a21044 | 1:300 |
| ヤギ抗ウサギ 488 IgG | Invitrogen | a11008 | 1:500 |
| Iba1抗体(ウサギ) | 和光 | 019-1974 | 1:500 |
| MACS セパレーター | ミルテニ | 130-042-303 | |
| マスターフレックス C/L ポンプシステム | サーモフィッシャー | 77122-22 | |
| MEM | Corning | 15-015-CV | |
| メタノール | Sigma-Adlrich | 439193 | |
| 埋込 Medium | Vector Laboratories | H-1000-10 | |
| MS カラム | Miltenyi | 130-042-401 | |
| O4 抗体 | R&D | MAB1326 | |
| ペニシリン-ストレプトマイシン | Gibco | 15070063 | |
| プラグド 9" ガラス パスツールピペット | VWR | 14672-412 | |
| RNeasy Plus マイクロキット | Qiagen | 74034 | |
| Royal-tek 外科用メス刃 No. 10 | フィッシャー サイエンティフィック | 22-079-683 | |
| 小静脈輸液セット、23 G x 19 mm | 川澄 | D3K2-23G |