本稿では、無人航空機(UAV)リモートセンシングから得られたデータを活用して、侵入種のバイオマス評価と空間分布を捉える侵入植物バイオマス推定手法の詳細な手順を報告する。このアプローチは、ハザード評価と侵入植物の早期警告を実施するのに非常に有益であることが証明されています。
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本稿では、無人航空機(UAV)リモートセンシングから得られたデータを活用して、侵入種のバイオマス評価と空間分布を捉える侵入植物バイオマス推定手法の詳細な手順を報告する。このアプローチは、ハザード評価と侵入植物の早期警告を実施するのに非常に有益であることが証明されています。
UAVリモートセンシングとコンピュータビジョンに基づいて侵入植物のバイオマスを推定する方法の詳細な手順について報告します。調査範囲からサンプルを収集するために、サンプリングポイントをランダム化するためのサンプル正方形アセンブリを準備しました。ドローンとカメラを用いて無人航空カメラシステムを構築し、自動ナビゲーションにより調査地域のRGB画像を連続的に取得するシステムを構築しました。撮影終了後、サンプルフレーム内の地上バイオマスを回収し、すべての対応物にラベルを付けてパッケージ化しました。サンプル データを処理して、航空画像を 280 x 280 ピクセルの小さな画像に分割して、画像データセットを作成しました。深層畳み込みニューラルネットワークを用いて、調査地域における Mikania micrantha の分布をマッピングし、その植生指数を求めた。採取した生物を乾燥させ、その乾燥重量をグラウンドトゥルースバイオマスとして記録しました。侵略的植物バイオマス回帰モデルは、サンプル画像から植生指数を独立変数として抽出し、それを従属変数としてグラウンドトゥルースバイオマスと統合することにより、K最近傍回帰(KNNR)を使用して構築されました。その結果、外来植物のバイオマスを正確に予測できることが示されました。画像トラバーサルにより、侵入植物バイオマスの正確な空間分布マップが生成され、侵入植物の影響を受けるリスクの高い地域を正確に特定することができました。要約すると、この研究は、無人航空機のリモートセンシングと機械学習技術を組み合わせて、侵入植物のバイオマスを推定する可能性を示しています。これは、侵入植物のリアルタイム監視のための新しい技術と方法の研究に大きく貢献し、地域規模でのインテリジェントな監視と危険評価のための技術サポートを提供します。
このプロトコルでは、UAVリモートセンシングとコンピュータービジョンに基づく侵襲的バイオマス推定の提案された方法は、侵入生物の分布を反映し、侵襲的バイオハザードの程度を予測することができます。侵入生物の分布とバイオマスの推定は、これらの生物の予防と制御にとって重要です。侵入植物が侵入すると、生態系に損害を与え、莫大な経済的損失を引き起こす可能性があります。侵入植物の迅速かつ正確な特定と主要な侵入植物バイオマスの推定は、侵入植物の監視と制御における主要な課題です。このプロトコルでは、 Mikania micrantha を例に、無人空中リモートセンシングとコンピュータービジョンに基づく侵入植物バイオマス推定方法を探求し、侵入植物の生態学的研究のための新しいアプローチと方法を提供し、侵入植物の生態学的研究と管理を促進します。
現在、 Mikania micrantha のバイオマス測定は、主に手動サンプリング1によって行われています。従来のバイオマス測定方法では、多くの労働力と材料資源が必要ですが、これらは非効率的で地形によって制限されています。 Mikania micrantha の地域バイオマス推定のニーズを満たすことは困難です。このプロトコルを使用する主な利点は、地域のサンプリング制限を考慮せず、手動調査の必要性を排除する方法で、地域の侵入植物バイオマスと侵入植物の空間分布を定量化する方法を提供することです。
UAVリモートセンシング技術は、植物バイオマスの推定において一定の結果を達成しており、農業2,3,4,5,6,7、林業8,9,10,11、および草地12,13,14で広く使用されています.UAVリモートセンシング技術には、低コスト、高効率、高精度、および柔軟な操作15,16という利点があり、調査エリアでリモートセンシング画像データを効率的に取得できます。次に、リモートセンシング画像のテクスチャ特徴と植生指数を抽出し、広域の植物バイオマスの推定のためのデータを提供します。現在の植物バイオマス推定手法は、主にパラメトリックモデルとノンパラメトリックモデルに分類される17。機械学習アルゴリズムの発展に伴い、より精度の高いノンパラメトリック機械学習モデルは、植物バイオマスのリモートセンシング推定に広く利用されています。Chen et al.18は、混合ロジスティック回帰(MLR)、KNNR、およびランダムフォレスト回帰(RFR)を使用して、雲南省の森林の地上バイオマスを推定しました。彼らは、機械学習モデル、特にKNNRとRFRがMLRと比較して優れた結果をもたらしたと結論付けました。Yanら19は、RFRと極度勾配ブースティング(XGBR)回帰モデルを使用して、さまざまな変数セットを使用して亜熱帯林バイオマスを推定する精度を評価しました。Tianら20は、11の機械学習モデルを利用して、北武湾のさまざまなマングローブ林種の地上バイオマスを推定しました。研究者たちは、XGBR法がマングローブ林の地上部バイオマスを決定するのにより効果的であることを発見しました。マンマシンリモートセンシングを用いた植物バイオマス推定は確立された手法ですが、侵入植物Mikania micranthaのバイオマス推定のためのUAVの使用は、まだ国内外で報告されていません。このアプローチは、侵入植物、特にMikania micranthaのバイオマス推定の以前のすべての方法と根本的に異なります。
要約すると、UAVリモートセンシングには、高解像度、高効率、低コストという利点があります。リモートセンシング画像の特徴変数抽出では、テクスチャ特徴量と植生指数を組み合わせることで、より優れた回帰予測性能を得ることができます。ノンパラメトリックモデルは、植物バイオマス推定においてパラメトリックモデルよりも正確な回帰モデルを取得できます。したがって、侵入植物とそのバイオマスのヌル分布を正確に計算するために、UAVとコンピュータービジョンを使用したリモートセンシングに依存する侵入植物バイオマス実験の次の手順を概説することを提案します。
1. データセットの準備

2. Mikania micranthaの同定
3. 外来植物バイオマスの推定


私たちは、コンピュータ上でプログラム的に実装された、コンピュータビジョンに基づく侵入植物の推定方法の代表的な結果を示します。本実験では、 Mikania micrantha を研究対象として、外来植物の自然生息地における空間分布の評価とバイオマスの推定を行いました。ドローンカメラシステムを用いて研究現場の画像を取得し、その一部を 図3に示します。ResNet101畳み込みニューラルネットワークを利用して、調査地域内に存在する植物を特定しました。その後、侵入植物の空間分布をマッピングし、調査結果の一部を 図4に示しました。 図3では、白い花で飾られた植物の上に 登るMikania micrantha を観察できます。他の植物、道路、それに付随する要素は、背景に均一に描かれています。 図 4 では、モデルは赤い部分を Mikania micrantha として認識しています。2つの画像を比較すると、ResNet101が複雑な背景で Mikania micrantha を強力に検出していることが明らかです。さらに、調査地域内の Mikania micrantha の分布を高精度で正確にマッピングします。
調査地域における外来植物のバイオマスは、オルソフォトからのすべての Mikania micrantha サンプルプロット画像を280ピクセル×280ピクセルで切り捨て、植生指数RBRI、GBRI、GRRI、RGRI、NGBDI、およびNGBDIを抽出することによって推定されました。回帰分析は、KNNR回帰モデルを用いて、6つの指標を推定モデルへの入力、バイオマスをモデルの出力として実施しました。 図 5 は、グラフの水平座標がフィールド測定されたバイオマスの値を表し、垂直座標がモデル予測バイオマスの値を表し、灰色の領域が信頼区間を表している結果を示しています。この結果は、R² 値が 0.62、RMSE が 10.56 g/m2 という強力な予測性能を示しています。このモデルは、 Mikania micranthaバイオマス推定の精度を向上させ、 図6 の空間分布マップは 、Mikania micrantha バイオマスの分布を効果的に捉えています。

図1:UAVリモートセンシングシステム。 UAVでキャプチャしたRGB画像データの例をいくつかご紹介します。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図 2: ルート プランニング。 地域ルート計画に関する研究 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図3:調査地域内の侵入植物の同定結果。 この図は、ResNet101畳み込みニューラルネットワークを介して研究ゾーンで Mikania micrantha を同定した結果を示しています。写真の赤い領域は、ResNet101によって Mikania micranthaとして検出された領域を示し、もう一方の背景は残りの調査領域を示しています。これらの結果は、 図 1 に示されているサンプル イメージに対応しています。これらはそれぞれ 図1の認識結果を表しています。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図4:侵入植物の空間分布。 モデルは赤い部分を Mikania micranthaとして認識します。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図5:バイオマス予測の回帰結果。 横軸は現場で観測されたバイオマス値を示し、縦軸はモデルによって推定されたバイオマス値を示しています。灰色の網掛け領域は信頼区間を示します。KNNRモデルは、テストセットで0.65のR2 を達成しましたが、最小の二乗平均平方根誤差は30.59 g / m2に達しました。モデルの回帰散布図では、多くの Mikania micrantha バイオマス推定値が信頼区間内にあり、バイオマス予測の妥当性を示しています。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図6: Mikania micrantha バイオマスの空間分布。 図は、KNNRを予測モデルとして利用した研究領域全体の ミカニア・ミクランタ バイオマスの推定と、抽出した ミカニア・ミクランタ ・バイオマス分布図を示しています。暗い影の領域は、 Mikania micrantha バイオマスの量が多いことを表します。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図7:このプロトコルの主な開発の概略図。 この図は、提示されたプロトコルの主な手順を示しています。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
| 植生指数名 | 計算式 |
| グリーンブルーレシオインデックス | GBRI=DNG/DNB |
| グリーンレッドレシオインデックス | GRRI=DNG/DNRの |
| レッドブルーレシオインデックス | RBRI=DNR/DNB |
| レッドグリーンレシオインデックス | RGRI=DNR/DNG |
| 正規化された緑、青、差分指数 | NGBDI = (DNG - DNB)/(DNG + DNB) |
| 正規化された緑、赤、差分指数 | NGRDI = (DNG - DNR)/(DNG + DNR) |
表1:植生指数の計算式。 このプロトコルで使用される植生指数とそれぞれの計算式。
補足図1:OpenCVライブラリを使用してPythonスクリプトで画像を280 x 280ピクセルにトリミングします。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
補足図 2: データセットをトレーニング セット、検証セット、およびテスト セットに分割する。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
補足図3:特徴の抽出と次元の縮小。(A)初期特徴抽出。(B)畳み込み操作。(C)次元の縮小。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
補足図4:ResNetアーキテクチャのFCレイヤーに機能を伝達する。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
補足図5:パラメータの設定。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
補足的な図6:包括的な分布マップを生成するための特定の実装コード。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
補足図 7: RandomResizedCrop 関数と RandomHorizontalFlip 関数。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
UAVリモートセンシングとコンピュータビジョンを用いて外来植物のバイオマスを推定する実験の詳細な手順を紹介します。この契約の主なプロセスと手順を 図 7 に示します。適切なサンプル品質は、プログラムの最も重要で困難な側面の1つです。この重要性は、すべての侵入植物だけでなく、他の植物バイオマス推定実験にも当てはまります24。
調査地域内の侵入植物の分布を特定するには、まずUAVからのリモートセンシングを使用して、調査地域の可視かつ連続的な写真測量を取得する必要があります。これを実現するには、適切なUAV撮影高度とカメラの解像度が必要です。これにより、畳み込みニューラルネットワークであるResNet101は、画像から植生指数やテクスチャなどの特徴を取得できるようになります。これらの特徴は、複雑な環境背景でも侵入植物を特定し、最終的に分析範囲内の分布をマッピングするのに役立ちます。
調査領域内の侵入植物のバイオマスを推定するためには、25〜50のランダムサンプリングポイントを持つ正方形のサンプルフレーム25 を作成する必要がある。無人航空機システムが写真撮影のプロセスを完了すると、サンプルフレームから侵入植物を収集する必要があります。最初のセクションで述べたように、フレームからのバイオマスの収集は、フレームを移動せずに、一意の番号を割り当てることによって正確に行う必要があることに注意することが重要です。さらに、正確な測定値を得るためには、バイオマスを実験室で繊細に乾燥させ、秤量する必要があります。KNNR回帰モデル18 を用いて、UAVカメラシステムにより取得した画像から抽出した6つの植生指数を推定モデルに入力し、バイオマスをモデル出力として、侵入植物の空間分布を求めた。
この論文で説明されている侵入植物の個体数を推定する方法は、すべてを網羅しているわけではありません。比較可能なデータを取得するために追加のツールを利用することができ、多数の実用的または革新的な修正を採用することができます。さまざまなドローンを利用することができ、そのうちプロトコルで指定されたモデルは1つのオプションとしてのみ機能し、自動ナビゲーション統合、ジンバルに適応する能力、最大50メートルの飛行能力、選択したカメラのペイロード容量を超えるペイロード容量、および研究エリア全体をカバーする範囲を備えた任意のドローンに置き換えることができます。UAV用のカメラを選択する際には、最大解像度、有効画像ピクセル数、最大ピクセル数、その他のイメージングパラメータ、UAV負荷のサイズと重量の制限などの要素を考慮することが重要です。さらに、撮影プロセスを正常に完了するには、適切な範囲が必要です。さらに、同定のためのモデルは唯一の方法ではなく、木本植物や多様な種類の植物など、複数の侵入植物種に合わせて調整して、提案された方法を強化することができます。この戦略は、より少ないサンプルを使用し、追加の植生指数を取得し、より高い精度を達成する回帰アルゴリズムに進めることもできます。あるいは、侵入植物を同定するために縮小された同定ネットワークを実装し、インテリジェントな同定方法の実用化を可能にすることもできる。
提示された方法の主な制約は、モデルの照明条件と背景への依存性です。より高い精度に向けた改善は、マルチスペクトル26、LiDAR12、および気象データ27をさらに組み込むことによってのみもたらされます。この種のデータを取得するのは難しく、高価な機器が必要になる場合がありますが、直射日光を避け、UAV撮影システムを介してエリアをサンプリングする際に植物の背景を分離することで、データの精度を高めることができます。
この方法論を利用する利点は、他の方法論とは対照的に、指定された調査地域内の侵入植物種の空間分布を提供できることにあります。分布は、UAVカメラシステムを介してキャプチャされた画像から抽出された6つの植生指数を入力として、バイオマスをモデルの出力として、回帰分析によって決定されます。このアプローチは、複数の調査領域のバイオマスを同時に推定するためのポータブルな方法を利用しており、これは従来の手動のバイオマス収集方法とは基本的に異なります。従来の方法では、手作業で調査を行い、大量のデータを収集することになりますが、これは非効率的で主観的であり28、したがって、複雑な条件下でバイオマスの実用的な推定を提供することができません。
前述の方法論を用いて侵入植物バイオマスを推定することで、地域分布の定量化が可能となります。さらに、地域レベルでのインテリジェントな監視とハザード評価のための技術支援を提供します。
著者は何も開示していません。
著者は、この研究を支援してくれた中国農業科学院と広西大学に感謝します。この研究は、中国の国家重点研究開発プログラム(2022YFC2601500および2022YFC2601504)、中国国家自然科学基金会(32272633)、深セン科学技術プログラム(KCXFZ20230731093259009)の支援を受けました
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| デジタル一眼レフカメラ | ニコン | D850 | センサータイプ:CMOS;最大ピクセル数:4,689万ピクセル。有効画素数:4,575万画素数最大解像度8256 x 5504。 |
| GPU - グラフィックス プロセッシング ユニット | NVIDIA | ||
| ヘキサコプ | ターDJI | M600PRO | 水平飛行:65 km / h(風環境なし)。最大飛行負荷:6000 g |
| PyCharm | Python IDE | 2023.1 | |
| Python | Python | 3.8.0 | |
| Pytorch | Pytorch | 1.8.1 |
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