ここでは、懸濁液HEK293細胞ベースのAAV生産プロトコルを提示し、その結果、商用ベンダーから研究目的で入手可能なコンポーネントを使用してベクターを生産するために必要な時間と労力を削減します。
方法論記事
ここでは、懸濁液HEK293細胞ベースのAAV生産プロトコルを提示し、その結果、商用ベンダーから研究目的で入手可能なコンポーネントを使用してベクターを生産するために必要な時間と労力を削減します。
アデノ随伴ウイルスベクター(AAV)は、中枢神経系(CNS)を調査するための優れたツールです。AAVなどの革新的なカプシド。PHP.eBは、マウスの静脈内注射による中枢神経系の広範な形質導入を示しています。同等の形質導入を実現するには、中枢神経系実質への直接注入と比較して、100倍高い力価(最小1 x 1011 ゲノムコピー/マウス)が必要です。私たちのグループでは、AAVを含むAAV生産。PHP.eBは、接着HEK293T細胞とトリプルトランスフェクション法に依存しています。接着細胞でAAVの高収率を達成するには、労力と材料を大量に消費するプロセスが必要です。この制約により、コニカルチューブでの懸濁液ベースの細胞培養のプロトコルが開発されました。接着細胞で生成したAAVを懸濁液製造法と比較しました。トランスフェクション試薬ポリエチレンイミンまたはTransItを用いた懸濁液中での培養を比較しました。AAVベクターは、ヨウジキサノールグラジエント超遠心分離により精製し、その後、バッファー交換および遠心フィルターを用いた濃縮を行いました。アドヒレント法では平均2.6 x 1012 GCを達成したが、懸濁法とポリエチレンイミンでは合計7.7 x 1012 GC、TransItでは合計2.4 x 1013 GCであった。接着液で作製したベクター間の in vivo 形質導入効率は、浮遊細胞系と比較して差はありません。要約すると、懸濁液HEK293細胞ベースのAAV生産プロトコルが導入され、ベクター生産に必要な時間と労力が削減され、研究目的で商用ベンダーから入手可能なコンポーネントを使用して3〜9倍の収率を達成します。
アデノ随伴ウイルス(AAV)は1965年に発見され、それ以来、無数の用途で使用されてきました1。AAVは、遺伝子や神経細胞の機能の研究、神経回路のマッピング、疾患の動物モデルの作成など、神経科学研究に応用されています2。伝統的に、これはほとんどの自然な血清型が血液脳関門を通らないか、またはそうするために高線量を必要とするので、興味のある部位に直接注入することによって行われます1,2,3。
AAVの発見により。PHP.B4 や AAV などの次世代の capsid です。PHP.eB5 と AAV.CAP-B106は、簡易な全身注射を用いて中枢神経系(CNS)を標的とすることができる。空間マッピングにより、AAV の標的となる細胞が明らかになります。PHP.eB(セルラーレベル6,7)。これらのカプシドは、特定のプロモーター/エンハンサーと組み合わせることで、神経科学者が非侵襲的なAAV送達によって遺伝子と脳機能を研究する幅広い機会を提供します4,8。
AAVにはより低い用量が必要ですが。AAV9(4 x 1012 GC/マウス)と比較して、PHP.eB(通常1〜5 x 1011 11ゲノムコピー(GC)/マウス)7は、直接注入戦略(通常1 x 109 GC/μL注入)と比較して、さらに多くのベクターを作製する必要があります。ほとんどの天然血清型は、ヨージキサノール精製9,10,11,12と組み合わせた古典的な接着細胞培養システムを使用して作製できます。AAVの場合。PHP.eB:これは、1回の実験に十分なベクターを得るために、細胞を培養およびトランスフェクションするための労働集約的なプロセスを伴います8。そこで、コニカルチューブでの浮遊細胞培養におけるAAVの生産が開発されました。最大容量300mLのコニカルチューブはコンパクトで、インキュベーターのスペースとプラスチックの両方を節約できます。浮遊細胞は、15 cmプレート上の接着細胞よりも大量に培養および処理がはるかに簡単です。プロトコルのトランスフェクションコンポーネントは変わりません。したがって、以前に接着系で使用されたプラスミドは、浮遊細胞での産生に基づいて、このプロトコルで容易に使用できます。このプロトコルは、研究室の他の研究者への転送に成功し、さまざまなカプシドやコンストラクトに使用されました。
すべての実験手順は、オランダ王立科学アカデミー(KNAW)の動物実験委員会によって承認され、プロジェクト番号AVD8010020199126に基づくオランダの動物実験法に準拠していました。 図1に、完全なプロトコルの概略図を示します。細胞の播種からAAV精製まで、プロトコルは完了するまでに6日かかります。
1. 試薬調製
2. HEK293浮遊細胞の培養
3. トランスフェクション
4. 細胞の採取
5. ヨウオジキサノールの精製
ほとんどの学術研究室では、AAV産生に接着性HEK293T細胞を使用しています8,9。これは、直接注入に少量のAAVが必要な場合には比較的うまく機能しますが、AAVなどの全身性キャプシドで同様の形質導入を達成するには、100倍高い力価(最低でも1 x 1011 GC/マウス)が必要です。PHP.eBです。
このプロトコルでは、円錐管で培養した懸濁液HEK293細胞を使用したAAVの産生が確立されました。小規模培養は50 mLチューブで、大規模培養は600 mLチューブで行うことができます。特定のシェーカー(材料表を参照)には、最大16本の大きなチューブを同時に培養できるラックを使用できます。このラックは、50 mL チューブ用の特殊なインサートと組み合わせて使用します(図 2A)。このシステムは、このプロトコルの培養およびトランスフェクションセグメントの時間を大幅に短縮します。生産の初期セットアップは、ルシフェラーゼと緑色蛍光タンパク質(GFP)のレポーターコンストラクトで行われました10,11。並行して、GFPコンストラクトは、以前に公開されたプロトコル12に記載されているように、12、15cm2プレートで製造されました。平均して、ポリエチレンイミン(PEI)を使用して合計 7.7 x 1012 GC の収率を達成し、TransIt を使用して合計 2.4 x 1013 GC の収率を達成しました(図 2B)。PEIの場合、これはほぼ3倍の改善です。TransIt では、接着培養で得られた力価(2.6 x 1012)よりも 9.2 倍改善されます。浮遊細胞のトランスフェクションに使用すると、TransItはPEIと比較して収量が約3倍向上します(図2B)。
その後、AAVベクターの性能を in vivoで試験しました。GFPベクターはPEIおよびTransItで作製し、従来の接着系で作製したGFPベクターと比較しました。注射後4週間で、マウス(6週間C57BL/6雌マウス体重20-25g)を屠殺し、マウスの脳におけるGFP発現を組織学で評価した(図3A)。比較解析は矢状脳切片で行われました。これらの産生法を用いて産生されたウイルスの形質導入パターンに差は認められなかった(図3B)。いずれかの方法で作製したベクターのルシフェラーゼ活性も評価しました。形質導入は in vivo で 3 週間測定しました。経時的な発現パターンは、どのトランスフェクション試薬を使用しても類似しています(図4)。
次に、プロトコルはチームの他のメンバーによってテストされ、実装されました(表2)。PEIを用いた他のキャプシドの作製は成功し、平均収量は3.5 × 1012 GCベクターでした。キャプシド B10 の生産では、TransIt と PEI を比較することで 3 倍の改善を達成できます。別のプロジェクトでは、AAv.PHP.eBにパッケージ化されたいくつかのコンストラクトが平均収量3.7 x 1012を与え、これはマウス1匹あたり5 x 1011 GCの用量で7匹のマウスに静脈内注射するのに十分である。これらの結果は、このプロトコルが複数の研究者によってさまざまなカプシドおよびコンストラクトの組み合わせにうまく使用できることを示しています。

図1:生産の概略図。 1日目(D1)に、細胞を300mLチューブで培養します。2日目(D2)に、細胞に適切なプラスミドをトランスフェクションします。5日目(D5)に、細胞を回収し、10倍トゥイーン溶解バッファーを使用して溶解します。溶解後、細胞破片は遠心分離によって除去されます。続いて、細胞溶解物を濾過して大きなタンパク質を除去し、ポリエチレングリコール(PEG)8000を使用してAAVウイルスを沈殿させます。6日目(D6)に、ヨジキサノールの精製と濃縮を行います。前日のPEG濃縮液をDNaseで処理し、その後、ヨジキサノールグラジエントにかけます。精製されたベクターは、その後、遠心フィルターを使用して脱塩および濃縮されます。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

図2:インキュベーターのセットアップとAAV収量。 (A)ウイルス産生細胞を、直径50cmの振とうインキュベーターで培養します。このインキュベーターには、600mLチューブ用のアダプタープレートと、メカトロニクス部門が製造した50mLチューブ用の特別なインサートが装備されています。(B)初期セットアップに続いて、レポーターコンストラクトは、ポリエチレンイミン(PEI;合計7.7 x 1012 GC、n=5)またはTransIt(合計2.4 x 1013 GC、n=5)のいずれかをトランスフェクション法として使用し、Verhaagenら12に記載されているように、従来の接着法(合計2.6 x 1012 GC、n=5)で達成された収量と比較します。データは平均±標準偏差で表されます。この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

図3: in vivo 評価後のGFP発現パターン。 (A)ユビキタスプロモーターCMV即時早期エンハンサー、ニワトリβアクチンプロモーター、ウサギβ-グロビンスプライスアクセプターサイト(CAG)とそれに続く緑色蛍光タンパク質(GFP)、ウッドチャック肝炎ウイルス(WHV)転写後調節要素(WPRE)およびポリアデニル化末尾部(pA)を含む典型的なAAVベクターコンストラクトの模式図13.ここでは、6週齢の雌マウス(n = 3)に、マウスあたり5 x 1011 の総ゲノムコピー(gc)を含む尾静脈注射を受けました。注射後4週間で、マウスを屠殺し、脳を組織学で分析した。(B)ポリエチレンイミン(PEI)またはTransItトランスフェクション試薬を用いた接着HEK293T細胞および浮遊細胞を用いた矢状切片における形質導入パターンの代表的な描写は、使用する製造方法に関係なく同様の形質導入パターンが観察される。スケールバー = 1000 μm。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

図4:トランスフェクション法に関係なく類似したルシフェラーゼ活性。 (a)V5タグおよびウシ成長ホルモンポリアデニル化テール(BGHpA)を有するユビキタスプロモーターCMV即時早期エンハンサー、ニワトリβアクチンプロモーター、およびウサギβ-グロビンスプライスアクセプターサイト(CAG)ルシフェラーゼ(LUC)を含む、使用したコンストラクトの概略図、 5 x 1011 GC合計/マウス(n=3)を尾静脈から注入し、頭蓋領域におけるルシフェラーゼ活性(赤丸、 実施例画像)を生物発光画像として毎週測定した。(B)生物発光活性は、相対発光単位(RLU)として測定し、PEI産生の場合は青色のバー、TransItの場合は茶色のバーで示しました。選択した脳領域におけるルシフェラーゼ活性に有意差は群間で観察されなかった。データは平均±標準偏差で表されます。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。
表1:トランスフェクションパラメータ。この表をダウンロードするには、ここをクリックしてください。
表2:実装されたプロトコルの歩留まり。 他の研究者がAAVを生成するために使用する懸濁プロトコル。 この表をダウンロードするには、ここをクリックしてください。
AAVの全身投与は、中枢神経系への遺伝子導入のための強力なツールです。しかし、AAVの製造は高価で手間のかかるプロセスです。浮遊細胞を使用することで、15cm2 プレート上のHEK293Tの接着培養と比較して、労力とプラスチックが削減されます。さらに、ここに実装されている円錐形のチューブは取り扱いが簡単で、実験室のスペースを最大限に活用できます。このプロトコルは、2人の研究者によって設定され、その後、研究室の他の研究者によって適用されました。3人の独立した研究者による一連の作製により、平均して、バッチあたり6〜7匹のマウスを注入するのに十分なベクターが得られました。
HEK293浮遊細胞の使用は、以前に説明されています13,14。しかしながら、記載された浮遊細胞株は、研究目的で自由に利用できるものではない。これは、学術研究者が説明されている方法を適用する際のボトルネックです。このプロトコルで記述されている懸濁液のセルラインは研究の為に自由に利用できる。浮遊細胞の培養は、スペースと時間を節約するために、三角チューブではなく円錐形チューブで行われました。三角マイヤーでは、最大4つの生産物を同時に培養できますが、円錐形のチューブを使用すると12の生産物が培養されます。円錐形のチューブは、収穫のために遠心分離機に直接移すことができます。
浮遊細胞培養系の代替可能性の1つは、バキュロウイルス系です。バキュロシステムの利点は、これらの細胞と培地が一般に公開されており、簡単に適用できることです。学術的には、すぐに使用できるAAVトランスファープラスミドの大規模なライブラリを含むAddgeneなどのリポジトリが利用可能です12。これらには、ITRの欠陥などの注意点もありますが、プラグアンドプレイ実験の優れたソースとして機能します。HEK293ベースの生産システムを維持することを選択したのは、利用可能なプラスミドをバキュロウイルスにコンストラクトを移すことなく、生産に直接使用できるためです。
トランスフェクションには、ポリエチレンイミンが比較的安価であるため、トランスフェクション試薬として最適です。代替として、ベクターの収量を増加させるために、新しいトランスフェクション法(TransIt)を評価しました。半分の量のプラスミドを使用して3倍の改善が観察されました。このため、TransItは、より大きなストックが必要な場合に興味深い代替トランスフェクション試薬となります。これの限界はコストであり、小ロットではあまり面白くありません。
要約すると、ここでは、学術実験室の設定で浮遊細胞で高収率AAVを産生するために使用できるプロトコルを示します。高収率でAAVを製造するために学術研究室で使用できるツールについて説明します。
TransITの無料サンプルは、初期テストのためにMirusから提供され、その後、試薬を購入してさらに使用しました。著者らは、報告すべき他の競合する金銭的利害関係を有していない。
この研究は、オランダ王立芸術科学アカデミー(KNAW)研究基金からの助成金とStart2Cure(0-TI-01)からの助成金によって支援されました。プロトコルの設定における Leisha Kopp 氏の意見とアドバイスに感謝します。図はBiorenderを使用して作成されました。
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| 39 mL、クイックシールラウンドトップポリプロピレンチューブ、25 x 89 mm - 50Pk | ベックマンコールター | 342414 | |
| アダプター600 mLコニカルチューブ、ローターS-4x1000用、 | eppendorf | 5920701002 | |
| Infors HT/TPP | 587633 | のバイオリアクター16個に適合 | |
| 、750 mL丸型バケット用 | eppendorf | 5820747005 | |
| Centrifuge 5920 R G, 230 V, 50-60 Hz, incl. rotor S-4x1000, round buckets and adapter 15 mL/50 mL conical tubes | eppendorf | 5948000315 | |
| Distilled Water | Gibco | ||
| DNase I 組換え体、RNase フリー | Roche | 4716728001 | |
| DNase I 組換え体、RNase フリー | Roche | 4716728001 | |
| DPBS、カルシウム、マグネシウム | Gibco | 14040091 | |
| DPBS、カルシウムなし、マグネシウム | Gibco | 14190144 | |
| Fisherbrand 使い捨て PES フィルターユニット 0,2 | フィッシャー | ||
| フィッシャーブランド 使い捨てPESフィルターユニット 0.45 | フィッシャー | FB12566505 | |
| 50ml培養チューブ用ホルダーも適合 | インフォサーズHT/TPP | 31362 | |
| 600ml細胞培養チューブ用ホルダー | インフォサーズHT/TPP | 66129 | |
| インキュベーター ミニトロン 50mm | インフォサーズHT | 500043 | |
| LV-MAX 生産媒体 | ギブコ | ||
| N-Tray Universal | Infors HT/ TPP | 31321 | |
| OptiPrep - Iodixanol | Serumwerk bernburg | 1893 | |
| PEI MAX - トランスフェクショングレード 直鎖状ポリエチレンイミン塩酸塩 (MW 40,000) | Poly-sciences | 24765-100 | |
| フェノールレッド溶液 | Sigma-Aldrich | 72420100 | |
| ポリ(エチレングリコール) 8000 | Sigma-Aldrich | 89510 | |
| TransIT-VirusGEN | Mirus Mir | 6706 | |
| Trypan Blue Solution, 0.4% | Gibco | 5250061 | |
| TubeSpin Bioreactors-50ml | TTP | 87050 | |
| TubeSpin Bioreactors-600ml | TTP | 87600 | |
| ウイルス産生細胞 | Gibco | A35347 | |
| ビバスピン 20 MWCO 100 000 | Cytvia | 28932363 |
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